北京基因组所阿尔兹海默症基因知识库ALzBase正式上线
阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease,AD）是一种在老年人人群中常见的神经退行性疾病，目前无有效治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的进展。为了能够更好地助力AD相关的研究，中国科学院北京基因组研究所雷红星研究组通过整合不同来源的数据，以阿尔兹海默症扰动基因为核心整理并开发了阿尔兹海默症基因知识库AlzBase，相关论文于近期发表于Molecular Neurobiology。 雷红星研究员多年来一直从事AD相关的研究工作，特别是在组学数据相关的研究领域开展了一系列的研究，例如AD相关致病机制的系统生物学研究，AD外周血扰动特异性研究以及AD相关染色体区域的研究等。这些研究成果为Alzbase的开发与上线打下了坚实的基础，同时也使得AlzBase作为AD组学研究领域的知识型数据库更具专业性和指导性。 AlzBase知识库收集了若干组代表性的AD脑转录组研究结果，并结合AD研究中的一些热点......阅读全文
DNA－microarray相关的基因表达数据处理攻略
基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具，本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片，是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因
基因检测解码“生命说明书”－全球竞跑基因数据库
随着华大基因上市临近，基因检测概念再度被关注。 华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍，给基因学家一滴血，能查到生育、肿瘤、感染，从三检合一到N检合一，液体活检可以做更多的事情。 相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物，基因检测技术的优势在于，在更早的发病初始期，从分子
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
解码“基因宝藏”：最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚，华大生命科学研究院（简称“华大”）联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
－Cook研发的Zilver－PTX再获积极研究数据
Cook医药公司研发的Zilver PTX于今年四月份被美国FDA宣布召回，这一决定距Zilver PTX获得FDA通过仅仅过去了数月之久。现在，Cook公司再次在该设备的实验中取得了理想结果。这一横跨美国、欧盟和日本的研究为其四年，有479名患者志愿参加。Zilver PTX就其治疗外
研究人员用手机数据追踪疟疾传播
新华社北京10月15日电 一个国际研究团队日前报告说，他们通过分析所收集的数据成功对肯尼亚部分地区的疟疾传播趋势进行跟踪观测，这种新的分析方法有望提高对这类疾病疫情的监控效率。 据美国科学促进会主办的EurekAlert网站介绍，来自卡耐基梅隆大学等机构的研究人员在2008年6月~20
《科学通报》出版“大数据研究与应用”专辑
大数据带来的信息风暴正在改变世界，数据科学也随之产生和发展。为了对这一新兴科学进行深入探讨，《科学通报》于2015年第5-6期出版了“大数据研究与应用”专辑。该专辑由中国科学院计算技术研究所张云泉研究员、清华大学交叉信息研究院徐葳教授以及清华大学物理系龙桂鲁教授共同担任客座编辑，采用交叉学科的思
Nature：大型研究的数据共享陷入困境
Eric Dishman在大学时（1989年）被检出患有某种罕见的肾脏癌症，当时医生曾告诉他只有两三年可活。这么多年来，他已经接受了很多不同的治疗，这些治疗都没有很好的效果。然后他开始怀疑，自己可能并不是得了肾脏癌症，而有可能是其他病症。五年前，他请研究机构测序了自己的全基因组，并将数据寄给了肿
北大健康医疗大数据研究中心成立
8月28日，北京大学健康医疗大数据研究中心成立仪式在该校举行。政府、高校医疗机构领导、健康医疗领域行业专家、大数据技术团队及产业界的200余名嘉宾共同见证了此次盛会。 据介绍，北京大学健康医疗大数据研究中心将开展国家级重大医疗战略和公共卫生政策研究以及标志性示范性临床应用研究，同时将开发一整套高
LAMOST数据中碳星的研究获进展
碳星是一类特殊恒星，它的光谱中表现出强烈的碳分子吸收带特征。近日，河北师范大学和中国科学院国家天文台联合培养的研究生纪伟、河北师范大学教授崔文元和国家天文台副研究员刘超等人发现碳星在特定的谱指数空间有着独特的分布特征，结合新发现的碳星红外颜色判据成功且高效地从LAMOST DR2恒星光谱库中挑选
电子容重器测量研究稻谷容重数据
从今年全市粮食清仓查库记录中整理出435组完整的数据(其中稻谷162组，小麦273组)进行作图和统计分析，证明影响粮食储藏容重的主要因素是粮食的定等容重，另外储藏年限对其储藏容重也有一定程度的影响，且呈正相关，而粮堆高度对储藏容重无影响。容重测定的仪器主要有电子容重器。 这
研究揭示个人生理数据暗藏疾病玄机
日前，当代的生物学传奇人物之一、现年78岁的Leroy Hood在《自然-生物技术》上发表了他的最新研究成果《关于个性化的、密集的和动态数据云的108个人的健康研究》，探寻个性化的生理数据之于健康管理的意义。 Leroy Hood是人类基因组计划的发起人之一，同时是美国科学院、工程院、医学院
科学家如何保护研究敏感数据
在丢失了自己的电子设备后，美国耶鲁大学生物信息学家Mark Gerstein感到十分焦虑，因为设备里有其私人信息和研究数据。 “我非常有安全意识，但也有点健忘。”Gerstein说。 Gerstein回忆起到波士顿的一次旅行，当时他就把手机忘在了出租车上。幸运的是，Gerstein能联系到出
前列腺癌药物！强生Erleada研究数据
近日，美国医药公司强生（JNJ）在芝加哥举行的2019年美国临床肿瘤学会（ASCO）年会上公布了前列腺癌药物Erleada（apalutamide）联合雄激素剥夺疗法（ADT）治疗转移性去势敏感性前列腺癌（mCSPC）患者的III期研究TITAN的数据。结果显示，与安慰剂+ADT相比，Erlea
为存数据－研究人员给细菌编程
“Hello World！”是许多程序员的第一行代码，但你见过从活的生物体内读出的“Hello World！”吗？哥伦比亚大学的一个研究小组做到了，他们把数据写入活细菌的DNA，相关研究11日发表在《自然-生物化学》上。 对数据存储而言，DNA在许多方面都很有吸引力。比如，相较于目前结构最紧凑
全国城市健康大数据研究成果出炉
12月23日，由清华大学万科公共卫生与健康学院、清华大学健康中国研究院、清华大学中国新型城镇化研究院联合主办的《清华城市健康指数2021》发布会在京召开。 国家卫生健康委规划司司长、全国爱卫办副主任、健康中国行动推进办副主任毛群安，清华大学校务委员会副主任、清华校友总会副会长史宗恺，清华大学
公众环保投诉大数据挖掘研究取得进展
随着我国城市化水平不断提高，居民对生活品质诉求日益增强，公众环境意识显著提升，环境保护投诉的数量随之增加。区别于自上而下的传统环境监测网络，环保投诉直接来自于公众，具有快速直接反应城市环境问题、包含丰富的环境信息等特点。目前，网络投诉这类非结构化的文本数据多采用人工处理，效率较低，缺乏快速和自动
大数据驱动的管理与决策研究重大研究计划项目指南
大数据驱动的管理与决策研究重大研究计划2016年度项目指南 移动互联环境下的新兴技术快速发展与应用（如物联网、云计算、可穿戴设备、人工智能、增强/虚拟现实等）催生了新模式、新业态和新人群，为社会经济生活注入了新的活力，也进一步丰富和拓展了大数据应用创新领域，并为学术界、产业界以及政府
基因调控的研究方法
筛选突变型 这是在原核生物中广泛应用的方法，例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型，包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型，以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。 激素诱导 在高等的真核生物中，除了离体培养的体细胞以
简述基因的影响研究
女性生育的时间与基因存在关联。科学家通过研究发现特定的基因变异能够让生育期更长、更年期更迟，从而使一些女性拥有高于常人10%的生育率。Mills教授和其他250名研究员一起，通过对33万男女生育信息进行统计和分析，结果发现基因能够影响一个人首次性行为的时间，另外对首次怀孕的年龄以及更年期何时到来
基因功能研究策略
随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况：DNA→mRNA→蛋白质→功能（遗传效应以及表型）二、 基因功能研究策略：1、 基因功能的获得（
死亡基因的研究意义
这一特别的基因会影响一个人会在一天的哪个时间段内死去。人体内几乎所有的生理过程都有一个昼夜节律，这意味着，它们的高峰值主要出现在一天的某个时间段内。甚至死亡(也是一种生理过程)也有它的昼夜节律，大多数人的死亡昼夜节律平均出现在早晨，所以大多数人通常死于早晨。有些人死亡节律时间段在上午11点左右。研究
遗传重组热点基因研究
遗传重组(它涉及DNA股的断开和重接以产生新的基因组合)是真核细胞生物中的一种基本的生物学过程。在哺乳动物减数分裂的时候，在这一专门化的细胞分裂过程中，来自母系和父系的染色体被一分为二并产生出精子细胞和卵子细胞，而重组过程则将同源染色体的不同部分连接在了一起，从而导致了后代中的基
转基因技术基因工程疫苗的研究
使用DNA重组生物技术，把天然的或人工合成的遗传物质定向插入细菌、酵母菌或哺乳动物细胞中，使之充分表达，经纯化后而制得的疫苗。应用基因工程技术能制出不含感染性物质的亚单位疫苗、稳定的减毒疫苗及能预防多种疾病的多价疫苗。 目前已经商业化使用的部分基因工程疫苗： 乙肝疫苗、丙肝疫苗、百日咳基因工
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
欧洲食品安全局开放转基因数据
图片来源：blog.friendseat.com 欧洲食品安全局(EFSA)近日公布了孟山都公司为获转基因玉米NK603的批准证书而提交的文件和资料。这些资料在EFSA发布的一份公告中出现，这样做说明EFSA打算着手满足公众所倡仪的透明度，旨在通过数据使得广大科学社
基因测序：数据处理与标准问题仍待解
图片来源：百度图片 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况，亟须得到改变。 基因测序，一直被视为生命科学和生物技术发展的重大革命。在经历过前些年的积累之后，今年的基因测序行
基因测序：数据处理与标准问题仍待解
【导读】目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测序行业良莠不齐。这种情况，亟须得到改变。 目前我国在数据行业标准方面概念还很模糊，这就导致科研机构、医疗机构、企业在利用基因数据的时候，没有统一的规则，也造成基因测
科学家提出基因测序数据分类新标准
有助于开发出更有效的疫苗;更迅速应对潜在公共卫生突发事件 最近，美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(LANL)的一个遗传学小组和一国际财团联合提出了一套旨在阐明可公开获取的基因测序数据信息的质量标准。新标准最终可使遗传研究人员开发出更有效的疫苗，或有助于公共健康部门或安全人员更迅速地应对潜在的公共卫生