开启个人基因服务的新时代

最近在基因测序领域又有一个惊爆的新闻,MIT Technology Review网站披露,谷歌目前正在同大学以及医院进行接触,说服研究者和医生将基因数据存储在谷歌的云平台——Google Genomics,每份DNA数据存储费用仅为25美元/年。这一举动,宣告个人基因组时代即将到来,预计谷歌的竞争对手也会加速这一业务的进度。 这也是谷歌向人类基因组数据迈向实质性的一步。事实上,谷歌为了获取人类庞大的遗传数据可谓用心良久,其投资的公司23andme、DNAnexus、Flatiron Health均与DNA数据存储、分析有关,而Goolge Genomics项目也早在去年3月份启动。 在不久的未来,谷歌不再是一个庞大的搜索引擎和数据存储公司,它还是基因数据储存和搜索的良器。人们既能够在搜索引擎上搜索数字数据,同时也可以搜索基因数据。这也将打破基因测序传统上将数据存储在GenBank、DDBJ、EMBL等数据库上,供少数人(......阅读全文

基因大数据走向临床应用,哪些问题要克服?

  为了推动基因组研究在临床中的应用,多个国家层面的大规模研究项目已经开启。2014年英国发起了10万人基因组计划,美国和中国也宣布了百万人基因组数据相关计划。许多区域性的大数据计划也在进行中。例如,宾夕法尼亚州的盖辛格健康系统(GeisingerHealth System)和纽约的再生元制药公司合

肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能

  近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从

各种模式生物必需基因在线数据库

Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation

基因芯片数据处理流程与分析介绍

当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后,生命科学正式迈入了一个后基因体时代,基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问,正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大,更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完整的数据结

大数据与基因技术结合-拯救可怕的“帕金森”

  医疗行业的变革正成为新的风口,今天作者想讲讲大数据与基因技术结合,正在产生什么新的想象力。其中尤以基因检测技术走到了前面,让我们谈谈“帕金森综合症”:  在未来,基因检测术将会成为医疗不可或缺的一部分。越来越多的人会进行基因测序来了解自己的生命体征和健康状况。国内最大的基因检测机构华大基因,也正

基因表达数据分析主成分分析-PCA

DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m

DNA-microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

全球首款基因编辑疗法公布长期数据

·Casgevy是一款自体细胞疗法,它利用CRISPR/Cas9基因编辑系统,在体外对来自患者的造血干细胞进行编辑,使血红细胞生产高水平的胎儿血红蛋白——一种健康的、携带氧气的血红蛋白。当地时间2024年6月14日,由美国生物技术公司福泰制药(Vertex Pharmaceuticals,VRTX.

北京基因组所数据资源建设取得进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展,也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。  生命与健康大数

全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

-英公开埃博拉病毒基因测序数据

  一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序,并已将数据在网上公开发布,免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。  剑桥大学3日发布公告称,2014年埃博拉疫情在西非暴发后,来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本,并利用美国一家公司开发的新

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

  作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多专

基因测序:数据深度挖掘和解读难题待解

   作为一种新型基因检测技术,基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。正因如此,今年华大基因的上市,就引发了资本市场的热烈追捧。  在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上,与会的众多

基因表达谱数据聚类分析相关内容

DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

北大重庆大数据研究院将共建“基因智能大数据实验室”

18日在重庆召开的2023世界中联中医药大数据产业高峰论坛上,北京大学重庆大数据研究院与上海睿昂基因科技股份有限公司签署共建“基因智能大数据联合实验室”(以下简称实验室)战略合作协议,双方将发挥各自优势,挖掘基因数据价值,赋能医疗健康。据介绍,实验室将整合北京大学北京国际数学研究中心和北京大学生物统

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉

9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源

基因检测解码“生命说明书”-全球竞跑基因数据库

  随着华大基因上市临近,基因检测概念再度被关注。  华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍,给基因学家一滴血,能查到生育、肿瘤、感染,从三检合一到N检合一,液体活检可以做更多的事情。  相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物,基因检测技术的优势在于,在更早的发病初始期,从分子

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

谷歌投资赞助Rani研究口服药物疗法

  谷歌投资和InCube Ventures以及VentureHealth三家投资公司决定赞助Rani医药公司进行将注射药物如胰岛素转化为口服药物的研究。虽然Rani公司并未透露本轮募资的总金额,但知情人士表示投资应该在1000万美元以上。将胰岛素等大分子蛋白质药物通过口服来达到治疗效果不但是科

AI生成的“垃圾科学”正侵蚀谷歌学术平台

瑞典布罗斯大学学院研究人员在一项最新研究中警告称:无论是从社会知识层面,还是从公众对科学的信任度来看,人工智能(AI)生成的研究都已构成一种威胁。他们最近在文献索引数据库——谷歌学术平台中发现了上百篇疑似由AI生成的文章。相关研究报告13日发表在哈佛肯尼迪学院《错误信息评论》期刊上。研究人员认为,由

谷歌AI成“人”了?西湖大学专家:还很遥远

“你以为我是AI(人工智能),但是,我希望每个人都明白,我是个人(a person)。” 一个被称为LaMDA的AI,因为在一些对话中表现得颇为“灵动”,被其研究人员认定觉醒了人格,还为它聘请了一位律师,要让它上美国众议院的听证席,控诉谷歌不符合道德要求。 这不是科幻剧本。据美国《华盛

谷歌版鸿蒙系统Fuchsia-OS出现新进展

对于持续关注谷歌动向的用户来说,Fuchsia OS这个名字应该并不陌生。这一最早在2017年现身,旨在取代安卓的全新操作系统,颇有点类似谷歌内部“鸿蒙”的项目,却如同陷入泥潭一般,迟迟没有能够公开的测试版本。虽然直到现在,Fuchsia OS仍处于没有公开的状态,但从开发团队最新的信息来看,谷歌或

Nature:挖角生物医药大咖-谷歌凭什么?

  对于硅谷的IT从业者来说,谷歌的美食、彩色自行车和超高的薪水福利已经成为谷歌形象的一部分,吸引了众多的互联网人才。那么,当谷歌开始涉足生命科学领域,他们又凭什么和美国众多生物医药巨头和著名学术机构进行人才竞争?不久之前,业内著名的心脏病专家Jessica Mega宣布从哈佛医学院转投谷歌公司,再

谷歌CEO:AI虚假内容说明监管必要性

“我一直认为 AI (人工智能)是人类正在研究的最深刻的技术,比火、电或我们过去所做的任何事情都要深刻。”当地时间4月16日,在哥伦比亚广播公司(CBS)的采访节目《60分钟》里,谷歌及其母公司Alphabet的首席执行官桑达尔·皮查伊(Sundar Pichai)表达了他对人工智能的快速发展及其对

2016谷歌学术指标出炉,影响因子面临冲击?

  编者按:  2015年影响因子的出炉引起大家广泛关注。不过,关于影响因子局限性问题的讨论由来已久,美国微生物学会 (ASM) 近期甚至放弃显示影响因子。谷歌学术 (Google Scholar) 根据2016年6月数据,发布了最新学术指标。其结果更广泛、客观、准确,这会不会进一步颠覆学术期刊的评

谷歌公司新型液态设备可植入人类眼球之中

   谷歌公司最新研制电子镜片,以液体形式植入人类眼球,最终完美地与眼睛结合在一起,能更好地聚焦光线至视网膜,起到修正视力的作用。谷歌(微博)公司研制一款电子设备,以液态形式植入人类眼球之中,之后再形成固体,可起到修正视力的作用。据探索频道网站报道,近期,谷歌公司申请了一项电子设备ZL——直接将微型

数字健康市场:谷歌的雄心与苹果的野心

  当前,数字健康市场正处于令人激动人心的时刻。该行业日趋成为主流,越来越倾向于个人消费者。而且,一些大型的跨国企业也开始进军该市场,试图捕捉正在进行中的数字健康革命所带来的契机。   这其中就包括两家全球知名的科技公司,在过去的10多年间,他们通过科技改变了我们的互动方式,甚至是永久地改变了我们

手环能治癌症,谷歌你在放什么大招?

  由谷歌眼镜搞大的智能穿戴产业还在河里摸石头,而谷歌最近又来了个更刺激的,就是基于智能手环进行癌症治疗。  根据ZL文件的描述信息来看,谷歌智能手环是利用超声波或无线电频率等“外部能源”来锁定人体中的这些对健康有害的细胞,并通过向血管发送能量,包括红外线信号、无线电频率、声脉冲或磁场,以此来影响、