《科学》：古老蛋白塑造细菌紧凑基因组
该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素 与人类相比，细菌不携带过多的“垃圾DNA”，它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA，而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现，细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为Rho的古老蛋白。它具有调节功能，能够平衡基因的活性并能结合辅助因子“沉默”外来DNA.。相关论文5月16日发表在《科学》（Science）杂志上。 美国纽约大学医学院的Evgeny Nudler和同事结合了基因组学和蛋白质组学方法，用常用的动物抗生素——双环霉素抑制Rho的活性，观测了基因的开关情况。接下来，研究人员利用微分基因电泳（DIGE）技术挑出了大肠杆菌基因响应抗生素而产生的蛋白，并用质谱学方法鉴别了这些蛋白。 Nudler表示，“我们的研究显示了Rho是广泛存在的，它几乎能够终止所有基......阅读全文
细菌基因组DNA提取实验
细菌基因组DNA提取可应用于：（1）获得细菌基因组DNA；（2）作为PCR模板；（3）用于测序、遗传信息分析等。实验方法原理本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术，结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DN
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术，结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术，结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0×109 细菌中获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。实验材料 细菌培养物
细菌中制备基因组DNA实验
小量制备 氯化铯法 实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
细菌基因组DNA提取方法综述
细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr
《科学》：古老蛋白塑造细菌紧凑基因组
该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素 与人类相比，细菌不携带过多的“垃圾DNA”，它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA，而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现，细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
人体肠道细菌基因组集研究成果
2019年2月5日上午，深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组，为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据，同时
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
方法二：细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一 二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；
Nature子刊：基因编辑揭开细菌基因组秘密
由美国伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程系的赵惠民教授(音译，Huimin Zhao)带领的一个研究团队指出，他们利用一种创新的DNA工程技术，发现了隐藏在细菌基因组中的潜在的、有价值的功能。这项研究成果发表在12月5日的Nature Communications杂志上。 每种
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（一）
细菌基因组DNA提取试剂使用说明书◆ 产品说明基于硅胶柱纯化方式。试剂中的溶菌酶消化去除细菌的细胞壁，革兰氏阳性细菌还可加入玻璃珠涡旋破壁，在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化，DNA释放到裂解液中。加入乙醇后，转移至吸附柱中过滤，DNA被吸附至吸附柱的膜上，而蛋白质则被去除。吸附柱经Buffer G
细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明
细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂，采用独特的溶解系统，可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿，也无需进行耗时的醇类沉淀，整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（二）
三.组织或液体样品中细菌DNA提取该方案适合于从各种组织、血液、分泌液等液体样品中提取基因组DNA和寄生的细菌DNA。纯化的DNA可直接用于各种细菌的检测。若需从粪便样品中提取细菌DNA，我们推荐使用DePure Stool DNA Kit，若需要从土壤样品中提取细菌DNA，推荐使用DePure
Genome－Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M
细菌中制备基因组DNA实验——氯化铯法
实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料细菌试剂、试剂盒溴化乙锭氯化铯丁醇仪器、耗材离心机巴斯吸管摇床实验步骤1. 培养100 ml
研究证实细菌DNA可整合至人类基因组
日前，马里兰大学医学院(University of Maryland School of Medicine)的科学家们找到了细菌基因可偶然性地整合至人类基因组中的强力证据。研究发现，大约 1/3 的健康基因组中含有细菌 DNA 序列，而癌细胞中则更高。从而证实了来自细菌的侧向基因转移(L
科学家为一种细菌重编基因组密码
报道，最近，美国耶鲁大学和哈佛大学的科学家合作，为一种细菌重新编写了完整的基因组编码，并提高了其抗病毒能力。相关论文发表在10月18日的《科学》杂志上。 “这是第一次从根本上改变了遗传密码。”论文共同高级作者、耶鲁大学分子、细胞与发育生物学副教授法伦·艾萨克斯说，“创造一个有着新基因编码的
揭秘口腔细菌Fretibacterium－fastidiosum的完整基因组序列－助力牙周病研究
人类口腔微生物组由多种细菌组成。由于体外培养存在挑战，并非所有口腔细菌都被充分研究。在这项研究中，研究人员报告了一种最近发现的口腔细菌 —— 苛求弗雷特杆菌（Fretibacterium fastidiosum）的完整基因组序列。口腔微生物组包含 700 多种细菌，其中超过三分之一尚未被培养出来。苛
中国科大研究组在CRISPRCas系统调控细菌基因组重塑...
近日，中国科学技术大学生命学院及医学中心孙宝林研究组在CRISPR-Cas系统领域研究取得进展，在美国微生物学会知名期刊mSphere上发表题为《Chromosomal Targeting by the Type III-A CRISPR-Cas System Can Reshape Genom
中国科大CRISPRCas系统调控细菌基因组重塑研究获进展
CRISPR-Cas（成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白质）系统是原核生物特有的一类适应性免疫系统，可以保护宿主不受外源核酸的入侵。目前关于CRISPR-Cas系统的研究主要集中在防御机制、被开发为基因编辑工具运用于原核和真核生物的基因组编辑等方面，而关于CRISPR-Cas系统对于宿主
Science：鉴定出保持细菌基因组完整性的关键分子ppGpp
在一项新的研究中，来自美国纽约大学朗格尼医学中心和俄罗斯科学院的研究人员发现一种关键的生物化学分子ppGpp能够让细菌修复它们DNA上的致命性损伤，包括抗生素导致的DNA损伤。相关研究结果发表在2016年5月20日那期Science期刊上，论文标题为“ppGpp couples transcri
新进展：基因组监测技术助力发现并减缓“超级细菌”传播
澳大利亚一项最新的研究显示，基因组监测技术的进步可以帮助人们发现并减缓“超级细菌”的传播，从而改善全球健康状况。 “超级细菌”是指那些对常规抗生素和抗菌药物产生抗性的细菌，使感染更难治疗，并增加了疾病传播、严重疾病和死亡的风险。据研究，这种抗药性主要是由于细菌、病毒、真菌和寄生虫随着时间的推移
哈尔滨医科大学最新文章：细菌基因组的奥秘
科学通报，中国科学C辑:生命科学，这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的，我国学术期刊中的知名品牌，被国内外各主要检索系统收录，如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI，英国的SA，日本的《科技文献
俄生物学家筛选出可降解石油的细菌基因组
莫斯科罗蒙诺索夫国立大学物理化学生物研究所在巴伦支海寻找到一种细菌，并从该细菌中筛选出可降解石油和其它环境污染物的基因组，相关成果发表在《Marine Genomics》学术期刊上。 Thalassolituus oleivorans细菌K–188型菌种是在巴伦支海水面收集到的，该菌种含有可
山东大学构建dsDNA重组工程的细菌多元基因组编辑方法
近日，微生物技术国家重点实验室卞小莹教授和张友明教授团队在微生物基因组编辑技术领域取得突破。相关研究成果以“Improved dsDNA recombineering enables versatile multiplex genome engineering of kilobase-scale
Sanger采用SMRT测序技术获得－NCTC－3,000株细菌基因组图谱
英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences（PacBio）合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作，其中包括一些世界上最危险的细菌，如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA，研究人员能够更好地了解细菌
德国硬颈蒜内生细菌全基因组测序助力大蒜种植研究
2022 年 8 月，从纽约拉什的比绍平农场获得成熟的田间种植德国硬颈蒜鳞茎（经度：?77.6374368；纬度：43.01495449999999）。用无菌手术刀无菌切除带有花茎的大蒜植株顶部，使用带无菌吸头的微量移液器无菌收集切面上积聚的茎汁，将收集到的汁液转移到无菌离心管中。然后将汁液置于胰蛋
中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果
中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果，相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系