首次测定南极抗冻鱼基因组序列

近,包括美国东北大学H. William Detrich教授在内的一个国际研究小组,首次测定了南极抗冻鱼(Antarctic notothenioid fish)的基因组序列。他说,这一突破性成果,将阐明动物对寒冷水域独特的进化适应性,将有助于揭示鱼类如何应对海水温度上升,由于气候变化,预计接下来的两个世纪会出现海水温度上升。 Detrich是东北大学海洋科学中心的海洋分子生物学和生物化学教授,他与韩国、澳大利亚以及俄勒冈几家机构的研究人员共同合作,将相关研究结果发表在最近的《Genome Biology》杂志。 Detrich指出,抗冻鱼大约有100个物种,在过去4000万年里它们已经适应了南冰洋低至冰点的零下20摄氏度水温。虽然许多其他鱼类逃至温暖水域,但抗冻鱼依然保留在原地。由于具有更少的食物竞争,因此这一物种的种群和物种数量增加,这一过程被称为适应辐射(adaptive radiation)。 通过测定南极大头......阅读全文

北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库

  随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构

刘少军教授团队揭示了人工异源四倍体鱼基因组

9月14日,中国工程院院士、湖南师范大学省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室主任刘少军教授团队在《BMC生物学》(BMC Biology)上在线发表论文,揭示了人工异源四倍体鱼的基因组。刘少军为通讯作者,湖南师范大学副教授任力、高鑫博士、崔佳琳博士、张纯教授和北京百迈客生物科技有限公司戴鹤为该文

冻干技术原理之预冻阶段

预冻就是将溶液中的自由水固化,赋予干后产品与干燥前相同的形态,防止抽空干燥时起泡、浓缩和溶质移动等不可逆变化发生,尽量减少由温度引起的物质可溶性减少和生命特性的变化。 1、 预冻的方法 溶液的预冻方法有两种:冻干箱内预冻法和箱外预冻法。箱内预冻法是直接把产品放置在冻干机内的多层搁板上,由冻干机的冷冻

我国科学家完成大黄鱼全基因组序列图谱绘制

  浙江省科技厅、上海市科委30日在浙江省舟山市共同宣布,来自浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等院所的科学家已绘制完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱。   据介绍,这是我国科学家完成的第二个鱼类基因组序列图谱,也是世界上首个石首鱼科鱼类基因组序列图谱。   大黄鱼属硬骨鱼

斑马鱼早期临床前筛选揭示:候选抗炎治疗剂TnP的安全性

斑马鱼毒理学临床前筛选除了具有形态学特征的优点外,与其他替代性试验相比,还具有保守生理和代谢功能。MS研究的挑战之一是了解髓鞘再生过程的缺点以及制定恢复髓鞘再生的策略。我们的研究小组开展了一项大型研究,证明TnP对于开发有效的药物控制MS神经炎症和预防脱髓鞘具有重要的特性。我们发现皮下TnP治疗(预

斑马鱼早期临床前筛选揭示:候选抗炎治疗剂TnP的安全性

斑马鱼毒理学临床前筛选除了具有形态学特征的优点外,与其他替代性试验相比,还具有保守生理和代谢功能。MS研究的挑战之一是了解髓鞘再生过程的缺点以及制定恢复髓鞘再生的策略。我们的研究小组开展了一项大型研究,证明TnP对于开发有效的药物控制MS神经炎症和预防脱髓鞘具有重要的特性。我们发现皮下TnP治疗(预

Nature:解析腔棘鱼基因-一窥生物演变

  近日,生物学家表示,已解开“活化石”腔棘鱼的DNA谜团,这种鱼隐藏的古老身世,将有助科学家了解数亿年前生物如何从海洋前进陆地。生物学家分析腔棘鱼的基因组后发现30亿个DNA“码”,数量与人类相当。研究结果刊载于英国《自然》(Nature)期刊。   此一基因蓝图几亿年来出乎意料地改变甚少,显示

GenBank数据库概述(四)

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由

海洋鱼类的恒温演化与环境适应机制获揭示

近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员林强团队联合厦门大学环境与生态学院教授王大志团队、德国康斯坦茨大学教授Axel Meyer等合作,研究揭示海洋鱼类的恒温演化与环境适应机制。相关研究发表于Cell集团旗下国际综合刊物《创新》(The Innovation)。 在

“土著”鱼发烧友罗昊:追寻原生鱼踪迹

  对于很多人来说,中国原生鱼是个陌生的概念。中国原生鱼,泛指中国本土区域以内的土著鱼种。中国幅员辽阔,水系纵横,孕育着多样性丰富的原生鱼资源。但它们得到的关注度却不算高,即使在博物爱好者中,喜欢鱼类的也只占一小部分,而且众多鱼友们又以偏爱热带观赏鱼者居多。  不过,在国内也有相当一批原生鱼发烧友,

鱼糜凝胶强度如何测定?鱼糜弹性如何测?

研究背景中国是世界水产加工大国,渔业资源十分丰富。对于鱼类资源的高效化利用,鱼糜及其制品加工是恰到好处的方式。鱼肉深加工成鱼糜制品,契合人们营养健康消费需求,推动了中国现代农业产业化发展的速度。面对巨大的市场流通量,人们日益增强的食品安全意识,完善的品质评价方法也在逐步建立。目前,评价鱼糜及其制品品

真骨鱼类全基因组加倍后重复基因进化研究引起关注

  基因和基因组加倍在进化过程中起了重要作用。1970年,Ohno提出脊椎动物进化早期的两次基因组加倍导致了脊椎动物基因组大小和复杂性的增加,同时也为脊椎动物的进化多样性提供了基础。大量的比较基因组学研究显示,真骨鱼类还经历了第三次基因组加倍,这一加倍被称为鱼类特有的基因组加倍。然而,在物种形成过程

千年基因与中国西南野生生物种质资源库携手合作

  近日,千年基因与中国西南野生生物种质资源库建立密切的科研合作,植物种质资源与基因组研究中心主任高立志研究员将与千年基因共同开展大规模的植物全基因组测序,旨在揭示物种的遗传信息,并促进中国西南地区珍稀种质资源的保护及重要经济作物的研究利用。   中国西南野生生物种质资源库依托于中国科学院昆明植物

最新发现:华南近海发现鱼类新种

中国科学院南海海洋研究所研究员林强团队在海龙目鱼类资源与分类领域取得新进展,基于近岸海龙目鱼类资源调查和系统分类研究,在我国南海和东海近岸海域发现了2个海蛾鱼新种,分别命名为南海海蛾鱼(Spinipegasus nanhaiensis sp. nov.)和中华海蛾鱼(Pegasus sinensis

冻干机冻干一般要冻多久

冻干机的整个冻干过程都是在低温低压环境下进行,冻干方式能有效地保留冻干产品的热敏性成分及原有生物特性。冻干过程是一个由低温逐渐缓慢升温的过程,如果升温过快、温度过高,容易导致最终冻干产品外观崩塌、品相不佳,冻干过程分为:预冻、升华干燥、解析干燥等三个阶段。因此冻干一次一般需要24小时左右,具体冻干产

影响冻干技术冻干时序的因素

  产品的品种:产品不同则共熔点亦不同,共熔点低的产品要求预冻的温度低;加热时板层的温度亦相应要低些。有些产品受冷冻的影响较大,有些产品则影响较小;一般细菌性的产品受冷冻的影响较大,病毒性的产品受冷冻的影响较小。要根据试验找出一个产品的最优冷冻速率,以获得高质量的产品和较短的冷冻干燥时间。另外产品不

冻干技术冻干曲线关键数据解析

定冻干曲线和冻干时序主要确定下列数据:预冻速率预冻速率的快慢,对产品冻结中晶粒的大小、活菌的存活率和升华的速率均有直接的影响。一般来说,慢冻晶粒大,产品外观粗糙、不容易损伤活菌,但升华速率快,而速冻则与此相反。通常冻干机是不能调节冻结速率的。如需冻结得快一些,则先将干燥室(箱)预冷至较低温度,再将制

蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成

  内蒙古农业大学和深圳华大基因研究院8月9日在呼和浩特市联合宣布,蒙古羊、蒙古牛、蒙古马和阿拉善双峰驼全基因组序列图谱绘制完成。这是我国科学家首次独立完成蒙古高原物种全基因组序列图谱,标志着我国地方畜种研究进入基因组水平。  蒙古羊、蒙古牛、蒙古马、阿拉善双峰驼是我国古老的原始品种和畜牧

对某一个物种的基因组测序大概花多少钱

要根据基因组的大小决定的。而且选择测序的仪器也有区别。您如果自己购买仪器测序价格自然又有不同了。比如测一个5M的基因组,基本上用第二代测序仪器一个run即可完成,大概需要15万RMB

鱼纲分类实验

实验方法原理1.  熟悉鱼类各主要目的特征;2.  认识常见代表种和有经济价值的种类; 3.  学习鱼纲的分类方法。实验材料鱼类标本仪器、耗材解剖盘解剖器测量尺实验步骤一、鱼类的一般测量和常用术语全长:自吻端至尾鳍末端的长度。体长:自吻端至尾鳍基部的长度。体高:躯干部最高处的垂直高。头长:由吻端至鳃

水生所——跨亚科鱼类基因编辑配子“借腹生殖”研究获进展

  精原干细胞(Spermatogonial stem cells,SSCs)是成体雄性性腺中具有自我更新和分化潜能的一类生殖干细胞。利用精原干细胞移植(Spermatogonial stem cell transplantation, SSCT)技术,有可能实现跨个体甚至是跨物种的“借腹生殖”,也

science:科学家发现突变体鱼对有毒废弃物有高度耐受性

  研究者们最近在美国东部海岸发现了一类发生突变的鱼类,该种鱼抵抗有毒废弃物的能力是正常的鱼类的8000多倍。  这些条纹状的"荫鱼",或者叫鳉鱼,常常居住在高度污染的水域,比如新泽西的Newark以及弗吉尼亚的Elizabeth流域。如今,科学家们发现其在发生了极度地突变之后能够适应当地的污染废弃

我国南海和东海近岸海域发现2个海蛾鱼新种

南海海蛾鱼(Spinipegasus nanhaiensis sp. nov.)。王信 供图 近日,中国科学院南海海洋研究所研究员林强团队在海龙目鱼类资源与分类领域取得研究新进展。他们基于近岸海龙目鱼类资源调查和系统分类研究,在我国南海和东海近岸海域发现2个海蛾鱼新种,分别命名为南海海蛾鱼

中国学者9月参与发表多篇Nature文章

  进入九月份,中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中主要包括首次发现初始全颌鱼(Entelognathus primordialis),昼夜温度逐年变化对于植物生长和碳循环的影响,以及多项基因组测序研究新成果。   首先中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的研究人员在

科学家解释野生鱼与养殖鱼有何不同

  美国研究人员确定,野生鱼与处于养殖环境的同类鱼相比,在脱氧核糖核酸(DNA)层面,会有令人惊异的差异。   这项研究由俄勒冈州立大学与州政府鱼类和野生动物部门联手,涉及名为“硬头鳟”的三文鱼品种,确定野生鱼与第一代网箱养殖鱼相比,超过700个基因的活性存在差异。   研究人员发现,第一代网箱养殖

冻干工艺

冻干工艺不同于以上的干燥方法,产品的干燥基本上在0℃以下的温度进行,即在产品冻结的状态下进行,直到后期,为了进一步降低产品的残余水份含量,才让产品升至0℃以上的温度,但一般不超过40℃。冻干工艺就是把含有大量水分物质,预先进行降温冻结成固体,然后在真空的条件下使固态水直接升华出来,而物质本身剩留在冻

细菌类组蛋白HNS翻译后修饰研究取得进展

  基因组压缩与动态调控是生命体共通的科学问题。细菌缺乏真核生物核小体结构,依赖H-NS等核结合蛋白实现基因组的压缩与调控功能。H-NS可沉默原噬菌体、毒力岛等外来基因元件,维持基因组稳定性。此前研究发现,细菌能在特定环境下解除H-NS的沉默并激活外源基因表达,这一过程是细菌环境适应的关键过程。但细

美研究发现全球海洋中存在多种虎鲸

      美国研究人员日前在《基因组研究》杂志上报告说,他们对虎鲸线粒体脱氧核糖核酸测序后发现了至少3个新的虎鲸物种,这也表明全球海洋中存在不止一种虎鲸。       由于行为、捕食以及身体特征方面有所不同,研究人员一直怀疑虎鲸并非只有一种。但由于未能对虎鲸进行全基因组测序,他们的怀疑此前未能

4月25日《自然》杂志内容精选

  验证量子性的经典方法   与量子系统所发生的实验相互作用是有限的,也是有必要如此的,那么是否有可能控制和命令这样的系统?Ben Reichardt等人参考量子计算和密码学(它们都涉及不完美模拟的或“不可信的”系统)来探讨关于量子力学的这一基础哲学问题。他们描述了一个能对大型量子系

SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略

大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(