华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中，来自丹麦工业大学（DTU）、华大基因、华南理工大学和哥本哈根大学等处的研究人员提出一种方法，基于对一系列宏基因组样品的co-abundant基因进行分级，可让研究人员能够全面发现新的微生物、病毒和共遗传的基因实体，并有助于微生物基因组的组装，而无需参考序列。 研究人员将这种新的原则，命名为co-abundant原理。这一原理的基本假设是，来自相同生物体的不同DNA片段，在一份样品中会以相同的数量发生，这个数量在一系列样品之间会有所变化。 利用这种方法，DTU生物学序列分析中心的研究人员发现了500种以前未......阅读全文
Science：炎症会促使肠道微生物进化
欧洲的科学家们发现沙门氏菌感染引起的肠道炎症能激活细菌内的噬菌体，从而帮助帮助感染了细菌的病毒传播给其它菌株，并提高它们的增殖成功率。这些发现不仅揭示了病毒中遗传性状的编码特点，如毒力增强，而且也指出了如果用一种疫苗来减轻炎症，也许能帮助治疗某些感染。 这一研究成果公布在3月16日的Scien
经常暴饮暴食？肠道微生物群在作怪！
暴饮暴食症（OD）患者通常表现出对可口食物的渴望。对暴饮暴食的控制减少通常会导致过度偏好高能量和美味的食物，以及在短时间内过度进食。这可能会严重影响身心健康。饮食和压力是OD发展的两个最重要的因素。在训练过的动物中也发现了类似的由压力和节食史引起的暴饮行为。ODs在当代社会仍然是一个普遍存在的问
新生儿肠道微生物菌群研究
肠道微生物菌群被认为与人类健康息息相关。但是微生物菌群是如何稳定建立的，还没有很好的定量研究。在近期的《Cell Host & Microbe》上，通过宏基因组测序分析，科学家们分析了新生儿和母亲肠道菌群，分析了新生儿出生第一年肠道微生物菌群的建立。他们发现，自然生成的婴儿和剖腹产婴儿的肠道菌群
婴儿交换的不只玩具，还有肠道微生物
1月21日，一项发表于《自然》的研究发现，婴儿肠道中正在发育的微生物群，有很大一部分来自托儿所的同龄伙伴，且这种情况在入托仅一个月后就会出现。 这项研究分析了婴儿入托第一年的肠道菌群变化情况。结果显示，婴儿间的微生物传播量在这一年内持续增长。入托4个月后，托儿所内的婴儿肠道菌群已有15%至20
Nature旗下期刊解析鸡肠道微生物
大量人体肠道宏基因组学的研究表明，很多慢性疾病都与肠道微生物的组成相关。但由于宿主遗传背景、生理条件和外界环境等因素的制约，迄今为止，人类对于自身机体同肠道微生物之间的关系并不十分清楚。 2013年1月30日，Nature出版集团旗下期刊《Scientific Reports》在线发表
肠道微生物与高血压的微妙关系
根据MIT的一项新研究，肠道中的微生物有助于防止高盐饮食带来的负面影响。 MIT团队与德国研究人员合作研究发现，无论是小鼠还是人类，高盐饮食都会使某种有益菌的种群减少。所以，称为Th-17的促炎性免疫细胞的数量会增加。这些免疫细胞与高血压相关，但是目前尚不清楚二者之间相互关联的准确机制。 研
Science：肠道微生物调节肠炎新机制
肠道微生物最调节宿主的免疫系统以及在炎症性肠炎（IBD）等疾病发病过程中发挥了十分重要的作用。由于在同卵双胞胎中该疾病的发病率一致性只有40%-50%，因此遗传-环境因素的相互作用对该疾病的发病具有重要的影响。DNA测序技术的发展使得我们能够详细地了解人体基因组的信息以及肠道微生物的基因组构成，
动物肠道微生物作用机制研究获进展
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人类关键肠道微生物可能来自奶牛
即使是严格的素食主义者也需要微生物的帮助来消化植物。尽管人类口腔、胃和肠道中的酶可以分解糖果和土豆中的简单碳水化合物，但它们不能自行溶解植物细胞壁的关键成分纤维素。相反，人们依靠肠道中的细菌来完成这项工作。纤维素（左）和肠道细菌哈氏真杆菌。近日，一个研究小组在《科学》报道称，数千年前，人类可能首次从
人类肠道微生物改变了小鼠的代谢
据一项新的研究披露，接受来自胖人肠道细菌的无菌小鼠会比给予来自瘦人肠道细菌的小鼠增加更多的体重并积累更多的脂肪。这一发现——它证明了身体与代谢特征可通过肠道中的微生物群落进行传播——由该类啮齿动物的饮食所决定，而有关的研究人员提出，它可能代表了朝着研发个性化、基于益生菌的肥胖症疗法所迈出的重要的
肠道微生物会让人爱上运动吗？
意志力可能是把人从沙发上拽起来锻炼的关键，细菌则可能为此“推了一把”。近日发表于《自然》的一项研究表明，肠道中的微生物可能是导致锻炼欲望差异的关键。 美国科研人员集中研究了特定的微生物分子，这些分子能刺激啮齿动物奔跑的欲望。通过准确揭示这些分子与大脑的“对话”方式，该小组为研究类似信号是否有助
微塑料改变海鸟肠道微生物群
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研究发现肠炎与肠道微生物缺失有关
在美国，约有100万人患有溃疡性结肠炎，这是一种无法治愈且病因不明的严重结肠疾病。近日，斯坦福大学医学院的研究人员进行的一项研究将其与一种肠道微生物的缺失联系在了一起。 文章作者，胃肠病学和肝脏病学副教授Aida Habtezion博士说：“这项研究有助于我们更好地了解这种疾病。 我们希望能够
年终盘点：2018肠道微生物重要研究盘点
在人体肠道内的微生物中，超过99%都是细菌。人体正常的肠道细菌种类有500～1000 种。人肠道中的细菌细胞数达100万亿个，占人体总微生物量的 78 %，然而人体细胞总数也不过10万亿个，这意味着胃肠道内的细菌总数比人体细胞总数还多10倍。 肠道细菌不仅数量庞大，种类也繁多。占主要地位的是厚
肠道微生物究竟有什么可研究的？
人体的肠道内寄居着大量微生物，数量超过10万亿个，而其中99％为细菌，是人体真核细胞数目的10倍以上。这些共生的细菌可以影响人体免疫系统功能，营养的吸收过程，物质的代谢过程等，肠道微生物的组合以及菌群间的互相制约、互相依存使其形成一种生态平衡。在漫长的协同进化过程之中，肠道微生物与宿主之间形成
肠道微生物组与儿童行为问题有关
一项新的研究表明，有行为问题的孩子的肠道微生物组可能有不同的成分，父母在差异的明显程度方面起着重要作用，值得重视。 肠道微生物很重要 肠道微生物组中至少有400种细菌，数万亿种微生物生活在消化道中，这意味着肠道中细菌的数量比体内所有细胞都要多。肠道中的微生物执行重要功能，包括合成维生素、抵御
免疫球蛋白－影响肠道微生物组
IgA（免疫球蛋白A）是最丰富的黏膜抗体，动物模型实验表明它可以强化肠道屏障，防止危险细菌破坏宿主。然而，缺乏特异性IgA的人通常只有轻微的症状。法国巴黎免疫与疾病研究中心珍妮·法德拉等科学家，比较了健康个体与缺乏IgA个体的粪便微生物组，发现在缺乏IgA的不同患者中，不同属的细菌占不同的主导地
微塑料改变海鸟肠道微生物群
意大利科学家在最新一期《自然·生态与进化》杂志发表的一项研究指出，与摄入较少微塑料的海鸟相比，摄入高水平微塑料的野生海鸟肠道内的微生物总体上更丰富多样，但目前尚不清楚这种多样性的增加对海鸟意味着什么。微塑料是宽度小于5毫米的塑料碎片。本月发表的一项研究指出，海洋上漂浮着大约230万吨微塑料。海鸟寿命
母亲基因影响孩子肠道菌群
最近，加州大学（UC）戴维斯分校的研究人员发现一个基因——该基因在一些母亲当中是不活跃的，可产生母乳糖影响其婴儿肠道菌群的发展。产生的这种糖，被称为“secretors”不能被婴儿消化，而是滋养出生后不久婴儿肠道中定植的特定细菌。延伸阅读：基因和饮食哪个对肠道菌群影响更大？ 称为“non-se
哈佛大学开发人体肠道微生物器官芯片技术监测肠道菌群
人体微生物群（microbiome）是我们体内和体表大量微生物的集合，对人类健康和疾病有着深远的影响。尤其是人体肠道菌群，这里蕴藏着最密集的微生物，不仅分解营养物质释放对我们生存至关重要的分子，而且是许多疾病发展的关键因素，包括感染、炎症性肠病、癌症、代谢性疾病、自身免疫性疾病和神经精神病。
研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库
近日，西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构，在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展，研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本，分别构建了包含1.6亿
Science:新研究揭示肠道微生物抗流感机制
美国一项研究表明，一种名为梭状芽孢杆菌的肠道微生物通过代谢黄酮类化合物，能够帮助小鼠抵御重流感。研究人员在4日出版的《科学》杂志上发表论文称，黄酮类化合物在人们日常消费的红茶、红酒和蓝莓等食物中天然存在，多吃这些食物有助抗流感。 流感对老年人、婴幼儿、孕妇以及哮喘等慢性病患者危害极大。美国疾病
－Science：人类肠道微生物群有多稳定
研究人员研发出了一种改进了的、用来分析在我们肠道中和平相处的细菌群落的技术，这使得他们能够对这些细菌群落随着时间的推移而呈现的稳定性有所了解。对于为了长期的健康干预而用这些多样的微生物作为标靶而言，定义人类肠道微生物群落的稳定性是至关重要的。然而，科学家们对有关这些微生物株在我们肠道中是多么难以
应将肠道微生物作为评估鱼类健康的指标
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“肠道芯片”促进对微生物学理解
发表于新一期《APL生物工程》杂志上的研究中，来自美国加利福尼亚大学劳伦斯伯克利国家实验室的研究人员描述了一种新设备——肠道芯片，该设备模型成功地维持了人类肠道细胞和微生物群的共生体长达几天，甚至是几周的时间。 器官芯片是人体器官的微型模型。它们含有微小的通道，细胞和组织培养物与精确控制的营养
揭开肠道微生物诸多秘密的NCS重磅研究
最近几年关于肠道微生物的研究越来越火热，日益深入的研究也逐渐揭开了肠道微生物的诸多秘密，越来越多的研究发现肠道微生物与人类健康密切相关。本文中小编为大家盘点了近期关于肠道微生物与健康相关的NCS重磅研究，分享给大家。 【1】Cell：震惊！肿瘤微生物组竟能决定癌症患者的生死 DOI：10.1
What肠道微生物菌群能够促进器官发育？
肠道是一个复杂的生态系统，也是多种寄生微生物与动物宿主微生物之间相互共生的地点。动物的宿主微生物菌群能够促进动物胃肠道发育的作用已经不容置疑。 然而，动物体内的寄生微生物菌群对消化器官发育所产生的影响仍然难以捉摸。 在本文中，研究人员Hill 等人提出肠道微生物菌群在斑马鱼早期幼鱼发育过程中，
脂肪肝，原来还有肠道微生物在作祟
许多人的体检报告上都提示有脂肪肝。这种肝脏疾病通常与肥胖、酒精和糖尿病相关。不过，根据本周发表在《Nature Medicine》上的一项研究，肠道微生物似乎也促进了疾病发展，表明有望通过粪便微生物移植来治疗。 肝脂肪变性（hepatic steatosis）是指肝细胞的胞浆内出现脂肪滴。通俗
Science：新研究揭示肠道微生物抗流感机制
美国一项研究表明，一种名为梭状芽孢杆菌的肠道微生物通过代谢黄酮类化合物，能够帮助小鼠抵御重流感。研究人员在4日出版的《科学》杂志上发表论文称，黄酮类化合物在人们日常消费的红茶、红酒和蓝莓等食物中天然存在，多吃这些食物有助抗流感。 流感对老年人、婴幼儿、孕妇以及哮喘等慢性病患者危害极大。美国疾病
帕金森氏症或是肠道微生物“惹的祸”
帕金森氏症常常被认为是一种大脑疾病，但美国研究人员在新一期《细胞》杂志上发表的动物研究显示，这种常见的神经退行性疾病可能与肠道里的微生物变化有关。这一发现可能带来全新的帕金森氏症治疗策略。 美国加州理工学院的研究人员先培育出了两组过多生成阿尔法—突触核蛋白的实验鼠，这种蛋白被认为是帕金森氏症