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基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中心。 SWATH™ 采集软件采用非数据依赖的采集方法,能够系统地生成完全的、高特异性的碎片离子全貌图,通过使用目标数据分析法可以查询任何感兴趣的蛋白质是否存在,并对其定量。传统的“鸟枪法”蛋白质组学测定不完整的蛋白质,故难以重复,而SWATH™软件解决了数据丢失的问题,第一次让重复的蛋白质组研究变得可行。 据AB Sciex介绍,SWATH软件能够一次查看数千个蛋白质,而几乎不需要方法开发。如今有了云端的应用程序,客户处理数据的速度可提高50倍。AB SCIEX的总裁Rainer ......阅读全文

生物大数据挖掘寻找控制蛋白质死亡之门的钥匙

  蛋白质是自然界中最神秘的物质之一,几乎所有的生命活动都有它的身影。正如人有生死,生物体内的蛋白质也有出生与死亡。蛋白质的出生是一个精准的从脱氧核糖核酸(DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)进而翻译合成蛋白质的过程。当蛋白质的功能使命完成后,需要被及时降解掉(死亡),否则,蛋白质过早或者过晚

生物信息分析数据挖掘

DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达,检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化,显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据,仅仅进行差异表达分析还远远不够,如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现

生物数据唤醒日常家居

   谈到智能物体,多数的家居用品都相当地不够智能。它们蹲在固定位置,了无生气,跟主人毫无交流。但据亚力克斯·罗瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言,即使是最不声不响的物体也能拥有神奇的互动性,而这只是个时间问题。这些设计师称,通过身体传达出的数据,家居用品将可以与我们进行互动。  在都柏林科学画廊生命记录展的

生物医疗大数据如何应用?

  随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟,生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而,与其它行业的数据不同,生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业,数据具有时效性以及数据很轻、易于解析;生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出

蛋白质生物合成过程

  1.氨基酸的活化与搬运:氨基酸的活化以及活化氨基酸与tRNA的结合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反应完成后,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酰tRNA。  2.活化氨基酸的缩合——核蛋白体循环:活化氨基酸在核蛋白体上反复翻译mRNA

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材 扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件 实验步骤 用 Progenesis、Excel 和 The  Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。 3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶 在本章节中不再阐述,但要确定染色方法以便进行

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材:扫描仪                                                                  图像分析软件                                                                  Exc

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材 扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤 用 Progenesis、Excel 和 The  Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述,但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析(见注释 1 )。3

蛋白质生物合成的调控

生物体内蛋白质合成的速度,主要在转录水平上,其次在翻译过程中进行调节控制。它受性别、激素、细胞周期、生长发育、健康状况和生存环境等多种因素及参与蛋白质合成的众多的生化物质变化的影响。由于原核生物的翻译与转录通常是偶联在一起的,且其mRNA的寿命短,因而蛋白质合成的速度主要由转录的速度决定。弱化作用是

生物样本--蛋白质的提取

由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02~0.05mol/L磷酸缓冲溶