11月9日《科学》杂志精选
封面文章 寻找宇宙射线源 一个国际研究小组报告说，许多撞击大气层的神秘高能宇宙射线似乎来自被称为活动星系核(Active Galactic Nuclei)的星系中心。几十年来，研究人员一直试图找到这些粒子的发生源，其中有些在进入大气层时具有极高的能量。活动星系核是巨型黑洞所在星系的紧密中心，可能向星际空间喷射大量的等离子体流，理论曾预测它们是可能的宇宙射线源。这个来自阿根廷皮埃尔·奥格(Pierre Auger)天文台的新结果是基于探测到的大约80个高能宇宙线事件的。该研究组报告，他们探测到的能量最高的宇宙线通常来自附近活动星系核较多的天空区域。这些宇宙线也许被环绕黑洞的磁场加速，这能帮助解释它们极高的能量。 肥胖症基因与DNA修饰有关 本期一篇报告指出，一个最近确定出来的增加个体肥胖症易患性的基因，出乎意料地编码一个涉及DNA修饰的酶。这一发现为研究肥胖症的分子机理提供了新的方向......阅读全文
与DNA白修饰相关因子介绍EWSR1
该基因编码一种多功能蛋白，参与多种细胞过程，包括基因表达、细胞信号传导、RNA加工和转运。该蛋白包括一个N末端转录激活域和一个C末端RNA结合域。该基因与编码转录因子的各种基因之间的染色体易位导致参与肿瘤发生的嵌合蛋白的产生。这些嵌合蛋白通常由该蛋白的N末端转录激活域与转录因子蛋白的C末端DNA结合
与DNA白修饰相关因子介绍TAF1
rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid，它与核心启动子结合以正确定位聚合酶，充当组装其余转录复合物的支架，并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白（tbp）和一组进化上保守的蛋白质（tbp相关因子或taf）组成。tafs可能参与基础转录
与DNA白修饰相关因子介绍SMARCD1
该基因编码的蛋白质是SWI / SNF蛋白质家族的成员，其成员具有解旋酶和ATPase活性，被认为可以通过改变那些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。 编码的蛋白质是大型ATP依赖的染色质重塑复合体SNF / SWI的一部分，并且与酵母Swp73蛋白具有序列相似性。 已经发现该基因的两个编码不
与DNA白修饰相关因子介绍MEN1
这个基因编码脑膜，一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明，脑膜定位于细胞核，具有两种功能性核定位信号，并通过JUND抑制转录激活，但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息，但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。This
与DNA白修饰相关因子介绍EP300
该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶，通过染色质重塑调节转录，在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A（缺氧诱导因子1α）的共激活物，因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这
与DNA白修饰相关因子介绍SMARCA4
该基因编码的蛋白是Swi/SNF蛋白家族的一员，与果蝇的布拉马蛋白相似。这个家族的成员有螺旋酶和ATP酶活性，被认为通过改变这些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。编码蛋白是大型ATP依赖染色质重塑复合物snf/swi的一部分，这是染色质抑制的基因转录激活所必需的。此外，该蛋白能结合BRCA1
组蛋白修饰基因通路KMT2C基因
该基因是髓系/淋巴系或混合系白血病（MLL）家族的成员，编码核蛋白，具有AT-Hook DNA结合域、DHHC型锌指、六个PhD型锌指、一个集合域、一个后集合域和一个环状锌指。该蛋白是ASC-2/NCOA6复合物（ASCOM）的成员，具有组蛋白甲基化活性，参与转录协同激活。
组蛋白修饰基因通路KDM5C基因
该基因是smcy同系物家族的成员，编码一个干旱区、一个jmjc区、一个jmjn区和两个phd型锌指蛋白。DNA结合基序表明该蛋白参与转录和染色质重塑的调节。这种基因的突变与X连锁精神发育迟滞有关。选择性剪接导致多个转录变体。
组蛋白修饰基因通路KMT2D基因
这个基因编码的蛋白质是组蛋白甲基转移酶，它甲基化组蛋白H3的Lys-4位置。编码蛋白是一种叫做抗坏血酸的大蛋白复合物的一部分，它被证明是β-珠蛋白和雌激素受体基因的转录调节器。这种基因的突变被证明是导致歌舞伎综合征的原因。
组蛋白研究进展速览！
本文中，小编盘点了多篇研究报告，共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就，与大家一起学习！图片来源：Daniel N. Weinberg et al，doi:10.1038/s41586-019-1534-3 【1】Nature：揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN
大麦基因编辑修饰淀粉研究获进展
近日，四川农业大学小麦研究所郑有良教授团队江千涛教授研究组利用CRIPR/Cas9技术对大麦淀粉合成酶基因SSIIa进行基因编辑，获得了高抗性淀粉大麦新种质，结合酶活、转录组和代谢组学阐明淀粉的特性变化机制，相关成果发表在国际著名学术期刊《碳水化合物聚合物》（Carbohydrate Polymer
关于组蛋白修饰—DNA甲基的基本内容介绍
在引起基因沉默的过程中，沉默信号（DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配）是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白甲基化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白— 2
Cell子刊：DNA酶促氧化修饰新调控作用
哺乳动物基因组DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的动态平衡调节胚胎和成年哺乳动物的神经发生。这种表观遗传修饰不仅控制神经前体细胞的增殖和存活，还会影响新生神经元的轴突生长。近期研究发现5mC在体内可以被TET家族蛋白氧化成5-羟甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而这些氧化修饰在早期胚胎和哺
研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统
DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理 近日，武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统，并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。 细菌磷硫酰化
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
神经干细胞
神经干细胞关于神经干 细胞研究起步较晚，由于分离神经干细胞所需的胎儿 脑组织较难取材，加之胚胎细胞研究的争议尚未平息，神经干细胞的研究仍处于初级阶段。理论上讲，任何一种 中枢神经系统疾病都可归结为神经干细胞功能的紊乱。脑和脊髓由于 血脑屏障的存在使之在干细胞移植到中枢神经系统后不会产生免疫排斥反
基因检测DNA分析
DNA分析主要用于识别单个基因异常引发的遗传性疾病，如亨廷顿病等。DNA分析的细胞来自血液或胎儿细胞。
组蛋白修饰分工调控基因表达水平和基因表达噪音
基因表达过程依赖于转录因子、染色质调控因子和染色质等生物大分子在布朗运动过程中的随机碰撞，因此，即使是基因型和分化类型完全相同的细胞在相同环境下也存在基因表达的差异，被称为基因表达噪音。研究基因表达噪音，对研究干细胞增殖分化、个体发育、病原菌的抗药性以及农作物的稳产有着重要的意义，而其在人类早期
神经干细胞竞争“上岗”－两个基因是“幕后推手”
研究发现，位于金字塔顶端的10%的神经干细胞是“胜者”，它们最终产生了30%—40%的大脑神经元，而位于金字塔底层的10%的神经干细胞只贡献了1%—2%的神经元。 值得一提的是，在发育早期被清除掉的干细胞，没有任何机会产生子代神经元。 1859年，英国生物学家查尔斯·达尔文系统阐述生物进化理
遗传发育所发现一个新的人类肥胖症基因
流行病学调查显示，约1/3的美国人和10-25%的欧洲人患有肥胖症，其发生率在我国呈逐年上升的趋势，已超过10%。2013年美国医学会将肥胖症正式列为一种疾病，其所导致的并发症如心血管疾病、糖尿病等成为危害人类健康的重要杀手。肥胖症的发生一般认为是遗传与环境的相互作用所引起，主要因饮食摄取和运动
与DNA白修饰相关因子介绍C8ORF34
该基因编码与环状AMP依赖性蛋白激酶调节剂有关的蛋白。 在接受化学治疗的患者中，该基因的天然突变与发生严重毒性反应的风险增加有关，例如腹泻和中性粒细胞减少。 [由RefSeq提供，2017年3月]This gene encodes a protein that is related to the c
邓子新团队DNA骨架硫修饰研究获新突破
近日，上海交通大学邓子新院士团队对DNA骨架硫修饰生物学意义的研究又获得两项突破。 聚焦核酸研究的著名国际学术刊物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)以特写文章(Featured article)发表了由该团队由德林副教授主持，博士生徐铁刚和姚芬为共同第一作者的
新研究发现维生素C直接参与DNA修饰
近日，国际权威学术期刊《自然》在线发表了来自中科院上海生物化学与细胞生物学研究所徐国良院士联合复旦大学唐惠儒教授和中科院武汉水生生物研究所黄开耀研究员等多个课题组合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an alga
关于神经干细胞的应用前景分析
神经干细胞的来源、分离、培养及鉴定还有许多工作要做，神经干细胞诱导、分化及迁移机制有待进一步研究。通过细胞培养技术及基因组的研究，如DNA微列阵技术，进一步明确成体神经干细胞的确切位置，可以设计药物特异性地激活这些细胞。进一步认识神经干细胞的本质和控制分化基因，通过调控靶基因，可以从神经干细胞诱
基因编辑技术成功精确修饰人类T细胞
美国加州大学旧金山分校的研究小组利用基因编辑技术CRISPR/Cas9精确修饰了人类T细胞。由于T细胞在人体免疫系统中作用十分重要，这一研究成果将为治疗糖尿病、艾滋病及癌症等提供全新的手段。 CRISPR/Cas9是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。新的方法能
关于组蛋白修饰—基因调控的基本介绍
基因表达是一个受多因素调控的复杂过程.组蛋白是染色体基本结构-核小体中的重要组成部分，其N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化等多种共价修饰作用.组蛋白的修饰可通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性，从而改变染色质的疏松或凝集状态，或通过影响其它转录因子与结构基因启
细菌的限制修饰系统包含哪些基因？
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因：（1）hsd R：编码限制性核酸内切酶（2）hsd M：编码限制性甲基化酶（3）hsd S：编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
基因修饰让玉米无壳且美味
本报讯 科学家表示，今天的玉米之所以长成现在的样子是因为该作物的基因发生了一种小变化。大约在距今9000年前，墨西哥人利用野生墨西哥类蜀黍培育出了玉米，那时的玉米粒被一层坚硬的外壳包裹着，使其不适宜人类食用。数十年来，科学家一直在研究野生苞谷如何生长成现在人们食用的玉米。 现在，一项遗传学领
基因修饰让玉米无壳且美味
科学家表示，今天的玉米之所以长成现在的样子是因为该作物的基因发生了一种小变化。大约在距今9000年前，墨西哥人利用野生墨西哥类蜀黍培育出了玉米，那时的玉米粒被一层坚硬的外壳包裹着，使其不适宜人类食用。数十年来，科学家一直在研究野生苞谷如何生长成现在人们食用的玉米。 现在，一项遗传学领域的新研