华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中，来自丹麦工业大学（DTU）、华大基因、华南理工大学和哥本哈根大学等处的研究人员提出一种方法，基于对一系列宏基因组样品的co-abundant基因进行分级，可让研究人员能够全面发现新的微生物、病毒和共遗传的基因实体，并有助于微生物基因组的组装，而无需参考序列。 研究人员将这种新的原则，命名为co-abundant原理。这一原理的基本假设是，来自相同生物体的不同DNA片段，在一份样品中会以相同的数量发生，这个数量在一系列样品之间会有所变化。 利用这种方法，DTU生物学序列分析中心的研究人员发现了500种以前未......阅读全文
基因测序找出肠道核心微生物群－有助于判断多种疾病
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素、
Nature子刊：猪肠道微生物基因集构建科研成果面世
2月17日，由中国科学院院士黄路生领衔的江西农业大学科研团队在国际顶级学术期刊《Nature Communications 》发表重大科研成果，提供了目前为止国际上规模最为宏大的猪肠道微生物基因集和基于宏基因组组装的基因组。该成果的面世，为猪肠道微生物组相关研究提供了重要的扩展资源。 家猪是
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
喝红酒或能提高肠道微生物多样性－增强肠道健康
近日，一项刊登在国际杂志Gastroenterology上的研究报告中，来自伦敦国王学院的科学家们通过研究发现，与不喝红酒的人群相比，喝红酒的人群机体肠道微生物多样性较高（肠道健康的一个标志），同时其患肥胖风险较低，机体坏胆固醇水平较低。文章中，研究人员对916对英国女性双胞胎进行研究，分析了啤
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
PLoS－ONE：新研究揭示肠道微生物与肠道疾病的关系
近日，德州农工大学兽医学院的一项研究提供了关于狗的肠道细菌如何影响胃肠道健康的新见解，这可能有助于开发针对两种胃肠道疾病的新疗法。 在10月31日发表于《 PLOS ONE》的这项研究中，博士生Amanda Blake测量了狗粪便中细菌代谢产物——粪便乳酸和次级胆汁酸（BA）的水平。 粪便中
口腔微生物与肠道微生物的同源性
3月30日，由生物谷主办的2018(第四届)肠道微生态与健康国际研讨会隆重召开。在分会场四“肠道微生物与其他疾病”中，来自四川大学华西口腔医学院的李雨庆副教授为我们作了题为“口腔微生物与肠道微生物生物同源性”的精彩报告。 李雨庆副教授是四川省微生物学会的理事兼秘书长、口腔生物学教研室主任、口腔
酶制剂对肠道微生物的影响
饲料通过家禽的胃时，被胃内的盐酸和胃蛋白酶杀菌。食糜进入十二指肠后由于pH值的变化以及大量消化酶、胆汁、卵磷脂和溶菌酶的流入，故在十二指肠存活的细菌很少。由于胰酶的高浓度和肠细胞的高效吸收活性，肠道上段的消化效率最高(Uni等，1999).随着食糜通过小肠，分解和吸收作用逐渐下降(Campbell等
婴儿肠道微生物繁荣兴衰史
来自华盛顿大学医学院的研究人员发现细菌不是定植在婴儿肠道内的唯一外来者，病毒也会在那里安家，这些看不见的体内居民对于人类健康具有重要影响。相关研究结果发表在国际学术期刊nature medicine上。 研究人员指出：“我们才刚刚开始理解生活在我们肠道中的不同生命之间的关系，它们并不是互相
肠道细胞利用microRNAs控制微生物组
生物学前沿之一就是谈论操纵我们的肠道微生物组（microbiome）。这听起来像一个大胆的想法，但它看起来像是我们可能一直就在修改我们的微生物组，甚至都没有意识到这一点。一篇新的来自美国哈佛大学医学院的Howard Weiner、Shirong Liu及其研究团队的论文提示着
NSP酶对肠道微生物的影响
Dgnicke等(1999)发现添加木聚糖酶显著降低肠细菌和总的厌氧菌，对革兰氏阳性菌也有相似趋势。这与Vahjen等(1998)报道的一致，小麦日粮中添加木聚糖酶可降低肉仔鸡肠腔内粘附细菌数量。大麦日粮显著增加粪链球菌的数量(Salih等，1991)，大麦日粮对抗生素的反应比其它日粮高(Moran
见微知著－：从肠道微生物看你的健康
人体内含有数十万亿的人类细胞，数百万亿的细菌微生物。微生物是自然形成的细菌，有些是有益的，甚至对身体健康十分必要。总之，所有这些细胞和微生物组成了研究人员所谓的人类微生物组。 现在有一个全民科学项目旨在扩大我们对这种复杂关系的理解。科罗拉多大学学者与30名分布在世界各地研究机构的研究员联手发起
肠道微生物组进展一览
本期为大家带来的是肠道微生物相关领域的研究进展，希望读者朋友们能够喜欢。 1. Nutrition Reviews：饮食对肠道菌群的影响 DOI: 10.1093/nutrit/nuz106 根据乔治华盛顿大学（GW）和美国国家标准研究院（National Institute of Sta
肠道微生物菌群失调引起哪些疾病
肠道菌群失调与多种疾病相关，比较突出的是肠道疾病等。从血管疾病角度来看，肠道菌群与肥胖、糖尿病有关。肠道菌群失衡可能是造成肥胖、糖尿病等多种多种代谢异常的重要原因之一。肠道菌群造成代谢异常的主要原因，是失衡的肠道菌群产生的脂多糖等内毒素进入人体，被免疫细胞识别后产生多种炎症因子，使得机体进入低度炎症
酶制剂对肠道微生物的影响
饲料通过家禽的胃时，被胃内的盐酸和胃蛋白酶杀菌。食糜进入十二指肠后由于pH值的变化以及大量消化酶、胆汁、卵磷脂和溶菌酶的流入，故在十二指肠存活的细菌很少。由于胰酶的高浓度和肠细胞的高效吸收活性，肠道上段的消化效率最高(Uni等，1999).随着食糜通过小肠，分解和吸收作用逐渐下降(Campbell等
用于微生物组研究的人造肠道
微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中，这些微生物群落的集合被称为微生物组。近年来，微生物组研究成为一个热门，去年10月份，Science和Nature两大期刊同时发文，倡议开展浩大的微生物组研究，以理解和利用微生物组——栖息在多种多样生态系统（如人类肠道和海洋）的微生物群落，来改善人类
肠道微生物：心脏病的开关？
“每种动物都有相对应的共生微生物种群，它与该物种的基因一起被称为两套基因组。现在研究让两套基因组如何和谐对话是重点，而这样的研究可能将揭开慢性病真正的原因。” 人类的疾病对于科学家来说，是一个永无止境的研究领域，因为不断有新的研究发现推进人类对自身的认知。 近日，刊登在《细胞》上的一
Nature子刊重要发现：基因和出生地共同塑造肠道微生物组
人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用，许多人类疾病都与微生物组失衡有关。美国能源部西北太平洋国家实验室和劳伦斯伯克利国家实验室的科学家们最近解析了塑造肠道微生物组的背后推手。他们十一月二十八日在Nature
改良肠道微生物群－治疗患儿胃肠道和行为症状
肠道微生物作为人体最庞大、最复杂的微生态系统，不仅关乎了人体的生理功能，许多研究表明某些心理疾病也受肠道微生物的影响，比如困扰当代许多人的自闭症。 近日由Dae-Wook Kang发表的一篇名为《微生物转移治疗对自闭症和肠道微生物的长期疗效》指出自闭症谱系障碍(ASD)患者肠道微生物群与自闭症
转基因细菌清理肠道毒素
一种新型益生素正在路上 图片来源：Studio 52 film 本报讯 一项日前发表于《科学—转化医学》的研究显示，转基因细菌补充剂可通过清除肠道内的毒素治疗肝脏和肠道疾病。 这种方法，即改造细菌使其能将有害氨变成安全的化合物，已在动物测试和健康人类志愿者身上表现出前景。 如今，很多人每天服用
转基因细菌清理肠道毒素
一项日前发表于《科学—转化医学》的研究显示，转基因细菌补充剂可通过清除肠道内的毒素治疗肝脏和肠道疾病。 这种方法，即改造细菌使其能将有害氨变成安全的化合物，已在动物测试和健康人类志愿者身上表现出前景。 如今，很多人每天服用益生菌帮助补充肠道内的有益细菌，尽管目前尚不明确它们真的能带来多少益处
科学家发现人类肠道微生物所产基因毒素对DNA的破坏机制
近日，美国哈佛大学和明尼苏达大学的研究人员针对肠道细菌毒素破坏双链dNA的机制，在Science杂志上发表了题为“The human gut bacterial genotoxin colibactin alkylates DNA”的文章。他们利用化学合成、小鼠实验和基于非靶向质谱测定的组学分析
微塑料改变海鸟肠道微生物群
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497279.shtm
微塑料改变海鸟肠道微生物群
意大利科学家在最新一期《自然·生态与进化》杂志发表的一项研究指出，与摄入较少微塑料的海鸟相比，摄入高水平微塑料的野生海鸟肠道内的微生物总体上更丰富多样，但目前尚不清楚这种多样性的增加对海鸟意味着什么。微塑料是宽度小于5毫米的塑料碎片。本月发表的一项研究指出，海洋上漂浮着大约230万吨微塑料。海鸟寿命
动物肠道微生物作用机制研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502917.shtm
人类肠道微生物改变了小鼠的代谢
据一项新的研究披露，接受来自胖人肠道细菌的无菌小鼠会比给予来自瘦人肠道细菌的小鼠增加更多的体重并积累更多的脂肪。这一发现——它证明了身体与代谢特征可通过肠道中的微生物群落进行传播——由该类啮齿动物的饮食所决定，而有关的研究人员提出，它可能代表了朝着研发个性化、基于益生菌的肥胖症疗法所迈出的重要的
肠道微生物是如何与大脑交流的
肠道微生物是近年来十分热门的一个研究领域。最近的研究表明，它们可以影响人类的健康、行为和某些神经疾病，比如自闭症。但是它们如何与大脑交流呢？来自伊利诺伊大学的一项新研究结果表明，某些肠道细菌和大脑代谢物之间存在着一种沟通途径，这种途径是通过一种名为皮质醇的血液化合物来实现的。出乎意料的是，这一发
肠道微生物会让人爱上运动吗？
意志力可能是把人从沙发上拽起来锻炼的关键，细菌则可能为此“推了一把”。近日发表于《自然》的一项研究表明，肠道中的微生物可能是导致锻炼欲望差异的关键。 美国科研人员集中研究了特定的微生物分子，这些分子能刺激啮齿动物奔跑的欲望。通过准确揭示这些分子与大脑的“对话”方式，该小组为研究类似信号是否有助
雄性小鼠肠道微生物会影响后代健康
据新一期《自然》发表的论文表明，雄性小鼠肠道微生物组的紊乱可能会影响其后代健康。众所周知，导致肠道微生物生态系统失衡的环境因素会塑造宿主的生理和疾病相关反应。但父系肠道微生物组对后代的影响尚不明确。为了评估雄性小鼠肠道微生物群紊乱对后代的影响，欧洲分子生物学实验室的研究团队给雄性小鼠注射了6周抗生素