厦门大学陈瑞川教授JBC发表表观遗传学新成果

真核生物的基因转录是一个复杂而精密的过程。近年来人们发现的正性转录延伸因子P-TEFb,是调控转录延伸的一种基本蛋白,参与了参与绝大多数基因的转录表达。该蛋白的作用机制一直是相关领域的一个主要研究热点。 可诱导的基因表达在许多细胞过程中起到了至关重要的作用,而转录延伸被认为是这种基因表达的关键限速步骤。蛋白BRD4(bromodomain-containing protein)能通过招募P-TEFb,对转录延伸进行调控,但它必须先从染色质上释放出来才能有效发挥作用。迄今为止,人们对BRD4的这种功能转变还并不了解。 为此,厦门大学和清华长三角研究院的研究人员展开了深入研究。他们解析了BRD4在控制压力诱导的基因表达时,受到的表观遗传学调控,这一成果发表在近期的the Journal of Biological Chemisitry杂志上。文章的通讯作者分别是清华长三角研究院的Feng Ding和厦门大学的陈瑞川教授。 ......阅读全文

关于基因转录的基本内容介绍

  基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。  如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时,基因不表达;而从靶基因上去除阻遏蛋白

T细胞基因的转录激活及其表达

  TCR/CD3复合物与配体结合后,经多种信号转导途径传递信号,最终导致T细胞活化和增殖。信号转导中所涉及的基因根据其活化时间可以分为早早期、早期、晚期基因三种类型(表8-5)。早早期基因的转录不需蛋白的合成,而早期及晚期基因的转录则需蛋白的合成。早早期及早期基因转录在有丝分裂期之前,而晚期基因转

科学家揭示基因转录终止机制

DNA是遗传信息的载体,遗传信息通过转录从DNA传递到RNA,随后通过翻译解码成蛋白质。基因是DNA遗传信息的编码单元,基因的正确解码需要执行基因转录的RNA聚合酶严谨识别基因的的起始序列(启动子)和终止序列(终止子)。转录终止过程发生异常会干扰下游基因的表达,影响DNA复制,破坏基因组稳定性等。

中科院:蛋白质能以“表面活性剂”方式调控基因转录

  4月24日,中国科学院生物物理研究所张宏课题组在Developmental Cell杂志在线发表论文,揭示了转录因子凝聚体界面参与调控下游基因转录起始的过程,并发现细胞内多种蛋白因子能够以协同表面活性剂的方式调控转录因子凝聚体的界面性质及转录活性。  近年来,人们发现在细胞内存在一类无膜细胞器,

类转录化学药物诱导型基因组编辑和转录激活系统

  生物学变化多受到高度动态的分子事件调控,为了更精确的理解并研究这些过程,应用条件性可诱导的技术手段是十分必要的。此前,得到广泛应用的药物诱导技术之一是通过配体结合激发雌激素受体蛋白(ER)从细胞质到细胞核的转运。在没有激素配体的情况下,ER与热激蛋白(hsp90)结合定位于细胞质中;一旦与配体结

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强 

转录因子和调节蛋白是包含关系吗

调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。

自闭症相关蛋白POGZ抑制2C基因和逆转录转座元件

  神经发育障碍疾病(如自闭症和儿童多动症)的发病率在世界范围内呈现不断攀升的趋势。基因组测序研究表明,自闭症是高异质性遗传发育疾病。根据个体遗传背景的不同,患者表现出不同程度的神经系统功能异常,如智力、语言、运动行为缺陷等。然而,由于目前缺乏对疾病病因的深入认知,临床上尚无有效的治疗手段。  内源

揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化中二价基因转录的功能

  2月10日,中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作,在《科学》(Science)上,在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents bivalent genes from premature activation during differentiati

小干扰RNA转录后基因沉默的介绍

  siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR

逆转录病毒介导的基因技术

是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因组R

分子遗传学词汇反转录假基因

中文名称:反转录假基因英文名称:retropseudogene定  义:反转录形成的没有启动子而不能表达的cDNA片段。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

概述转录后基因沉默的基本内容

  PTGS在多种生物中有共性,对PTGS的激活和与其相关的RNA降解调控过程有了初步的认识。也发现植物病毒在转基因植物和非转基因植物中都能和转基因一样诱发转录后基因沉默。令人吃惊的是,转基因植物的共抑制现象(转基因与同源的内源基因一起失活)、转基因植物的病毒抗性和非转基因植物对病毒正常自然侵染的抗

逆转录病毒介导的基因技术

是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因组R

转录定位法进行基因定位的方法介绍

许多 RNA病毒的整个基因组往往作为一个单位转录。随着转录的进行,由基因组上各个基因所编码的蛋白质也依序在寄主细胞中出现。当寄主细胞被紫外线照射使本身的蛋白质合成受到抑制时,病毒蛋白的出现更为明显。紫外线照射也起着抑制病毒基因组的转录的作用。紫外线在 RNA分子的某一部位造成损伤后,损伤的部位和它后

逆转录病毒介导的基因技术

是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因组R

如何在基因中选择合适的转录本?

 一段基因的DNA序列,一般按从5’到3’的方向分别为:5’非编码区(图中黑色)、外显子(Exon,图中红色)与内含子(intron,图中浅蓝色)区、3’非编码区(图中黑色)等。而在从DNA转录到mRNA的过程中,其中的内含子会被剪切掉、而外显子区再次重新连接起来,最终形成的序列就是mRNA序列了。

基因表达的转录后调控的相关介绍

  基因表达的转录后调控:真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。  携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2-调控醇溶蛋白

  玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有

玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白

玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道,玉米籽粒

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

实验材料mRNA 显示蛋白翻译反应产物试剂、试剂盒Oligo 纤维素Oligo(dT)结合缓冲液Oligo 洗涤缓冲液Ni-NTA 琼脂糖NI-NTA 结合缓冲液Ni-NTA 洗脱缓冲液鲑精 DNABSADNA splintSuperscript Ⅱ 逆转录酶缓冲液DTT脱氧核苷三磷酸Supersc

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

            实验材料 mRNA 显示蛋白翻译反应产物 试剂、试剂盒 Oligo 纤维素 Oligo(dT)结合缓冲液

信号转导及转录激活蛋白的功能

中文名称信号转导及转录激活蛋白英文名称signal transducer and activator of transcription;STAT定  义一组含有SH2和/或SH3功能域,具有信号转导和转录因子作用的DNA结合蛋白。其SH2域可与细胞因子受体的磷酸化酪氨酸结合,随后其本身被JAK酪氨酸

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

实验材料 mRNA 显示蛋白翻译反应产物试剂、试剂盒 Oligo 纤维素Oligo(dT)结合缓冲液Oligo 洗涤缓冲液Ni-NTA 琼脂糖NI-NTA 结合缓冲液Ni-NTA 洗脱缓冲液鲑精 DNABSADNA splintSuperscript Ⅱ 逆转录酶缓冲液DTT脱氧核苷三磷酸S

基因调节蛋白

中文名称基因调节蛋白英文名称gene regulatory protein定  义与基因的DNA序列相互作用调控转录的蛋白质。即反式作用因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

表观遗传学开关控制基因节律性转录

  当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。   Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期

tDEG(转录组差异表达基因深度分析)

 本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化;对两个以上生物学样本之间的差异表达基因进行可信分析;对差异表达所揭示出的重要科学问题进行中肯分析;让您快速“发现”所关注生物学问题,医学问题和农业问题

如何证明基因需要转录调控元件调控表达

如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3)

全基因组及转录组测序案例分析

案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25

关于真核生物的基因调控—真核基因的转录分类介绍

  几乎所有的真核生物的 mRNA都有一个5′帽端,但并不是所有基因的mRNA都有3′多聚A尾部,也不是所有基因的mRNA都必须经过拼接。根据这后两种加工过程的有无和复杂程度,可将真核基因的转录单位分为两大类型:一类是简单的只编码产生一种蛋白质的基因,另一类是复杂的编码两种或更多种蛋白质的转录单位。