上海交大研究人员系统阐述胆囊癌基因突变图谱

7月7日,记者从中科院上海生科院营养科学研究所获悉,该所王慧研究组与上海交通大学附属新华医院教授刘颖斌、复旦大学生物医学研究院副教授刘赟等合作,运用全基因组外显子测序和靶基因深度测序技术,首次系统阐述胆囊癌基因突变图谱,发现驱动胆囊癌发生发展的关键基因和信号通路,揭示ErbB信号通路的突变与胆囊癌病人预后显著相关。7月6日,相关研究成果在线发表于《自然—遗传学》。 胆囊癌是恶性程度最高的消化道肿瘤之一,其发病具有典型的地域性、种族和性别差异性,女性发病率显著高于男性。由于胆囊癌具有恶性程度高、对放化疗不敏感等生物学特征,治疗目前主要依靠手术,总体预后极差。 研究团队通过对57对肿瘤患者的癌组织和相应的癌旁正常组织进行了全基因外显子组测序和283个肿瘤相关靶基因深度测序,发现了C>T的碱基频繁颠换现象。值得关注的是,研究首次发现了胆囊癌ErbB信号通路在病人中突变最为显著,在57份样本中有21例存在该信号通路的突变......阅读全文

免疫疗法之IDO信号通路介绍

免疫逃避是识别恶性肿瘤的标志之一,研究者一直在努力地研究以明确能使癌细胞回避宿主免疫系统的复杂机制。癌症细胞以便于生存、增长、入侵及恶性肿瘤细胞的转移使用吲哚胺2,3-双氧酶(IDO)途径来抑制宿主的免疫应答。启维益成提供的IDO通路在许多的癌症中是非常活跃的,对于T细胞袭击提供直接防御。这个IDO

IL17信号通路研究背景

IL-17家族由六个成员IL-17A-F组成,而IL-17受体家族由五个成员IL-17RA到IL-17RE组成。IL-17RA是一种常见的受体,与IL-17RB、IL-17RC和IL-17RE形成异二聚体复合物。到目前为止,所有的IL-17受体都招募Act1作为下游信号转导的衔接分子。IL-17A和

细胞周期信号通路相关TYMS

胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸(亚甲基四氢叶酸)作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该

NFKB信号通路研究背景

在该途径中,NF-κB/Rel蛋白被IκB蛋白结合和抑制。生长因子、促炎细胞因子、化疗、放疗和抗原受体激活IKK复合物,该复合物磷酸化IκB蛋白。IκB的磷酸化导致其泛素化和蛋白酶体降解,释放NFκB/Rel复合物。转录因子NF-κB由此释放并促进细胞因子、细胞粘附分子和抗凋亡蛋白的表达。免疫系统发

Notch信号通路的基本信息

Notch信号通路广泛存在于脊椎动物和非脊椎动物,在进化上高度保守,通过相邻细胞之间的相互作用调节细胞、组织、器官的分化和发育。Notch信号通路由Notch受体、Notch配体(DSL蛋白)、CSL (CBF-1,Suppressor of hairless,Lag的合称)DNA结合蛋白、其他的效

Notch信号通路的激活过程

首先在细胞内,合成的受体蛋白单链前体分子被高尔基体内的furin蛋白酶酶切,酶切位点在Notch跨膜区胞外端的s1位点,酶切形成的ECN(extracellular Notch domain)和NTM (Notch transmembrane fragment)通过一种ca2+依赖的非共价键结合在一

死亡受体信号通路——Novus凋亡研究

死亡受体(Death Receptor)是肿瘤坏死因子受体(TNF, Tumor Necrosis Factor Receptor)基因超家族的成员,具有富含Cys的胞外结构域和胞内死亡结构域(DD, Death Domain)。死亡结构域具有诱导细胞凋亡的功能。目前已知的死亡受体有5种,其

T细胞受体信号通路研究背景

T细胞受体(TCR)在T细胞的功能和免疫突触的形成中起着关键作用。它在T细胞和抗原呈递细胞(APC)之间提供连接。TCRs激活促进了一系列信号级联,最终通过调节细胞因子的产生、细胞存活、增殖和分化来决定细胞的命运。T淋巴细胞的激活是免疫系统有效反应的关键事件。TCR激活受各种共刺激受体调节。CD28

p38-MAPK信号通路图

p38 MAPK是1993年由Brewster等人在研究高渗环境对真菌的影响时发现的[8]。以后又发现它也存在于哺乳动物的细胞内,也是MAPKs的亚类之一,其性质与JNK相似,同属应激激活的蛋白激酶。目前已发现p38MAPK有5个异构体,分别为p38α(p38)、p38β1、p38β2、p38γ、p

B细胞受体的信号通路描述

B细胞受体信号传导途径的示意图。B细胞受体的聚集会迅速激活SRC家族激酶,包括BLK、LYN和FYN以及SYK和BTK酪氨酸激酶。最终会形成由B细胞受体、上述酪氨酸激酶和接头蛋白组成的“信号小体(signalosome)”。 B细胞受体作为B细胞活动的关键调节位点,参与了多个信号通路。一般而言,膜结

核受体信号通路相关因子PPARG

该基因编码核受体过氧化物酶体增殖激活受体(ppar)亚家族的一个成员。ppar与维甲酸x受体(rxrs)形成异二聚体,这些异二聚体调节各种基因的转录。已知三种ppar亚型:pparα、pparδ和pparγ。该基因编码的蛋白是pparγ,是脂肪细胞分化的调节因子。此外,pparγ还与许多疾病的病理学

胆囊癌的诊断

  1)、早期症状极不典型,诊断比较困难。多数病人临床表现与慢性胆囊炎,胆石症相似。以右上腹痛为主要症状,向右肩胛部放射,伴有食欲不振、乏力、腹胀、低热,恶心及黄疸等。对40岁以上女性病人,有长期慢性胆囊炎、胆石症病史,若疼痛性质从阵发性发作转变为右上腹持续钝痛,且进行性加重,局部触及胆囊肿块,进行

胆囊癌的治疗

  1)手术治疗:早期胆囊癌的治疗以手术切除为首选方案。只要患者一般情况许可,应尽可能争取手术切除病变的胆囊,并根据病理结果决定是否进行扩大的清除手术。一般认为当病变累及胆囊肌层时应该进行扩大清扫手术,包括切除胆囊床附近的肝脏组织及肝十二指肠韧带的软组织并对引流胆囊区域的淋巴结进行清扫,当怀疑有肝外

胆囊癌的分类

  1)病理形态分型  ①浸润型:最常见,约占75%~80%,早期多见于胆囊颈部壁内。肿块呈浸润性生长,胆囊壁广泛增厚变硬,胆囊因癌性收缩而萎缩,易侵犯邻近器官,晚期为实体性肿瘤,呈皮革样,切面为灰白色,预后差。  ②肿块型:约占15%,癌灶呈肿块状向胆囊腔内生长,位于胆囊颈或胆囊管可阻塞胆囊出口,

G蛋白偶联受体信号通路相关SNCAIP

该基因编码一种含有多个蛋白质相互作用域的蛋白质,包括锚蛋白样重复序列、卷曲螺旋结构域和atp/gtp结合基序。编码蛋白与神经元组织中的α-突触核蛋白相互作用,可能在胞浆内含物的形成和神经变性中起作用。这个基因的突变与帕金森氏症有关。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2015年4月]T

与--Notch信号通路相关因子介绍AR

雄激素受体(AR),也称为NR3C4(核受体亚家族3,C组,成员4),是一种核受体,通过结合任何雄激素激活,包括睾酮和二氢睾酮在细胞质中,然后易位到细胞核。 雄激素受体与孕酮受体的关系最为密切,较高剂量的孕激素可以阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调节基因表达的DNA结合转录因子; 然而,

与--Notch信号通路相关因子介绍REL

该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子(rhd/ipt)家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤,包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠

与-Hedgehog信号通路相关因子介绍SPOP

该基因编码一种蛋白质,可调节死亡相关蛋白6(daxx)的转录抑制活性,daxx与组蛋白脱乙酰酶、核心组蛋白和其他组蛋白相关蛋白相互作用。在小鼠中,编码的蛋白质与macroh2a1.2的假定亮氨酸拉链结构域结合,macroh2a1.2是一种富含失活x染色体的变异h2a组蛋白。该蛋白的btb/poz结构

与-Hedgehog信号通路相关因子介绍GNAS

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

遗传风险基因信号通路相关因子HFE

该基因编码的蛋白是一种膜蛋白,与mhcⅠ类蛋白相似,与beta2微球蛋白(beta2m)相关。认为该蛋白通过调节转铁蛋白受体与转铁蛋白的相互作用来调节铁的吸收。铁储存障碍,遗传性血色素沉着症,是一种隐性遗传疾病,是由该基因缺陷引起的。至少有9个选择性剪接的变异已经被描述为这个基因。已发现其他变体,但

遗传风险基因信号通路相关因子SDHC

这个基因编码四个核编码亚单位之一,包括琥珀酸脱氢酶,也被称为线粒体复合物ii,一个三羧酸循环和线粒体有氧呼吸链的关键酶复合物。编码的蛋白质是两个完整的膜蛋白之一,它们将复合物的其他亚单位(形成催化核心)固定在线粒体内膜上。这个基因在不同染色体上有几个相关的假基因。这个基因的突变与副神经节瘤有关。另外

遗传风险基因信号通路相关因子SDHB

呼吸链的复合物II,特别参与琥珀酸的氧化,携带电子从FADH到COQ。复合物由四个核编码亚单位组成,并定位于线粒体内膜。铁硫亚单位高度保守,包含三个富含半胱氨酸的簇,这些簇可能包含酶的铁硫中心。该基因的零星和家族性突变导致副神经节瘤和嗜铬细胞瘤,并支持线粒体功能障碍和肿瘤发生之间的联系。Comple

遗传风险基因信号通路相关因子BLM

bloom综合征基因产物与含有dna解旋酶的desh盒recq亚群有关,具有dna刺激的atp酶和atp依赖的dna解旋酶活性。引起布鲁姆综合征的突变会删除或改变螺旋酶基序,并可能使3'-5'螺旋酶活性丧失。正常蛋白可能起到抑制不适当重组的作用。[由RefSeq提供,2008年7月]

遗传风险基因信号通路相关因子MITF

该基因编码一个转录因子,包含碱性螺旋环螺旋和亮氨酸拉链结构特征。调节黑素细胞视网膜色素上皮的分化和发育,并负责黑素生成酶基因的色素细胞特异性转录。该基因的杂合子突变引起听觉色素综合征,如Waardenburg综合征2型和Tietz综合征。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。This gene

遗传风险基因信号通路相关因子FANCG

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

遗传风险基因信号通路相关因子PTEN

PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。

遗传风险基因信号通路相关因子MAX

该基因编码的蛋白质是碱性螺旋环螺旋亮氨酸拉链(bhlhz)转录因子家族的成员。它能与其他家族成员形成同二聚体和异二聚体,包括mad、mxi1和myc。myc是一种参与细胞增殖、分化和凋亡的肿瘤蛋白。同二聚体和异二聚体竞争一个共同的dna靶位点(e盒),这些二聚体形式之间的重排提供了一个复杂的转录调控

与-Notch信号通路相关因子介绍REL

该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子(rhd/ipt)家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤,包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠

与-Wnt信号通路相关因子介绍TERT

端粒酶是一种核糖核蛋白聚合酶,通过添加端粒重复序列TTagg来维持端粒末端。这种酶由一种具有逆转录酶活性的蛋白质成分(由该基因编码)和一种作为端粒重复模板的RNA成分组成。端粒酶的表达在细胞衰老中起作用,因为它通常在出生后的体细胞中被抑制,导致端粒逐渐缩短。体细胞端粒酶表达的放松调控可能与肿瘤发生有

与--Notch信号通路相关因子介绍MYCN

这个基因是myc家族的一员,编码一个具有基本螺旋-环-螺旋(bhlh)结构域的蛋白质。这种蛋白位于细胞核内,必须与另一种bhlh蛋白二聚以结合DNA。这种基因的扩增与多种肿瘤有关,尤其是神经母细胞瘤。该基因有多种编码不同亚型的选择性剪接转录变体。This gene is a member of th