Nature子刊:表观遗传学修饰调控染色体数

众所周知,染色体数的异常往往与癌症发展有关。日前瑞典卡罗琳斯卡医学院的科学家们发现,一个微小的表观遗传学改变,在染色体的正确分离中起到了至关重要的作用。这项研究于二月十六日提前发表在Nature Structural and Molecular Biology杂志的网站上。 在正常情况下,细胞在分裂时会将染色体平均分配给两个子细胞。为此,与细胞分裂有关的分子机器会在细胞分裂前抓住染色体的着丝粒区域,以便将两个姐妹染色体单体分开,使每个子细胞得到同样的基因组拷贝。然而,肿瘤细胞中的染色体数常常出现异常(要么过多要么过少),导致许多基因无法正常表达。 泛素存在于真核生物中,是在进化过程中高度保守的小分子蛋白,含有76个氨基酸残基。泛素具有多种不同的形态,在修饰过程中,泛素之间可以相互连接在一起形成泛素链。早在1975年,人们就在真核生物中发现了泛素,但当时他们并没有意识到该蛋白的重要性。 泛素化是真核生物中......阅读全文

关于泛素缀合酶的分类介绍

  泛素结合酶E2可以被进一步分为四个类:有些仅仅有UBC结构域组成E2为第Ⅰ类,他们需要E3来进行底物识别;除了核心结构域之外,C末端具有延伸部分的属于第Ⅱ类;N末端具有延伸部分的属于第Ⅲ类;C末端和N末端都有延伸区域的归为第Ⅳ类 。

简述泛素缀合酶的结构组成

  E2s家族成员都含有一个由150-200个氨基酸组成的高度保守的泛素结合结构域(UBC)。该结构域的分子量大约为14-16kDa,并且其中有35%的序列在不同的E2s成员中是保守的,它可以为泛素活化酶E1s,泛素连接酶E3s和活化的Ub或UBL提供结合位点。UBL是一种类泛素蛋白,如SUMO,I

Cell子刊:探寻泛素的秘密

  从帕金森症到糖尿病,泛素是治疗多种疾病的关键。1975年,人们在真核生物中发现了泛素,但当时他们并没有意识到该蛋白的重要性。近年来的研究表明,泛素具有多种不同的形态,在细胞的基础程序中具有重要作用,包括控制细胞生物钟、清理有害物质等等。   为了挖掘泛素治疗疾病的潜力,科学家们开始解析泛素的不

关于泛素化反应过程的介绍

  具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(

概述泛素缀合酶的作用原理

  泛素结合酶E2的UBC结构域中有一个保守的半胱氨酸残基,这个Cys残基作为活性位点与泛素分子(Ub)形成硫酯键。泛素活化酶E1将泛素转移到E2的半胱氨酸活性位点上,形成Ub-E2复合体,之后或是直接结合底物将泛素连接在靶蛋白上,或是与泛素连接酶E3相互作用,将泛素转移到靶蛋白上。  在泛素化过程

简述泛素活化酶的作用机理

  泛素激活酶(Uba或E1)水解ATP,在自身的活性位点的半胱氨酸(Cys)的和泛素C末端76号甘氨酸(Gly76)之间形成高能硫酯键,从而激活泛素的-COOH末端,为下一步亲核攻击做准备 [3] 。编码E1的基因为uba1.

泛素化的生物学意义

泛素化是指泛素分子在一系列酶作用下,对靶蛋白进行特异性修饰的过程。它在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用。参与细胞周期、增殖、凋亡、分化、转移、基因表达、转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控。通过泛素化的修饰能使一些生命过程中起决定作用的酶特定识别要

泛素结合酶的基本信息

泛素结合酶,也称为E2酶,极少数情况下也称为泛素载体酶 (ubiquitin-carrier enzymes),执行泛素化反应的第二步,该反应可以通过蛋白酶体降解靶蛋白。

泛素结合酶的基本类型

泛素结合酶E2可以被进一步分为四个类:有些仅仅有UBC结构域组成E2为第Ⅰ类,他们需要E3来进行底物识别;除了核心结构域之外,C末端具有延伸部分的属于第Ⅱ类;N末端具有延伸部分的属于第Ⅲ类;C末端和N末端都有延伸区域的归为第Ⅳ类。

泛素活化酶的基本信息

中文名称泛素活化酶英文名称ubiquitin-activating enzyme定  义编号:EC 6.3.2.19。泛素化级联反应中的第一个酶(E1)。在MgATP存在下,一个分子泛素(Ub)被腺苷酸化形成AMP-Ub,通过非共价键与E1结合,而另一分子Ub的C端甘氨酸(G76)的羧基与E1中的—

去泛素化酶(DUBs)家族介绍

去泛素化酶(DUBs),是一类数量很大的蛋白酶类家族。它主要通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来。人类基因组编码近100种去泛素酶,使得它们成为泛素系统酶中最大家族。在人类中的去泛素化酶基因,可分为两大类:半胱氨酸蛋白酶家族和金属蛋白酶

cdc27基因的结构特点及作用

该基因编码的蛋白与酿酒酵母Cdc27蛋白和pombe-nuc 2裂殖酵母的基因产物具有很强的相似性该蛋白是由8个蛋白亚基组成的后期促进复合物(APC)的组成部分,在真核细胞中高度保守该复合物催化细胞周期蛋白b泛素结合物的形成,该结合物负责泛素介导的b型细胞周期蛋白的蛋白水解。由该基因和apc复合物的

如何将染色体上DNA与组蛋白分离

用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.TE 缓冲液琼脂糖凝胶电泳或紫外分光光度计

eLife:为什么只有X染色体能招募剂量补偿蛋白

  对许多动物来说,雌性有两条X染色体,雄性只有1条。为了确保雌性动物X染色体上的蛋白质编码基因的正确表达,而不是多表达1倍剂量,雌性动物们采取了剂量补偿(dosage compensation)措施来纠正这种不平衡性。不同物种的该过程机制有所不同,但它们通常都涉及到一种监管复合体,它们与一条X性染

染色体中的蛋白质有什么用

染色体上的蛋白质包括组蛋白和非组蛋白。组蛋白是染色体的结构蛋白,它与DNA组成核小体。通常可以用2mol/LNaCl或0.25mol/L的HCl/H2SO4处理使组蛋白与DNA分开。组蛋白分为H1、H2A、H2B、H3及H4。这些组蛋白都含有大量的赖氨酸和精氨酸,其中H3、H4富含精氨酸,H1富含赖

VPS37A基因的结构特点和作用

该基因属于VPS37家族,编码ESCRT-I(运输I所需的内质分选复合物)蛋白复合物的一个组成部分,将泛素化跨膜蛋白分类到多泡体内。该基因在肝细胞癌中的表达下调,该基因的突变与常染色体隐性痉挛性截瘫-53有关。在5号染色体上发现了一个相关的假基因。另外,还发现了该基因的剪接转录变体。

USP8基因编码的功能和结构描述

这个基因编码一种属于泛素特异性加工蛋白酶家族的蛋白质编码蛋白被认为是通过蛋白质在细胞器上的泛素化来调节内体的形态,并参与内体早期的货物分类和膜运输。这种蛋白质是细胞进入细胞周期s期所必需的,在发育过程中也是hedgehog信号通路中的一个正调节因子。这个基因的假基因存在于2号和6号染色体上交替剪接导

USP8基因突变因子与药物介绍

这个基因编码一种属于泛素特异性加工蛋白酶家族的蛋白质编码蛋白被认为是通过蛋白质在细胞器上的泛素化来调节内体的形态,并参与内体早期的货物分类和膜运输。这种蛋白质是细胞进入细胞周期s期所必需的,在发育过程中也是hedgehog信号通路中的一个正调节因子。这个基因的假基因存在于2号和6号染色体上交替剪接导

遗传发育所发现泛素蛋白酶体系统调控免疫受体的稳定性

  植物细胞内抗病受体蛋白(NLR)介导对病原菌的专化性抗性并通常伴有侵染部位的细胞死亡,调控这类免疫受体的稳定性对植物抗病意义重大。在拟南芥中的研究表明,结构类似的免疫受体蛋白直接受泛素蛋白酶体系统(UPS)调控,而在作物中尤其是麦类作物中没有NLR受体直接受UPS蛋白降解途径调控的报道。  中国

遗传发育所发现泛素蛋白酶体系统调控免疫受体的稳定性

植物细胞内抗病受体蛋白(NLR)介导对病原菌的专化性抗性并通常伴有侵染部位的细胞死亡,调控这类免疫受体的稳定性对植物抗病意义重大。在拟南芥中的研究表明,结构类似的免疫受体蛋白直接受泛素蛋白酶体系统(UPS)调控,而在作物中尤其是麦类作物中没有NLR受体直接受UPS蛋白降解途径调控的报道。中国科学院遗

我国揭示蛋白酶体在泛素链诱导下的变构及底物识别机制

  近日,国际学术期刊Molecular Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)丛尧研究组的最新研究成果“Structural snapshots of 26S proteasome reveal tetraubiquitin-induced confor

Nature:研究发现调控血管形成的关键因子

  血管生成是在原有血管网基础上,通过内皮细胞芽出而形成新生血管的复杂过程,这一复杂构成涉及几个分子信号通路。   近日,RIKEN BioResource中心Yoichi Gondo与一队来自加拿大的研究人员合作,发现了一种新的调节血管生成的分子,并确定其调控机制。   研究小组发现Gum

实体肿瘤检测FANCL基因介绍

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增

浙大曹雪涛院士Cell子刊解析表观遗传与免疫

  来自浙江大学医学院、第二军医大学和复旦大学等处的研究人员发现,组蛋白甲基转移酶Ash1l通过诱导泛素编辑酶A20,抑制了IL-6生成及炎症性自身免疫疾病。这一研究在线发表在9月5日的《免疫》(Immunity)杂志上。   文章的通讯作者是现任职浙江大学医学院和第二军医大学的曹雪涛(Xueta

单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究获进展

  人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN

RSPO2基因的结构特点和生理作用

这个基因编码一个R-反应蛋白家族的成员。这些蛋白是富含亮氨酸重复序列的分泌配体,含有g蛋白偶联受体,通过抑制泛素e3连接酶增强wnt信号传导。在多种人类癌症中,包括这个基因座在内的染色体易位导致了基因融合的形成。选择性剪接导致多个转录变体。

DDB1基因的结构特点及主要作用

这个基因编码的蛋白质是异二聚体dna损伤结合(ddb)复合物的大亚基(p127),而另一个蛋白质(p48)形成小亚基。这种蛋白复合物在核苷酸切除修复中起作用,并在紫外线损伤后与DNA结合这种复合物的活性缺陷导致色素性干皮病互补组(xpe)患者的修复缺陷,xpe是一种常染色体隐性遗传疾病,以光敏性和早

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

FANCL基因突变与药物因子介绍

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增

FANCL基因编码功能及结构描述

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增