Science突破性成果:鸟瞰细胞RNA
如同在房地产中一样,在生物学中位置也很重要。活化基因的mRNAs战略性定位在整个活体组织中,它们的位置往往帮助调控了细胞和组织的生长及发育方式。然而为了同时分析许多的mRNAs,科学学家们不得不将细胞碾磨成浆,这使得他们没有好的办法精确确定这些mRNAs在细胞内的定位。 现在,哈佛大学Wyss生物启发工程研究所和哈佛医学院的一个研究小组,与Allen脑科学研究所展开协作开发了一种新方法,使得科学家们能够在完整细胞中同时确定数以千计mRNAs和其他类型RNAs的定位——测定碱基序列来鉴别它们,并揭示出它们在做什么。 研究人员将这种方法命名为荧光原位RNA测序(FISSEQ),其有可能促成早期癌症诊断揭示出看似健康组织中驱动癌症的分子改变。并有可能追踪癌症突变以及它们对于现代靶向疗法的反应,并揭示出一些更安全、有效的治疗靶点。 该方法还有可能帮助生物学家们了解胚胎发育过程中组织的微妙变化——甚至帮助绘制出人类大......阅读全文
LavaAmp:随时随地复制NDA序列
LavaAmp,一台小到可以别在裤腰带上、能够随时随地复制DNA序列的链式反应仪。图片来源:staticflickr.com LavaAmp的样机是用金属薄片做成的,一端有个小小的圆筒形突起部分,上面绕着两根细导线。你可以用5号电池给它供电,或者直接把它连接到笔记本电脑上的USB接口也行。La
细胞化学词汇自主复制序列
ARS(autonomously replicating sequence)。在真核生物中发现的一类能启动DNA复制的序列,含有一个AT富集区。最早在酵母中分离得到,随后在其它真核生物中也发现了ARS序列的存在。这些序列是在人工合成的环形质粒中作为复制器起作用的。
自主复制序列的定义和作用
ARS(autonomously replicating sequence)。在真核生物中发现的一类能启动DNA复制的序列,含有一个AT富集区。最早在酵母中分离得到,随后在其它真核生物中也发现了ARS序列的存在。这些序列是在人工合成的环形质粒中作为复制器起作用的。
基因复制速率的概念
比较基因组研究结果表明基因复制在大多数研究的物种中都很常见。这可以通过人类 或果蝇的基因组中的可变拷贝数(拷贝数变异)来证明。但是,很难衡量这种复制发生的速率。最近发现秀丽隐杆线虫中的基因复制率大约为10-7复制/基因/代,即在1000万个蠕虫的群体中,每一代将有一个基因重复。该速率比该物种中每个核
基因复制的其他功能
复制基因的另一个可能的命运是两个拷贝同样可以自由地积累退行性突变,只要任何一方突变造成的缺陷能由另一个拷贝补充,这种现象称为中性的“亚功能化”。这两个基因都不会丢失,因为它们现在都执行重要的非冗余功能,但最终都无法实现新功能。亚功能化可以通过中性过程发生,其中突变积累既没有害处也没有益处。但是,在某
基因的复制与表达
生物的遗传物质基础是核酸(nucleic acid),它也是基因的基本结构,它们的化学组成分子结构符合遗传物质的稳定性、连续性及多样性的要求。 (一)核酸的化学组成 核酸结构的基本单位是核苷酸(nucleic acid),每个核苷酸由1个磷酸、1个五碳糖和1个碱基3部分组成。核酸有两类:
重叠基因的调控序列
①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN
复制型基因的克隆方法
将目的基因仍保留在染色体以外的克隆系统称为复制型基因克隆系统,以区别整合到染色体上的整合型克隆系统。尽管有大量不同的噬菌体,但所有已知的乳球菌复制型克隆系统都是由质粒构建的。乳球菌遗传学研究证明,乳球菌含有数量不等的质粒,多则十几个。它们当中一些编码重要的代谢物质,为了分析和克隆这些基因,以及了解它
基因序列仪的分类介绍
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类:1. 平板型电泳:平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术,具有样品判读序列长(600-900bp)、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。2. 毛细管电泳:将凝胶高分子聚合物
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'
什么是基因的核心序列?
中文名称核心序列英文名称core sequence定 义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
关于复制型基因的克隆介绍
将目的基因仍保留在染色体以外的克隆系统称为复制型基因克隆系统,以区别整合到染色体上的整合型克隆系统。尽管有大量不同的噬菌体,但所有已知的乳球菌复制型克隆系统都是由质粒构建的。 乳球菌遗传学研究证明,乳球菌含有数量不等的质粒,多则十几个。它们当中一些编码重要的代谢物质,为了分析和克隆这些基因,以
基因复制的主要功能
基因复制是遗传创新和进化创新的来源。基因复制也产生遗传冗余,每个基因的第二拷贝通常没有选择压力,这样的话,即使发生突变, 其突变对其宿主生物也没有有害影响。如果某个基因的一个拷贝发生了影响其原始功能的突变,则第二个拷贝可以作为“备份”并继续正常运行。因此,复制的基因比功能性单拷贝基因能更快地累积突变
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
割裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,
什么是基因的间插序列?
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然
常见的几种基因复制的原因介绍
天然基因扩增,也称为染色体复制,或基因复制,是生物分子进化过程中产生新遗传物质的主要机制。它指的是任何含有基因的DNA片段的复制。基因复制可能源于DNA复制和修复错误,也可能源于自私遗传元件的偶然捕获。常见的几种基因复制的原因包括:异位重组(重组过程的交叉发生在非同源位点)、逆转录事件、非整倍性、多
常见的基因复制的原因有哪些?
常见的几种基因复制的原因包括:异位重组(重组过程的交叉发生在非同源位点)、逆转录事件、非整倍性、多倍性和复制滑动(滑链错配)。
DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列
Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9
首次测定玉米蛇基因组序列
在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动
结构基因的侧翼序列的介绍
1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'UT)。前导区和尾部区转录后的相应序列在mRNA中起维持mRNA稳定性的
3000株水稻基因序列公开发表
近日,3000株水稻基因组测序文章在GigaScience正式发表,且整套水稻基因序列以可引用形式在该杂志的附属开放获取数据库GigaDB中公开。 该项目产生的数据是目前已公开水稻序列数据量的四倍。该成果标志着3000株水稻基因组项目第一阶段的完成,主要由中国农业科学院、国际水稻研究
基因序列揭示非洲人早期历史
人类在非洲的早期历史正日益成为人们关注的焦点。一项新的研究对源自这片大陆的十几个族群的180个基因组进行了研究,其中一些基因组之前从未被分析过。 初步研究结果表明,在4万多年前,其中两个族群(桑人和巴卡人)的规模相当于当时其他族群的两倍,并且这两个族群生活在中东部非洲或南部非洲。 研究人员在
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA,用cDNA作为模板扩增基因的CDS区,然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部复制下来,在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始(比如18bp),反向引物从CDS最后一
概述酿酒酵母的基因组序列
1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10] 在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定
关于复制子的基因级的介绍
为了正确的遗传,一个细菌复制子需要以下功能:1、起始复制的过程。2、控制起始的频率。3、将复制的染色体分到子细胞中去。前两种功能都是原点来行使。分配可能是一种独立的功能,但在原核系统中通常与邻近原点的序列有关。真核生物的原点不行使分配的功能,它只与复制有关。 根据一个普遍的规律,含有原点的DN
至少复制几次可以得到独立的目的基因?
至少复制3次才能得到独立的目的基因.
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
科学家首次发现重度抑郁基因序列
【新闻事件】:本周《自然》发表了一篇重要论文。在分析5303例汉族女性重度抑郁患者和5337名对照的DNA序列后发现两个和重度抑郁相关的基因序列。一个紧靠SIRT1,另一个是LHPP的内含子。这是科学家第一次把重度抑郁和某个基因序列可靠地联系在一起,为以后药物开发打下基础。 【药源解析】:抑郁