中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征，在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题，随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起，新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势，目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性，从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法，通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计，从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为，该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文
脑糖原分布变化可视化技术问世－研究脑疾病有重要作用
日本理化研究所脑科学综合研究中心平濑肇和大江祐树等领导的联合研究小组，开发出一种脑内糖原分布变化可视化技术，并利用这一技术成功观察到脑内糖原随年龄改变的分布变化。 糖原是由肝脏和肌肉合成并储存能量的一种多糖，在脑中也有储存。科学家最近发现，糖原不仅是脑活动的能源，还参与记忆固定等重要的大脑活动
三维重建数据二次可视化方法获新突破
近日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员卢静带领团队发表了一种基于开源三维可视化软件Drishti的新方法。这种方法打破了不同三维软件之间三维重建结果无法互通和交叉验证的壁垒，实现不同三维可视化软件文件的二次分割与可视化。该成果发表于《皇家学会开放科学》。CT等三维成像技术在生物学和古生物学中
掀开空间转录组学的面纱：可视化观察组织中的基因表达
在一项新的研究中，来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学（spatial transcriptomics）的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的。这种方法能够被用于所有类型的组织中，而且在临床前研究和癌症诊断中是有价值的。相关研究结果发表在
三维重建数据二次可视化方法获新突破
近日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员卢静带领团队发表了一种基于开源三维可视化软件Drishti的新方法。这种方法打破了不同三维软件之间三维重建结果无法互通和交叉验证的壁垒，实现不同三维可视化软件文件的二次分割与可视化。该成果发表于《皇家学会开放科学》。CT等三维成像技术在生物学和古生物学中
硅基介孔纳米棒的构建及其在可视化基因递送的应用
在免疫微环境中，癌细胞通过特殊抗原的表达形式抑制T细胞TCR-pMHC通路的信号转导，导致T细胞休眠或耗竭。激活并增强患者自身免疫系统，实现对癌症的识别和防御成为亟待解决的难题。近期研究表明，双特异性靶向抗体（BsAb）可连接T细胞和靶标癌细胞，进而激活T细胞对癌细胞的识别作用并诱发特异性杀伤。
北大要茂盛课题组研究呼出气气流的可视化获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500087.shtm 在人类社会历经多次大流行疾病冲击的背景之下，对疾病传播的认知得到了显著的提升，特别是经历过新冠疫情以来。经由呼吸道释放的颗粒物及气流中可形成稳定悬浮的气溶胶体系被称为为人体呼出气
科学家利用磁共振成像使心律失常治疗效果可视化
探寻无创确认介入治疗效果的新方法 日本国立循环器官病研究中心于2016年8月5日宣布，他们成功使用磁共振成像（MRI）对心律失常介入治疗的效果进行了视觉观测，并已在多家医疗机构展开临床试验。 该中心心律失常科的宫本康二医生、草野研吾部长等人组成的团队完成了相关研究。具体成果已刊载在科学杂志
“肿瘤演进与诊疗的分子功能可视化研究”2019年项目指南
近日，国家自然科学基金委员会发布了关于发布肿瘤演进与诊疗的分子功能可视化研究重大研究计划2019年度项目指南的通告。关于发布肿瘤演进与诊疗的分子功能可视化研究重大研究计划2019年度项目指南的通告国科金发计〔2019〕40号 国家自然科学基金委员会现发布“肿瘤演进与诊疗的分子功能可视化研究”重
上海巴斯德所建立可视化的埃博拉病毒药物评价动物模型
7月20日，国际学术期刊《病毒学杂志》（Journal of Virology）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所黄忠课题组的研究成果An Ebola virus-like particle-based reporter system enables evaluation of antivir
微生物代谢的原位拉曼可视化定量分析成功实现
记者21日从中科院海洋研究所获悉，该所研究员张鑫课题组和孙超岷课题组共同合作，基于共聚焦显微拉曼技术，通过三维定量成像实现了长期、近实时、非破坏性的微生物监测，对微生物生长和代谢情况进行可视化及定量分析，为未来分析微生物原位生物过程提供了新思路。研究成果近日发表于《微生物学谱》上。记者了解到，张鑫课
通过电子轨道的成像和可视化，测定其特征和对称性
【引言】 如今，重型运输和航空航天的电气化对电池中电极材料的能量密度增加提出了更高的要求。而利用阴离子氧化还原反应则代表了一类可实现此目标的新兴策略。然而，由于与氧化还原反应相关的电子轨道目前尚不能用标准实验进行测量，关于O2−/O−氧氧化还原这一典型范例的有效性以及阴离子容量起源解释的问题仍
微生物代谢的原位拉曼可视化定量分析成功实现
记者21日从中科院海洋研究所获悉，该所研究员张鑫课题组和孙超岷课题组共同合作，基于共聚焦显微拉曼技术，通过三维定量成像实现了长期、近实时、非破坏性的微生物监测，对微生物生长和代谢情况进行可视化及定量分析，为未来分析微生物原位生物过程提供了新思路。研究成果近日发表于《微生物学谱》上。 固体培养基
日本大阪大学最新发明：新技术让骨骼吸收过程可视化
日本大阪大学一个研究小组最新发明一项技术，可实时观察实验鼠骨骼吸收的过程，这将有助于研究与骨骼发育和代谢有关的疾病。 大阪大学日前发布的一份研究报告称，从造血干细胞分化而来的破骨细胞是骨组织成分的一种，能够溶解老化的骨细胞，发挥骨吸收的功能。破骨细胞对于骨骼的发育和修复等具有重要的作用。破骨细
RNASPLIT－技术是揭开Xist－RNA扩展的关键机制的可视化工具
越来越多的研究开始使用活体成像的方式观测生物体内各种反应的全过程，比如细胞去分化以及组织再生等，以期为多种生物学过程增加时间轴上的信息。X染色体失活（X chromosome inactivation，XCI）现象是哺乳动物中XX雌性为了维持X连锁基因表达与XY雄性相等的水平而出现的机制。X染色
若斌生物参展CBIFS：微生物培养中提供可追溯、可视化数据
2023年3月17日，第十五届中国国际食品安全技术论坛（CBIFS 2023）在重庆开幕，来自国内外的100多家知名厂商，在本次论坛上集中展出食品安全分析、微生物和快速检测最新产品与解决方案。第十五届中国国际食品安全技术论坛 本届CBIFS 2023上，分析测试百科网邀请四川若斌生物科技有限责
利用荧光光镊系统对Cas9脱靶效应进行实时可视化评估
CRISPR-Cas9作为一种有效的基因编辑方法，在疾病预防与治疗中具有巨大的潜能，但是在临床转化中必须要考虑到它的脱靶效应。传统的生物学手段如电泳或测序等，虽然也可以用来研究Cas9的靶向性，但是其结果大多数为静态的、平均的。2019年3月发表在Nature Structural and Mo
必备技能！云序生物教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质
再帕尔·阿不力孜最新成果：建立质谱成像可视化新方法
中国医学科学院&北京协和医学院药物研究所“天然药物活性物质与功能”国家重点实验室再帕尔•阿不力孜研究员团队，在《药学学报》英文刊（Acta Pharmaceutica Sinica B）发表了题为“时空分辨代谢组学与同位素示踪方法揭示中枢神经系统药物靶标”的研究论文。 由于大脑结构与功能的复杂
嫦娥二号绕月探测任务三维可视化系统平台研发成功
“‘嫦娥二号’绕月探测任务三维可视化系统平台已经研发成功，这几天进行最后调试，届时大家会通过这一平台看到‘嫦娥二号’绕月的精彩之旅。”9月17日，记者连线正在北京航天飞行控制中心的“嫦娥二号”绕月探测任务三维可视化系统平台总负责人、石家庄铁道大学信息与科学工程学院院长赵正旭教授。 嫦娥二
上海药物所实现光控药物胞浆递送和肿瘤的可视化治疗
细胞毒性T细胞具有特异性杀伤异常细胞的能力，在肿瘤治疗中发挥着重要作用。嵌合抗原受体-T细胞（CAR-T）的发明进一步拓宽了其在肿瘤治疗领域的应用。然而，细胞毒性T细胞在体内的行为难以监测和调控，在实体瘤治疗中由于免疫微环境的存在疗效有限，且需要从患者提取T细胞进行修饰，规模化制备受限。 中国
界面可视化技术揭示水生植物根际异质性氧环境变化特征
长期以来，利用水生植物控制湖泊污染并重建良好水生态环境一直是湖泊领域中的研究热点。水生植物根系生长发育和生理代谢等活动会导致其在根系附近沉积物中形成不同于非根际环境的根际微生态系统，这决定了各种污染物质的迁移、转化和生物的有效性，被认为是湖泊污染的生态修复的核心区域。因此，开展根际微环境特征研究
可视化三维胃类器官－揭示细胞更新质量控制新机制
记者从中国科学技术大学获悉，该校细胞动力学教育部重点实验室与生命科学学院姚雪彪、刘行、臧建业团队与合作者在细胞更新质量控制研究方面取得重要进展，相关研究结果日前在《自然·化学生物学》在线发表。 纺锤体是调控真核细胞更新细胞质量控制的重要无膜细胞器，其动态组装与可塑性调控是物质科学与生命科学的共
合肥研究院在可视化快速传感器件食品安全监测取得进展
近期，中科院合肥研究院固体所能源材料与器件研究部蒋长龙研究员团队在基于上转换材料构建的可视化快速传感器件用于食品安全及人体健康监测研究方面取得系列新进展。相关成果分别发表在国际著名期刊Analytical Chemistry和Sensors and Actuators: B. Chemica
Science子刊：高分辨率可视化观察HIV病毒在体内如何增殖
为了治疗疾病，人们必须了解它是如何产生的。在一项新的研究中，来自德国、英国、法国、西班牙和澳大利亚的研究人员如今利用高分辨成像技术在毫秒分辨率下可视化观察HIV病毒如何在活细胞之间扩散。通过使用超高分辨率STED荧光显微镜，他们首次提供了直接证据表明自艾滋病病原体（即HIV病毒）为它的自身复制构
生物物理所开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空
研究可视化观察增强子和启动子的动态运动控制基因活性
尽管密集地排列在细胞核中，但储存我们遗传信息的染色体总是处于运动状态。这使得染色体的特定区域能够被接触到，从而激活一些基因。在一项新的研究中，来自奥地利科技学院、美国普林斯顿大学和法国巴斯德研究所的研究人员可视化观察这一动态过程，并对DNA的物理特性提出了新的见解。相关研究结果发表在2023年6
智能所利用普通打印机打印出可视化的生物传感器
在国家自然科学基金委的支持下，中科院合肥物质科学研究院智能所张忠平研究员领衔的研究团队利用氧化石墨烯上功能基团的有机胺化反应，制备出具有高荧光量子产率的发光氧化石墨烯。以此为“墨水”，可通过普通打印机在衬底上打印出荧光“开”的生物传感器，这实现了对多种生物分子如生物硫醇、蛋白质、DNA等的可视化
内源性分子靶向的荧光探针用于铁死亡可视化综述论文发表
近日，西安交通大学医学部基础医学院王福教授团队在《配位化学评论》期刊上发表了题为《内源性分子靶向的荧光探针用于铁死亡可视化：目前的进展和未来展望》的综述论文。医学部基础医学院青年教师舒文杰和医学部大三本科生曹正之为该论文的第一作者，其他两位作者闫宇星和蔡壮也均为医学部大三本科生，教授王福为论文的
VR＋化学：化学家用VR可视化药物分子结构－帮助新药研发
药物研发公司C4XD开发了一款VR工具——4Sight，能帮助化学家将复杂分子的结构可视化，用以研发与癌症等疾病相关的新药。 VR结合医学早已不是什么新鲜事。从VR心脏模型、VR医疗平台到模拟手术机器人，VR已经为医学领域带来了众多便利。而最近，科学家们更是利用VR观察分子结构，以
可视化三维胃类器官－揭示细胞更新质量控制新机制
记者从中国科学技术大学获悉，该校细胞动力学教育部重点实验室与生命科学学院姚雪彪、刘行、臧建业团队与合作者在细胞更新质量控制研究方面取得重要进展，相关研究结果日前在《自然·化学生物学》在线发表。 纺锤体是调控真核细胞更新细胞质量控制的重要无膜细胞器，其动态组装与可塑性调控是物质科学与生命科学的共