基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中心。 SWATH™ 采集软件采用非数据依赖的采集方法,能够系统地生成完全的、高特异性的碎片离子全貌图,通过使用目标数据分析法可以查询任何感兴趣的蛋白质是否存在,并对其定量。传统的“鸟枪法”蛋白质组学测定不完整的蛋白质,故难以重复,而SWATH™软件解决了数据丢失的问题,第一次让重复的蛋白质组研究变得可行。 据AB Sciex介绍,SWATH软件能够一次查看数千个蛋白质,而几乎不需要方法开发。如今有了云端的应用程序,客户处理数据的速度可提高50倍。AB SCIEX的总裁Rainer ......阅读全文
蛋白质的生物合成标记实验
实验材料 蛋白质试剂、试剂盒 甲硫氨酸PBS仪器、耗材 培养箱离心管实验步骤 1. 培养悬浮细胞至对数增长期,室温300 g 离心5 min。回收107~108细胞。 2. 每2×107细胞用约10 ml 37℃的短时间标记培养基在圆锥型试管中洗涤,于室温300 g 离心5 min 回收细胞,小
蛋白质的生物合成标记实验
甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞 甲硫氨酸短时间标记贴壁培养细胞 甲硫氨酸对细胞进行脉冲追踪标记 实验材料 蛋白质
关于生物蛋白质的充分-条件介绍
要使蛋白质具有活性,多肽链要进行修饰、加工等,还要进行折叠具有一定的空间结构。 刚合成的多肽链是没有生物活性的。 蛋白质的结构可以分为四个等级。 一级结构:构成蛋白质的单元氨基酸通过肽键连接形成的线性序列,为多肽链。 二级结构:一级结构中部分肽链的弯曲或折叠产生二级结构。 三级结构:在
生物样品蛋白质的常用分离技术
(1)加热法当待测组分热稳定性好时,可采用加热的方法将一些热变性蛋白质沉淀。加热温度视待测组分的热稳定性而定,通常可加热到90℃。蛋白质沉淀后可用离心或过滤除去,这种方法最简单,但只能除去热变性蛋白质。(2)盐析法利用不同蛋白质在高浓度的盐溶液中溶解度不同程度的降低来沉淀除去蛋白质。在低盐浓度下,蛋
蛋白质生物合成的抑制剂
蛋白质生物合成的抑制剂 许多蛋白质生物合成抑制剂具有高度专一性,这对于研究合成机制很重要。许多临床有效的抗生素是通过特异抑制原核生物的蛋白质合成而发挥作用的,它们抑制细菌生长而不损害人体细胞。利用两类生物蛋白质合成的差异,可以找出治疗细菌感染引起的疾病的药物。表中列出一些较为重要的蛋白质生物合成抑制
蛋白质的生物合成过程的介绍
第一步,氨基酸活化与转运。这个过程是在氨基酸活化酶和镁离子作用下把氨基酸激活成为活化氨基酸。当然,这一过程还有许多其它因子的参与,其发生部位在细胞质。 第二步,肽链(蛋白质)合成的起动。以原核细胞中肽链合成的起动为例:首先是原核细胞中的起始因子结合在核蛋白体的小亚基上,使大小亚基分开,再与信使
蛋白质生物合成的抑制剂
蛋白质生物合成的抑制剂 许多蛋白质生物合成抑制剂具有高度专一性,这对于研究合成机制很重要。许多临床有效的抗生素是通过特异抑制原核生物的蛋白质合成而发挥作用的,它们抑制细菌生长而不损害人体细胞。利用两类生物蛋白质合成的差异,可以找出治疗细菌感染引起的疾病的药物。表中列出一些较为重要的蛋白质生物合成抑制
对蛋白质生物塑料性能的研究
自从我国的经济取得了一定的发展,人们对产品蛋白质含量有了进一步的要求,一些科学家已经在不断的研究如何提高动植物体内的蛋白质方法,并且使用一些相关的仪器像全自动定氮仪来准确的了解蛋白质的含量。我们主要还是需要对蛋白质的性能特点进行了解的,主要包括拉伸度以及数量等,也就是我们常说的蛋白质活性以
单细胞蛋白质的微生物
生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。 糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。 正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。 甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。 甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为甲醇利用菌
蛋白质的生物合成标记实验
甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞 甲硫氨酸短时间标记贴壁培养细胞 甲硫氨酸对细胞进行脉冲追踪标记 实验材料 蛋白质
生物分子蛋白质核磁共振光谱
利用核磁谱研究蛋白质,已经成为结构生物学领域的一项重要技术手段。X射线单晶衍射和核磁都可获得高分辨率的蛋白质三维结构,不过核磁常局限于35kDa以下的小分子蛋白,尽管随着技术的进步,稍大的蛋白质结构也可以被核磁解析出来。另外,获得本质上非结构化(Intrinsically Unstructured)
第三届全国生物质谱暨蛋白质组数据处理学术交流会
(第一轮通知) 为了积极促进我国生物质谱、蛋白质组学技术发展和应用以及数据挖掘的经验交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会、中国质谱学会生物质谱专业委员会和中国化学会分析化学委员会主办,北京蛋白质组研究中心和复旦大学共同承办的全国生物质谱暨蛋白质组数据处理学术交流会定于2010
水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法
水德浮游生物大数据平台 目前,绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位,对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段,这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后,而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物
新软件首次实现自动检测蛋白质组数据
莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员将可能解决现代生命科学的重要难题:在大量的蛋白质原始数据组中自动检测公开的数据库中未被开发利用的数据。由于数据格式多样、数量庞大,精确查找这些数据一直以来都相当复杂。莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员在最新一期《自然生物技术》(“Natrue Biotech
新软件首次实现自动检测蛋白质组数据
莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员将可能解决现代生命科学的重要难题:在大量的蛋白质原始数据组中自动检测公开的数据库中未被开发利用的数据。由于数据格式多样、数量庞大,精确查找这些数据一直以来都相当复杂。莱布尼茨学会分析科学研究所的研究人员在最新一期《自然生物技术》(“Natrue Biotech
2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学
2025年10月14日下午,聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集,现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中
-生物医学基因大数据:现状与展望
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域:临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂,无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
JAMA:生物医学大数据缺失的环节
有人认为,大数据将有助于提高医疗保健行业的效率,促进在该行业推行问责制。然而到目前为止,其他行业在这方面要成功得多:通过对多种数据源进行大规模的整合和分析,获得了实用价值。那些成功行业弄明白了一个问题,那就是:当不同的数据集在具体某个人的层面上连接起来时,大数据就会产生变革性的价值。相比之下,生
生物大数据研讨会聚焦前沿问题
首届中国生物大数据统计方法研讨会近日在重庆举行。会议围绕大数据统计方法与传统统计方法的关系、生物大数据的特征与分类、生物医学大数据的功能与运用等前沿问题展开专题报告和自由研讨。 会议由中国卫生信息学会卫生统计理论与方法专业委员会主办,第三军医大学军事预防医学院承办,来自北京大学、重庆大学、中山
英国生物样本库发布大规模遗传数据
近日在线发表于《自然》的两篇论文集中介绍了英国生物样本库的遗传数据。两篇论文对整个数据集进行了详细描述,并对大脑遗传结构进行了深入研究。该数据集涵盖了约50万个个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录。 英国生物样本库包含50万年龄(招募时)在40~69岁之间英国人的遗传和临床数据,这些资
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的
中国生物技术发展中心调研生物大数据发展情况
为应对大数据时代带来的挑战,了解大数据技术发展态势以及对未来我国生物技术领域的科研能力、公共管理和产业竞争力方面的影响,探讨应对措施,生物中心肖诗鹰副主任于2014年5月6-7日带队到复旦大学、浙江大学进行了调研。 在复旦大学、浙江大学科研管理部门的支持配合下,召开了题为“大数据对我国生物
生物梅里埃收购Applied-Maths,增强生物数据处理能力
分析测试百科网讯 生物梅里埃于近日宣布收购Applied Maths,Applied Maths是一家专业为生物科技开发最先进的软件解决方案的公司,尤其擅长复杂数据的数据库存储、分析和解读。该公司成立于1992年,以其在信息学和生物学方面专业的综合知识而享誉全球。 随着新技
蛋白质的生物合成相关内容
蛋白质在生物体内常处于合成和分解的动态平衡。因而各种蛋白质都以其固有的速度进行分解或重新合成。在细胞内合成蛋白质的场所是核蛋白体。核蛋白体在细胞内以游离的或结合在粗面内质网上的状态而存在,前者主要进行细胞质(酶)的合成,后者主要是以分泌蛋白质(酶)及膜组成成分的蛋白质的合成。蛋白质的一级结构,即
蛋白质在原核生物中的表达
实验概要将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点:易于生长和控制;用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵;有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择
蛋白质的生物合成遗传密码表
在mRNA的开放式阅读框架区,以每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨基酸 (amino acid) 或其他信息,这种三联体形势称为密码子(codon)。通常的开放式阅读框架区包含500个以上的密码子。
蛋白质的生物合成标记实验(二)
实验材料细胞试剂、试剂盒PBS甲硫氨酸仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 在100 mm 直径的培养皿上培养贴壁细胞(0.5~2×107)至70%~90%汇片,吸去培养液,用10 ml 于37℃短时间标记培养基轻轻搖晃冼两次细胞。2. 加入5 ml 于37℃短时间标记培养基,在5%CO2的加湿培
特殊蛋白质打破生物学核心规则
生物学核心规则是:一个细胞中的信息往往从DNA开始,然后通过核糖核酸(RNA)通路到达蛋白……然而Phys.org报道称,在1月2日发表于《科学》的论文中,研究人员发现了一种打破这种规则的蛋白。当一个细胞在建立蛋白时出现某种错误后,另一个蛋白Rqc2就趁虚而入,在没有DNA或RNA的任何指导下向
缩短蛋白质疗法的上游生物工艺时间
过去十五年来,蛋白质疗法在全世界范围内的应用急剧增长。因此,对于很多生物制药公司而言,当务之急是寻找更经济和更有效的方法提升上游生物工艺生产。 提高上游生产的策略之一是使用生物工艺模型模仿大型生物反应器,以帮助选择最合适的克隆,并优化培养基、补料和过程参数。识别最佳的蛋白质生产克隆株并优化其