基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中心。 SWATH™ 采集软件采用非数据依赖的采集方法,能够系统地生成完全的、高特异性的碎片离子全貌图,通过使用目标数据分析法可以查询任何感兴趣的蛋白质是否存在,并对其定量。传统的“鸟枪法”蛋白质组学测定不完整的蛋白质,故难以重复,而SWATH™软件解决了数据丢失的问题,第一次让重复的蛋白质组研究变得可行。 据AB Sciex介绍,SWATH软件能够一次查看数千个蛋白质,而几乎不需要方法开发。如今有了云端的应用程序,客户处理数据的速度可提高50倍。AB SCIEX的总裁Rainer ......阅读全文

生物大数据挖掘寻找控制蛋白质死亡之门的钥匙

  蛋白质是自然界中最神秘的物质之一,几乎所有的生命活动都有它的身影。正如人有生死,生物体内的蛋白质也有出生与死亡。蛋白质的出生是一个精准的从脱氧核糖核酸(DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)进而翻译合成蛋白质的过程。当蛋白质的功能使命完成后,需要被及时降解掉(死亡),否则,蛋白质过早或者过晚

生物信息分析数据挖掘

DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达,检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化,显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据,仅仅进行差异表达分析还远远不够,如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现

生物数据唤醒日常家居

   谈到智能物体,多数的家居用品都相当地不够智能。它们蹲在固定位置,了无生气,跟主人毫无交流。但据亚力克斯·罗瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言,即使是最不声不响的物体也能拥有神奇的互动性,而这只是个时间问题。这些设计师称,通过身体传达出的数据,家居用品将可以与我们进行互动。  在都柏林科学画廊生命记录展的

蛋白质生物合成过程

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

蛋白质的生物合成

生物按照从脱氧核糖核酸 (DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)上的遗传信息合成蛋白质的过程。由于mRNA上的遗传信息是以密码(见遗传密码)形式存在的,只有合成为蛋白质才能表达出生物性状,因此将蛋白质生物合成比拟为转译或翻译。所以,RNA是蛋白质合成的直接模板。

蛋白质的含量生物

蛋白质在人体中占18%左右,它是人类生命活动的物质基础,如果体内缺乏蛋白质,容易引起营养不良,诱发疾病的发生。一般医学上说的蛋白质多少,指的是人体血液中的白蛋白和球蛋白,人体白蛋白正常含量是35-55g/L,球蛋白是20-30g/L。

生物医疗大数据如何应用?

  随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟,生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而,与其它行业的数据不同,生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业,数据具有时效性以及数据很轻、易于解析;生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤用 Progenesis、Excel 和 The  Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述,但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析(见注释 1 )。3.2

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材:扫描仪                                                                  图像分析软件                                                                  Exc

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材 扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤 用 Progenesis、Excel 和 The  Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述,但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析(见注释 1 )。3

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

生物样本蛋白质的提取

由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02~0.05mol/L磷酸缓冲溶

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

蛋白质生物合成翻译模板

不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区;真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子结构能与帽子结合,在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合,启动蛋白质生物的合成;帽子结构和p

蛋白质生物合成过程的介绍

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

生物活性物质蛋白质的简介

  蛋白质是由许多α氨基酸按照一定的序列通过酰胺键 (或肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子。蛋白质是生命的载体,任何有生命的机体都不可能离开蛋白质。蛋白质在生命活动和种族繁衍中有重要的生物学意义,承担着强大的功能。  ① 结构功能:蛋白质是生物组织和细胞的组成成分,并发

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

蛋白质芯片技术生物分子反应

使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。

生物组织中蛋白质的检测

  蛋白质的鉴定原理:鉴定生物组织中是否含有蛋白质时,常用双缩脲法,使用的是双缩脲试剂。双缩脲试剂的成分是质量浓度为0.1 g/mL的氢氧化钠溶液和质量浓度为0.01 g/mL的硫酸铜溶液。在碱性溶液(NaOH)中,双缩脲(H2NOC—NH—CONH2)能与Cu2+作用,形成紫色或紫红色的络合物,这

蛋白质的生物意义和功能

蛋白质是由许多α氨基酸按照一定的序列通过酰胺键 (或肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子。蛋白质是生命的载体,任何有生命的机体都不可能离开蛋白质。蛋白质在生命活动和种族繁衍中有重要的生物学意义,承担着强大的功能。 ① 结构功能:蛋白质是生物组织和细胞的组成成分,并发挥着保

2025蛋白质组学大会之模式生物蛋白质组

2025年10月13日14:00-16:00,模式生物蛋白质组分论坛成功举办。论坛云集圣保罗大学、中国科学院昆明动物研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、中国科学院大连化学物理研究所、湖南师范大学、东北林业大学、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)、湖北工业大学等10余家国内外高校及科研机构的顶尖专

生物医学大数据亟待深挖利用

图片来源于网络   “我国是人类遗传资源大国,但不是强国,随着健康中国、大数据等国家重大战略的实施,迫切需要加强对人类遗传资源的深入研究和信息挖掘。”  10月10日,人类遗传资源开发创新研究高层论坛在京召开。中国生物技术发展中心主任张新民坦承,国家人类遗传资源管理和保护涉及生命伦理和国家安全,在资

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

大数据:生物医学变革新契机

  “我国目前每年医疗费用总额超过2.4万亿元,如果按照麦肯锡报告的预测,我国医疗领域利用大数据每年将节省医疗费用近2000亿元。”军事医学科学院研究员朱云平在11月29日召开的“第五届重大疾病防治科技创新高峰论坛”上如是说。  大数据影响的深度和广度仍在不断扩张。对于生物医学来说,其发展过程中积淀

英国生物库数据开始对外开放

  英国生物库数据于3月30日正式面向研究人员开放。通过这一数据库,全球的科学家都可以将近50万英国人的各种健康数据用于研究,这无疑对全球医学研究起到积极的推动作用。   英国生物库项目于2006年8月正式启动,旨在收集大量的生物样本和医学数据用于医学研究。数据收集目标为40岁到65岁的英国人,数

世界微生物数据中心落户微生物所

  在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。   W

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

圆二光谱仪蛋白质数据处理

.数据处理 使用公式:BSA平均分子量为67000,配制的BSA样品浓度为10ug/ml,换算得到BSA浓度为1.4925*10-7 mol/L [θ] = 100θ/cl,其中c =1.4925*10-7 mol/L,l = 25px-1根据杨氏公式fα,222 = -([θ]222 + 3000

蛋白质数据+基因序列精准构建进化树

西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究,展示了如何利用蛋白质三维形状,解开生命中古老的“历史密码”,揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合,提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”(艺术概念图)。图片来源:《

蛋白质组学常用数据库一览

  一蛋白质数据库  1.UniProt (The Universal Protein Resource)  网址:http://www.uniprot.org/  http://www.ebi.ac.uk/uniprot/  简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞