华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中，来自丹麦工业大学（DTU）、华大基因、华南理工大学和哥本哈根大学等处的研究人员提出一种方法，基于对一系列宏基因组样品的co-abundant基因进行分级，可让研究人员能够全面发现新的微生物、病毒和共遗传的基因实体，并有助于微生物基因组的组装，而无需参考序列。 研究人员将这种新的原则，命名为co-abundant原理。这一原理的基本假设是，来自相同生物体的不同DNA片段，在一份样品中会以相同的数量发生，这个数量在一系列样品之间会有所变化。 利用这种方法，DTU生物学序列分析中心的研究人员发现了500种以前未......阅读全文
迄今最详细合成肠道微生物群构建
美国研究人员在最新一期《细胞》杂志上撰文指出，他们构建出了迄今最详细、最完整的合成肠道微生物群——由100多种细菌组成，并将其成功移植到小鼠体内。能够添加、删除和编辑单个细菌，将使科学家更好地理解肠道微生物群与健康之间的联系，并最终开发出一流的微生物组疗法。 此前研究表明，肠道微生物群会影响人的
肠道微生物研究，代谢产物分析不容忽视！
为了更好地了解肠道微生物对人体健康的潜在影响，临床医生需要了解的不仅是粪便样品中存在的细菌，而且还包括那些细菌产生的氨基酸等代谢物，澳大利亚和英国的研究人员指出，这项研究成果本周发表在mSphere杂志上。 微生物学和感染性疾病副教授兼南澳大利亚卫生和医学研究所成员Geraint B. Rog
肠道微生物对免疫系统有什么影响？
隶属于美国若干机构的一组研究人员发现，一种类型的肠道细菌根据其所处环境的状态触发不同种类的免疫反应。在“免疫学杂志”杂志上发表的论文中，他们描述了他们研究肠道生物群落和幽门螺杆菌的情况。 人类有数万种肠道细菌类型，其中大多数是有益的 -它们提供诸如帮助消化某些食物的服务。但是其他类型的细菌会
科学家们实现体外培养肠道微生物
根据最近由来自EMBL研究者们做出的一项研究，肠道微生物能够成功地在实验室条件下进行培养。在发表在最近一期的《Nature Microbiology》杂志上的一篇文章中，作者报道了96%的不同类型肠道微生物的营养偏好。这一结果将有助于我们进一步理解肠道微生物组的特性。 肠道内的细菌对我们的
Nature－med：婴儿肠道微生物繁荣兴衰史
近日，来自华盛顿大学医学院的研究人员发现细菌不是定植在婴儿肠道内的唯一外来者，病毒也会在那里安家，这些看不见的体内居民对于人类健康具有重要影响。相关研究结果发表在国际学术期刊nature medicine上。 研究人员指出："我们才刚刚开始理解生活在我们肠道中的不同生命之间的关系，它们并不是互
长江野生鱼类肠道内微生物多为暂住者
在水生动物中，肠道微生物群落结构随着宿主发育和生存环境而发生变迁，理解环境影响水生动物肠道微生物的机制对于评估和管理水生态系统健康至关重要。 中国水产科学研究院长江水产研究所科研人员发现长江野生鱼类肠道内微生物主要来自与鱼类食性相关的环境微生物，大多只是匆匆过客（暂住者），和宿主形成稳定适应
肠道微生物可改变脑内免疫细胞活性
英国《自然》杂志近日在线发表了一项神经科学研究：美国科学家团队通过小鼠实验发现，肠道微生物组的变化，改变了多发性硬化症（MS）实验小鼠的脑内免疫细胞的活性。这项研究扩大了我们对肠道和脑之间相互作用的理解，有助于开发针对多发性硬化症和其他神经疾病的新疗法。图片来源于网络 数以万亿计的细菌生活在
Mayo－Clin－Proc：肠道微生物对体重的影响
根据最近发表在《Mayo Clinic Proceedings》杂志上的一篇文章，对于特定人群来说，肠道微生物的特殊活性或许有助于减肥。这一效应不依赖于控制饮食以及日常锻炼等行为。（图片来源： adrian_ilie825 / Fotolia） “我们知道不同人的减肥效率存在差别，即使在接受了
“抗癌战场”加入新生力军：肠道微生物
2015年，Bertrand Routy还是法国古斯塔夫·鲁西癌症中心的一位博士生，他常去医院收集癌症患者的粪便样本。医生嘲笑他，甚至给他取了个外号：便便先生。某些肠道细菌似乎可以提高人们对抗癌治疗的反应。医生也盼望研究者能分析患者的粪便样本，以预测他们是否对抗癌药物产生反应。图片来源：Ola
环境和生活方式塑造肠道微生物组
科技日报讯 （实习记者张佳欣）人类肠道中的细菌与多种疾病有关，但有哪些细菌是健康的，哪些是由疾病或药物造成的？科学家迄今尚不十分清楚。荷兰格罗宁根大学傅静远教授团队与合作者在4月13日的《自然》杂志上发表最新研究，系统地揭示了环境和遗传因素与人类肠道微生物组之间的关联，这将促进微生物组靶向治疗的未来
研究发现低纤维饮食妨碍肠道微生物恢复
在老鼠身上的实验表明，低纤维食物的养生法会在抗生素疗法后阻碍健康肠道微生物群恢复。 美国加州斯坦福大学的Kerwyn Casey Huang和同事研究了植入人类肠道微生物的老鼠的肠道菌群。在5天里，研究小组用常见的抗生素，如链霉素和环丙沙星，对小鼠进行治疗。相关成果近日发表于《细胞—宿主和微
Nature：意外！肠道微生物竟然决定药物是否有效！
有没有想过为什么一种对别人有效的药物对你似乎没有效果？你可能想要检查一下你的肠道来寻找答案。研究人员已经找到了加工150多种药物的肠道细菌，他们还发现了赋予这种细菌这种能力的基因。耶鲁大学研究小组称，这一发现强调了肠道细菌在人们对药物的反应中所起的作用。图片来源：http://cn.bing.com
《自然－微生物学》报道昆虫肠道微生物稳态的调节机制
2017年3月1日，国际微生物学顶级学术期刊《自然 微生物学》 (Nature Microbiology) 以长文 (Article) 的形式在线发表了“A Mesh-Duox pathway regulates homeostasis in the insect gut (Mesh-Duox
微生物组影响的不仅是肠道，还有头发
为了让自己看上去美美哒，每个人每年都在头发上花了不少时间和金钱。不过，也许你还不知道，细菌和头发之间也存在着一种奇怪的共生关系。近日，加州大学旧金山分校的研究人员在《Cell Host & Microbe》上阐明了这种关系。 调节性T细胞（Treg）是一类让人体能够耐受共生微生物的免疫细胞，
惊讶！肠道微生物或能团队合作来改善机体健康
我们机体的消化道中居住者数万亿个微生物，其中主要是细菌，其能帮助我们消化食物，制造维生素、增加机体免疫系统、抵御外来细菌感染，同时还能产生多种分子来影响机体健康的多个方面，此前研究人员研究肠道微生物的组成非常复杂，想要识别这些微生物就必须在实验室中进行培养，然而很多微生物都无法在实验室中进行培养
遗传印迹揭示导致癌症发生的肠道微生物
根据最近在《nature》杂志上发表的研究，肠道中常见的一种细菌可能导致肠癌。 这项由来自荷兰，英国和美国的科学家做出的研究结果表明，大肠杆菌释放的毒素会导致肠道内膜细胞发生“独特”的DNA损伤模式。这一结果首次显示出细菌毒素与驱动癌症发展的遗传变化之间的直接联系。 研究小组认为，将来可以通
研究称肠道微生物可导致严重营养不良
肠道微生物可导致严重营养不良 一则对马拉维的年幼双胞胎的研究揭示，一种叫做夸休可尔症的严重、急性形式的营养不良与某些肠道细菌有关，而不是仅仅与营养有关。这些结果表明，对世界上某些营养不良的儿童来说，仅仅让他们摄入更多的卡路里将不足以让他们变得健康。更令人乐观的是，在一则相关的文章中，Dav
肠道微生物可以刺激免疫系统对抗癌症
近些年，关于免疫检查点调控的生物医药研发越来越火爆。去年，首个免疫检查点抑制剂已在中国获批上市。它的出现是癌症免疫治疗的一个重大突破。它释放了人体免疫系统的“刹车”，从而对肿瘤发动一场有效的攻击。然而，这些疗法并非对所有人都有效，且经常伴有严重的副作用。因此，基于对免疫检查点抑制剂的潜在反应对患
咖啡能带来更健康的肠道微生物群？
一项新的研究表明，咖啡因的摄入与健康的肠道微生物群有关。肠道微生物群是生活在消化道中的数万亿微生物，它们影响着你的整体健康。 近年来，大量研究表明，从2型糖尿病到某些癌症再到帕金森氏症，饮用咖啡与降低各种健康风险之间存在关联。 与此同时，越来越多的证据表明，肠道微生物群落的组成可能会影响你的
核桃有益健康？除了宿主，还会“贿赂”肠道微生物
核桃（Walnuts）营养价值丰富（富含omega-3脂肪酸、抗氧化剂、维生素、膳食纤维等成分），被称为“超级食物”。图片来源：Pixabay 现在，来自于美国伊利诺伊大学食品科学与人类营养学助理教授Hannah Holscher带领团队找到了“超级”的潜在原因。他们发现，核桃不仅仅会影响肠道
惊讶！肠道微生物或能团队合作来改善机体健康
我们机体的消化道中居住者数万亿个微生物，其中主要是细菌，其能帮助我们消化食物，制造维生素、增加机体免疫系统、抵御外来细菌感染，同时还能产生多种分子来影响机体健康的多个方面，此前研究人员研究肠道微生物的组成非常复杂，想要识别这些微生物就必须在实验室中进行培养，然而很多微生物都无法在实验室中进行培养
生产和喂养方式会影响婴儿肠道微生物组成
一项新的研究表明，阴道分娩和母乳喂养方式能够显著影响婴儿肠道细菌的组成。 胃肠道微生物的组成，尤其是大肠中的微生物，能够影响机体的免疫系统功能以及机体对营养物质的吸收过程。 在该项研究中，研究者们过对100名婴儿的出生记录进行了分析，其中，婴儿的年龄均为6个月，研究人员发现，阴道分娩的婴儿
肠道微生物：血脑屏障的加速剂－助力脑发育
肠道微生物：血脑屏障的加速剂 助力脑发育 什么是血脑屏障？ 血脑屏障是指脑毛细血管壁与神经胶质细胞形成的血浆与脑细胞之间的屏障和由脉络丛形成的血浆和脑脊液之间的屏障，这些屏障能够阻止某些物质（多半是有害的）由血液进入脑组织。 血液中多种溶质从脑毛细血管进入脑组织，有难有易：
肠道微生物群可以防止急性砷中毒
在蒙大拿州立大学进行的研究表明，人体肠道中的微生物在防止砷毒性方面发挥着重要作用，这一问题影响了通过受污染的饮用水接触砷的大约2亿人。 在过去的五年中，MSU博士候选人Michael Coryell与他的顾问Seth Walk和委员会成员Timothy McDermott一起研究人类肠道
JCI：肠道微生物与风湿病之间的关系
对于患有类风湿性关节炎的患者来说，自体反应性的T细胞激活会引发严重的炎症反应，进而引起滑液关节的恶性损伤。尽管目前与类风湿性关节炎有关的遗传因素已经被鉴定得到，然而环境因素同样起到了十分重要的影响。最近一项研究表明，类风湿性关节炎最初是由肠道微生物引发的免疫反应导致的，不过肠道来源的自体免疫反应
研究发现荞麦蜜可以明显改善人肠道微生物
近日，中国农业科学院蜜蜂研究所蜂产品加工与功能评价团队研究发现，荞麦蜜中多酚类成分和低聚糖可以发挥协同作用，选择性地促进有益菌生长，抑制致病菌，从而明显改善人肠道微生物，对低价蜂蜜的提质增效和深度开发提供了理论依据。该研究成果在线发表在《循证补充和替代医学（Evidence-based Comp
我国构建小鼠肠道微生物资源库
1月7日，《自然-通讯》发表了中国科学家完成的小鼠肠道微生物资源库工作。 肠道微生物是近年来生命科学和健康领域研究的前沿和热点。越来越多的证据表明，肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关，在未来人体健康管理和医疗产业发展中，具有十分重要的作用。肠道微生物资源库的建设，是开发利用肠道微生物的基础
肠道微生物竟然影响癌症免疫治疗效果？！
检查点抑制剂是能够唤醒免疫系统抵抗肿瘤的新型药物，对癌症的治疗具有显著的疗效。然而一些临床结果表明该类药物对一部分病人并没有效果。最近两篇研究文章对此内在的机理进行了阐释。作者们认为这部分病人体内的微生物种群存在异常，因而不能正常地产生免疫反应。 这两项研究第一次将免疫检查点抑制剂与肠道的菌群
登上Nature！精准编辑“肠道微生物”，或可治疗疾病
在这项研究中，来自德克萨斯大学西南医学中心等机构的科学家们在结肠炎小鼠模型中，通过对肠道菌群的精准编辑，预防或降低了炎症的严重程度。 在多种疾病中，肠道微生物发生变化 被誉为人类“第二基因组”的肠道微生物，对我们的健康至关重要，它们能够帮助消化、培养免疫系统、抵御感染。然而，当这一微生物群体
抗菌牙膏不会影响肠道菌群和口腔微生物
根据小型随机试验测定，一些含有抗生素三氯生的个人卫生用品，如肥皂和牙膏，对微生物群落或内分泌功能没有重大影响。这项研究结果在线发表在mSphere上。 “有很多人害怕三氯生，但在我们的研究中我们没有发现任何相关的支持论点。“医学博士Julie Parsonnet说，“当大多数抗生素应用到人类中