Nature:解析腔棘鱼基因一窥生物演变
近日,生物学家表示,已解开“活化石”腔棘鱼的DNA谜团,这种鱼隐藏的古老身世,将有助科学家了解数亿年前生物如何从海洋前进陆地。生物学家分析腔棘鱼的基因组后发现30亿个DNA“码”,数量与人类相当。研究结果刊载于英国《自然》(Nature)期刊。 此一基因蓝图几亿年来出乎意料地改变甚少,显示这是研究员所研究过最成功的物种之一。 麻省理工学院-哈佛大学布洛德研究所(Broad Institute of MIT and Harvard)的艾佛迪(Jessica Alfoeldi)表示:“这些基因的演变速度,比我们所观察的其他鱼种及陆地脊椎生物慢许多。” 腔棘鱼是现今仍存在最古老的物种之一,生存于南非外的深海,印尼海岸外也能发现腔棘鱼的同类鱼。这种灰褐色的鱼种身长可达2公尺,重达91公斤。 最有趣的特点之一,是腔棘鱼拥有形如肺叶般的鳍。 科学家因此揣测,腔棘鱼是会利用短而粗鱼鳍帮助它们在水中前进的鱼......阅读全文
“活化石”腔棘鱼基因组被破译
生活在非洲东部近海以及印度尼西亚近海的腔棘鱼素有“活化石”之称,被认为与陆地上行走的四足动物及人类的远祖有亲缘关系。日前这种“活化石”的基因组被日本科研人员破译完毕。 日本东京工业大学等机构参与的一个国际研究小组,22日在新一期美国期刊《基因组研究》上报告说,他们分别对生活在非洲东部坦桑尼
“活化石”腔棘鱼可以活到100岁
很少有动物活的和人类一样长。但西印度洋腔棘鱼(矛尾鱼)可能是一个罕见的例外。这是一种濒临灭绝的鱼类,它可以长达2米、重达100公斤。一项新研究发现,这种“水下巨兽”可能会活到100岁。日前,相关研究发表于《当代生物学》。 为了算出这个数字,研究人员计算了保存在法国博物馆的腔棘鱼鳞片上的微小环状
日本研究人员解读“活化石”腔棘鱼全部染色体组
日本研究人员日前成功解读了有“活化石”之称的腔棘鱼的全部染色体组,由此发现腔棘鱼具有与哺乳类和爬虫类等陆地动物相同类型的基因,属于鱼类进化到陆地动物的中间类型。这一发现有助于弄清动物由海洋向陆地进化的过程。 腔棘鱼是一种活动灵活、鳍呈肢状的肉食鱼类,约3.6亿年前就已在地球上出现,被认为与
Nature:解析腔棘鱼基因-一窥生物演变
近日,生物学家表示,已解开“活化石”腔棘鱼的DNA谜团,这种鱼隐藏的古老身世,将有助科学家了解数亿年前生物如何从海洋前进陆地。生物学家分析腔棘鱼的基因组后发现30亿个DNA“码”,数量与人类相当。研究结果刊载于英国《自然》(Nature)期刊。 此一基因蓝图几亿年来出乎意料地改变甚少,显示
10年努力,Nature发布基因组里程碑式成果
腔棘鱼,是一种具有历史意义的鱼类,有着让人感兴趣的过去。现在科学家们完成了对它的基因组测序,从而为人们了解从水生环境到陆地适应所发生的遗传改变提供了丰富的信息。这一里程碑式的基因组研究论文被选作封面文章发表在4月18日的《自然》(Nature)杂志上。 该研究的领导者、美国Benaroya
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者: 种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae) 基因组:~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
研究发现2.49亿年前新属种鱼化石
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所徐光辉研究员率领合作研究团队,最近在安徽省马鞍山市和县早三叠世海相沉积地层发现两块保存精美的、约2.49亿年前的鱼化石标本,经详细对比研究,确认其属于腔棘鱼目怀特鱼科,并建立怀特鱼属一个新种命名为安妮怀特鱼。创造亚洲首次和亚洲最早两项纪录徐光辉研究员10月21日在北
科摩罗国家馆日:生态旅游展现巨大潜力
上海世博会今天迎来科摩罗国家馆日。科摩罗副总统兼农业、渔业、环境、能源、工业和手工业部部长伊迪・纳杜瓦姆与我国农业部副部长张桃林出席官方仪式并致辞。留学上海的科摩罗留学生们为来宾献上了极具非洲风情的舞蹈。 今天是科摩罗独立35周年纪念日,中国是第一个承认并与科摩罗
破解-“活化石”——银杏基因组
近日,开放期刊GigaScience发表论文介绍现存的最古老的树种——银杏的基因组。该研究由华大基因、浙江大学和中国科学院的科学家团队完成,研究人员从头组装并分析了这个超大(>10G)的基因组。银杏被认为是“活化石”,也就是说从出现到现在的2.7亿年生存史中,它的形式和结构的变化都非常小。银杏如
云南孔骨鱼化石:肉鳍鱼类起源中国说再获验证
最早的现代型空棘鱼——云南孔骨鱼复原图Brian Choo绘 作为肉鳍鱼类的一支,空棘鱼与陆生脊椎动物有着密切的亲缘关系,在四足动物起源研究中扮演着关键的角色。 中科院古脊椎动物与古人类研究所研究员朱敏等人,在云南昭通早泥盆世布拉格期地层中,发现了迄今为止最早的空棘鱼化石——云南
阿洛酮糖在植物培养行业的应用
阿洛酮糖这类稀少糖不只是对动物产生作用,研究表明它对植物也具有很大的影响。香川大学农学部正在进行用多少稀少糖可以诱导并发现水稻等作物防御病虫害基因的研究,以及发现它是否具有调节植物生长作用的研究。并且正在开发可以诱导植物耐病性和生育调节的材料,同时正在研究他们的利用方法。为了具有实用性,香川大学正在
Nature子刊发表虹鳟鱼基因组测序
法国国家农业研究院的Yann Guiguen领导跨国研究团队,对虹鳟鱼基因组进行了测序,并将结果发表在本周的Nature Communications杂志上。解读这种生物的遗传学信息,可以帮助人们进一步理解脊椎动物的进化。 在大约一亿年前,虹鳟鱼发生了一次罕见的基因组加倍,研究人员通过
The-scientist:2013年度最热基因组
新的一年即将来临,The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究,让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。 斑马鱼基因组 种属:Zebrafish, Danio rerio 基因组大小:~1.41 billion base pairs 斑马鱼(Da
国际最新研究揭示长棘毛唇隆头鱼如何感知肤色变化
施普林格·自然旗下学术期刊《自然-通讯》最新发表一篇生态学论文称,研究人员揭示出长棘毛唇隆头鱼如何发现并监测它们肤色的快速变化。这项研究结果有助于进一步理解长棘毛唇隆头鱼的行为和演化,以及特定动物如何能快速适应它们的肤色。该论文介绍,快速改变肤色的能力在许多不同的动物中发生过多次演化,包括鱿鱼、两栖
Nature:基因分析助力棘冠海星防治
许多海星的外观赏心悦目,但有的种类会对面临严重威胁的珊瑚进一步造成威胁,比如棘冠海星(Acanthaster planci)。这种海星在印度洋-太平洋区域泛滥成灾,会整个爬上珊瑚枝把胃从口中翻出来分泌消化酶,将珊瑚虫的组织液化并吸收。 通过分析最新测序的棘冠海星基因组及其分泌的蛋白质,研究人员
-Nature:一种软骨鱼的第一个基因组序列
象鲨(Callorhinchus milii)是澳大利亚南部和新西兰温带水域的一种本地软骨鱼,生活在200米到500米深处,在春季迁移到浅水中进食。 本期Nature发表了这种鱼的基因组序列。与其他脊椎动物基因组所做比较显示,它是所有已知脊椎动物(包括腔棘鱼)中演化最慢的基因组。
转基因斑马鱼的构建
实验概要本实验对斑马鱼导入含 EGFP的质粒,观察其在动物体内的表达情况,在斑马鱼体内,绿色荧光蛋白从原肠胚到出苗期均能在荧光显微镜下观察到绿色荧光。主要试剂EGFP、绿色荧光蛋白基因、pEGFP-N2载体、E.coli主要设备试管、试管架、可调式微量加样器、电泳仪、电泳槽、染色缸、42℃恒温水浴箱
斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼,因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类,同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小,成鱼体长约4-6厘米,而且成鱼常年产卵且产卵量大,可达300-1000粒,还是体外受精并发育,因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。斑马鱼这种原
“活化石”软体动物基因组揭示眼睛进化密码
眼睛是我们接收外界信息的一个重要器官,通过眼睛我们才能看到这个多样的世界。但人类的视觉和其他物种有着很大的差别,更有一些物种眼睛的结构和色彩感知能力远不如人类,虽然其近亲进化出了复杂的眼睛,那些眼睛只有简单结构的“古老”物种,是如何保持其原始眼睛特征的? 5月11日,《自然-生态与进化》杂志
2013年04月18日《自然》杂志精选
封面故事:非洲腔棘鱼基因组已被测序 The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution 本期封面照片是由Laurent Ballesta在南非的“索德瓦纳湾”拍摄的一条非洲腔棘鱼和一个潜水员。1938
创建荧光鱼研究基因功能
研究人员正在利用作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《期刊》(The Journal of Biological Chemistry)上。 Sp2是Sp转录因子家庭的成员之一,
“活化石”焕发新生命
6月8日,来自21个国家和地区及全国质检系统代表约200人齐聚宁波,出席第二届中国-中东欧国家质检合作对话会。 作为古代大运河南端出海口、记载“一带一路”历史的“活化石”,宁波曾于2015年成功举办首届中国-中东欧国家部长合作发展论坛。时隔两年,中国-中东欧国家领导人、官员、学者、企业家再次欢
《自然》:非洲文化或是“活化石”
国际著名学术期刊《自然》最新发表一篇考古学研究论文称,非洲东部和南部人群之间的文化联系一直保持到至少5万年前,这比遗传学分析预测的两者分离时间晚了约2万年。在论文中,研究人员通过分析过去5万年里非洲东、南部这些地区的鸵鸟蛋壳串珠的样式变化,揭示出了这些社会联系网络,为非洲的社会动态性与文化演变增添了
定向基因编辑改写斑马鱼的DNA
斑马鱼是基因研究中一种常用的模式生物。现在科学家可以对它们的基因组进行定向的编辑。 据Nature近日报导,在对脊椎动物和人类疾病的研究中,斑马鱼是一种重要的模式生物。它的卵是透明的,在体外孵化,它的繁殖周期很短,生长速度快,这些都意味着,很适合在生物生存的条件下对它的胚胎进行密切研究。而
迄今最全斑马鱼基因图谱发布
一个国际科研团队在5日出版的《自然·遗传学》杂志上发布了迄今最全面的斑马鱼基因图谱。斑马鱼是医学和生命科学研究领域使用量第二大的动物模型,这一成果将帮助科学家们更好地研究各种癌症、心脏病和神经退行性疾病,以及在研究中用斑马鱼模型取代哺乳动物模型。 最新研究由DANIO-CODE联盟开展,该联盟由
Cell:我国免疫学家“新研究”抗体产生机制起源提前1亿年
徐安龙教授(图片来源:中山大学附属第三医院) 日前,由徐安龙教授领导的中山大学团队宣布,在人类免疫系统起源研究中取得突破性进展,将生物适应性免疫起源向前推进1亿年。 据介绍,这一研究成果已在国际生物类著名期刊《细胞》杂志发表。这是科学家首次在无脊椎动物文昌鱼体内发现决定抗体重排的DNA片段,
美或批准转基因鱼上市-生长速度比普通鱼快1倍
转基因大马哈鱼18个月可长到60厘米长、3公斤重,而养殖大马哈鱼则需3年时间。转基因的大马哈鱼最重可达5公斤。 公司表示,所有转基因大马哈鱼都被设计为雌性,且不具备繁殖后代能力,理论上杜绝异种繁殖的危险。 本报讯 据英国《每日邮报》11月25日报道,在加拿大政府批准一种可食用转基
崖柏:“活化石”植物重获新生
崖柏:“活化石”植物重获新生 2021年10月回归到原生地的崖柏 郭泉水摄 2021年11月回归崖柏的果实 郭泉水摄 2021年11月回归崖柏在野外结实 黄吉兰摄 2021年11月崖柏种子 黄吉兰摄 这是一种被发现后又“绝迹”100多年的恐龙时代的孑遗植物。 崖柏,柏
我科学家完成棘球绦虫基因组解析
包虫病威胁着我国约5000万人口,其元凶――细粒棘球绦虫的遗传密码最近被科学家“破译”。昨天,记者从国家人类基因组南方研究中心获悉,经过中外科学家长达三年的协同努力,解析出了细粒棘球绦虫的基因组合转录组,英国《自然・遗传学》杂志前天在线发布了这一成果。 由棘球绦虫所引起的包虫病是人和家畜
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4