中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题,随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起,新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势,目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性,从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法,通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计,从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为,该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文
如何读懂空间转录组测序数据结果
空间转录组学研究是很多老师非常感兴趣的一种最新组学研究技术。做完空间转录组测序后,能拿到哪些结果,是不是存在买家秀和卖家秀的差距?本期,生物芯片生物信息团队利用已发表数据的实操分析,为大家展示空间转录组测序数据结果。 我们分析了来自10x Genomics 的Visium技术生成的某肿瘤生
“液态门”不是科幻场景,将在化学检测中出现
外星科技利用流动液态的“星际之门”,扭曲了时间和空间的虫洞,实现物质在宇宙中瞬间传送……这是在科幻电影《星际之门》中的场景。日前发表在国际学术期刊《德国应用化学》上的一项研究,可能让“液态门”一步步走向现实应用。 这项最新研究成果来自于厦门大学化学化工学院和物理科学与技术学院双聘教授侯旭团
华东理工序列响应型近红外荧光染料研究获新进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/455012.shtm 近日,华东理工大学化学与分子工程学院、教育部前沿科学中心郭志前教授团队在创制序列响应型近红外染料研究方面取得系列重要进展。相关研究成果以“肿瘤内乏氧依赖下近红外光活化菁染料分子实
国家863计划对“农田生境感知系统关键技术”课题中期检查
2015年7月30日,“十二五”国家863计划现代农业技术领域“作物数字化技术研究”主题项目“农田生境感知系统关键技术”课题中期检查会议在湖北宜昌召开。罗锡文院士为组长的中期检查组专家、项目首席、课题负责人、课题合作单位的主要研究人员以及科技部农村中心有关人员共计20余人参加了此次会议
bplus验证工具链
b-plus的验证工具链(The Validation Toolchain)提供了一个完整的系统包含了一个强大的新可视化框架AVETO.vis,来记录、分析和处理多个传感器输入数据。有了这个软件,b-plus为一个灵活的可视化系统提供了最优的解决方案,在ECU的测试和验证阶段,具有应用程序的可能
一种荧光变色传感器可提高钍检测效率
近日,西安交通大学能源与动力工程学院核科学与技术学院林健教授团队开发了一类荧光颜色可调的镧系金属有机框架(Ln-MOFs)作为钍(Th)Th4+离子的荧光变色传感器。这些传感器基于创新的溶解-重结晶机制,实现了Th4+离子实时可视化检测。同时,团队还设计了一种与材料荧光匹配的便携式红绿蓝(RGB)三
一种荧光变色传感器可提高钍检测效率
近日,西安交通大学能源与动力工程学院核科学与技术学院林健教授团队开发了一类荧光颜色可调的镧系金属有机框架(Ln-MOFs)作为钍(Th)Th4+离子的荧光变色传感器。这些传感器基于创新的溶解-重结晶机制,实现了Th4+离子实时可视化检测。同时,团队还设计了一种与材料荧光匹配的便携式红绿蓝(RGB)三
红外分光测油仪有哪些主要特点?
主要特点 检测项目:工业废水和生活污水中石油类和动植物油类、土壤及污泥中石油类、固定污染源废气中油烟和油雾的测定。 操作简单:7 寸彩色触摸屏,可视化智能引导操作,操作简单。 智能校准:具备开机智能校准功能,标准曲线校准和校正系数校准多种校准方式。 联机操作:可连接Windows电脑操作
热分析仪检测设备的原理
热分析仪检测设备主要是测量热物性值中热渗透率的一种设备,可以进行微小领域(微米等级)、纳米薄膜、Sic(单晶体、多晶体)、AIN等的测量。热分析仪检测设备利用激光对样品进行调制循环加热、通过红外线放射量的变化,将样品内部异常部分的检测或不均匀性的热特性可视化。内载红外宏观光学系照相机,可高倍率观察。
多项技术助力神舟九号与天宫一号对接成功
在神舟九号与天宫一号成功对接后,记者获悉,包括航天测控可视化系统、交会对接微波雷达、高精度加速度计等在内的多项技术成果,保障了神舟九号与天宫一号的对接成功。 在北京飞控大厅前方的巨幅显示屏上,三维动画把飞行器在太空中飞行的姿态实时展现出来。北京飞控中心软件室主任孙军介绍,针对此次任务“载人
科学家开发新型有机室温磷光探针
华东理工大学化学与分子工程学院、费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心教授田禾、马骧团队,研制了一种可激活的红/近红外水溶性有机纯有机室温磷光(RTP)探针,有助于多功能高分辨率磷光成像,可用于体内可视化特定的生物标志物和病理过程。10月29日,相关研究发表于《国家科学评论》。RTP探针可长时间持续发光,
北大韩鸿宾小组实现脑细胞生存微环境可视
由我国科学家发明的一项脑研究ZL新技术,将为目前陷入困境的脑病治疗提供新的思路。日前,这项由北京大学韩鸿宾教授及其团队发明的技术,在动物活体上实现了神经细胞生存的微观内环境三维可视化成像显示与定量分析。在中国科协组织的第76期新观点新学说学术沙龙上,这引起了与会专家的浓厚兴趣。 这项新的脑
如何评估-Immune-Cell-Atlas-基准数据集的数据偏差?
评估 Immune Cell Atlas 基准数据集的数据偏差可以考虑以下几个方面: 1. 样本特征分析 - 检查样本的来源,包括种族、年龄、性别、地理位置等分布情况,判断是否存在不均衡或过度集中的现象。 2. 实验方法和技术一致性 - 了解样本采集、细胞分离、测序平台和实验
北大韩鸿宾小组实现脑细胞生存微环境可视
由我国科学家发明的一项脑研究ZL新技术,将为目前陷入困境的脑病治疗提供新的思路。日前,这项由北京大学韩鸿宾教授及其团队发明的技术,在动物活体上实现了神经细胞生存的微观内环境三维可视化成像显示与定量分析。在中国科协组织的第76期新观点新学说学术沙龙上,这引起了与会专家的浓厚兴趣。 这项
“文物保护传承和创新技术应用研究与示范”通过验收
1月17日,“十二五”国家科技支撑计划“文物保护传承和创新技术应用研究与示范”(2015BAK01B00)在北京通过了由科技部社会发展科技司组织的专家验收。 该项目针对文物遗址及文博展陈两类应用场景中物探设备的开发及干扰排除、多源数据的实时汇集与分析、公众对文化遗产信息资源需求的实时感知以及三
刘榜:肉食品真实性精准鉴别和快速检测关键技术研发
分析测试百科网讯 2020年9月22-23日,“第九届中国食品与农产品安全检测技术与质量控制国际论坛(简称 CFAS 2020)”在江苏南京召开。大会第二日围绕农兽药残留检测、快速检测、重金属及元素检测等食品安全话题展开交流。快速检测技术专题论坛邀请了暨南大学石磊教授、国家饲料质量监督检验中心(
这条4亿岁的古鱼上墙了!
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500932.shtm 中国古动物馆外墙三维可视化展示效果图(拟石科技制作)。受访者供图 志留纪古海洋VR场景灰模示意图(拟石科技制作)。 化石三维重建。 ■本报记者 胡珉琦
全基因组测序各步骤工具
全基因组测序(WGS)是下一代测序技术,用于快速,低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大,解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块,数据处理、检测变异和综合分析,具体如下图所示:由于WGS现在已经非常成熟了,
这条4亿岁的古鱼上墙了!
中国古动物馆外墙三维可视化展示效果图(拟石科技制作)。受访者供图志留纪古海洋VR场景灰模示意图(拟石科技制作)。化石三维重建。■本报记者 胡珉琦中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(以下简称古脊椎所)研究员卢静最喜欢的鱼,是中国古动物馆中的“镇馆之宝”——保持了4亿年前古老面貌的“活化石”拉蒂迈鱼。在
欧阳钢锋:内源性生命活性物质新分析方法研究
分析测试百科网讯 2019年8月31日,在第四届全国样品制备学术报告会上,中山大学化学学院教授欧阳钢锋带来了题为《内源性生命活性物质新分析方法研究》的报告。中山大学化学学院教授 欧阳钢锋 在胆酸类分子检测中,欧阳钢锋介绍了基于主客体作用的固相微萃取(SPME)探针应用于胆酸类物质的富集与检测。
如何读懂空间转录组测序数据结果
空间转录组学研究是很多老师非常感兴趣的一种最新组学研究技术。做完空间转录组测序后,能拿到哪些结果,是不是存在买家秀和卖家秀的差距?本期,生物芯片生物信息团队利用已发表数据的实操分析,为大家展示空间转录组测序数据结果。 我们分析了来自10x Genomics 的Visium技术生成的某肿瘤生
基因组所成功开发整合网络工具iBIG
近日,中科院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,带领其团队成功开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy),该研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Hum
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析
技术优势:● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接● 可视化数据展示,提供paper级结果图表● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍: 人类基因组中仅有约2%的DNA序列最
诺奖团队最新论文:利用CRISPR系统,实现活细胞内单分子RNA成像
要了解单细胞中单个 RNA 分子的多种动态行为,就需要实时以高分辨率对其进行可视化。然而,目前还没有能够以通用的方式实现对未经修饰的内源性 RNA 进行单分子活细胞成像。2025年2月18日,诺贝尔化学奖得主、CRISPR 基因编辑技术先驱 Jennifer Doudna 教授团队在 Nature
环境空气检测与废气检测的检测项目
1、室内空气检测 甲醛、氨、三苯、臭氧、氡、总挥发性有机化合物(TVOC)等 2、环境空气检测 甲醛、颗粒物、臭氧、挥发性有机物VOC等 3、工作场所空气与废气检测 有机物(苯、甲苯、二甲苯、非甲烷总烃、VOC、丙烯腈,正己烷、丙酮、丁酮、苯乙烯、乙酸乙酯、乙酸丁酯等),金属(镉、锰、
“液态门”不是科幻场景,将在化学检测中出现
日前来自于厦门大学化学化工学院和物理科学与技术学院双聘教授侯旭团队,发表在国际学术期刊《德国应用化学》上的一项研究,该研究首次提出了响应性“液态门”的调控机制,通过采用限域空间物理化学界面设计,建立了一种物质检测的新方法。 外星科技利用流动液态的“星际之门”,扭曲了时间和空间的虫洞,实现物质在宇
生物物理所在铁蛋白探针精准靶向肝癌研究中获进展
中国科学院生物物理研究所阎锡蕴课题组在前期利用人铁蛋白特异识别肿瘤标记分子TfR1的特性,将纳米酶精准输送到肿瘤部位,并通过酶催化产生活性氧(ROS)杀伤肿瘤的基础上(Nature Communications 2018),又设计出一种能够特异靶向肝癌,使其可视化并杀死肝癌细胞的新型铁蛋白探针,
百人计划张忠平团队以纳米颗粒实现细胞检测及精准导航
近期,智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果近日发表在国际著名化学期刊ACS Nano(DOI: 10.1021/acsnano.8b00743)上,并已申请了国家发明ZL。肿瘤细胞专属性球形核酸探针用于肿瘤的跨平台检测 癌症是一种高
五元素分析仪的主要特点
1、该系统由电脑控制,可完成绝大多数金属材料中元素的含量测定。系统程序的编制采用目前时尚的可视化编程语言,因此系统的功能强大,界面友好,系统的操作简单快捷。 2、系统在分析过程中,零点和满度自动跟踪,并由电脑进行辅助定标,保证了测量精度。 3、配备了电子天平,实现了分析过程的不定量称样,提高
免疫荧光技术的优点有哪些?
高灵敏度:免疫荧光技术对抗原的检测具有很高的灵敏度,即使在极微量的抗原存在下也能进行检测。 高特异性:由于抗体与抗原的特异性结合,免疫荧光技术可以准确地定位和检测特定的蛋白质或抗原。 可视化:该技术允许直接在细胞或组织中观察靶标抗原,提供了直观的视觉信息,有利于了解抗原的分布和定位。 双重