北京基因组所阿尔兹海默症基因知识库ALzBase正式上线
阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease,AD）是一种在老年人人群中常见的神经退行性疾病，目前无有效治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的进展。为了能够更好地助力AD相关的研究，中国科学院北京基因组研究所雷红星研究组通过整合不同来源的数据，以阿尔兹海默症扰动基因为核心整理并开发了阿尔兹海默症基因知识库AlzBase，相关论文于近期发表于Molecular Neurobiology。 雷红星研究员多年来一直从事AD相关的研究工作，特别是在组学数据相关的研究领域开展了一系列的研究，例如AD相关致病机制的系统生物学研究，AD外周血扰动特异性研究以及AD相关染色体区域的研究等。这些研究成果为Alzbase的开发与上线打下了坚实的基础，同时也使得AlzBase作为AD组学研究领域的知识型数据库更具专业性和指导性。 AlzBase知识库收集了若干组代表性的AD脑转录组研究结果，并结合AD研究中的一些热点......阅读全文
最新研究可以用光速存储数据
电子（橙色的圆圈）和光脉冲（粉色）在记忆细胞（红色的小条）中交叉。这两种信号都可以在细胞上编码信息。图片来源：Nikolaos Farmakidis 物理学家已经找到了一种方法，可以让光信号穿过硅片的限制读写数据。这可能使开发一种设备成为可能，这种设备可以将传统计算机中使用的电信号与正在开发的
清华用大数据－做定量城市研究
“我们用大数据和开放数据来做定量城市研究，是希望用新数据来回答老问题，从而认识、管理和改造我们的城市，改善居民生活质量。”清华大学建筑学院副研究员龙灜在第三届北京城市实验室年会上这样表示。该年会近日在北京举行，以“新数据环境下的城市：品质、活力与设计”为主题，百余位专家、学者和社会各界人士对新数
科学研究部门优化数据存贮空间
和企业一样，大型研究机构也正在为日益增长的非结构化数据困惑不已，运用正确的文档存贮解决方案，能够创造出显著的存储空间。 科 学研究部门的数据保存必须保证安全，以备时隔数十年后还能方便准确地调用。有些数据和研究方法还要保存在公开的档案里，以便能够重复这些研究项目和进行结 果检验。研究
RNAi研究顶尖牛人被曝伪造数据
来自苏黎世瑞士联邦理工学院的Olivier Voinnet教授是植物生物学RNA干扰研究方面的一位著名专家，他与其他人曾在十多年前发现了植物中存在细胞外RNA（extracellular RNA , exRNA ）信号通路的证据，并且在多年的研究实验中尝试弄清楚这种exRNA在人体内是否具有相似
研究数据支持透析患者可以从事工作
埃默里大学的康复医学教授NancyG.Kutner的一项大规模研究结果，达到无导管置留和血清白蛋白水平≥4g/dl的目标与透析患者能够重返工作岗位相关。 透析患者就业问题并没有受到太多关注，人们总体上认为大多数患者甚至并不尝试重新就业，即便是开始透析之前仍在工作的患者。为此，Kutner博士及
CEMS数据精准性实践分析研究
【前言】CEMS是专业术语“固定污染物在线监测系统”的英文简写。CEMS系统已经成为我国环境废气排放监测的主要手段和环境指标评价的重要依据。在当前环保政策法规和标准规范越来越严厉的新形势下，企业自身必须做到自觉合规运作和达标排放。以下为各参数从采样测量、传输、终端显示的各个环节的基本关系链路。
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
GenomeAsia－100K最新数据公布！探索亚洲人基因数据的秘密
目前已经测序的人类基因组序列中约有6%的样本来自亚洲个体。而世界上约一半的人口是亚洲人。GenomeAsia 100K项目成立于2016年，由Macrogen、盆唐首尔大学医院精准医疗中心、新加坡南洋理工大学、印度基因组分析企业MedGenome和美国罗氏集团子公司Genentech等组成，旨在
华大基因回应14万中国人基因大数据是否外泄
就深交所问询函，华大基因回复表示：“14 万中国人基因大数据”项目无外方合作机构。项目分析工作均在境内由中国科研团队完成。14 万中国人基因大数据来自同意将样本和数据供科学研究的受检者。研究披露的是群体分析结果，不包含任何可识别个人身份信息，不存在泄露个人隐私的风险。 昨天北京青年报记者获悉，
华大发布最大规模中国人基因组学大数据研究成果
北京时间2018年10月4日，正当全国各族人民都在以各种形式庆祝祖国母亲69岁生日之际，华大也献上一份“厚礼”。 刚刚，华大在国际顶级学术期刊《细胞》上发表了迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果。这是由中国科学家主导，历时两年，对14余万中国人无创产前基因检测数据进行深入研究的成果。
研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库
近日，西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构，在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展，研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本，分别构建了包含1.6亿
如何利用数据分布分析评估大气污染研究数据的代表性？
利用数据分布分析评估大气污染研究数据的代表性，可以按照以下步骤进行：数据收集和整理：首先，收集所需的大气污染研究数据，并进行整理和预处理，确保数据的准确性和完整性。绘制频率分布直方图：将数据按照一定的区间进行分组，然后计算每个区间内数据的频率，并绘制频率分布直方图。通过直方图可以直观地观察数据的分布
数据平台让水稻更易“读懂”－以水稻为研究对象的数据库
水稻生物学数据库众多、信息量大，但大多是生物学原始数据；国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能；国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者，一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”（http://www.riced
近红外光谱分析方法研究——从传统数据到大数据
红外光谱分析技术作为一种绿色分析技术，在许多领域中已得到广泛应用。 随着应用的深入和拓展，近红外光谱的数据类型逐渐从传统数据变成近红外光谱大数据。本文总结了近红外光谱的预处理、奇异样本筛选、多元校正和模型转移等技术及其在相关领域的应用。对近红外光谱大数据分析技术的初步研究，包括近红外光谱在工业品在
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多专
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多
AbbVie公布泛基因型丙肝疗法数据
图片来源于网络 近日，在美国肝病研究学会（AASLD）组织的The LiverMeeting？2018上， AbbVie公司宣布了关于其泛基因型慢性丙型肝炎病毒（HCV）疗法Mavyret（glecaprevir/pibrentasvir）的新数据。来自3b期临床试验EXPEDITION-8的结果
北京基因组所数据资源建设取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式，整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展，也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 生命与健康大数
基因测癌：在大数据中酝酿“中国突破”
研制鼻咽癌疫苗，引进国际先进的基因检测平台……我国科学家表示，如果加大对临床试验的数据采集和共享，有望通过基因测序技术让更多癌症患者受益。 中医提倡“治未病”，西医也在研究通过基因提前治病。一批国际知名的生命科学学者和临床医学专家，近日共同交流基因测序的最新研究成果，并探讨如何在临床转化上取
为何大家愿意公开自己基因组数据？
2007年，在诺贝尔奖得主James Watson共同发现DNA结构的54年之后，他成为了第一个完成个人基因组测序的人，当时这花费了近100万美元。但随着近年来测序成本的下降，到了测序先驱Craig Venter这里，已经可以在一个小时内，花不到100美元的钱就能得到个人基因组序列了。 这一市
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
大数据与基因技术结合－拯救可怕的“帕金森”
医疗行业的变革正成为新的风口，今天作者想讲讲大数据与基因技术结合，正在产生什么新的想象力。其中尤以基因检测技术走到了前面，让我们谈谈“帕金森综合症”： 在未来，基因检测术将会成为医疗不可或缺的一部分。越来越多的人会进行基因测序来了解自己的生命体征和健康状况。国内最大的基因检测机构华大基因，也正
基因芯片数据处理流程与分析介绍
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后，生命科学正式迈入了一个后基因体时代，基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问，正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大，更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完整的数据结
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
又一灭绝物种全基因组数据解析
日前，吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据，重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起源
plos－biology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
全球最大癌症基因数据库发布
美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库，为研究者们提供了迄今为止最全面的方式，搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称，基于基因组学研究的新数据库，将对全球开放获取，预计将有助于研究人员加快新药的开发，同时能够更
基因大数据走向临床应用，哪些问题要克服？
为了推动基因组研究在临床中的应用，多个国家层面的大规模研究项目已经开启。2014年英国发起了10万人基因组计划，美国和中国也宣布了百万人基因组数据相关计划。许多区域性的大数据计划也在进行中。例如，宾夕法尼亚州的盖辛格健康系统（GeisingerHealth System）和纽约的再生元制药公司合
全球首款基因编辑疗法公布长期数据
·Casgevy是一款自体细胞疗法，它利用CRISPR/Cas9基因编辑系统，在体外对来自患者的造血干细胞进行编辑，使血红细胞生产高水平的胎儿血红蛋白——一种健康的、携带氧气的血红蛋白。当地时间2024年6月14日，由美国生物技术公司福泰制药（Vertex Pharmaceuticals，VRTX.