复旦徐彦辉发现白血病发生关键蛋白工作新机制
复旦大学生物医学研究院研究员、复旦大学附属肿瘤医院双聘教授徐彦辉博士带领其课题组成员博士研究生郭雪、王玲(共同第一作者)等应用X射线晶体学等研究方法,经4年多潜心研究,终于首次发现人体内一种名叫“DNMT3A”蛋白酶在抑制状态和激活状态下的三维晶体结构,并成功揭示了“DNMT3A”蛋白酶是如何在人体基因DNA上精确建立 “甲基化修饰”的机制。该研究对日后设计出可调控“DNMT3A活性”的药物,用以治疗白血病等有重大意义。11月10日国际顶级学术期刊《自然》(Nature)在线发表这一重要成果,引起世界同行高度关注。 据悉,人体基因组DNA是生命遗传信息的基本载体,生命延续和繁衍需要DNA上的一种“甲基化修饰” ,“DNMT3A”是一种存在于人体内的蛋白酶,它就具有在DNA基因上建立“甲基化修饰”的特殊本领。“甲基化修饰”具有调控人体内特定基因的表达和决定细胞命运的作用,可使细胞发生程序化的改变,在人体发育过程中有......阅读全文
我科学家成功解析MLL家族蛋白复合物结构
中科院上海生科院生化与细胞所国家蛋白质科学中心(上海)雷鸣、陈勇研究组和中科院大连化学物理研究所李国辉研究组近日成功解析出甲基转移酶MLL家族蛋白复合物的结构,并阐释了其活性调控的分子机制。国际学术期刊《自然》2月18日以长文形式在线发表该成果。 以基因组DNA和组蛋白的共价修饰为主要标志的表
关于乳铁蛋白酶活性的介绍
乳铁蛋白可在某些催化反应中充当酶的功能。乳铁蛋白和核糖核酸酶A之间的某些基序有显著相似性。乳铁蛋白具有DNA结合特征,并可以在特定DNA序列的转录激活中发挥作用或作为信号转导介质。在所有的牛乳蛋白中,乳铁蛋白具有最高的淀粉酶和ATP酶活性,然而,它们并不是唯一的酶促活性。乳铁蛋白表现出的各种各样
角蛋白酶的活性测定方法介绍
角蛋白不溶于水及大部分有机溶剂,使得角蛋白酶活性测定比一般蛋白酶困难。常用测定角蛋白酶的原理是以底物水解后释放的氨基酸的量来确定角蛋白酶的活性。目前测定角蛋白酶的方法主要有三种,一种是直接用角蛋白粉作为底物进行测定,涂国全等(1998)曾以羽毛粉作为测定角蛋白酶的底物[59]。第二种是使用经过修
木瓜蛋白酶的酶活性的测定
本方法仅适用于木瓜蛋白酶。 基本原理木瓜蛋白酶能使N-苯甲酰-L-精氨酸乙酯(底物)水解而释出N-苯甲酰-L-精氨酸,其释出量可用氢氧化钠液滴定,以此确定酶活力。酶活单位在25℃下,每分钟内能催化分解1umol底物的酶量,称为1单位。试液制备1、底物溶液:准确称取N-苯甲酰-L-精氨酸乙酯盐酸盐1.
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)
甲基化是目前的研究热点,就我所做的一点工作并其中一点心得,与大家分享。希望能够对大家有所帮助。 第一部分 基因组DNA的提取。 这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应
不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEA
Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A
说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN
多肽稳定标同位素记技术与甲基化修饰技术
1. 多肽稳定标同位素记技术 随着多肽在生物医药领域越来越广泛和深入的应用,标记和修饰性的多肽种类的需求越来越多,质量需求也越来越高。稳定同位素标记(同位素示踪法)就是其中典型的一种。稳定同位素标记多肽是指用稳定同位素标记的氨基酸合成的多肽。与标准氨基酸相比,同位素标记是指用2H,13C或1
研究发现DNA甲基化修饰精准调控植物生物钟周期
生物钟通过协调细胞内代谢和生理活动的节律性以适应由地球自转而产生的昼夜光温周期性变化,为植物生长发育提供适应性优势。在多种真核生物中均已发现组蛋白修饰可参与调控生物钟周期,但DNA甲基化作为表观修饰的另一重要类型,是否参与以及如何调控真核生物的生物钟尚不清楚。 中国科学院植物研究所研究员王雷研
Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰-m1A
说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN
关于组蛋白修饰的方式—甲基化的基本信息介绍
组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histonemethyl transferase,HMT)完成的。甲基化可发生在组蛋白的赖氨酸和精氨酸残基上,而且赖氨酸残基能够发生单、双、三甲基化,而精氨酸残基能够单、双甲基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修饰和调节基因表达的复杂性。甲基化的作用
高静压诱导马铃薯蛋白结构修饰及其抗氧化活性研究
高静压诱导马铃薯Patatin蛋白结构修饰及其抗氧化活性研究 中国农科院供图 中国农业科学院农产品加工研究所薯类加工与品质调控创新团队研究发现,高静压处理会改变马铃薯Patatin蛋白的结构、提高其抗氧化能力。相关论文发表于Molecules。 我国是世界上最大的马铃薯生产国,其产量约占世界总产
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(一)
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)2
此步细节:1:在使用注射器时,一定要用力均匀且轻,如使用暴力,会将小柱内的薄膜挤破,失去作用。2:乙酸铵、糖原不需新鲜配制,糖原配好后放在-20度保存,乙酸铵室温即可,因为这样浓度的乙酸铵非常难溶,一旦放在4度,取出用时也会有很多溶质析出。3:异丙醇、70%乙醇都不需要新鲜配制,但如果用量大,现场配
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)
那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢? 首先,提取病毒RNA 无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
研究揭示叶绿体核糖体RNA甲基化修饰的机制和功能
核糖体RNA(rRNA)的甲基化修饰是生物界中普遍存在的一种转录后修饰机制,可以改变rRNA分子的局部空间结构,从而优化核糖体的蛋白翻译效率。不同物种之间的rRNA甲基化程度存在明显差别,是rRNA进化的标志性事件之一。叶绿体是高等植物中重要的细胞器,由蓝细菌经过内共生过程演化而来,具有自己的核
我国首次发现RNA甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟
我国科研人员在国际上首次发现脊椎动物的配子成熟需要甲基转移酶mettl3催化的m6A甲基化修饰,从而揭开了该甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟这一此前尚未为人所知的秘密。(2018(第二届)模式动物与重大疾病动物模型研究与应用研讨会) 记者13日从中国科学院水生生物研究所了解到,该所科研人员以模
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)(2)
第三部分 修饰后DNA纯化回收EP管如无特别说明均为高压蒸汽灭菌的。1. 将移液器枪头伸入石蜡油层下,先轻轻加压使其中一小段石蜡油排出,然后吸取混合液至一洁净1.5mlEP管中。2:以下使用Promega Wizard Cleanup DNA纯化回收系统(Promega,A7280)1)70℃水浴预
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)1
第一部分 基因组DNA的提取。这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋
6mA甲基化修饰调控工业微藻油脂合成过程揭示
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初级生产力中贡献卓著,是颇有前景的合成生物学底盘细胞。为了探索工业固碳产油微藻的表观遗传机制和生理作用,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以海洋微拟球藻为模式,解析了野生型和6mA扰动突变株中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,6
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(三)
随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性 如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用,我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒(OP-0002),该试剂盒可以快速提取核蛋白,同时可确保提取后的酶活性保持完整。 收集了核提取物后,进行甲
二价离子抑制胰蛋白酶活性吗?
二价离子的确抑制胰蛋白酶活性。EDTA用来螯合游离的镁离子和钙离子,以便保持抑制胰蛋白酶的活性。建议胰蛋白酶处理细胞前,用EDTA清洗细胞,以消除来自培养基中所有的二价离子。
胰蛋白酶的化学结构如何影响其活性?
活性中心:胰蛋白酶的活性中心位于其氨基酸序列中的Cys残基和His残基之间。这两个残基通过形成氢键来稳定一个称为“酶-底物复合物”的结构。这种结构使得胰蛋白酶能够准确地识别并切割底物中的特定肽键。 电荷分布:胰蛋白酶分子中的氨基酸残基带有不同的电荷,这有助于它与带电的底物分子相互作用。例如,胰
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(
酶的活性调节方式
酶的活性可以通过以下几种方式进行调节:一、酶活性的别构调节概念:别构酶具有别构效应,即一些小分子化合物与酶蛋白分子活性中心以外的某一部位特异结合,引起酶蛋白分子构象变化,从而改变酶的活性。调节方式:别构激活:使酶活性增强的效应。通常由底物或底物以外的别构激活剂引起。别构抑制:使酶活性降低的效应。可由
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:R
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。 近三个月高分文章部分列表: 2月28日
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。 近三个月高分文章部分列表: 2月28日
PLOS-Genetics:甲基转移酶OsFIP在植物早期孢子发生的作用
N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化在不同物种的发育过程中起重要作用。然而,单子叶植物中m6A RNA甲基化的知识仍然有限。2019年5月22号,中山大学陈月琴 、张玉婵研究团队等人在PLOS Genetics上在线发表了题为The subunit of RNA N6-methyladenosi