美国科学家开发出快速精准肿瘤基因组分析软件

美国 Mayo Clinic的研究人员设计了一款可识别肿瘤基因改变的软件——BIMA V3(Binary Indexing Mapping Algorithm,version 3),比其他常用基因测序程序速度快20倍,准确度高25%。 成对测序技术是一种复杂的昂贵的技术,可用来检测整个基因的改变。研究人员比较两种普通的测序校准程序,BIMA在所有的项目测试中胜过 Burrows-Wheeler校准仪和Novoalign,在速度和可靠性检测中,BIMA V3校准了对照组的基因组序列,比竞争者快20倍,准确度高25%。而BIMA允许评价肿瘤基因组,只花费一小部分的时间,且仅需要几种普通的技术。 较早的BIMA版本已促进研究人员开发t细胞淋巴瘤,前列腺癌和子宫内膜癌。最新的版本建立在较早版本上,提高了速度和可靠性。 研究人员相信这个工具将能让人们更好地理解肿瘤基因组,更快地研究更多肿瘤样本,......阅读全文

实体肿瘤检测HRAS基因介绍

HRAS编码的HRAS蛋白为GTP酶,HRas是一种小的G蛋白,属于小GTP酶超家族,当HRas与鸟苷三磷酸结合后,会结合Raf激酶比如c-Raf,再进一步激活MAPK/ERK通路。这个基因的突变与多种癌症相关,包括膀胱癌,滤泡状甲状腺癌,口腔鳞状细胞癌。

实体肿瘤检测AR基因介绍

雄激素受体(AR),也称为NR3C4(核受体亚家族3,C组,成员4),是一种核受体,通过结合任何雄激素激活,包括睾酮和二氢睾酮在细胞质中,然后易位到细胞核。 雄激素受体与孕酮受体的关系最为密切,较高剂量的孕激素可以阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调节基因表达的DNA结合转录因子; 然而,

实体肿瘤检测UMPS基因介绍

这个基因编码尿苷5'-单磷酸合酶。编码的蛋白质是一种双功能酶,对从头嘧啶生物合成途径的最后两个步骤进行催化。第一个反应是由N-末端的酶-磷酸核糖基转移酶进行的,该酶将乳清酸转化为5'-单磷酸盐。末端反应是由C末端酶OMP脱羧酶进行的,该酶能将5'-单磷酸列替丁转化为单磷酸尿苷

实体肿瘤检测SDHB基因介绍

呼吸链的复合物II,特别参与琥珀酸的氧化,携带电子从FADH到COQ。复合物由四个核编码亚单位组成,并定位于线粒体内膜。铁硫亚单位高度保守,包含三个富含半胱氨酸的簇,这些簇可能包含酶的铁硫中心。该基因的零星和家族性突变导致副神经节瘤和嗜铬细胞瘤,并支持线粒体功能障碍和肿瘤发生之间的联系。Comple

牛津基因简化重要肿瘤基因变异的检测流程

  分子遗传学公司Oxford Gene Technology(牛津基因技术公司,简称OGT)已推出其SureSeq myPanel™新一代测序定制肿瘤探针组合库,为科学人员提供与他们研究相关的完全定制的预优化新一代测序探针组合库。这个完整的基因内容库覆盖主要的肿瘤类型,包括髓样白血病、慢性淋巴细胞

研究破译肿瘤“货物”的包装,揭示肿瘤的传播过程

  美国圣母大学的研究人员概述了肿瘤细胞将核酸从表面转移到小囊泡的传递机制,这些信息最终与肿瘤微环境中的其他细胞共享,从而导致癌症扩散。这项发表在《Nature Cell Biology》杂志上的研究展示了microRNA"货物"是如何进入细胞外囊泡的,其过程类似于通过一系列卡车、汽车和邮递员运送包

研究破译肿瘤“货物”的包装,揭示肿瘤的传播过程

  美国圣母大学的研究人员概述了肿瘤细胞将核酸从表面转移到小囊泡的传递机制,这些信息最终与肿瘤微环境中的其他细胞共享,从而导致癌症扩散。这项发表在《Nature Cell Biology》杂志上的研究展示了microRNA"货物"是如何进入细胞外囊泡的,其过程类似于通过一系列卡车、汽车和邮递员运送包

肿瘤干细胞研究取得进展

  恶性肿瘤严重威胁人类健康和生命。越来越多的证据表明,肿瘤细胞具有高度异质性(Heterogeneity)和可塑性(Plasticity)。肿瘤中的一小群具有无限增殖潜能的、能重建肿瘤发生的细胞被称作肿瘤干细胞(Cancer stem cell),又称肿瘤起始细胞(Tumour initiatin

循环肿瘤细胞的临床研究

  药物靶向治疗靶点开发  国外很多大的药厂都投入巨资开发肿瘤新药,在开发的过程中不仅把实体肿瘤作为靶向治疗的一个靶标,同时也认识到可以把CTC作为药物治疗的对象。  指导个体化治疗  个体化治疗指的是针对每一个不同的肿瘤病人,医生开出不同的治疗方案。在临床诊疗过程中,一般都是医生根据临床诊治标准及

抑制肿瘤转移研究获进展

  近日,华东师大生命医学研究所、上海市调控生物学重点实验室、“千人计划”刘明耀教授领衔的课题组发现了一种新型抗肿瘤体内生长和转移的抑制剂。国际肿瘤学期刊《美国国立癌症研究所杂志》日前发表了这一成果。   随着全球肿瘤发病率的显著提高,我国已成为世界上肿瘤发病和死亡的大国。预计到2030年,世界上

耐药肿瘤治疗研究获突破

近日,华东理工大学材料科学与工程学院教授刘润辉课题组在耐药肿瘤研究中取得突破。该团队以β多肽聚合物模拟宿主防御肽,发现其具备高效抗耐药肿瘤功能。相关成果以《异手性β多肽聚合物有效对抗多药耐药肿瘤且不易产生耐药性》为题发表于《美国化学会志》。 展现出体

肿瘤微环境的研究意义

肿瘤与环境,两者既是相互依存,相互促进,又是相互拮抗,相互斗争的。它是现代肿瘤生物学的一个关键和核心的问题。近年来由于肿瘤细胞学和分子生物学的进展,人们对于肿瘤和环境的相互关系有了更加深入的了解。这不仅对于认识肿瘤的发生、发展、转移等有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用。除

耐药肿瘤治疗研究获突破

近日,华东理工大学材料科学与工程学院教授刘润辉课题组在耐药肿瘤研究中取得突破。该团队以β多肽聚合物模拟宿主防御肽,发现其具备高效抗耐药肿瘤功能。相关成果以《异手性β多肽聚合物有效对抗多药耐药肿瘤且不易产生耐药性》为题发表于《美国化学会志》。 展现出体

肿瘤检测肿瘤基因P53抗体(P53AB)介绍

肿瘤基因P53抗体(P53-AB)介绍:  P53基因是研究得比较广泛深入的一个基因。P53抗体可用于各种肿瘤的早期诊断和肿瘤的筛选试验。肿瘤基因P53抗体(P53-AB)正常值:  肿瘤基因P53抗体阴性。肿瘤基因P53抗体(P53-AB)临床意义:  在肿瘤血清中P53抗体呈阳性的患者中,其抗体

Brain:肿瘤抑制基因Merlin的缺失导致肿瘤异常生长的机制

  近日,普利茅斯大学Peninsula Schools of Medicine and Dentistry研究人员领导的一项研究首次发现一个特定肿瘤抑制蛋白的缺失是如何导致大脑和神经系统肿瘤异常生长的机制。   这项研究发表在Brain杂志上,肿瘤抑制基因存在于我们的身体细胞中,防止细胞分裂

《癌细胞》:美研究发现脑癌与肿瘤抑制基因p53缺陷有关

  据《每日科学》网站6月6日报道称,美国密歇根大学的一个研究小组发现,脑癌与大脑神经干细胞中的肿瘤抑制基因p53缺陷有关。此项发现将有助于找到更好的预防和治疗脑癌的方法。该研究成果刊发在6月2日出版的《癌细胞》杂志上。   研究文章称,研究人员首次发现,恶性胶质瘤可能源于位于在脑下室区(SVZ)

肿瘤中基因扩增的分子分析实验

实验材料肿瘤组织试剂、试剂盒NaCl 溶液乙醇TE 缓冲液小牛胸腺 DNA 标准品毛细试验溶液1 X TNE 缓冲液亚精胺限制酶和相关的10 X 缓冲液牛血清白蛋白6 X 上样缓冲液HCl20 X 和 60 X SSC绯精子DNA双链 DNA 探针20% SDS仪器、耗材DNA 提取试剂盒7. 5

关于肿瘤基因的基本内容介绍

  肿瘤基因,人体细胞内有原癌基因和抑癌基因,当这两种基因因为一些条件变异后,会产生癌症。肿瘤是癌症的表现形式之一。基因疗法定点清除癌细胞从本质上来讲,癌症是一种基因病,其发生、发展与复发均与基因的变异、缺失、畸形相关。  要依赖显微学方法,一般先通过染色体中断、缺失或异质性缺失等手段确定异常基因的

实体肿瘤检测JAK-1基因介绍

JAK1是人类酪氨酸激酶蛋白,对于某些I型和II型细胞因子的信号传导是必需的。它与I型细胞因子受体的共同γ链(γc)相互作用,从IL-2受体家族(如IL-2R,IL-7R,IL-9R和IL-15R),IL-4受体中引发信号。家族(如IL-4R和IL-13R),gp130受体家族(如IL-6R,IL-

实体肿瘤检测HOXB-13基因介绍

该基因编码属于同源盒基因家族的转录因子。该家族的基因在脊椎动物中高度保守,对脊椎动物胚胎发育至关重要。该基因与胎儿皮肤发育和皮肤再生有关。在小鼠体内,一个类似的基因在胚胎的主轴上表现出时间和空间的共线性,但没有在第二轴上表达,这表明了在沿着主轴的身体模式中的功能。这个基因和其他hoxb基因在染色体1

肿瘤坏死因子的基因特点

人类TNF-α基因于1985年成功克隆,定位于6p21.4,长约3.6 kbp,有4个外显子和3个内含子,与主要组织相容性复合体(MHC)基因紧密连锁位于HLA-B 和 HLA-C2 位点之间的 MHC3 类基因区内,由TNFA和TNFB组成,分别编码TNFα和TNFβ。位于启动子区238位和308

转基因动物的肿瘤学应用

肿瘤基因的发现是近10年来肿瘤学研究的重大突破,现已发现乳腺癌基因等100多个肿瘤基因。实验证明,各种脊椎动物都携带肿瘤基因,在通常情况下并不引起细胞癌变,只有在某些条件下才能被激活使癌细胞增生而导致癌变。建立带有肿瘤基因的转基因动物可了解哪些组织对肿瘤基因转化活性敏感、肿瘤形成与其基因的关系、肿瘤

基因组测序助力肿瘤精密治疗

  最近,约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家,在对101例胰腺癌患者的血液和肿瘤进行基因组测序后发现,至少三分之一患者的肿瘤有基因突变,这些突变有朝一日可能帮助指导疾病的精密治疗。他们说,与标准的影像学检查方法相比,血液检测的结果,可以早半年预测到癌症的复发。  约翰斯霍普金斯大学医学院肿

重磅!消灭肿瘤细胞!新型基因疗法问世!

   目前随着基因测序技术以及CRISPR-Cas9等基因编辑技术的发展,越来越多的遗传疾病的治疗不再是“天方夜谭”。虽然各项技术的发展给与遗传病的临床治疗莫大帮助,但MIT的研究人员并不止步于基于DNA编辑技术的基因疗法。目前,来自MIT Tasuku Kitada教授的研究团队开发出一种基于RN

实体肿瘤检测ERCC-1基因介绍

该基因的产物在核苷酸切除修复途径中起作用,是修复紫外光诱导或顺铂等亲电化合物形成的DNA损伤所必需的。编码蛋白与xpf内切酶(也称为ercc4)形成异二聚体,异二聚内切酶催化DNA损伤切除过程中的5'切口。异二聚内切酶也参与重组DNA修复和链间交联修复。该基因突变导致脑-眼骨骼综合征,改变该

肿瘤靶向治疗基因检测纳入医保范围

  将基因检测作为基本医疗保险诊疗项目纳入医保,让更多患者从中受益,并可以接受更标准的治疗。  1月23日,沈阳市人大代表、辽宁省肿瘤医院肿瘤内科主任李晓玲对肿瘤治疗中的基因检测费用提出了建议。  临床实践证明基因检测  是靶向药治疗的基础和前提  “靶向药物的使用要以基因检测为基础,需明确患者的基

互联网+肿瘤基因检测迎来“风口”

  用户线上下单,样品采集盒通过快递送到指定地址,经过实验室检测后的报告发送到用户手机终端,这种“肿瘤基因检测+互联网”的模式近期受到资本青睐。日前在杭州举办的“共享互联网+早癌筛查新格局”高峰论坛上,诺辉健康推出“肿瘤基因检测+互联网”新品“常卫明”,并透露公司B轮融资在明年完成。  据悉,目前基

惊喜!Cell:沉默“垃圾”基因,阻止肿瘤生长

  12月14日,《Cell》期刊最新发表一篇题为“Oncogenic Role of THOR, a Conserved Cancer/Testis Long Non-coding RNA”的文章揭示了一个长非编码RNA——THOR,虽然不编码蛋白质,但是却对癌细胞有“直接影响”。科学家们最新发现

遗传病与肿瘤的基因诊断

从DNA水平上寻找确诊遗传病的指标或探讨遗传病和肿瘤的病因等方面,已取得很大成绩,对产前诊断,早期确诊和突变基因携带者的检出等都有重要意义。所用的方法大体有以下几种。 一、分离基因进行结构分析 利用DNA离体转化,制备探针,制备基因文库进行筛检,最后鉴定载体中插入DNA片段的特性等一系

遗传病与肿瘤的基因诊断

从DNA水平上寻找确诊遗传病的指标或探讨遗传病和肿瘤的病因等方面,已取得很大成绩,这对产前诊断,早期确诊和突变基因携带者的检出等都有重要意义。所用的方法大体有以下几种。  一、分离基因进行结构分析  利用DNA离体转化,制备探针,制备基因文库进行筛检,最后鉴定载体中插入DNA片段的特性等一系列技术,