“汤姆索亚”调节蛋白以一种撞了就跑的机制启动基因转录
一个基因组科学家团队发现了一种“撞了就跑”的机制，它可让细胞核中的调节蛋白在涉及启动基因激活的运作时采取一种“汤姆-索亚”的行为。 他们的这一刊载于《美国科学院学报》上的研究所聚焦的蛋白是可组织基因信息从DNA流向信使RNA（mRNA）的转录因子。他们的结果显示了转录因子（TFs）是如何先激活某个基因的mRNA合成，然后再离开现场--其模式被称作“撞了就跑”的转录。 纽约大学的生物学教授Coruzzi是该研究的资深作者；Coruzzi解释说：“与马克？吐温的汤姆？索亚很像，汤姆？索亚先开始给波莉姨妈油漆栅栏，然后说服其他人他们有参与的荣幸，接着他自己离开工作去放松；这一先驱转录因子会与某基因启动子结合来启动转录并接着离开现场，但它会招募其朋友来继续它启动的工作。” 被研究的转录因子对激活需要对氮——它是一种在植物生长中作为限速成分的营养物信号——做出反应的基因是至关重要的。 因此，除了揭示了一种新的“撞了就跑”的转录......阅读全文
国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”
2013年11月19日，深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome，Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题，助力科研人员开发出新的技术及策略，以更好地应对鱼类
关于逆转录病毒介导的基因技术的介绍
是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分，广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒（MO-MLV）改建的。该病毒为RNA病毒，感染细胞后，其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒，前病毒转录产生正链即为病毒基因
Cell：武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制
近日，来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实，SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用，促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制，深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
两项研究：肝病防护转录因子FOXO3
来自堪萨斯大学的研究者在最新一期American Journal of Pathology杂志上分别发表了两项研究成果，表明转录因子FOXO3能够预防丙型肝炎和酒精引起的肝脏损伤。他们认为，对FOXO3通路的调整，能够为由HCV-酒精引起的肝脏损伤提供一种潜在的治疗方法。 最新一期的A
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计： 在刚刚发布的“十四五”规划中，“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域，近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析，帮助读者了
昆明动物所人类大脑转录组进化研究获进展
人类在进化过程中，脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力，比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰，如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA，进而翻译成不同的蛋白质构体，是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展，转录后
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
天津工生所蓝细菌转录组研究获进展
原绿球藻(Prochlorococcus)是分布在全球热带和亚热带海域的蓝细菌，也是目前发现的海洋中含量最丰富的光合生物。虽然只具有极小的细胞体积(直径约0.6 um)和基因组(可以小到～1.6Mbp)，但原绿球藻细胞数量的庞大以及高效的光合作用，使得其对于全球生物圈初级产物的生产和碳循环具
Nature：新研究发现确保DNA正确转录方向的机制
麻省理工学院的生物学家发现了人体细胞确保其DNA向正确方向进行阅读、阻止“垃圾DNA”拷贝的机制。 人类基因组中大约有15%是蛋白质编码基因，但是近年来科学家发现有相当多的垃圾DNA，或者说基因间DNA可转录为RNA。科学家们一直在试图了解这些RNA的作用。在2008 年，MIT的科学
The－Plant－Cell：茉莉酸信号转录调控机理研究取得进展
作为一种重要的植物激素，茉莉酸不仅调控植物对于机械损伤、昆虫取食和腐生型病原菌侵害的防御反应，还参与调控诸多生长发育过程。basic Helix-Loop-Helix（bHLH）类型转录因子MYC2是茉莉酸信号通路的核心转录因子，其所指导的转录调控过程是整个茉莉酸信号通路的核心事件。目前人们对M
研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制
纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体，在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达，从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中，一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞，在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而，hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚，妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此，对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。 研究思
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞，在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而，hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚，妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此，对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。 研究思
研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制
7月11日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti
中科院PLosONE文章发表转录组研究新成果
来自中科院动物研究所和山西大学生命科学与技术学院的研究人员联合发表了题为“Large-Scale Transcriptome Analysis of Retroelements in the Migratory Locust, Locusta migratoria”的论文，公布了对飞蝗(Lo
研究揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制
在国家自然科学基金等项目资助下，广东省农业科学院果树研究所研究员易干军/毕方铖团队，成功揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制。相关成果近日发表于《高级研究杂志》（Journal of Advanced Research）。MaEIL9-MaZIP5-MaSCL8分子模块调控香蕉后熟模式。研究
研究发现DNA损伤修复与DNA转录的协同作用
最近，来自挪威科学技术大学的Barbara van Loon博士等人在遗传信息修复方面有了新发现，该发现发表在最近的《Nature Communications》杂志上。 Van Loon的研究小组发现，阅读DNA的分子元件和纠正DNA错误的分子元件可以协同工作。（图片来源：NTNU） Va
人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中，血液都是对人类进行分子分析的主要来源，并且是许多治疗策略的目标，这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划（www.proteinatlas.org）是一个开放式数据库，旨在通过整合各种组学技术（包括基于抗体的成像）来绘制所有人类蛋白的图谱。在
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核
转录体分析找到调控神经退化的基因和讯息传递路径
神经元大规模消失是正常神经系统发育中的一个重要过程，然而，神经退化性病变也有相同的特征，例如阿兹海默症，帕金森氏症，亨丁顿氏症和肌萎缩性侧索硬化症等。虽然在不同的神经退化性疾病中，触发这些神经死亡的分子机制是不同的，但这些疾病以及发育性调节神经元死亡所引起的下游神经细胞凋亡过程是共通的。为了理解
科学家成功解析叶绿体基因转录蛋白质机器构造
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能，吸收二氧化碳，释放氧气，是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中，叶绿体基因要么被废弃，要么逐渐转移到细胞核染色体中，导致多数陆地植物叶绿体基因组只保留了110-130个基因。其中，大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合
Nat－Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结
花生转录组denovo测序揭示果针发育相关的功能基因
近日，由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士，山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
乳腺癌全转录组关联分析发现新的风险基因
美国范德堡大学和澳大利亚昆士兰医学研究所（QIMR Berghofer）领导的研究团队利用全转录组关联分析方法，找到与乳腺癌存在明显关联的48个基因。这项成果于6月18日发表在《Nature Genetics》上。 研究人员利用近12.3万名乳腺癌患者和近10.6万名对照的遗传预测基因表达谱
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关