复旦徐彦辉发现白血病发生关键蛋白工作新机制

复旦大学生物医学研究院研究员、复旦大学附属肿瘤医院双聘教授徐彦辉博士带领其课题组成员博士研究生郭雪、王玲(共同第一作者)等应用X射线晶体学等研究方法,经4年多潜心研究,终于首次发现人体内一种名叫“DNMT3A”蛋白酶在抑制状态和激活状态下的三维晶体结构,并成功揭示了“DNMT3A”蛋白酶是如何在人体基因DNA上精确建立 “甲基化修饰”的机制。该研究对日后设计出可调控“DNMT3A活性”的药物,用以治疗白血病等有重大意义。11月10日国际顶级学术期刊《自然》(Nature)在线发表这一重要成果,引起世界同行高度关注。 据悉,人体基因组DNA是生命遗传信息的基本载体,生命延续和繁衍需要DNA上的一种“甲基化修饰” ,“DNMT3A”是一种存在于人体内的蛋白酶,它就具有在DNA基因上建立“甲基化修饰”的特殊本领。“甲基化修饰”具有调控人体内特定基因的表达和决定细胞命运的作用,可使细胞发生程序化的改变,在人体发育过程中有......阅读全文

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

复旦徐彦辉发现白血病发生关键蛋白工作新机制

  复旦大学生物医学研究院研究员、复旦大学附属肿瘤医院双聘教授徐彦辉博士带领其课题组成员博士研究生郭雪、王玲(共同第一作者)等应用X射线晶体学等研究方法,经4年多潜心研究,终于首次发现人体内一种名叫“DNMT3A”蛋白酶在抑制状态和激活状态下的三维晶体结构,并成功揭示了“DNMT3A”蛋白

最新进展:RNA的甲基化与去甲基化修饰

  德国慕尼黑的路德维希-马克西米利安大学(LMU)研究人员发现了细菌RNA中一种新型的化学修饰形式。显然,只有当细胞处于应激状态时,这种修饰才会附着在分子上,并且在恢复过程中会迅速去除。  核糖核酸(RNA)在化学形式上与DNA密切相关,而DNA是所有细胞中遗传信息的载体。实际上,RNA本身在将遗

钙蛋白酶的活性调节

激活调节细胞中钙蛋白酶活性受到Ca2+和钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin)、钙蛋白酶激活蛋白(calpain activator)的调节,其中calpain activator是calpain的正调节因子。提高Ca2+浓度,钙蛋白酶的活性增强,Ca2+浓度进一步提高将导致构象变化而表现蛋白水

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化

亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较

修饰性甲基化酶的基本信息

中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定  义编号:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上,从而保护该酶切位点,使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学(

修饰性甲基化酶的基本信息

中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定  义编号:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上,从而保护该酶切位点,使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学(

拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展

  3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha

组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系

在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—

研究揭示蓝细菌中赖氨酸甲基转移酶的作用机制

  蛋白质翻译后修饰通过在一个或几个氨基酸残基上加上化学修饰基团而改变蛋白质的结构和功能,参与蛋白质的活性状态、定位、折叠以及蛋白质-蛋白质间相互作用。赖氨酸甲基化是常见的蛋白质翻译后修饰类型之一,其调控机制复杂,在生命调控过程中的地位较为重要,尤其在真核生物中的组蛋白上发生的甲基化修饰,对异染色质

胃蛋白酶的活性如何调节?

  胃蛋白酶的活性可以通过多种方式进行调节。首先,胃蛋白酶原在酸性环境下被激活成为胃蛋白酶,而胃蛋白酶的活性可以被胃酸的浓度所影响。其次,胃液中的黏液可以保护胃黏膜免受胃蛋白酶的损伤,从而间接地调节胃蛋白酶的活性。此外,胃液中的其他物质,如胃泌素和抑胃肽等,也可以影响胃蛋白酶的分泌和活性。最后,一些

表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(一)

DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-

2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总

  感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!光阴如梭,一年转瞬又将成为历史,新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战,决心再接再厉,更上一层楼。回首即将过去的2019,云序生物不断创新,硕果累累;展望2020,任重道远却信心倍

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的介绍

  DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基

DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰

DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一,是正常发育、分化所必需的,具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)

表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(二)

3、数据分析标准分析:(1)DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p

简述组蛋白修饰种类、位点及其意义

1、种类:染色质的共价修饰主要是组蛋白的修饰。2、组成核小体的组蛋白八聚体的组蛋白H3和H4是蛋白酶修饰的主要位点。3、意义:Mi22NHRD由核心(HDAC1、HDAC2、RBAP46öRBAP48)+Mi2、MTA1öMTA2、MBD3组成,其中MBD3含有MBD样序列,与甲基化DNA有低亲和力

丝氨酸蛋白酶活性的调节方式

酶原激活酶原是酶的通常无活性的前体。如果消化酶在合成时活跃,它们会立即开始咀嚼合成器官和组织。急性胰腺炎就是这样一种情况,其中胰腺中的消化酶过早激活,导致自我消化(自溶)。它还使死后调查复杂化,因为胰腺通常会在进行肉眼评估之前自行消化。酶原是大的、无活性的结构,能够分解或变成较小的活化酶。酶原和活化

角蛋白酶的活性测定方法

活性测定方法角蛋白不溶于水及大部分有机溶剂,使得角蛋白酶活性测定比一般蛋白酶困难。常用测定角蛋白酶的原理是以底物水解后释放的氨基酸的量来确定角蛋白酶的活性。目前测定角蛋白酶的方法主要有三种。一种是直接用角蛋白粉作为底物进行测定,涂国全等(1998)曾以羽毛粉作为测定角蛋白酶的底物。第二种是使用经过修

丝氨酸蛋白酶活性的调节方法

宿主生物必须确保丝氨酸蛋白酶的活性得到充分调节。这是通过对初始蛋白酶激活和抑制剂分泌的要求来实现的。酶原激活酶原是酶的通常无活性的前体。如果消化酶在合成时活跃,它们会立即开始咀嚼合成器官和组织。急性胰腺炎就是这样一种情况,其中胰腺中的消化酶过早激活,导致自我消化(自溶)。它还使死后调查复杂化,因为胰

菠萝蛋白酶的活性成分及性状

主要活性成分本品系从菠萝皮、茎、芯中提取制备的蛋白水解酶,按干燥品计算,每1mg的效价应不少于800单位。 [3] 性状本品为浅黄色或浅棕黄色粉末。本品在水中大部分溶解,在甲醇、乙醚和氯仿中几乎不溶。 [3] 鉴别取本品约10mg,置大试管中,加水2ml混匀,加20%脱脂奶粉(取脱脂奶粉20g,加水

如何检测丝氨酸蛋白酶的活性?

  检测丝氨酸蛋白酶活性通常涉及几种不同的实验方法。  首先,可以使用光谱法来监测底物在丝氨酸蛋白酶作用下的分解情况,因为丝氨酸蛋白酶的活性会导致底物特定光谱性质的改变。  其次,荧光共振能量转移(FRET)技术可以用来检测丝氨酸蛋白酶与其特异性底物之间的相互作用,并量化酶的活性。  此外,基于色谱

小小甲基化修饰让小菜蛾“百毒不侵”

  小菜蛾作为一种世界性为害的重大农业害虫,也是世界上第一个被报道在田间对Bt生物杀虫剂产生高抗性的农业害虫。  小菜蛾能在不影响其自身生长发育的前提下对Bt杀虫剂进化出完美的高抗性。  近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所(以下简称蔬菜所)研究员张友军团队解析了小菜蛾Bt抗性的适合度代价补偿机制,首

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚(氢醌)亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul; 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH;  3. 42℃水浴30min; 水浴期间配制: 4.10mM对苯二酚(氢醌)

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA

亚硫酸氢盐修饰后测序法甲基化检测

第一部分 基因组DNA的提取这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白

看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用

如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R

关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的程序介绍

  1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能

亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化

DNA甲基化             实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以