上海交大研究人员系统阐述胆囊癌基因突变图谱
7月7日,记者从中科院上海生科院营养科学研究所获悉,该所王慧研究组与上海交通大学附属新华医院教授刘颖斌、复旦大学生物医学研究院副教授刘赟等合作,运用全基因组外显子测序和靶基因深度测序技术,首次系统阐述胆囊癌基因突变图谱,发现驱动胆囊癌发生发展的关键基因和信号通路,揭示ErbB信号通路的突变与胆囊癌病人预后显著相关。7月6日,相关研究成果在线发表于《自然—遗传学》。 胆囊癌是恶性程度最高的消化道肿瘤之一,其发病具有典型的地域性、种族和性别差异性,女性发病率显著高于男性。由于胆囊癌具有恶性程度高、对放化疗不敏感等生物学特征,治疗目前主要依靠手术,总体预后极差。 研究团队通过对57对肿瘤患者的癌组织和相应的癌旁正常组织进行了全基因外显子组测序和283个肿瘤相关靶基因深度测序,发现了C>T的碱基频繁颠换现象。值得关注的是,研究首次发现了胆囊癌ErbB信号通路在病人中突变最为显著,在57份样本中有21例存在该信号通路的突变......阅读全文
细胞周期信号通路相关POLE
该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
细胞周期信号通路相关REL
该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子(rhd/ipt)家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤,包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠
细胞周期信号通路相关AURKB
这个基因编码丝氨酸/苏氨酸激酶的极光激酶亚家族的一个成员。编码这个亚科另外两个成员的基因位于19号和20号染色体上。这些激酶通过与微管的结合参与有丝分裂和减数分裂过程中染色体排列和分离的调节。这个基因的一个假基因位于8号染色体上。另外,已经发现该基因的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2015年9
细胞周期信号通路相关A-TM
ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤
核受体信号通路相关因子CIC
该基因编码的蛋白质是果蝇黑胃管Capicua基因的一个同源基因,是转录抑制因子的高迁移率群(HMG)盒超家族成员。该蛋白包含一个参与DNA结合和核定位的保守HMG结构域和一个保守的C端。研究表明,这种蛋白的N末端区域与ATXN1(geneid:6310)相互作用,形成转录抑制复合物,体外研究表明,A
识别心脏肥大的分子信号通路
特定基因在心脏发育的早期阶段负责决定细胞生长和分化。这些基因在随后生活中的再激活会导致心肌的异常增厚。柏林夏里特医学院(Charité-Universit?tsmedizin Berlin)Silke Rickert-Sperling教授领导的研究团队,已经有能力识别这种疾病的基础分子机制。他们
细胞周期信号通路相关ATR
该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞
细胞周期信号通路相关AURKA
该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶,在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因,在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋
DNA修饰QKI基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,可调节mRNA的前剪接,从细胞核输出mRNA,蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化,并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。
什么是细胞信号传导通路?
细胞信号传导通路,人体细胞之间的信息转导可通过相邻细胞的直接接触来实现,但更重要的也是更为普遍的则是通过细胞分泌各种化学物质来调节自身和其他细胞的代谢和功能,因此在人体中,信息传导通路通常是由分泌释放信息物质的特定细胞、信息物质(包含细胞间与细胞内的信息物质和运载体、运输路径等)以及靶细胞(包含特异
核受体信号通路相关因子CTCF
该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(hd
细胞周期信号通路相关CREBBP
该基因广泛表达,参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白(creb)的核蛋白被分离出来,该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合,在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性,也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相
细胞周期信号通路相关PRKDC
该基因编码dna依赖性蛋白激酶(dna-pk)的催化亚单位。与ku70/ku80异二聚体蛋白共同参与dna双链断裂修复和重组。编码的蛋白质是PI3/PI4激酶家族的成员。[由RefSeq提供,2010年7月]This gene encodes the catalytic subunit of the
细胞信号通路与癌症治疗
2月16日的SCIENCESIGNALING为细胞信号通路与癌症治疗的专辑,发表了编者案“当细胞生物学遇到癌症治疗”,介绍本期和往期该杂志发表的关于细胞信号通路领域相关癌症治疗方面的内容,在这方面做了一个很好的概括。 生长和分化的细胞,包括癌细胞对代谢要求很高,因为它们必须建立新的蛋白质、膜和
核受体信号通路相关因子PPARG
该基因编码核受体过氧化物酶体增殖激活受体(ppar)亚家族的一个成员。ppar与维甲酸x受体(rxrs)形成异二聚体,这些异二聚体调节各种基因的转录。已知三种ppar亚型:pparα、pparδ和pparγ。该基因编码的蛋白是pparγ,是脂肪细胞分化的调节因子。此外,pparγ还与许多疾病的病理学
细胞周期信号通路相关MYC
该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白,在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明,来自上游、非aug(cug)帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两
核受体信号通路相关因子SRC
SRC基因编码的蛋白属于SRC家族激酶(SFKs),该家族由9个成员组成,分别是SCR、LYN、FYN、LCK、HCK、FGR、BLK、YRK和YES,其中SRC是目前研究最多的成员,也是与人类疾病联系最为密切的蛋白。SRC蛋白是非受体酪氨酸激酶,可被多条信号转导途径所激活,而激活后的SRC激酶又通
成体干细胞的信号通路介绍
成体干细胞研究一直集中在揭示控制其自我更新和分化的一般分子机制。NotchNotch信号通路已被发育生物学家知道了几十年。其在干细胞增殖的控制中的作用现在已经几种细胞的类型中被证明了,包括造血的,神经的和乳腺的[2]干细胞。Wnt这些发育途径也强烈地被牵涉作为干细胞调节剂。TGFβ细胞因子的TGFβ
细胞周期信号通路相关ATM
ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤
细胞周期信号通路相关TERT
端粒酶是一种核糖核蛋白聚合酶,通过添加端粒重复序列TTagg来维持端粒末端。这种酶由一种具有逆转录酶活性的蛋白质成分(由该基因编码)和一种作为端粒重复模板的RNA成分组成。端粒酶的表达在细胞衰老中起作用,因为它通常在出生后的体细胞中被抑制,导致端粒逐渐缩短。体细胞端粒酶表达的放松调控可能与肿瘤发生有
TGFbeta信号通路研究背景
TGF-β信号传导参与许多细胞(包括胶质瘤细胞)的增殖、分化和存活/或凋亡的调节。TGF-β通过特异性受体激活多种细胞内途径发挥作用,导致受体调节的Smad2/3蛋白磷酸化,这些蛋白与共同的介体Smad4相关。这种复合物易位到细胞核,与DNA结合并调节许多基因的转录。此外,TGFβ活化激酶-1(TA
IL10信号通路研究背景
白细胞介素-10(IL-10)是一种具有重要免疫调节功能的抗炎细胞因子。它是一种具有强大抗炎特性的细胞因子,通过激活的巨噬细胞抑制炎症细胞因子如TNF-α、IL-6和IL-1的表达。IL-10是一种具有重要免疫调节功能的多效性细胞因子。其作用影响免疫系统中许多细胞类型的活动。主要由抗原呈递细胞分泌,
JakStat信号通路研究背景
JAK-STAT信号通路传递来自调节生长、存活、分化和病原体抗性的细胞外化学信号的信息。JAK-STAT信号级联由三个主要组成部分组成:细胞表面受体、Janus激酶(JAK)和两个信号转导和转录激活蛋白(STAT)。JAK-STAT功能中断或失调可导致免疫缺陷综合征和癌症。细胞表面受体,通常是细胞因
Notch信号通路的激活过程
首先在细胞内,合成的受体蛋白单链前体分子被高尔基体内的furin蛋白酶酶切,酶切位点在Notch跨膜区胞外端的s1位点,酶切形成的ECN(extracellular Notch domain)和NTM (Notch transmembrane fragment)通过一种ca2+依赖的非共价键结合在一
P53信号通路研究背景
p53肿瘤抑制因子是主要的凋亡信号通路之一。p53蛋白是一种核转录因子,在基因毒性或细胞应激反应中调节与凋亡、生长停滞或衰老有关的多种基因的表达。p53蛋白水平受到E3泛素连接酶(包括MDM2)的负调控。E3连接酶促进p53泛素化和蛋白酶体依赖性降解。p53蛋白水平随着应激刺激而稳定,包括DNA损伤
Hedgehog信号通路的基本信息
哺乳动物中存在三个Hedgehog的同源基因:SonicHedgehog(SHH)、Indian Hedgehog(IHH)和Desert Hedgehog(DHH),分别编码Shh、Ihh和Dhh蛋白。Hh蛋白家族成员均由两个结构域组成:氨基端结构域(Hh-N)及羧基端结构域(Hh-C),其中Hh
T细胞受体信号通路研究背景
T细胞受体(TCR)在T细胞的功能和免疫突触的形成中起着关键作用。它在T细胞和抗原呈递细胞(APC)之间提供连接。TCRs激活促进了一系列信号级联,最终通过调节细胞因子的产生、细胞存活、增殖和分化来决定细胞的命运。T淋巴细胞的激活是免疫系统有效反应的关键事件。TCR激活受各种共刺激受体调节。CD28
NFKB信号通路研究背景
在该途径中,NF-κB/Rel蛋白被IκB蛋白结合和抑制。生长因子、促炎细胞因子、化疗、放疗和抗原受体激活IKK复合物,该复合物磷酸化IκB蛋白。IκB的磷酸化导致其泛素化和蛋白酶体降解,释放NFκB/Rel复合物。转录因子NF-κB由此释放并促进细胞因子、细胞粘附分子和抗凋亡蛋白的表达。免疫系统发
Notch信号通路的基本信息
Notch信号通路广泛存在于脊椎动物和非脊椎动物,在进化上高度保守,通过相邻细胞之间的相互作用调节细胞、组织、器官的分化和发育。Notch信号通路由Notch受体、Notch配体(DSL蛋白)、CSL (CBF-1,Suppressor of hairless,Lag的合称)DNA结合蛋白、其他的效
IL12信号通路研究背景
白细胞介素12(IL-12)家族具有唯一的异二聚体细胞因子,包括IL-12、IL-23、IL-27和IL-35。IL-12家族的异二聚体细胞因子由α链(p19、p28或p35)和β链(p40或Ebi3)组成。α链具有IL-12家族所属的IL-6超家族的四螺旋束结构特征。相反,β链与细胞因子(如IL-