ClinChem：科学家揭示阑尾癌基因突变蓝图
使用新一代DNA测序技术，Dartmouth科学家已经确定了阑尾癌潜在关键突变。他们的研究“Molecular Profiling of Appendiceal Epithelial Tumors Using Massively Parallel Sequencing to Identify Somatic Mutations”发表在Clinical Chemistry杂志上。当癌症类型特定突变被确定，患者可以选用化疗或其他靶向这些突变的药物进行处理。 两种类型阑尾肿瘤--低度恶性阑尾黏液性肿瘤(LAMN)和腺癌的分子生物学鲜为人知，但低度恶性阑尾黏液性肿瘤(LAMN)和腺癌都可以导致腹膜假性黏液瘤（PMP），其中癌细胞沿着腹部壁失控生长。 Dartmouth病理学家研究38 例LAMN和腺癌（其中有些已经发展到PMP）标本，以寻找可能负责异常细胞生长共同的遗传错误。使用AmpiSeq Hotspot Cancer Pa......阅读全文
乳腺癌相关的－－TUBB3基因突变类型及临床解释
该基因编码β-微管蛋白家族的一个III类成员。β微管蛋白是两个核心蛋白家族（α和β微管蛋白）之一，它们异二聚体化并聚集形成微管。这种蛋白主要在神经元中表达，可能参与神经发生和轴突的引导和维持。该基因突变是导致3型眼外肌先天性纤维化的原因。交替剪接导致多个转录变体。该基因的一个假基因在6号染色体上被发
乳腺癌相关的AKT1基因突变类型及临床解释
AKT1基因编码的是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可通过磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）依赖的机制被胞外信号激活，目前发现AKT家族有三个成员，分别为AKT1/PKBα、AKT2/PKBβ和AKT3/PKBγ。，AKT则是PI3K/AKT信号通路中核心因子，PI3Ks能特异性磷酸化磷脂酰肌醇（PI）的3位羟基
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享3
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享专家点评EGFR基因突变是非小细胞肺癌（NSCLC）中最常见的突变，欧美人群EGFR突变率约占10%-15%，亚裔人群突变率高达40%-50% [1]。EGFR 19外显子缺失和21外显子L858R点突变统称为经典突变[2]，随着分子生物学和二代测序技
乳腺癌相关的FCGR2B基因突变类型及临床解释
该基因编码的蛋白是免疫球蛋白γ复合物Fc区的低亲和力受体。编码蛋白参与免疫复合物的吞噬作用和B细胞产生抗体的调节。这种基因的变异可能增加对系统性红斑狼疮（SLE）的敏感性。一些转录变体编码不同的亚型已被发现的这个基因。
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释PHSPB1基因
这种基因编码的蛋白质是由环境压力和发育变化引起的。编码蛋白参与应激抵抗和肌动蛋白组织，并在应激诱导下从细胞质转运到细胞核。该基因的缺陷是导致2型Charcot-Marie牙病（CMT2F）和远端遗传性运动神经病（DHMN）的原因。
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释RRM1基因
这个基因编码核糖核苷酸还原酶的大的催化亚单位，这是一种将核糖核苷酸转化为脱氧核糖核苷酸所必需的酶。在细胞周期的S阶段以及多个DNA修复过程中，可用的脱氧核糖核苷酸池对DNA复制很重要。选择性剪接导致多个转录变体。
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释NOTCH3基因
该基因编码第三个被发现的果蝇黑腹型膜蛋白缺口的人类同源物。在果蝇中，notch与细胞结合配体（delta，serate）的相互作用建立了一个细胞间信号通路，在神经发育中起着关键作用。Notch配体的同系物也已在人类中鉴定出来，但这些配体与人类Notch同系物之间的精确相互作用仍有待确定。Notch3
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释RRM2基因
这个基因编码核糖核苷酸还原酶的两个不相同亚单位之一。这种还原酶催化核糖核苷酸形成脱氧核糖核苷酸。编码蛋白（m2）的合成以细胞周期依赖性方式调节。该基因的转录可以从替代启动子启动，这导致两种亚型的长度不同的N末端。在1号染色体和X号染色体上发现了相关的假基因。
乳腺癌相关的－PIK3R1因突变类型及临床解释
磷脂酰肌醇3-激酶在3-主要位置磷酸化磷脂酰肌醇的肌醇环。所述酶包括110 kD催化亚单位和85、55或50 kD调节亚单位。该基因编码85kD调节亚单位。磷脂酰肌醇3激酶在胰岛素的代谢作用中起着重要作用，该基因的突变与胰岛素抵抗有关。这种基因的选择性剪接导致四个转录变体编码不同的亚型。
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释PALB2基因
这个基因编码一种可能抑制肿瘤的蛋白质。这种蛋白与乳腺癌2早发蛋白（BRCA2）在核病灶结合并与之共定位，可能允许BRCA2稳定的核内定位和积累。
Nature，Nature－Genetics公布乳腺癌研究重大成果：72种新突变
10月23日Nature及Nature Genetics两份期刊同期发表了两项成果，报道了与乳腺癌患病风险增加或减少有关的一系列常见遗传变异。其中Nature论文分析了超过10万例乳腺癌患者的基因型，以及相同数量的基因组中非癌调控遗传位点，从中发现了65个与乳腺癌风险相关的新遗传区域；Natur
乳腺癌相关的－RAD51D基因突变类型及临床解释
这个基因编码的蛋白质是RAD51蛋白家族的一员。Rad51家族成员与细菌Reca和酿酒酵母Rad51非常相似，已知它们参与同源重组和DNA修复。这种蛋白与RAD51家族的其他几个成员形成复合物，包括RAD51L1、RAD51L2和XRCC2。与该蛋白形成的蛋白复合物已被证明催化单链和双链DNA之间的
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释IGF2基因
该基因编码多肽生长因子胰岛素家族的一个成员，参与发育和生长。它是一个印记基因，仅从父系等位基因表达，该位点的表观遗传变化与Wilms肿瘤、Beckwith-Wiedemann综合征、横纹肌肉瘤和Silver-Russell综合征有关。存在一个通读的INS-IGF2基因，其5'区与INS基因重
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释ERBB2基因
ERBB2编码的蛋白属于表皮生长因子受体家族，该家族包括HER1（erbB1，EGFR）、HER2（erbB2，NEU）、HER3（erbB3）及HER4（erbB4），也属于受体酪氨酸激酶家族。ERBB2没有与配体结合的结构域，但可以与家族成员形成异源二聚体来结合配体如表皮生长因子（EGF），从而
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释CDKN2A基因
CDKN2A基因通过可变剪切可产生不同的转录本，至少编码3个不同的蛋白，其中的两个蛋白分别为p16(INK4)与p14(ARF)，p16为细胞周期蛋白依赖的激酶抑制剂，p14可与MDM2结合防止p53被泛素化降解，这两种蛋白通过共同调节CDK4和p53，从而控制细胞从G1期转到S期，基因突变或缺失与
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释RB1基因
RB1基因编码的蛋白是细胞周期的负调控因子，是第一个发现的抑癌基因，因为该基因与视网膜母细胞瘤的发生相关，因此被命名为视网膜母细胞瘤基因（Retinoblastomal,RB1）。RB1具有维持染色质结构稳定的作用，处于去磷酸化形式的RB1可以与转录因子E2F1结合，作为细胞周期的负调控因子，阻止细
乳腺癌相关的－KMT2C基因突变类型及临床解释
该基因是髓系/淋巴系或混合系白血病（MLL）家族的成员，编码核蛋白，具有AT-Hook DNA结合域、DHHC型锌指、六个PhD型锌指、一个集合域、一个后集合域和一个环状锌指。该蛋白是ASC-2/NCOA6复合物（ASCOM）的成员，具有组蛋白甲基化活性，参与转录协同激活。
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释STK11基因
STK11编码的蛋白属于丝氨酸/苏氨酸激酶家族，参与调控细胞极性。STK11是一个抑癌基因，该基因的突变与常染色体现象遗传病黑斑息肉综合征（Peutz-Jeghers syndrome）相关，该病的特征是在皮肤和口腔上长色素斑，胃肠道中长息肉，该类患者的肿瘤发生率是普通人群的10倍-18倍，以消化道
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释SIRT1基因
这个基因编码sirtuin蛋白家族的一个成员，与酵母sir2蛋白同源。sirtuin家族成员以sirtuin核心域为特征，分为四类。人类sirtuin的功能尚未确定；然而，已知酵母sirtuin蛋白可调节表观遗传基因沉默和抑制RDNA的重组。研究表明，人sirtuins可能作为具有单ADP核糖转移酶
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释HIF1A基因
该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1（hif-1）的α亚单位，是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录，包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因，作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此，HIF-1在胚胎血管
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释NTRK1基因
原肌球蛋白受体激酶A（TrkA），也称为高亲和力神经生长因子受体，神经营养性酪氨酸激酶受体1型或TRK1转化酪氨酸激酶蛋白，是人类中由NTRK1基因编码的蛋白质。 该基因编码神经营养性酪氨酸激酶受体（NTKR）家族的成员。 该激酶是膜结合受体，其在神经营养蛋白结合后磷酸化自身（自身磷酸化）和MAPK
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释ETV1基因
这个基因编码一个转录因子家族成员。ets蛋白调节许多靶基因，这些靶基因调节细胞生长、血管生成、迁移、增殖和分化等生物学过程。所有的ets蛋白都含有一个ets-dna结合域，该域结合到含有共识5’-cgga[at]-3’的dna序列。该基因编码的蛋白质除了在C末端区域的ets-dna结合域外，在N末端
乳腺癌相关的CDKN1B基因突变类型及临床解释
该基因编码一种细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂，与CDK抑制剂CDKN1A/P21具有有限的相似性。编码蛋白结合并阻止细胞周期蛋白E-CDK2或细胞周期蛋白D-CDK4复合物的激活，从而控制细胞周期在G1的进展。这种蛋白的降解是由其依赖于CDK的磷酸化和随后由scf复合物泛素化引起的，是细胞从静止状态向增
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释SMAD4基因
SMAD4基因编码的蛋白属于SMAD家族，可以被跨膜丝氨酸/苏氨酸受体激酶激活，如转化生长因子TGF-β受体，因此作为TGF-β信号的重要胞浆内信号级联分子，SMAD4可以自身形成同源复合物或与激活型其他的SMAD家族成员形成异源复合物，转移位到细胞核内，与其他转录因子协同作用，调节TGF-β应答基
乳腺癌相关的PIK3CA基因突变类型及临床解释
PIK3CA基因编码的蛋白是PI3Ks的催化亚单位，PI3Ks是一种脂激酶家族，能特异性磷酸化磷脂酰肌醇的3位羟基，产生第二信使肌醇类物质。PI3Ks家族分I型、II型和III型，其中IA型又分为IA和IB两个亚型，PIK3CA则是IA型的催化亚单位。PIK3CA基因的突变可以导致PI3Ks的催化活
Nature：RAS突变激活胰腺癌细胞的巨胞饮作用，可避免挨饿
在一项新的研究中，来自美国纽约大学医学院的研究人员揭示了一种通过劫持从周围环境吸收营养物的过程来帮助胰腺癌细胞避免挨饿的机制。他们解释了RAS基因发生的突变不仅促进在90%的胰腺癌患者中观察到的异常生长，而且还加快为这种生长提供所需的氨基酸和代谢物的过程。相关研究结果近期发表在Nature期刊上
乳腺癌相关的CYP2D6基因突变类型及临床解释
这个基因编码细胞色素P450超家族的一个成员。细胞色素P450蛋白是单加氧酶，催化药物代谢和胆固醇、类固醇和其他脂质合成的许多反应。这种蛋白定位于内质网，已知能代谢多达25%的常用药物。其底物包括抗抑郁药、抗精神病药、止痛药和镇咳药、β-肾上腺素能阻滞剂、抗焦虑药和止吐药。该基因在人群中具有高度多态
乳腺癌相关的SF3B1基因突变类型及临床解释
该基因编码剪接因子3b蛋白复合物的亚单位1。剪接因子3b与剪接因子3a和12s RNA单元一起形成u2小核核糖核蛋白复合物（u2 snrnp）。剪接因子3b/3a复合物以序列独立的方式结合内含子分支位点上游的pre-mRNA，并可能将u2 snrnp锚定到pre-mRNA。剪接因子3b也是小U12型
科学家鉴别出诱发遗传性胰腺癌风险的基因突变
近日，一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自美国Dana-Farber癌症研究所等机构的研究人员通过对一组极易患癌的家庭进行研究的过程中鉴别出了一种罕见的遗传性基因突变，其或会明显增加个体在一生中患胰腺癌和其它癌症的风险。识别出这种此前未知的突变或能帮助研究人员对这
与胰腺癌相关的基因突变及临床解释1DH1基因
IDH1基因所编码的蛋白名为异柠檬酸脱氢酶1，人类IDH有三种类型，分别为IDH1、IDH2和IDH3，IDH1定位与细胞质和过氧化物酶体中，IDH2和IDH3定位与线粒体中。该类蛋白酶可以将异柠檬酸氧化为草酰琥珀酸，然后在转化为α-酮戊二酸。最先研究发现IDH1的突变与脑胶质瘤密切相关，之后又发现