肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从而从更精细的水平观察突变如何协同作用来驱动疾病。因而，相较于常规的基因检测，单细胞测序可以获得更为庞大的细胞遗传信息。 但在单细胞测序领域，如何对这些庞大的细胞遗传信息进行分析仍是一大难题。以免疫细胞T细胞为例，单细胞测序技术可以发现T细胞亚群、不同的T细胞状态、不同细胞亚群的异质性及其潜在效用。这些细胞信息都需要通过生物信息学工具进行分析、整合，才能充分发挥单细胞测序的优势，对庞杂的细胞遗传信息进行更深入的了解。 百奥智汇致力于单细胞测序技术和生物信息技术研究，通过与医院、科研机构以及制药公司合作，挖掘单细胞基因组学和生物信息学......阅读全文
人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗
胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所，是组成免疫系统的重要器官。到目前为止，还不清楚在整个生命过程中，人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究，但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。 由来自VIB炎症研究中心（VIB Center for
单细胞分析技术在肿瘤学中的应用
肿瘤异质性研究：通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞，揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异，为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如，在乳腺癌中，发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变，导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析：了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下多方面的应用：肿瘤细胞异质性研究鉴定肿瘤内不同的细胞亚群，包括具有不同基因突变、转录组特征和表型的细胞。揭示肿瘤细胞之间的差异对肿瘤进展、转移和治疗反应的影响。肿瘤微环境分析解析肿瘤微环境中免疫细胞、基质细胞等的组成和功能状态。研究肿瘤细胞与微环境中其他细胞的相互作用
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例： **案例一：乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析，发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群，这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
Science：构建肿瘤浸润T细胞的泛癌单细胞图谱
靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益，但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润T细胞经常进入功能失调状态，这一现象被广泛称为T细胞衰竭（T cell exhaustion），而效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节，包括调节性T细胞（Treg细胞）的存在。T细胞的状态和
基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱
肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”，不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性，可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中，每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性，肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式（即“代谢重编程”）来适应不同的微环境，以满足其对能量
单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势
单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势包括以下几个方面：多组学整合分析不仅局限于对肿瘤细胞的基因组和转录组测序，还将结合表观基因组、蛋白质组、代谢组等多组学数据，更全面地揭示肿瘤细胞的特征和调控机制。更高的分辨率和精度不断改进技术，以检测更微量的核酸物质，更准确地识别低频突变和罕见的细胞亚群，提高对肿
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下应用：肿瘤发生的早期检测能够追踪肿瘤起始细胞在早期阶段的变化，发现潜在的肿瘤发生标志，从而实现更早期的诊断。肿瘤异质性解析明确肿瘤内部不同细胞在空间位置上的基因表达差异，深入了解肿瘤异质性的形成机制和演化过程。肿瘤微环境研究分析肿瘤微环境中各种细胞（如免疫细胞
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例：乳腺癌研究通过时空分辨单细胞测序，研究人员发现了肿瘤细胞在不同部位的异质性，以及与肿瘤微环境中免疫细胞和基质细胞的动态相互作用。这有助于理解肿瘤的进展和转移机制，并为治疗策略的制定提供依据。黑色素瘤研究该技术揭示了黑色素瘤细胞在原发灶和转移灶中的基因表达
单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱
最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化，给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说，结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤，在某些情况下，会导致完全缓解。 尽管取得了重大进展，但只有少数人从免疫治疗中获益，原因尚不清楚。 免
时空分辨单细胞测序技术如何提高肿瘤研究的准确性？
时空分辨单细胞测序技术可以通过以下几种方式提高肿瘤研究的准确性：精确描绘肿瘤细胞的空间分布能够清晰地展示肿瘤组织中不同类型细胞（如肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞等）在特定区域的分布情况。这有助于了解肿瘤细胞与周围微环境的相互作用，以及它们如何影响肿瘤的生长、侵袭和转移。揭示肿瘤细胞的异质性在不同的空间
单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞
T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群，能够对肿瘤抗原产生反应，肩负着清除肿瘤细胞的重任，也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而，随着肿瘤发展，这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态，“战斗力”大幅下降，被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明，不同癌症的肿瘤微环境对
cell－张泽民团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱
2017年6月15日，北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 -清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Land
单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向
单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一，来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此，我们对该review中的部分内容进行解读和分享。
单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向
单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一，来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此，我们对该review中的部分内容进行解读和分享。
Cell:－中国学者首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱
2017 年 6 月 15 日，北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 -清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为
微流控芯片技术的肺癌循环肿瘤细胞检测及单细胞分析
我国是肺癌高发国家,近十年肺癌的发病率分别占男性和女性恶性肿瘤的第一和第二位,并且发病年龄有下降的趋势。肺癌的死亡率在恶性肿瘤中始终居于首位，根本原因是肺癌的高转移能力。因为肺癌具有极强的侵袭性及转移能力，大多数患者就诊时已处于晚期（III期、IV期），失去最佳的治疗机会。因此，提高肺癌检出率、控制
Nature：开启单细胞病理学新篇章－Hyperion助力临床肿瘤治疗
在临床上，对肿瘤的分类是癌症诊断、判断预后以及治疗方案选择的重要依据。目前这种分类主要是依据肿瘤组织学特征以及少量Marker的表型进行的。近年来，随着单细胞分析技术的发展，肿瘤患者个体间以及个体内普遍存的异质性被不断被揭示出来，这些复杂的单细胞表型及空间信息并未反映在组织学分类中。 近日，来
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针，可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等，如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测；获得单克隆细胞；用于单细胞基因扩增，
循环肿瘤细胞捕获及单细胞分析样机在大连研制成功
由大连医科大学牵头，与中国科学院深圳先进技术研究院等多家单位合作，在国家科技计划支持下，历经三年研发，成功构建了具有自主知识产权的循环肿瘤细胞（circulating tumor cell，CTC）捕获及单细胞分析样机，显示出较好的应用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各类肿瘤细胞的统称，对
单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向（二）
三．残留病变和复发：利用单核分析（冰冻材料）在许多癌症类型中，初始治疗后通常伴随着具有增强的侵袭性和抗药性的复发，突出了残留病变及其进展和生长对于建立复发性肿瘤的重要性。已有的研究比较了原发性和复发性肿瘤，并揭示耐药性的各种遗传原因。未来的研究将扩展这种方法，通过scRNA-seq进行比较，并提供更
单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向（一）
单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一，来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此，我们对该review中的部分内容进行解读和分享。作者
《分析化学》：基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法
肿瘤药敏性检测方法学是抗癌药物评价和筛选的前提，也是临床化疗方案设计的基础。青岛能源所单细胞中心开发了基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法D2O-CANST-R，具有快速、低成本、单细胞器精度、识别耐药细胞、体现抗癌机制、可对接单细胞分选和测序等特色，为癌细胞-药物互作研究、抗癌药物筛选等提供
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月，Namocell与CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞，并且将其进行单细胞测序，为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序（scRNA-s
单细胞分离用于单细胞基因扩增介绍
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针，可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等，如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测；获得单克隆细胞；用于单细胞基因扩增，用
分选率95.2％—循环肿瘤细胞捕获及单细胞分析样机研制成功
由大连医科大学牵头，与中国科学院深圳先进技术研究院等多家单位合作，在国家科技计划支持下，历经三年研发，成功构建了具有自主知识产权的循环肿瘤细胞（circulating tumor cell，CTC）捕获及单细胞分析样机，显示出较好的应用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各类肿瘤细胞的统称，
单细胞分离对单细胞测序领域的作用
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来，然后移到合适的培养基进行培养，分离法对操作技术有比较高的要求，多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞，还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选，对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ （ f.sight ）被开发用于满足这些需求， 它可以柔和地接种单个细胞至微孔，同时记录整个细胞接种过程，提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中，我们开展了六组实验，用无血清培养基
单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法对比
随着监管机构对细胞株开发的要求愈加严格，研究人员被要求开展单细胞克隆并提供细胞株源于单个细胞的证据（ 即单克隆性的证据 ）。 有限稀释是一个普遍接受的建立单克隆性的方法，它基于统计概率因此只有很少一部分（ 10-30% ）的微孔能被接种单个细胞。流式细胞分选是另一种传统的克隆方法，它可以高效地接种单