“汤姆索亚”调节蛋白以一种撞了就跑的机制启动基因转录
一个基因组科学家团队发现了一种“撞了就跑”的机制，它可让细胞核中的调节蛋白在涉及启动基因激活的运作时采取一种“汤姆-索亚”的行为。 他们的这一刊载于《美国科学院学报》上的研究所聚焦的蛋白是可组织基因信息从DNA流向信使RNA（mRNA）的转录因子。他们的结果显示了转录因子（TFs）是如何先激活某个基因的mRNA合成，然后再离开现场--其模式被称作“撞了就跑”的转录。 纽约大学的生物学教授Coruzzi是该研究的资深作者；Coruzzi解释说：“与马克？吐温的汤姆？索亚很像，汤姆？索亚先开始给波莉姨妈油漆栅栏，然后说服其他人他们有参与的荣幸，接着他自己离开工作去放松；这一先驱转录因子会与某基因启动子结合来启动转录并接着离开现场，但它会招募其朋友来继续它启动的工作。” 被研究的转录因子对激活需要对氮——它是一种在植物生长中作为限速成分的营养物信号——做出反应的基因是至关重要的。 因此，除了揭示了一种新的“撞了就跑”的转录......阅读全文
研究揭示细菌固有转录终止的结构基础
1月12日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队、美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队与浙江大学冯钰团队合作，在《自然》（Nature）上，发表题为Structural basis for intrinsic transcription ter
Cell新突破：CRISPR技术助力转录调控研究
CRISPRs 技术成为了最近的新宠儿，这种基因组编辑技术更易于操作，也具有更强的扩展性，近期来自加州大学旧金山分校，伯克利分校等处的研究人员发表了题为 “CRISPR-Mediated Modular RNA-Guided Regulation of Transcription in
单细胞转录组重要研究文献汇总（二）
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究，由于植物具有细胞壁的特点，使得植物的单细胞研究相比较难，但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下，中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 转录复合体将DNA转录
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下，中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 转录复合体将DNA转录
烟草转录调控因子WRKY基因家族基因功能分析取得进展
大量研究工作证实，植物WRKY基因家族的主要生物学功能是调控植物抗病反应及其信号转导途径的建立。WRKY转录调控因子在植物的抗病性方面，如抗病毒、抗细菌、抗机械伤害等方面参与了植物对逆境的应答反应，对高盐、干旱、高温、低温等非生物逆境因子的抗性也具有重要作用，这些对于一生保持原地不
Nature－Genetics：基因组其实是这样转录的
在人类基因组中大约储存着两万个基因和数千个调控元件。基因编码蛋白质合成的信息，其他基因组元件负责调节基因活性和执行其他功能。所有这些DNA编码信息都需要被复杂的分子机器读取，并转换为细胞能使用的信息。 人们一般认为，读取基因就和读一个语句差不多。读取机器被多种序列引导到基因的起始位置，然后从左
中国科学家揭示基因转录终止的分子机制
3月28日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室研究员张余课题组成功解析了酵母细胞mRNA转录终止状态的复合物结构，揭示了核酸外切酶介导mRNA转录终止的分子机制，对进一步理解基因转录的工作机制具有重要意义。相关研究发表于《自然》。准确高效的转录终止对于基因的正常表达和
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日，中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码，构建了油菜十万余个基因的转录全景图，使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库，将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报（The Plant Jour
Science：相分离与基因转录间存在怎样的关联？
DNA结合转录因子（TF）是真核基因表达的典型调节因子。针对转录因子的早期研究揭示出它们的结构良好的DNA结合结构域（DNA binding domain, DBD）并鉴定出转录所需的功能上至关重要的激活结构域（activation domain, AD）。后来很明显的是，许多激活结构域包含着固
中国科学家揭示基因转录终止的分子机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519911.shtm3月28日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室研究员张余课题组成功解析了酵母细胞mRNA转录终止状态的复合物结构，揭示了核酸外切酶介导mRNA转录终止的
逆转录PCR(RTPCR)扩增基因特异片段
逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段 一、实验原理RT-PCR是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA，再以cDNA为模板，扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛，可用于检测细胞中基因表达水平，细胞中R
逆转录病毒介导的基因技术的缺陷
①载体的滴度较低；②是辅助病毒与载体病毒重组重新获得包装信号使病人面临感染辅助病毒的危险性；③此载体只能整合至分裂相细胞；④此载体容纳的外源基因量较少，不利于较大的基因的插入。
通过转录组分析鉴定风筝果种子油脂代谢基因
蓖麻油酸的脂肪酸链上含有一个羟基官能团，是一种特殊脂肪酸，具有粘度高、酸度低、耐高温、不易氧化、不易凝固等特点，在500～600℃高温下不变质、不燃烧，零下18℃ 的低温下不凝固等特殊性能。利用蓖麻油生成的化学衍生物已达3000多种，广泛应用于国防、航空、航天、化工医药和机械制造等，是目前能替代
克隆化基因的体外转录和翻译实验
DNA的克隆是指在体外将含有目的基因或其它有意义的DNA片段同能够自我复制的载体DNA连接，然后将其转入宿主细胞或受体生物进行表达或进一步研究的分子操作的过程，因此DNA克隆又称分子克隆，基因操作或重组DNA技术。实验材料DNA试剂、试剂盒TE核苷三磷酸混合液RNA聚合酶缓冲液异丁醇NaOHTCA仪
克隆化基因的体外转录和翻译实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 TE核苷三磷酸混合液RNA聚合酶缓冲液异丁醇NaOHTCA仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1. 亚克隆编码蛋白质的目的DNA片段于质粒载体的SP6或T7启动子的下游。 2. 通过CsCl/溴化乙锭离心或PEG沉淀制备质粒DNA。 3. 用位点在终止密码子的立即下游
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
克隆化基因的体外转录和翻译实验
基本方案 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518620.shtm
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
近日，华南师范大学生命科学学院教授李胜和研究员任充华合作，以美洲大蠊为研究对象对其肢体再生的转录调控机制进行解析，找到了两条（BMP/JAK-STAT-zfh-2-B-H2和Notch-drm/bowl-bab1）在再生过程中分别控制着前期基芽细胞增殖和中后期形态建成的转录级联通路。相关成果以长文（
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达；也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达，还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目：表征人类基因组，选择的模式生物的D
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
黄粉甲触角转录组测序及嗅觉基因鉴定鞘翅目嗅觉基因
最新一期《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》（SCI收录，IF=2.823）杂志报导了安徽农业大学植保学院的研究人员在昆虫转录组测序方面的研究论文，该课题组利用第二代高通量测序技术对黄粉
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥