首款鲶鱼高密度SNP芯片的开发
为了破译鲶鱼抗病性状的遗传机制，改善鲶鱼的养殖，美国奥本大学(Auburn University)的研究人员利用Affymetrix公司的Axiom基因分型技术，开发出第一款高密度的鲶鱼SNP芯片——Catfish 250K SNP array。这项研究成果于近日发表在《BMC Research Notes》上。 鲶鱼是美国最重要的水产养殖品种。然而近年来，鲶鱼产业面临巨大的挑战，包括严重疾病，这造成了重大的经济损失。目前迫切需要提高亲鱼的抗病水平。数量性状，如抗病性，通常是由一组基因控制的，它们涉及到一系列复杂的调控。这些性状的遗传机制的破译需要大量的遗传标记。 单核苷酸多态性(SNP)是目前首选的标记，因为它们是最丰富的遗传变异，广泛分布在基因组中，并且通常是双等位基因多态性，适合自动化的基因分型。对全基因组关联研究(GWAS)而言，SNP很有效，因为在处理复杂性状时，通过高密度SNP可检测到连锁不平......阅读全文
LDR临床检测基因芯片
基因芯片生物芯片是指采用光导原位合成或微量点样等方法，将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子、组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物（如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体）的表面，组成密集二维分子排列，然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交，通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描对杂交信号的强
表达谱基因芯片实验
表达谱基因芯片可应用于：（1）疾病诊断；（2）新药开发；（3）环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下，载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号
生物芯片用于基因诊断
从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱，就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片诊断技术以其快速、高效、敏感、经济、平行化、自动化等特点，将成为一项现代化诊断新技术。例如Affymet
基因芯片的制备方法
基因芯片的片基主要有硅片、玻璃片、硝酸纤维膜、聚丙烯膜等寡核苷酸芯片以人工合成的寡核苷酸片断作为探针,制备方法主要有原位合成法和合成后点样法。而 cDNA 芯片以长片断的 PCR 产物作为探针,制备方法主要为合成后点样法。(1)原位合成法 制备寡核苷酸芯片原位合成法设备昂贵,技术复杂。(2)合成后
基因芯片检测原理（二）
1．荧光标记杂交信号的检测方法使用荧光标记物的研究者最多，因而相应的探测方法也就最多、最成熟。由于荧光显微镜可以选择性地激发和探测样品中的混合荧光标记物，并具有很好的空间分辨率和热分辨率，特别是当荧光显微镜中使用了共焦激光扫描时，分辨能力在实际应用中可接近由数值孔径和光波长决定的空间分辨率，而在传统
基因芯片与SNP分析
基因芯片技术作为一种新兴的生物技术，近年来得到迅速发展，其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性（SNP）作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90
基因芯片的测序原理
基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG，与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时，通过确定荧光强度最强的探针位置，获得一组序列完全互补的探针序
基因芯片的测序原理
基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG，与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时，通过确定荧光强度最强的探针位置，获得一组序列完全互补的探针序
基因芯片优缺点分析
基因芯片的最大优点在于其高通量。基因芯片出现之前，研究众多基因在特定研究体系中的表达变化的手段为原位杂交技术和NORTHERN技术。这两种技术有其各自优点。原位杂交技术可以精确定位待检测基因在组织中分布于哪些细胞类型，而NORTHERN技术可以显示待检测基因的分子量信息。但两个技术的致命缺点是极低的
基因芯片技术的原理
基因芯片又称DNA芯片(DNA chip )或DNA微阵列(DNA microarray)。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法将大量特定序列的探针分子密集、有序地固定于经过相应处理的硅片、玻片、硝酸纤维素膜等载体上,然后加入标记的待测样品,进行多元杂交,通过杂交信号的强弱及分布,来分析目的
基因芯片的背景介绍
高通量、全基因组的DNA芯片已经成为生物领域十分有用的工具。然而，芯片实验产生的数据量日益增长，由于不同的分析方法，会得出不同结论，因而分析起着关键作用。 基因芯片分析就是为了通过生物信息学方法从这些芯片数据中发现可能对生物效应起作用的关键基因，从中寻找特定模式并对每个基因给予注释，从而挖掘出
基因芯片实验的步骤
(1)样品制备和标记 为了获得目的基因的杂交信号必须对目的基因进行标记,由于目前常用的荧光检测系统的灵敏度还不够高,为了提高检测灵敏度,需要在对样品核酸进行荧光标记时,对目的基因进行扩增。生物样品成分复杂,往往含有较多的抑制物,在对样品进行扩增、荧光标记之前,必须先提取、纯化样品核酸。目前普遍采用
生物芯片入门（三）：基因表达谱芯片实验操作1
待检测样品制备生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体，除少数特殊样品外，一般不能直接与芯片反应，必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度，但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰，杂合癌基因的检
基因测序为何代替不了基因芯片以及PCR？
新一代基因测序技术在最近五年飞速发展，这吸引了不少人的目光，做为精准医疗的基础，之前市场上的报告都集中关注于基因测序。于是原本红火的基因芯片技术沉寂了不少。早些 年，有人甚至预言，芯片技术面临消亡。诚然，在某些方面，新一代测序让芯片失色，但就 很多应用而言，芯片仍然是不可取代的。 芯片和高通
芯片筛查耳聋基因又快又准
我国的耳聋基因携带人群非常庞大，这些耳聋基因携带者又大多表现听力正常，但在特定条件下会发病造成听力残疾或者在下一代人身上发病，然而这些都还没有引起全社会的足够重视。 近日，在生物芯片北京国家工程研究中心举行的“遗传性耳聋基因筛查突破百万暨科学与国际合作论坛”上，生物芯片北京国家工程研究中心
生物芯片技术用于基因诊断
从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱，就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片诊断技术以其快速、高效、敏感、经济、平行化、自动化等特点，将成为一项现代化诊断新技术。例如Affymet
基因芯片的的方法特点
基因芯片（又称DNA芯片）是以基因连锁、限制性长度的多态性及连锁不平衡等基因定位方法为基础，以同源DNA分子杂交为基本工作原理而设计的检测方法。
微流控芯片检测基因重排
基因重排主要是指高等动物、低等动物基因从远离启动子的地方且转移到距离启动子比较近的地方，从而促使各类动物基因重新启动转录的调控方式，其结合了传统诱变技术、细胞融合技术、基因突变技术等。研究显示，基因重排利于消化道淋巴瘤和非小细胞肺癌的诊断。国外研究显示，通常高等动物、低等动物T、B恶性淋巴瘤多表现T
日本东丽研发基因解析芯片
据《日本经济新闻》网站报道，东丽株式会社将在2019年内针对只用一滴血就能发现各种癌症的检测方法，向日本厚生劳动省申请制造销售许可。如果被选为优先审查对象，很可能最早在2020年获批。该方法有望尽早发现胰腺癌等癌症。 报道称，如果获批，预计只需几万日元（1万日元约合639元人民币）即可一次性检
基因多态性芯片检测原理？
基因芯片技术是将基因片段有序地固定在玻璃载体上，通过被检测者口腔黏膜脱落细胞DNA抽提，通过合成引物后扩增，用荧光标记的DNA片段上与之杂交、洗脱、结果扫描、软件提取并分析数据的一种快速、高效的分子生物学分析手段。 通过合理的探针设计和杂交条件的严格控制，基因芯片可应用于多种类
生物芯片技术用于基因诊断
从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱，就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片诊断技术以其快速、高效、敏感、经济、平行化、自动化等特点，将成为一项现代化诊断新技术。例如Affymet
基因芯片技术知识概要
生物科学正迅速地演变为一门信息科学。最明显的一个例子就是目前正在进行的HGP（human genome project），最终要搞清人类全部基因组的30亿左右碱基对的序列。除了人的遗传信息以外，还有其它生物尤其是模式生物（model organism）已经或正在被大规模测序，如大肠杆菌、啤酒酵母、秀
Science:－基因芯片正走向临床
“现在差不多有上百例的症状具有可以与特定表型相关联的染色体重组。”牛津基因科技公司(Oxford Gene Techonology，英国牛津)临床和基因组对策中心副总裁James Clough指出，“取决于受测群体，传统显微镜核型检测法诊断率为5~8%，而基因芯片的诊断率则是18~25%
挑选基因芯片的小技巧
上一期给大家聊了聊芯片vs RNA-seq哪个好（点我点我），但很多同学可能会发现，市场上的基因芯片有好多种啊，不知从何入手？今天就来818挑选基因芯片的小技巧。一句话—— 看研究目的。 先给大家科普两个词： 基因表达量：检测基因表达量的芯片一般针对某个基因的的所有转录本设计探针，经
比较基因组杂交芯片介绍
比较基因组杂交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比较基因组杂交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者阵列比较基因组杂交技术（array comparative gen
基因芯片数据的分析方法
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列，这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列，准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异，
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列，这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列，准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异，
基因芯片的应用与展望
一、基因芯片产生背景人类基因组计划(HGP)是人类为了认识自己而进行的一项最伟大和最具影响的研究计划。 人类基因组测序的“工作草图”即将向全球公布，预计在2003年完成全序列分析。此外，还测定了80万个cDNA片断(ESTs)，相当于4-5万个基因，占7-10万个人类总基因的50%左右。目前
挑选基因芯片的小技巧
上一期给大家聊了聊芯片vs RNA-seq哪个好（点我点我），但很多同学可能会发现，市场上的基因芯片有好多种啊，不知从何入手？今天就来818挑选基因芯片的小技巧。一句话—— 看研究目的。先给大家科普两个词：基因表达量：检测基因表达量的芯片一般针对某个基因的的所有转录本设计探针，经过对每个探针信号的算