上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱

近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破,《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。 DNA作为生命的遗传物质,是生命科学领域的研究焦点之一。由碳、氢、氧、氮和磷五种元素所构成的四种核苷酸序列编码着自然界生物的遗传现象。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展的里程碑。课题组所属邓子新研究团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰-磷硫酰化修饰。这一现象被国际同行公认为“迄今为止在DNA骨架上发现的第一个天然修饰”,是目前在DNA骨架上发现的第六种元素。多年来,围绕这一现象的探索已逐步形成了一个全新的研究领域,是对DNA......阅读全文

关于组蛋白修饰的方式—乙酰化的基本信息介绍

  组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上,是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。组蛋白乙酰化呈多样性,核小体上有多个位点可提供乙酰化位点,但特定基因部位的组蛋白乙酰化和去乙酰化是以一种非随机的、位置特异的方式进行。乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋白的影响,来

马拉硫磷液相分析方法

马拉硫磷液相分析方法:采用反相液相色谱外标法测定马拉硫磷原药中马拉硫磷的含量。马拉硫磷,又名马拉松、杀虫剂4049,学名O,O-二甲基-S-(1,2-二羟乙氧基乙基)二硫代磷酸酯,是一种有机化合物,化学式为C10H19O6PS2,为无色至淡黄色油状液体,为高效低毒虫、杀螨剂。2017年10月27日,

α微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制

  近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果,以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

   随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇

遗传发育所细胞壁乙酰化修饰调控机制研究获进展

  细胞壁是植物细胞特征性结构之一,不仅在形态建成、器官发育及信号传导中发挥重要作用,还是植物直立生长、营养运输、抵抗病虫害及适应逆境的物质基础。此外,细胞壁构成地球上最丰富的可再生资源,为人们提供赖以生存的食物、日常用品、建筑材料和工业原料等。  乙酰化是一种广泛存在于植物细胞壁上的修饰形式,介导

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

  随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇1

α微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制

  近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果,以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons

表观遗传修饰家族又添新成员-组蛋白丁酰化新功能诠释

  近年来,芝加哥大学赵英明教授课题组运用高分辨质谱技术发现了多种组蛋白密码,极大丰富了表观遗传修饰调控机制。在刚刚上线的国际知名期刊Molecular Cell上,该课题组又同时报道了三项最新研究成果。其中第一项研究首次发现了一种跟酮体代谢密切相关的表观遗传新修饰——组蛋白三羟基丁酰化[1];第二

Protein-Cell:病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控

   天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线,在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modifications,PTMs)广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰(non-hi

碳硫硅锰磷分析仪简介

  碳硫硅锰磷分析仪:国内先进的综合材料分析仪,能同时分析金属元素和非金属元素。是采用计算机技术、传感技术、根据国家标准分析方法,研制成功的新一代碳硫硅锰磷分析仪,可检测黑色金属中各种元素的含量,如普碳钢、低合金钢、中合金钢、高合金钢、生铸铁、球铁、合金铸铁、耐磨铸铁等多种材料。

组蛋白修饰基因通路HDAC1基因

多亚基复合物催化的组蛋白乙酰化和脱乙酰化在调节真核基因表达中起关键作用。 该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰基酶/ acuc / apha家族,是组蛋白脱乙酰基酶复合物的组成部分。 它还与视网膜母细胞瘤肿瘤抑制蛋白相互作用,这种复合物是控制细胞增殖和分化的关键因素。 它与转移相关蛋白2一起使p53脱

组蛋白修饰基因通路BRD4基因

该基因编码的蛋白质与小鼠蛋白MCAP(有丝分裂过程中与染色体相关)和人类Ring3蛋白(丝氨酸/苏氨酸激酶)同源。每一种蛋白质都包含两个溴域,一个保守的序列基序,可能参与染色质靶向。该基因被认为是T(15;19)易位的19号染色体靶基因(q13;p13.1),它定义了年轻人的上呼吸道癌。已经描述了两

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白修饰基因通路KMT2A基因

该基因编码一个转录辅激活子,在早期发育和造血过程中起到调节基因表达的重要作用。编码蛋白包含多个保守功能域。其中一个域,即集合域,负责其组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基转移酶活性,介导与表观遗传转录激活相关的染色质修饰。这种蛋白由酶Taspase 1加工成两个片段,MLL-C和MLL-N。这些片段重

组蛋白修饰基因通路KDM6A基因

该基因位于X染色体上,是编码四肽重复序列(TPR)蛋白的Y连锁基因的相应位点。该基因的编码蛋白包含一个JMJC结构域,并催化三/二甲基化组蛋白H3的去甲基化。已发现该基因的多个选择性剪接转录变体。

组蛋白修饰基因通路KAT6A基因

该基因编码组蛋白乙酰基转移酶的MOZ,YBFR2,SAS2,TIP60家族的成员。 该蛋白质由核定位域,与乙酰化组蛋白尾巴结合的双C2H2锌指结构域,组蛋白乙酰转移酶域,富含谷氨酸/天冬氨酸的区域以及富含丝氨酸和蛋氨酸的反式激活域组成。 它是乙酰化组蛋白3中赖氨酸9残基的复合物的一部分,此外,它还充

组蛋白修饰基因通路MEN1-基因

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

组蛋白修饰基因通路MEN1基因

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

组蛋白修饰基因通路CHD4基因

该基因的产物属于SNF2 / RAD54解旋酶家族。 它代表核小体重塑和脱乙酰基酶复合物的主要成分,并且在表观遗传转录抑制中起重要作用。 皮肌炎患者会产生针对这种蛋白质的抗体。 该基因的体细胞突变与浆膜性子宫内膜肿瘤有关。 选择性剪接导致编码不同同工型的多个转录变体。

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白修饰基因通路TAF1基因

rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装其余转录复合物的支架,并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白(tbp)和一组进化上保守的蛋白质(tbp相关因子或taf)组成。tafs可能参与基础转录

组蛋白修饰基因通路KDM5A基因

该基因编码Jumonji,富含AT的相互作用域1(JARID1)组蛋白脱甲基酶蛋白家族的成员。 编码的蛋白质通过组蛋白编码使组蛋白H3的赖氨酸4脱甲基,从而在基因调控中发挥作用。 编码的蛋白质与许多其他蛋白质(包括成视网膜细胞瘤蛋白质)相互作用,并与Hox基因和细胞因子的转录调控有关。 该基因可能在

组蛋白修饰基因通路EP300基因

该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶,通过染色质重塑调节转录,在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A(缺氧诱导因子1α)的共激活物,因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这

组蛋白修饰基因通路EP300基因

该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶,通过染色质重塑调节转录,在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A(缺氧诱导因子1α)的共激活物,因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这

上海药物所发现赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及其调控酶

  蛋白翻译后修饰是调控诸多生物学过程和疾病的主要生物学通路之一,因而,蛋白翻译后修饰通路研究正成为目前新药研发的重要热点之一。近日,中科院上海药物研究所联合美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室建立的中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心发现了细胞中赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及

ZDHHC18介导的cGAS棕榈酰化修饰抑制先天免疫的分子机制

  近日,我所分子模拟与设计研究组(1106组)李国辉研究员团队与清华大学药学院尹航教授团队合作,揭示了ZDHHC18介导的cGAS棕榈酰化修饰抑制先天免疫的分子机制。  环状GMP-AMP合酶(cGAS)是一种双链DNA(dsDNA)传感蛋白,在病原体来源的核酸诱导强有力的先天免疫反应中发挥着重要

动物所在乙酰化修饰对流感病毒与宿主互作的影响机制

  流感病毒是威胁人类健康的重要病原,其进入宿主体内后,利用宿主的复制和翻译系统完成其生活周期。流感病毒NP蛋白是流感病毒的主要结构蛋白,在病毒的复制和转录中具有重要作用。以往研究表明流感病毒NP蛋白受到泛素化、SUMO化和磷酸化调控,而NP蛋白是否受到乙酰化调控,以及是哪一种去乙酰化酶与NP蛋白有

DNA修饰QKI基因信号通路介绍

该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,可调节mRNA的前剪接,从细胞核输出mRNA,蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化,并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。

基因修饰和动物模型

  科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献

遗传修饰(转基因)风险评估(二)

3. 慎重向环境释放未经事先批准的转基因植物是不能够释放到环境中去的。在欧洲,2001/18 号欧盟指令( 见注 7 ) 专门规定了慎重向环境中释放转基因植物。该指令涵盖了两种类型的环境释放: 实验释放 ( B 部分)和投放市场的商业释放( C 部分)( 见注 8) 。对于每个授权的 B 释