英发明高效识别细菌“有用”基因新技术
英国研究人员16日报告说,他们发明一种快速高效分析细菌基因组中成千上万个基因的新技术,可以在一次实验中识别出“有用”的基因,从而防治细菌导致的疾病。 英国桑格研究所16日发布新闻公报说,这种名为TraDIS技术的实质是在基因层面上的“剪切和粘贴”。基因是DNA链上具有特定功能的一个片段,如果将这个片段中一些地方“剪切”掉,再“粘贴”上一段抑制其功能的物质,那么这个基因就会失去作用。 如研究人员对伤寒沙门氏菌的每个基因都进行了“剪切和粘贴”处理,得到约100万个发生了不同基因变化的细菌,随后,将它们一起培养。那些因为基因变化而功能受损的细菌不会生长,于是在一次实验中识别出了“有用”基因。结果显示,维持伤寒沙门氏菌基本生存的“有用”基因只有356个,其他数千个基因则不是必不可少的。 研究人员称,这一技术有助于医疗研究。比如伤寒沙门氏菌常存在于携带者的胆囊中,并由此传染他人,但这一传染途径的前提是细菌对胆汁要有抵......阅读全文
“超级细菌”的耐药性基因可遗传
德国科学家日前发布的一项研究成果显示,让细菌具有耐药性的基因不仅能够跨越不同物种传播,还能通过接触染色体而遗传。 以某些大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌已对多种抗生素具有耐药性。目前,多粘菌素是对抗耐药性细菌的最后一道防线,但是一个名为MCR-1的基因会让细菌对多粘菌素也产生耐药性,变成“超级细
细菌基因或推动陆地植物进化
数亿年前从微生物转移到绿藻的基因可能推动了陆地植物的进化。一项分析表明,来自细菌、真菌和病毒的数百种基因已被整合到植物中,使后者具有适于陆地生活的特性。3月2日,相关论文发表于《分子植物》。 “我们的研究改变了陆地植物进化的传统观点。”论文通讯作者、美国东卡罗莱纳大学生物学专家黄金玲(音译)说,
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡(Langone)医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸(transcription elongation)的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上,他们表示,该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶(RNAP)之间的协同作用,因为这种协同作用使得转录率对应于转
细菌的限制修饰系统包含哪些基因?
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因:(1)hsd R:编码限制性核酸内切酶(2)hsd M:编码限制性甲基化酶(3)hsd S:编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
用转基因光合细菌生产单糖好处多
美国哈佛大学维斯生物启迪工程研究所和哈佛医学院的研究人员表示,光合细菌进行基因工程改造后能够产生单糖和乳酸,利用该项研究成果有望开发出新的环保型生产日用化工产品的方法。相关研究刊登在新出版的《应用和环境生物》杂志上。 光合细菌(PSB)是一种能进行光合作用而不产氧的特殊生理
反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外m
真菌细菌如何影响基因表达和肿瘤存活
共聚焦显微镜下可见白色念珠菌生物膜代谢物刺激SCC25细胞 一项由巴西São Paulo州立大学(UNESP)的一组研究人员进行的体外研究显示了真菌和细菌如何激活与头颈部肿瘤相关的基因,由于生物膜的代谢(这些微生物以一种有结构和协调的方式自组织的群落)通过有利于肿瘤发展和抵抗治疗所需的细胞
科学家从北极细菌提取“耐寒基因”
加拿大研究人员从北极的喜寒细菌中提取的基因可以让某些细菌变得对温度非常敏感,因此,植入了这些耐寒基因的细菌菌株在一定温度下会死亡,这有助于研究人员研发出稳定的肺结核和其他传染病活疫苗。相关论文发表在最近出版的美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 研究人员表示,所有的细菌在进化过程中
《科学》:古老蛋白塑造细菌紧凑基因组
该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素 与人类相比,细菌不携带过多的“垃圾DNA”,它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA,而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现,细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R
英发明高效识别细菌“有用”基因新技术
英国研究人员16日报告说,他们发明一种快速高效分析细菌基因组中成千上万个基因的新技术,可以在一次实验中识别出“有用”的基因,从而防治细菌导致的疾病。 英国桑格研究所16日发布新闻公报说,这种名为TraDIS技术的实质是在基因层面上的“剪切和粘贴”。基因是DNA链上具有特定功能的一个片段,如
美用转基因细菌合成高能火箭燃料
图:石油基燃料和先进生物燃料的能量密度比较。先进生物燃料(绿色)与石油基燃料(黑色)相比,能量密度较低。蒎烯二聚体(红色)与石油基燃料JP-10能量密度类似。 目前的生物燃料体积热值太低,在应用与火箭、导弹中时,高能燃料非常重要。有一种从树木中提炼的化合物蒎烯,经二聚化后生成蒎
人造细胞-美利用人造基因“复活”细菌
美国一个研究小组20日报告说,他们合成了一个人工基因组,并用它使一个被掏空的单细胞细菌“起死回生”。研究人员表示,这是第一个完全由人造基因指令控制的细胞,它向人造生命形式迈出了关键一步。 美国J·克雷格·文特尔研究所的研究人员在最新一期美国《科学》杂志上报告说,他们人工合成了一种名为
基因改造细菌将废气转为化工原料
美国西北大学和郎泽科技公司研究人员在最新一期《自然·生物技术》发表论文称,他们在一项新的试点研究中,将一种梭菌进行遗传工程改造,用于合成此前它们无法产生的化合物,这种选择、设计和优化细菌菌株的过程,成功地证明了其将CO2转化为丙酮和异丙醇的能力。这种新的气体发酵过程不仅可从大气中去除温室气体,还
基因测序是怎么判断病毒或者细菌来源
目前以新冠病毒来解释,首先病毒的体外活性,其实他与病毒的种类和体外环境因素有关。病毒的起源似乎并不一定与其体外失活有关。由于病毒不能形成化石,其复制机制复杂,因此研究病毒的起源非常困难。事实上,它们可以感染几乎所有的生物,这使得问题更加复杂。一些病毒如疱疹病毒和单核细胞增多症病毒与其宿主细胞的基因有
反义RNA的调控细菌基因的表达功能
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补,因此在体外mic
细菌基因转移与重组的方式有哪些?
1.接合作用:当细菌与细菌相互接触时,质粒DNA就可从一个细菌转移到另一个细菌。2.转化作用:由外源性DNA导入宿主细胞,并引起生物类型改变或使宿主细胞获得新的遗传表型的过程,称为转化作用。3.转导作用:当病毒从被感染的细胞释放出来,再次感染另一细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液
人体肠道细菌基因组集研究成果
2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时
科学家合成“最小”细菌-仅有473个基因
当谈到基因组的大小时,一种被称为衣笠草的罕见日本植物无疑是当下的重量级冠军——其脱氧核糖核酸(DNA)数量是人类的50倍。而在天平的另一端,一个新的轻量级纪录保持者如今诞生在美国加利福尼亚州的一个培养皿中。在3月25日出版的《科学》杂志中,由基因组测序先驱Craig Venter率领的研究人员报
科学家揭示超级细菌产生耐药基因原因
[提要] 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力”,选择并进化这些整合有“耐药基因”的病菌,使得后者最终成为人类的噩梦――临床上的“耐药菌”。 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力
细菌利用基因开关来防御金属带来的死亡
格里菲斯大学的研究人员在一种常见细菌中发现了一种基因开关,这种基因开关有助于防御人体的自然免疫系统。格里菲斯大学药学院的Matthew Sullivan博士和Kelvin Goh博士研究了B族链球菌对锌和铜金属的反应,并发现了细菌能够抵抗金属压力的多种方式。沙利文博士说:“我们观察到B组链球菌的基因
方法二:细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞,蛋白酶降解蛋白,CTAB去除多糖成分一:仪器:同方法一 二:试剂:TE、TAE缓冲液;10%SDS;5MNaCL;20mg/ml蛋白酶K;CTAB/NaCL溶液(10% CTAB,0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中,缓慢加入10gCTAB,加热溶解);
使用基因测试可精确区分病毒和细菌感染
美国杜克大学医学院的研究人员近日研发出一种基因测试方式,可以准确区分病毒或细菌感染,从而有助于减少不必要的抗生素过量服用以及进而出现的细菌耐药性等问题。 杜克大学医学院的研究人员通过血液基因测试,成功区分了人类呼吸系统疾病的病毒和细菌感染,准确率可达90%以上。 这种测试可以检测出患
长读测序发现高达20%的果蝇基因来自细菌
科学家芭芭拉·麦克林托克在20世纪40年代首次发现了“跳跃基因”,即那些可以在其他物种基因组内移动或转移到其他物种基因组中的基因。然而,研究人员继续发现它们在进化和健康中的重要性。在UMSOM和IGS的微生物学和免疫学教授Julie Dunning Hotopp博士的带领下,IGS的研究人员使用了新
基于SHERLOCK的基因工具快速而全面地口腔细菌
由于一种使用SHERLOCK(CRISPR的进化版)检测唾液中细菌的新型工具,这在未来可能可以帮助人们在检查后很快带着关于口腔健康的更全面信息离开牙医。这种精确的工具比现有的方法要快得多,并可能导致口腔和其他疾病的早期检测和治疗。 来自马萨诸塞州福斯研究所的研究人员调整了基于基因编辑的CRIS
王友绍团队发现浮游细菌基因转移因子
近日,中科院南海海洋所研究员王友绍团队在南海北部首次发现浮游细菌的基因转移因子。相关成果发表在《公共科学图书馆·综合》上。 基因转移因子广泛存在于海洋细菌基因组上,可传递抗光合基因、固碳基因和硫还原基因等。目前,对海洋细菌基因转移因子研究尚处于起步阶段。 基因转移因子是一种由细菌释放的、形态
细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明
细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂,采用独特的溶解系统,可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M
细菌基因组DNA提取试剂使用说明(二)
三.组织或液体样品中细菌DNA提取该方案适合于从各种组织、血液、分泌液等液体样品中提取基因组DNA和寄生的细菌DNA。纯化的DNA可直接用于各种细菌的检测。若需从粪便样品中提取细菌DNA,我们推荐使用DePure Stool DNA Kit,若需要从土壤样品中提取细菌DNA,推荐使用DePure
《科学》:细菌能将基因转移到复杂有机体
细菌等微生物之间的横向基因转移(lateral gene transfer)现象频繁发生,这对于它们的进化发展至关重要。美国科学家最新研究发现,细菌也能将基因转移到复杂有机体中去。这将促使科学家重新思考种间基因转移在进化中的作用,也使得遗传学家今后在为新基因组排序时,不得不采用新的方法以过滤掉细菌基
英专家称“超级细菌”基因强悍-难治但易防
“超级细菌”近来引发全球关注,英国因其科研人员主导相关研究和国内病例数量较多而成为这一事件的焦点。记者就此采访了英国加的夫大学的马克·托尔曼博士。他指出,“超级细菌”的超强抗药性来源于一个强悍基因,虽抗药性超强,但致病性却并不一定强。对个人而言,多洗手,注意饮食卫生是目前简单有效的预防