中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题

中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题,随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起,新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势,目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性,从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法,通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计,从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为,该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文

新“访问”方式让人脑活动可视化

科技日报讯 (记者张梦然)据5月29日最新一期《科学·转化医学》报道,美国加州理工学院研究人员在人类头骨上设计了一种“定制窗口”,可用于将大脑活动数据可视化。这种颅窗使研究人员能在非手术室环境通过超声成像观察人类的大脑活动。该技术为临床医生和神经科学家提供一种侵入性较小方法,以高分辨率研究大脑。为了

新“访问”方式让人脑活动可视化

  据5月29日最新一期《科学·转化医学》报道,美国加州理工学院研究人员在人类头骨上设计了一种“定制窗口”,可用于将大脑活动数据可视化。这种颅窗使研究人员能在非手术室环境通过超声成像观察人类的大脑活动。该技术为临床医生和神经科学家提供一种侵入性较小方法,以高分辨率研究大脑。  为了研究、诊断和治疗脑

光子的量子纠缠实现快速可视化

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507000.shtm

人类中心粒组装实现可视化

沿着纵轴切割并从上方观察的人类中心粒模型。瑞士日内瓦大学科学家将高分辨率显微镜和运动学重建技术相结合,成功实现人类中心粒组装过程可视化。发表在《细胞》杂志上的这项研究,阐明了中心粒组装的复杂性,为研究其他细胞器开辟了新途径。中心粒是细胞内的一种桶状结构,由多个蛋白质组成。这些蛋白质的突变可引起一系列

肉馅“可视化”不如食品“可溯化”

   想包点儿饺子,很多消费者都习惯到超市买现成肉馅儿。不过,也有大爷大妈们不放心,担心买到问题肉。针对这种担心,日前国家食品药品监督管理总局公布了《超市生鲜食品包装和标签标注管理规范(征求意见稿)》,规定超市不得将购进的生鲜肉类预先加工成肉馅等产品形态进行包装销售或直接散装销售。(12月1日《新文

使用凝胶电泳如何可视化DNA

    凝胶电泳是一种允许在其组成分子水平上分析DNA的技术。在这种DNA可视化方法中,将样品放置在琼脂糖凝胶介质上,并在凝胶上施加电场。这会导致DNApian段根据其电化学特性以不同的速率通过凝胶迁移。溴化乙锭对于这种可视化技术,在电泳前将溴化乙锭与琼脂糖粉,EDTA缓冲液和水混合以形成凝胶基质。

合肥研究院发展无酶荧光可视化快速检测有机磷农残策略

  近日,中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所研究员蒋长龙团队基于比率荧光材料构建可视化传感平台,实现快速定量检测环境和食品中的草甘膦。相关研究成果发表在Journal of Hazardous Materials上。  草甘膦凭借其高效、快速等特点成为国际上使用量最大的除草剂,在有机磷农药中

利用荧光光谱仪实现水中铅的现场可视化和半定量化检测

  近期,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所智能微纳器件研究室研究团队在环境危害物可视化分析检测方面取得新进展。该团队设计制备了一种高效的比色荧光纳米探针,将其打印成荧光试纸,并根据试纸的颜色显示可以初步判断水中铅离子的检测情况,实现水中铅离子的现场可视化和半定量化检测。相关成果已发表在An

纤维素基胺荧光比率探针的可视化虾蟹新鲜度检测应用

  中科院张军、王树和张金明课题组利用醋酸纤维素链(CA)上的多羟基基团,将异硫氰酸荧光素(FITC)和原卟啉(PpIX)修饰其上,构筑了对胺宽浓度范围内(5  -2.5×104 ppm)超灵敏、快速且线性响应的材料,成功应用于海鲜实时、可视化新鲜度检测。文章指出:得益于纤维素衍生物良好的溶解性和易

光致电子转移过程的可视化

  理解光致电子转移的机理对于提高太阳能材料和光敏系统的光电转化效率有着重要的意义。近日,西南大学发光与实时分析化学教育部重点实验室的高鹏飞博士、黄承志教授团队在ACS Nano 杂志上发表论文,报道了通过暗场散射成像技术在单个银纳米颗粒上实现了光致电子转移过程可视化,为探索电子转移化学反应机理提供

癌症诊断新思路:“可听化”代替“可视化”

  最近一项研究展示了“数据可听化”是如何改进目前干细胞光谱学分析中的所用到的标准技术。  “数据可听化”  “数据可听化”近年来在众多领域得到广泛应用,例如医学、天体物理和人机交互等。它的原理是依赖听觉感知,运用非语音信号包括声音的频率、音色、音调等来传达信息,大大降低了视觉负荷。  那么如果将其

细菌可视化水龙头-让细菌随时可见

细菌可视化水龙头 让细菌随时可见   你有常洗手的习惯吗?如果在洗手的时候看到那些细菌在活泼的蠕动,会不会让你更认真对待洗手这件事呢?台湾的三名年轻设计师设计了一款概念的水龙头“iWash”,让你在洗手时完全可视化细菌。  iWash看起来和一般感应水龙头没有太大区别,只是造型变成

中国芯航天可视化——强大并华丽着

  航天在研制、运行和发布成果的全过程中,都会产生大数据和要求应用大数据。数据既是航天理论的基础,又是航天实践的基石。航天要对尺度远比地球大无数倍的广阔空间进行探索,其总量更多,要求更高。如果没有及时而精确的大数据支持,哪怕是一个小数点的错误,也会影响全局的成败。因此,航天大数据不仅具有一般大数据的

联合研究开发神经密度可视化技术

  近日,中国科学院自动化研究所分子影像团队联合华科大同济医学院附属同济医院教授王良团队开发了一种前列腺癌神经密度可视化技术,实现了活体评估前列腺癌的神经密度,并可通过纳米颗粒负载神经功能阻断药物,抑制前列腺癌进展。该研究为临床前列腺癌神经的成像和治疗提供了潜在的依据,相关成果已发表在Science

可视化成像揭示艾滋病病毒复制机制

  美国索尔克研究所和罗格斯大学研究人员首次确定了艾滋病病毒(HIV)Pol蛋白的分子结构,这是一种在HIV复制后期或病毒自我传播并扩散到全身过程中起关键作用的蛋白质,确定分子的结构有助于回答长期以来关于蛋白质如何分解自身以推进复制过程的问题。7月6日发表在《科学进展》杂志上的研究论文,揭示了该病毒

蔡林涛:给抗癌药穿上可视化“马甲”

  “做学问就是要坚持下去,任何失败都不低头,在任何领域里坚持做10—20年,必能有所突破。如果中途没有坚持下去,就很难做出让你心动的结果。  近年来,我国癌症发病率和死亡率呈明显上升趋势。然而,传统治疗手段不仅针对性低、而且毒副作用明显,导致药品无效耗费率高。  中国科学院深圳先进技术研究院医药所

首个海洋信息三维可视化平台建成

“数字海洋”信息基础框架通过验收   在“数字海洋”模拟屏前,触摸海洋的任意一点,那里的水温、盐度、流速等信息即可显示。这就是我国第一个集成海洋信息的三维可视化球体平台。   该平台是国家海洋局908专项(近海海洋综合调查与评价专项)“数字海洋”信息基础框架构建项目的成果之一。   记者从12

化石三维重建与可视化课程

  随着CT成像技术的发展,三维重建与可视化在古生物学研究中的应用日渐普及。为了帮助研究生们更熟练地掌握化石CT数据的处理方法,我所于12月4日至10日首次开办了《化石三维重建与可视化》课程。  本课程由卢静研究员主持开设,在为期一周的课程培训中针对化石CT扫描数据的三维重建和可视化为研究生介绍了包

新型可视化工具动态示踪细菌微结构

华东理工大学化学与分子工程学院、费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心教授贺晓鹏,中国医药工业研究总院研究员奕栋,中国科学院外籍院士、得克萨斯大学奥斯汀分校教授Jonathan Sessler合作,发展了一种新型糖靶向的超高分辨可视化工具,实现了对细菌微结构、抗生素处理后结构形变的动态原位超高分辨示踪,为

我国首个海洋信息三维可视化平台建成

本报北京12月14日讯(记者陆琦)在“数字海洋”模拟屏前,触摸海洋的任意一点,那里的水温、盐度、流速等信息即可显示。这就是我国第一个集成海洋信息的三维可视化球体平台。  该平台是国家海洋局908专项(近海海洋综合调查与评价专项)“数字海洋”信息基础框架构建项目的成果之一。  记者从今天召开

科学可视化偏光显微镜下的神秘世界!

Seeing is believing 眼见为实,在科研领域这个短语也一直被科研大佬引用,特别是做显微镜的,尤其近几年非常火的超高分辨率荧光显微镜。化学结晶这个过程大家都知道,但是我想拍的唯美一点,偏光显微镜被广泛用于研究矿石的晶像。这里我用来拍摄晶体结晶的过程。不同的晶体的结晶形态都不一样,在偏振

3D可视化技术:开启全新管理模式

  “3D可视化技术应用于石化行业,可克服传统管理系统的缺点,实现管理的精细化、直观化,为设备改造、维修、应急救援预案及模拟演练系统、三维交互式培训系统提供完整的三维可视化解决方案。”5月23~24日在济南市召开的山东省石油化工设备管理协会经验交流会上,山东大学韩云鹏教授对3D可视化技术在石化行业应

加一味稀土钆-靶向药实现可视化

  5月2日 传统临床药物进入人体,靶向效果如何监测评判?如今,这一难题有望得到解决。记者2日获悉,天津大学科学家借助纳米技术,通过添加稀土材料钆,开发出新型纳米颗粒,有望解决传统药物制剂缺陷,实现了靶向药物可视化引导观测,相关多篇研究成果在纳米技术领域顶级期刊ACS Nano发表。  天津大学生命

加一味稀土钆:靶向药实现可视化

  传统临床药物进入人体,靶向效果如何监测评判?如今,这一难题有望得到解决。记者2日获悉,天津大学科学家借助纳米技术,通过添加稀土材料钆,开发出新型纳米颗粒,有望解决传统药物制剂缺陷,实现了靶向药物可视化引导观测,相关多篇研究成果在纳米技术领域顶级期刊ACS Nano发表。  天津大学生命科学学院常

商丘师范学院实现β淀粉样蛋白可视化测定

  商丘师范学院生物分子识别与传感重点实验室周艳丽博士日前在阿尔茨海默氏症早期诊断方面取得新进展,实现了快速、高效β-淀粉样蛋白检测,相关成果发表于《微尺度》杂志。  阿尔茨海默氏症是老年痴呆症中最常见的类型,并且是一种发病率几乎与年龄成对数关系的进行性神经退化疾病。随着中国人口老龄化加速发展,阿尔

巧用荧光成像,实现肿瘤干细胞的可视化治疗

  众所周知,肿瘤由各种不同类型的细胞构成,目前我们还不清楚光动力检测是否能够识别肿瘤内部的所有细胞。  肿瘤干细胞(Cancer stem cells ,CSCs)是一种极其重要的、具有自我更新能力的肿瘤细胞。它们是影响肿瘤进程和放/化疗抗性的主要细胞类型,也是导致治疗后肿瘤复发的主要原因。评估以

血管可视化装置:针头再不会扎进肉里啦

          无论是体验还是献血,扎针总是令人心惊胆战的一步,如果遇到手生的医护人员,找不到血管,被多扎几次也是常有的事。但若因此而让想让献血的人却步,就有点得不偿失了。幸运的是,澳大利亚红十字会血液服务中心的研究人员开发了一款手持红外装置,能帮助定位血管,减少扎针时的焦虑。  这款血管可视化

研究人员开发神经密度可视化技术

  近日,中国科学院自动化研究所分子影像团队联合华科大同济医学院附属同济医院教授王良团队开发了一种前列腺癌神经密度可视化技术,实现了活体评估前列腺癌的神经密度,并可通过纳米颗粒负载神经功能阻断药物,抑制前列腺癌进展。该研究为临床前列腺癌神经的成像和治疗提供了潜在的依据,相关成果已发表在Science

以色列创新实验实现量子力学现象可视化

  以色列特拉维夫大学科研人员创造性地设计了一种大型机械系统,可通过耦合摆系统的运动实现特殊“拓扑”材料量子力学现象的可视化。相关研究发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  该项研究实现了量子力学的三个现象的可视化,分别为布洛赫振荡、齐纳隧道效应以及拓扑介质中的波演化。研究人员观测到了特殊“

加一味稀土钆-靶向药实现可视化

传统临床药物进入人体,靶向效果如何监测评判?如今,这一难题有望得到解决。记者2日获悉,天津大学科学家借助纳米技术,通过添加稀土材料钆,开发出新型纳米颗粒,有望解决传统药物制剂缺陷,实现了靶向药物可视化引导观测,相关多篇研究成果在纳米技术领域顶级期刊ACS Nano发表。 天津大学生命科