ClinChem：科学家揭示阑尾癌基因突变蓝图
使用新一代DNA测序技术，Dartmouth科学家已经确定了阑尾癌潜在关键突变。他们的研究“Molecular Profiling of Appendiceal Epithelial Tumors Using Massively Parallel Sequencing to Identify Somatic Mutations”发表在Clinical Chemistry杂志上。当癌症类型特定突变被确定，患者可以选用化疗或其他靶向这些突变的药物进行处理。 两种类型阑尾肿瘤--低度恶性阑尾黏液性肿瘤(LAMN)和腺癌的分子生物学鲜为人知，但低度恶性阑尾黏液性肿瘤(LAMN)和腺癌都可以导致腹膜假性黏液瘤（PMP），其中癌细胞沿着腹部壁失控生长。 Dartmouth病理学家研究38 例LAMN和腺癌（其中有些已经发展到PMP）标本，以寻找可能负责异常细胞生长共同的遗传错误。使用AmpiSeq Hotspot Cancer Pa......阅读全文
乳腺癌相关的SGK1基因突变类型及临床解释
该基因编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，在细胞应激反应中起重要作用。这种激酶激活某些钾、钠和氯通道，提示参与调节细胞存活、神经元兴奋性和肾钠排泄等过程。这种基因的高水平表达可能导致高血压和糖尿病肾病等疾病。几个选择性剪接的转录变体编码不同的亚型已经注意到这个基因。
乳腺癌相关的CDKN2A基因突变类型及临床解释
CDKN2A基因通过可变剪切可产生不同的转录本，至少编码3个不同的蛋白，其中的两个蛋白分别为p16(INK4)与p14(ARF)，p16为细胞周期蛋白依赖的激酶抑制剂，p14可与MDM2结合防止p53被泛素化降解，这两种蛋白通过共同调节CDK4和p53，从而控制细胞从G1期转到S期，基因突变或缺失与
乳腺癌相关的－CDK2基因突变类型及临床解释
细胞周期蛋白依赖性激酶2，也称为细胞分裂蛋白激酶2，是人类中由CDK2基因编码的酶。 由该基因编码的蛋白质是Ser / Thr蛋白激酶的细胞周期蛋白依赖性激酶家族的成员。该蛋白激酶与酿酒酵母cdc28和粟酒裂殖酵母cdc2的基因产物高度相似，在人类中也称为Cdk1。它是细胞周期蛋白依赖性激酶复合物的
乳腺癌相关的CHEK2基因突变类型及临床解释
在对DNA损伤和复制阻滞作出反应时，通过控制关键的细胞周期调节器，细胞周期进程停止。该基因编码的蛋白质是一种细胞周期检查点调节因子和假定的肿瘤抑制因子。它包含一个叉头相关蛋白相互作用域，在对DNA损伤作出反应时对激活至关重要，并在对复制阻滞和DNA损伤作出反应时迅速磷酸化。当被激活时，编码蛋白被认为
乳腺癌相关的BIRC5基因突变类型及临床解释
该基因是凋亡抑制因子（IAP）基因家族的成员，其编码抑制凋亡细胞死亡的负调节蛋白。IAP家族成员通常包含多个杆状病毒IAP重复序列（BIR）域，但该基因仅编码一个BIR域的蛋白质。编码蛋白也缺乏C端环指结构域。在胎儿发育和大多数肿瘤中基因表达较高，而在成人组织中表达较低。另外，还发现了编码该基因不同
乳腺癌相关的AKT3基因突变类型及临床解释
这个基因编码的蛋白质是AKT的一个成员，也被称为pkb，丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族。Akt激酶是已知的细胞信号调节器，对胰岛素和生长因子作出反应。参与多种生物学过程，包括细胞增殖、分化、凋亡、肿瘤发生以及糖原合成和葡萄糖摄取。这种激酶被血小板衍生生长因子（pdgf）、胰岛素和胰岛素样生长因子1（ig
乳腺癌相关的BRCA2基因突变类型及临床解释
BRCA1和BRCA2基因的遗传突变会增加患乳腺癌或卵巢癌的终生风险。BRCA1和BRCA2都参与了基因组稳定性的维持，特别是双链DNA修复的同源重组途径。BRCA2蛋白含有一个70 a a基序的几个拷贝，称为BRC基序，这些基序介导了与在DNA修复中起作用的RAD51重组酶的结合。BRCA2被认为
乳腺癌相关的－－TUBB3基因突变类型及临床解释
该基因编码β-微管蛋白家族的一个III类成员。β微管蛋白是两个核心蛋白家族（α和β微管蛋白）之一，它们异二聚体化并聚集形成微管。这种蛋白主要在神经元中表达，可能参与神经发生和轴突的引导和维持。该基因突变是导致3型眼外肌先天性纤维化的原因。交替剪接导致多个转录变体。该基因的一个假基因在6号染色体上被发
乳腺癌相关的AKT1基因突变类型及临床解释
AKT1基因编码的是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可通过磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）依赖的机制被胞外信号激活，目前发现AKT家族有三个成员，分别为AKT1/PKBα、AKT2/PKBβ和AKT3/PKBγ。，AKT则是PI3K/AKT信号通路中核心因子，PI3Ks能特异性磷酸化磷脂酰肌醇（PI）的3位羟基
“人胰腺癌6基因突变检测试剂盒”成功备案
近日，由复旦大学附属肿瘤医院教授长虞先濬团队自主研发的“人胰腺癌6基因突变检测试剂盒”正式通过上海市药品监督管理局备案。该试剂盒不仅是国内首批获批的医疗机构自行研制使用的体外诊断试剂，也是全球首款适应证明确指向胰腺癌的医疗机构自研试剂。胰腺癌因其“恶性程度高、进展迅猛、早期症状隐匿”，素有“癌中之王
乳腺癌相关的ERBB2基因突变类型及临床解释
ERBB2编码的蛋白属于表皮生长因子受体家族，该家族包括HER1（erbB1，EGFR）、HER2（erbB2，NEU）、HER3（erbB3）及HER4（erbB4），也属于受体酪氨酸激酶家族。ERBB2没有与配体结合的结构域，但可以与家族成员形成异源二聚体来结合配体如表皮生长因子（EGF），从而
乳腺癌相关的CCND1基因突变类型及临床解释
该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族，其成员在整个细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式，这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物并作为其调节亚单位发挥作用，其活性是
乳腺癌相关的NTRK3基因突变类型及临床解释
该基因编码神经营养性酪氨酸受体激酶（NTRK）家族的一个成员。这种激酶是一种膜结合受体，通过神经营养素结合，磷酸化自身和MAPK途径的成员。通过这种激酶的信号传导导致细胞分化，并可能在感知身体位置的本体感受神经元的发育中起到作用。这种基因的突变与髓母细胞瘤、分泌性乳腺癌和其他癌症有关。一些转录变体编
影响雌激素受体阳性乳腺癌预后的罕见基因突变会
《自然-通讯》本周发表的一项研究The prognostic effects of somatic mutations in ER-positive breast cancer指出，雌激素受体阳性乳腺癌患者体内三种罕见的基因突变会对疾病的预后产生不良影响。 突变复发和新的剪接位点突变。 雌激
乳腺癌相关的TOP2A基因突变类型及临床解释
这个基因编码一种DNA拓扑异构酶，这种酶在转录过程中控制和改变DNA的拓扑状态。这种核酶参与诸如染色体凝聚、染色单体分离以及DNA转录和复制过程中发生的扭转应力的减轻等过程。它催化双链DNA的两条链的瞬间断裂和重新结合，使双链彼此穿过，从而改变DNA的拓扑结构。这种酶有两种形式，可能是基因复制事件的
乳腺癌相关的－FCGR3A基因突变类型及临床解释
该基因编码免疫球蛋白G的Fc部分的受体，参与从循环中去除抗原抗体复合物以及其他抗体依赖性反应。该基因（fcgr3a）与位于1号染色体上的另一个邻近基因（fcgr3b）高度相似。该基因编码的受体在自然杀伤细胞（NK）上表达为一种通过跨膜肽锚定的完整膜糖蛋白，而fcgr3b在多形核中性粒细胞（PMN）上
乳腺癌相关的CCNE1基因突变类型及临床解释
该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族，其成员在细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式，这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK2形成复合物并作为其调节亚单位发挥作用，其活性是细胞周期G1/
乳腺癌相关的CD274基因突变类型及临床解释
程序性死亡配体1（PD-L1）也称为分化簇274（CD274）或B7同源物1（B7-H1）是人类中由CD274基因编码的蛋白质。 程序性死亡配体1（PD-L1）是一种40kDa的1型跨膜蛋白，据推测其在特定事件如妊娠，组织同种异体移植，自身免疫性疾病和其他疾病状态如肝炎中在抑制免疫系统中起主要作用。
乳腺癌相关的NCOA3基因突变类型及临床解释
该基因编码的蛋白是一种与核激素受体相互作用以增强其转录激活功能的核受体辅活化子。编码蛋白具有组蛋白乙酰转移酶活性，并招募p300/cbp相关因子和creb结合蛋白作为多亚单位协同激活复合物的一部分。这种蛋白质最初在细胞质中发现，但在磷酸化后转移到细胞核中。一些转录变体编码不同的亚型已被发现的这个基因
非吸烟肺腺癌人群关键致癌基因突变谱已完善
11月30日，PLoS ONE 在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组与复旦大学肿瘤医院合作的研究成果Spectrum of Oncogenic Driver Mutations in Lung Adenocarcinomas from East Asian Nev
乳腺癌相关的RB1基因突变类型及临床解释
RB1基因编码的蛋白是细胞周期的负调控因子，是第一个发现的抑癌基因，因为该基因与视网膜母细胞瘤的发生相关，因此被命名为视网膜母细胞瘤基因（Retinoblastomal,RB1）。RB1具有维持染色质结构稳定的作用，处于去磷酸化形式的RB1可以与转录因子E2F1结合，作为细胞周期的负调控因子，阻止细
乳腺癌相关的AKT2基因突变类型及临床解释
这个基因是一个假定的癌基因，编码一个属于丝氨酸/苏氨酸激酶亚家族的蛋白质，包含sh2样（SRC同源2样）结构域。该基因在8个卵巢癌细胞系中的2个和15个原发性卵巢肿瘤中的2个被扩增和过度表达。过度表达导致人导管胰腺癌亚群的恶性表型。编码蛋白是一种普通的蛋白激酶，能够对几种已知的蛋白进行磷酸化。
乳腺癌相关的ERBB4基因突变类型及临床解释
ERBB4编码的蛋白属于表皮生长因子受体家族，该家族包括HER1（erbB1，EGFR）、HER2（erbB2，NEU）、HER3（erbB3）及HER4（erbB4），也属于受体酪氨酸激酶家族。ERBB4可被neuregulins等蛋白激活，从而磷酸化下游蛋白，参与细胞的有丝分裂和分化，其突变与多
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享1
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享
乳腺癌相关的－MYD88基因突变类型及临床解释
该基因编码一种在先天性和适应性免疫反应中起核心作用的细胞溶质适配器蛋白。这种蛋白在白细胞介素-1和toll样受体信号通路中起重要的信号转导作用。这些途径调节许多促炎基因的激活。编码蛋白由一个N端死亡结构域和一个C端toll-interleukin1受体结构域组成。这种基因缺陷的患者对化脓性细菌感染的
奥拉帕利明显改善胚系BRCA突变胰腺癌患者生存
胰腺癌是严重威胁人类健康的恶性肿瘤之一，以恶性程度高、治疗效果差为显著特点，号称“癌中之王”，5年总体生存率仅约6%。大部分患者初次就诊时肿瘤已发生远处转移或局部广泛浸润而无法行手术切除，而化疗、靶向治疗等疗法对胰腺癌的作用有限。2019年6月2日，在ASCO会议上一项代号为“POLO”的Ⅲ期临
乳腺癌相关的PTPN12基因突变类型及临床解释
该基因编码的蛋白是蛋白酪氨酸磷酸酶（PTP）家族的成员。PTP是调节多种细胞过程的信号分子，包括细胞生长、分化、有丝分裂周期和致癌转化。这个ptp包含一个c-末端害虫基序，作为一个蛋白质-蛋白质相互作用域，可以调节蛋白质的细胞内半衰期。这种PTP被发现与癌基因c-abl的产物结合并去磷酸化，因此可能
乳腺癌相关的ESR1基因突变类型及临床解释
雌激素受体α（ERα），也称为NR3A1（核受体亚家族3，A组，成员1），是雌激素受体的两种主要类型之一，雌激素受体是由性激素雌激素激活的核受体。 在人类中，ERα由基因ESR1（雌激素受体1）编码。
乳腺癌相关的BRCA1基因突变类型及临床解释
该基因编码一种在维持基因组稳定性中起作用的核磷蛋白，并作为肿瘤抑制因子发挥作用。编码蛋白与其他肿瘤抑制因子、DNA损伤传感器和信号转导子结合形成一个大的多亚单位蛋白复合物，称为BRCA1相关基因组监测复合物（BASC）。该基因产物与RNA聚合酶Ⅱ结合，并通过C端域与组蛋白脱乙酰基酶复合物相互作用。因
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享3
阿法替尼治疗EGFR非经典突变晚期肺腺癌经验分享专家点评EGFR基因突变是非小细胞肺癌（NSCLC）中最常见的突变，欧美人群EGFR突变率约占10%-15%，亚裔人群突变率高达40%-50% [1]。EGFR 19外显子缺失和21外显子L858R点突变统称为经典突变[2]，随着分子生物学和二代测序技