上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破,《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。 DNA作为生命的遗传物质,是生命科学领域的研究焦点之一。由碳、氢、氧、氮和磷五种元素所构成的四种核苷酸序列编码着自然界生物的遗传现象。对DNA结构和功能的每一次全新认知,都是生命科学发展的里程碑。课题组所属邓子新研究团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰-磷硫酰化修饰。这一现象被国际同行公认为“迄今为止在DNA骨架上发现的第一个天然修饰”,是目前在DNA骨架上发现的第六种元素。多年来,围绕这一现象的探索已逐步形成了一个全新的研究领域,是对DNA......阅读全文
遗传修饰(转基因)风险评估(二)
3. 慎重向环境释放未经事先批准的转基因植物是不能够释放到环境中去的。在欧洲,2001/18 号欧盟指令( 见注 7 ) 专门规定了慎重向环境中释放转基因植物。该指令涵盖了两种类型的环境释放: 实验释放 ( B 部分)和投放市场的商业释放( C 部分)( 见注 8) 。对于每个授权的 B 释
邓子新团队DNA骨架硫修饰研究获新突破
近日,上海交通大学邓子新院士团队对DNA骨架硫修饰生物学意义的研究又获得两项突破。 聚焦核酸研究的著名国际学术刊物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)以特写文章(Featured article)发表了由该团队由德林副教授主持,博士生徐铁刚和姚芬为共同第一作者的
组蛋白修饰基因通路KMT2C基因
该基因是髓系/淋巴系或混合系白血病(MLL)家族的成员,编码核蛋白,具有AT-Hook DNA结合域、DHHC型锌指、六个PhD型锌指、一个集合域、一个后集合域和一个环状锌指。该蛋白是ASC-2/NCOA6复合物(ASCOM)的成员,具有组蛋白甲基化活性,参与转录协同激活。
组蛋白修饰基因通路KDM5C基因
该基因是smcy同系物家族的成员,编码一个干旱区、一个jmjc区、一个jmjn区和两个phd型锌指蛋白。DNA结合基序表明该蛋白参与转录和染色质重塑的调节。这种基因的突变与X连锁精神发育迟滞有关。选择性剪接导致多个转录变体。
组蛋白修饰基因通路KMT2D基因
这个基因编码的蛋白质是组蛋白甲基转移酶,它甲基化组蛋白H3的Lys-4位置。编码蛋白是一种叫做抗坏血酸的大蛋白复合物的一部分,它被证明是β-珠蛋白和雌激素受体基因的转录调节器。这种基因的突变被证明是导致歌舞伎综合征的原因。
乙酰化修饰对流感病毒与宿主互作的影响机制研究获进展
流行性感冒病毒,简称流感病毒,是一种造成人、狗、马、猪及禽类等患流行性感冒的RNA病毒,在分类学上,流感病毒属于正黏液病毒科。流感病毒是威胁人类健康的重要病原,其进入宿主体内后,利用宿主的复制和翻译系统完成其生活周期。流感病毒NP蛋白是流感病毒的主要结构蛋白,在病毒的复制和转录中具有重要作用。以
交大许杰:PDL1棕榈酰化修饰及相应的抑制剂开发策略
来自上海交通大学医学院附属仁济医院消化所等处研究人员发表了题为“Inhibiting PD-L1 palmitoylation enhances T-cell immune responses against tumours”的文章,报道了PD-L1的棕榈酰化修饰促进其表达的机制,并设计开发了可
邓子新团队发现DNA第六元素硫
找到对抗艾滋病新方法,新成果将发表于《自然—化学生物学》 DNA是生命的物质基础,科学界以往认为,它是由五种元素——碳、氢、氧、氮、磷构成的四种核苷酸序列。如今,上海交大科研人员发现了DNA的第六元素——硫,硫的“自我修饰”改变了遗传特性。通过“基因药物”干扰病菌DNA的“硫修饰”,有望对抗癌症和
湖北抽检信阳芽毛尖检出水胺硫磷超标
6月20日,湖北省市场监督管理局发布最新一期食品安全抽检信息,组织抽检饼干、茶叶及相关制品、蛋制品、糕点、食盐、保健食品共6类食品281批次,抽样检验项目合格样品280批次,不合格样品1批次。 抽检信息显示,不合格产品为:中百仓储咸宁购物广场有限公司通城店销售的标称武汉陆羽茶业有限责任公司生产的信阳
酰化的概念
如光化学烟雾形成过程中大气中的碳氢化合物经氧化、硝化化及酰化而生成过氧酰基硝酸酯,它们是大气氧化剂污染物。
什么是酰化?
酰化,又称酰基化,酰化作用。是指底物与酰化试剂在一定的条件下将酰基引入底物分子中的过程。酰化试剂的种类比较多,例如羧酸,羧酸酯,酸酐,酰氯等。根据酰化试剂酰化能力的大小选择不同的条件进行酰化反应。酰化之后的产物是酮(醛)、酰胺和酯等化合物,其机理包括双分子亲核取代反应和单分子亲核取代反应。常见的
上海药物所研发新型硫鎓修饰糖肽抗生素
目前全世界每年有70万人死于耐药细菌的感染。万古霉素耐药的金黄色葡萄球菌(VISA,VRSA)和肠球菌(VRE)被世界卫生组织(WHO)列入亟需新型抗生素的12种重要耐药菌之中。 中国科学院上海药物研究所黄蔚、蓝乐夫和宫丽崑研究团队针对耐药菌感染的重大临床需求,积极研发新型糖肽抗生素,在前期研
清华教授发文:首次揭示组蛋白巴豆酰化特异识别机制
生物通报道:组蛋白翻译后修饰是一类重要的表观遗传调控事件,被认为构成一类“组蛋白密码”,控制着染色质层面的遗传信息解读,在基因表达以及细胞命运决定等生命过程中发挥着关键作用。 来自清华大学医学院李海涛研究团队近期在组蛋白翻译后修饰研究领域取得了重要突破:他们通过对表观调控因子AF9和YEATS
大麦基因编辑修饰淀粉研究获进展
近日,四川农业大学小麦研究所郑有良教授团队江千涛教授研究组利用CRIPR/Cas9技术对大麦淀粉合成酶基因SSIIa进行基因编辑,获得了高抗性淀粉大麦新种质,结合酶活、转录组和代谢组学阐明淀粉的特性变化机制,相关成果发表在国际著名学术期刊《碳水化合物聚合物》(Carbohydrate Polymer
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
生物物理所揭示N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能
8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu
用质谱可检测生物体糖蛋白末端唾液酸氧乙酰化修饰
近日,江汉大学研究生吴兆冠的论文《基于基质辅助激光解析电离质谱结合全甲基化和甲胺化衍生测定唾液酸化聚糖的氧乙酰化》(Characterization of O-acetylation in Sialoglycans by MALDI-MS Using a Combination of Methy
巴豆酰辅酶A水合酶CDYL调控组蛋白巴豆酰化影响精子发生
组蛋白修饰是表观遗传学研究的重要方向,其影响了基因的表达调控,和众多生理、病理过程有密切的联系。除了研究较充分的组蛋白乙酰化、甲基化外,景杰生物的科学顾问,芝加哥大学赵英明教授课题组近年来鉴定了八种新型修饰,极大地增加人们对组蛋白修饰的认识,开辟了表观遗传调控的新领域。之后的一系列后续研究表明,
科研人员创造出含有定点共翻译修饰核小体的酵母菌
随着蛋白质谱技术的发展,许多组蛋白赖氨酸残基的酰化修饰被鉴定出来,其中巴豆酰化修饰是一类在酵母、哺乳动物等真核生物中保守存在的组蛋白酰化修饰。自2011年被发现以来,巴豆酰化修饰俨然成为了领域内的研究热点。这是因为该修饰是一种重要的表观遗传机制调节基因转录的翻译后修饰。尽管巴豆酰化和乙酰化基团的
有机磷农药的毒性相关介绍
各品种的毒性可不同,多数属剧毒和高毒类,少数为低毒类。 某些品种混合使用时有增毒作用,如马拉硫磷与敌百虫、敌百虫与谷硫磷等混合剂。 某些品种可经转化而增毒,如1605氧化后毒性增加,敌百虫在碱性溶液中转化为敌敌畏而毒性更大。 有机磷农药(有机磷酸酯类农药)在体内与胆碱酯酶形成磷酰化胆碱酯酶
加拿大提议逐步禁用亚胺硫磷杀虫剂
加拿大卫生部近日提议逐步淘汰亚胺硫磷杀虫剂,主要原因是通过标签管理并不能有效降低这一产品对人类健康的潜在威胁。该提议目前已经进入为期90天的公众评议阶段,加拿大有害生物管理局将在综合评估公众意见后,公布最终决定。 加拿大有害生物管理局(PMRA)称,根据目前获得的信息和最新的风险评估方法,在作
方法优化:双硫磷回收率低怎么办?
在双硫磷的检测中,我们进行了多种不同提取方法实验方案探究。首先我们按标准方法操作:标准中采用猪肉试样称取5g,加入25ml乙腈-甲醇混合液(4:1,v/v),超声20 min。以6000 rpm离心5min,移取上清液于一分液漏斗中。再分别用3×15 mL甲醇洗涤试样三次,洗液与前述上清液合
揭秘阿尔兹海默病患者如何失去对基因活性的控制?
阐明大脑中控制基因活性的分子机制或能帮助理解阿尔兹海默病的发病机理,近日,一项刊登在国际杂志Nature Neuroscience上的研究报告中,来自英国埃克塞特大学的科学家们通过研究揭开了基因活性指示器和阿尔兹海默病的发病关联,相关研究或为后期科学家们开发治疗阿尔兹海默病的新型疗法提供新的思路
关于组蛋白的医学应用介绍
1、预测 最新研究结果显示:组蛋白修饰的整体模式可预测低分级前列腺癌的复发风险。该研究第一作者加利福尼亚大学的Siavash K. Kurdistani表示:这种修饰模式最终可作为前列腺或其他类型癌症的预后或诊断指标,也可作为预测何种患者、患者会对一类o组蛋白去乙酰酶抑制剂新药产生反应的指标。
组蛋白修饰分工调控基因表达水平和基因表达噪音
基因表达过程依赖于转录因子、染色质调控因子和染色质等生物大分子在布朗运动过程中的随机碰撞,因此,即使是基因型和分化类型完全相同的细胞在相同环境下也存在基因表达的差异,被称为基因表达噪音。研究基因表达噪音,对研究干细胞增殖分化、个体发育、病原菌的抗药性以及农作物的稳产有着重要的意义,而其在人类早期
研究证明乙酰化过程与基因转录有重要关联
最近,一个来自格拉德斯通研究所的科学团队对一个最基本的生物学过程——基因转录有了重要发现。 2013年,Gladstone的高级研究员Melanie Ott博士发现,在哺乳动物等复杂生物体的基因转录过程中,聚合酶的调控尾部也会发生另一种称为乙酰化的修饰。然而,到目前为止,没有人知道乙酰化是做什
多组学挖掘进食DNA硫修饰细菌对线虫寿命的影响
近日,Nature系列刊物Communications biology在线发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队的文章“Phosphorothioate-DNA bacterial diet reduces the ROS levels in C. ele
清华Nature子刊发表表观遗传学新成果
生物通报道:高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。 最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu
什么是乙酰化?常见的乙酰化剂
乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应,最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。