【Nature子刊】农科院、华大基因联手完成甘蓝测序
中国农业科学院油料作物研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、华大基因等多家研究机构的科学家们近日完成了对甘蓝基因组的测序,并将这种作物的基因组草图发表在五月二十三日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是油料作物研究所的研究员刘胜毅(Shengyi Liu)。 多倍化(Polyploidization)为植物的适应性进化提供了大量的遗传变异。但迄今为止人们还不清楚,这种基因组加倍是如何推动物种分化的。 芸薹属植物(Brassica)是研究多倍体进化的一个理想模型,它属于十字花科,包含了多种重要的农业及园艺作物,例如白菜、甘蓝等等。 研究人员通过Illumina、Roche 454和Sanger测序,完成了甘蓝(Brassica oleracea)的基因组草图,并将其与之前测序的姊妹种——白菜(B. rapa)进行比较。研究显示,甘蓝的基因组加倍区域存在着大量的染色体重排和基因丢失事......阅读全文
北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果
来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
科学家进行基因组测序-成功破译金雕基因组
作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区
高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成
9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。
欧盟强化对我国冷冻草莓、柚子等商品的检查力度
据欧盟公报消息, 6月28日欧盟发布(EU)No 323/2014号委员会实施条例,修订(EC) No 669/2009号法规附录I,提高某些非动物源性饲料和食品的进口官方控制水平,其中涉及我国冷冻草莓、甘蓝等出口商品。 本轮强化检查产品涉及我国的冷冻草莓、甘蓝、柚子、茶叶产品。针对冷冻草莓
“千种动植物基因组计划”一期完成
记者近日从深圳华大基因研究院获悉,由该院发起的“千种动植物基因组计划”一期在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展。 于2010年1月正式启动的“千种动植物基因组计划”(简称“千种”计划)预计在未来两年内将破译千种具有重要经济和科研价值的动植物物种基因
加拿大对新食品全基因组测序数据指导书等征询意见
2017年5月31日,加拿大卫生部在其官方网站上发布消息,加拿大卫生部拟对全基因组测序数据来做新食品上市前评估指导书向公众征求意见。该指导书是加拿大食品检验署和卫生部制定的、根据申请者应该在组织和提交全基因组测序时应考虑的原则和良好操作规则、且作为新食品上市前申请书一部分内容而制定。评议期至20
青海抽检3大类51批次食品-发现熟酸奶、甘蓝等5批次不合格
8月9日,青海省市场监督管理局通报,近期该局组织开展的2019年省局本级食品安全监督抽检任务中,抽检食用农产品、水果制品、乳制品共3大类食品51批次样品,其中5批次产品不合格。 乳制品检出酸度、酵母不符合国家标准规定 不合格样品中,有3批次为乳制品,其中,有2批次检出酵母不符合食品安全国家标
双义基因组定义
中文名称双义基因组英文名称ambisense genome定 义双链DNA病毒中正义链和反义链同时含有可读框,其间被A-U富集区所分隔的一种基因组结构。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
基因组的进化特征
基因组不仅仅是生物体基因的总和,基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
线粒体基因组的简介
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是一个
揭秘基因组“暗物质”
记国家自然科学基金重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制” 在人类遗传信息传递过程中,非编码RNA不参与编码蛋白质,占全部RNA的98%,如同宇宙中神秘的“暗物质”,是生命活动调控的“幕后推手”。 2014年起,中国科学家发起重大研究计划,并于2023年底完成结束评估。 在
Nature:水母基因组之谜
太平洋侧腕水母的基因组中缺少很多常见基因。 栉水母基因序列草图的发表揭示了一种与众不同的神经系统。 栉水母(comb jelly)——或栉水母门动物(ctenophore)——看起来就像微小的迪斯科球,它们利用特殊的纤毛推动自己在海洋中游动,并且用粘性触手来捕获更微小的猎物。圣奥古斯丁佛罗里达大
线粒体基因组的概念
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,这些基因组统称为线粒体基因组。线粒体内的DNA,可参与蛋白质的合成,转录,与复制,具有较高的研究价值。
体内基因组编辑介绍
这应该是最受期待的基因治疗方法,即使用基因编辑技术直接修改体内突变的靶DNA,消除致病基因,恢复身体功能。这种方法的优点是可以治愈这种疾病。例如,在亨特综合征或血友病A患者中,尿酸-2-硫酸酯酶(IDS)或凝血因子-8在体内没有正常表达。如果将IDS或八因子基因插入基因组,它可以终身正常表达;缺点是
线粒体基因组的原理
线粒体基因组能够单独进行复制、转录及合成蛋白质,但这并不意味着线粒体基因组的遗传完全不受核基因的控制。线粒体自身结构和生命活动都需要核基因的参与并受其控制,说明真核细胞内尽管存在两个遗传系统,一个在细胞核内,一个在细胞质内,各自合成一些蛋白质和基因产物,造成了细胞核和细胞质对遗传的相互作用;但是
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
PNAS:甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
Nature公布小麦基因组
利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序,他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表,有望帮助人们增加小麦产量,培育更适应环境变化的品种。 到2050年,世界人口预计会从七十亿增加到九十亿,在可用耕地越来越少的情况下,要满足全球对粮食持续增长的需求,
Nature:基因组的“气味”
问问你身边的十个人,他们是如何寻找自己的伴侣的,也许你会得到十份不同的答案。不过也许他们都错了,一项最新的研究指出,嗅觉系统具有超乎想象的敏感性,能精确鉴别遗传上的相关性,这表明这种能力能为同类识别,伴侣选择,以及其它社会相互联系类型提供必要的信息。 许多方面的动物行为都需要了解
什么是基因组作图?
中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定 义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
基因组大小如何确定?
基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关。然而,在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后,这种相关性已不再存在 ,主要是因为重复DNA的缘故。
线粒体基因组的简介
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是
线粒体基因组的简介
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。除了少数低等真核生物的线粒体基因组是线状DNA分子外(如纤毛原生动物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及绿藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是
叶绿体基因组的概念
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,
什么是基因组进化?
基因组不仅仅是生物体基因的总和,基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
细胞核基因组
每条染色体含1个DNA分子,1个细胞的全部遗传信息(基因)都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体(2n),故所含的DNA是由两个基因组(genome)构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp.人类基因的平均长度为1~1.5kb,所以基因组以足以编码1.5×106蛋白质,但实
转基因组的定义
将一个生物或细胞的整个基因组转移到另一个细胞或物种里的转基因技术,包括,细胞核移植、动物克隆技术和人工合成基因组的合成生物学等领域。