《自然》:上海交大中药代谢组研究新方法

来自上海交通大学药学院的研究人员介绍的中药代谢组学研究新方法登上了7月12日出版的《自然》杂志的新闻特写(News Feature)栏目,并受到了高度评价。 代谢组学将成为评价中药体内整体性疗效的有效方法,并有可能使中医药和现代科学技术完全融合。采用系统生物学手段开展中药现代化研究受到国际学术界和医疗界越来越多的关注。上海交大药学院贾伟教授及其工作团队今年上半年数次登上《自然》杂志,他们所从事的中药代谢组学研究新方法被介绍在7月12日出版的最新一期的新闻特写(News Feature)栏目。 这篇题为“A Culture in the Balance”的特写文章,提出“在中医药与西方科学面临无可调和的差别之下,系统生物学是否可能使两者互融”的问题,其中着重介绍了贾伟教授团队采用的代谢组学用来评价中药体内整体性疗效的方法。 这些采用系统生物学的思维所开展的中药研究,在最近一期的《Nature Reviews Drug Dis......阅读全文

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借

代谢组学,妙手何来?|迈理奥,开拓代谢组学新科技的先锋

今天要讲到的代谢组学妙手来自何方? 来自我们优秀的用户——迈理奥(Meliomics)。迈理奥的快速崛起,源自于他们对代谢组学领域的深刻理解和持续创新,而安捷伦出色的仪器和解决方案也为其提供了重要支持。日前,我们有幸采访到了迈理奥首席科学家厉良教授(加拿大皇家科学院院士)和学术总监李佳博士,深入了解

上海交大JBC解析癌症代谢调控新机制

  来自上海交通大学的研究人员在新研究中证实,在癌细胞中PIM2可直接磷酸化PKM2促进糖酵解,这一研究发现在线发表在10月18日的《生物化学杂志》(JBC)上。   上海交通大学的黄钢(Gang Huang)教授是这篇论文的通讯作者。其主要研究方向包括肿瘤代谢机理与分子影像评价,肿瘤疗效评价

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

进入前景光明的代谢组学

内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

代谢组鉴定质控标准正式建立

   蛋白质组和代谢组技术都基于质谱,但相比于蓬勃发展的蛋白质组学技术,代谢组虽然技术流程更简单,但其应用却一直十分缓慢。究其原因,是因为蛋白质组学却很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR(假发现率)质控策略,可以保证鉴定结果的可靠性;而代谢组全谱鉴定一直缺乏有效的质控手段对鉴定结果进行

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现

油菜代谢组研究方面取得进展

  华中农大油菜团队联合小麦团队在Genome Biology发表了题为“Characterization of novel loci controlling seed oil content in Brassica napus by marker metabolite-based multi-om

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度

代谢组学:未来新方向

   加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

代谢组学样本收集答疑解惑

  样本收集是代谢组学研究的第一步,是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本?不同种类的生物样本的规范收集流程是什么?有哪些注意事项(抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节)?如何保存生物样本?可保存多久等等?这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题,本文将针对

《自然·代谢》:饭菜的香,能燃烧脂肪!

老话说到好吃的,那都要讲究一个色香味俱全,尤其是这个香,走在路上突然飘来一阵饭香,原本不饿的肚子都开始响鼓了。好闻的食物一般都更好吃,更好吃就会吃更多……抄起筷子的同时,奇点糕心里也有些不好过——今天肚皮吃饱饱,明天怕不是得长三斤吧!不过有意思的是,身体也很有智慧,美食的气味不单单令人食指大动,也会

定量代谢组学案列:用小分子代谢产物诊断肠癌

  近年来,医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉,系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队,近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究,现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。   

定量代谢组学案列:用小分子代谢产物诊断肠癌

近年来,医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉,系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队,近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究,现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。研究团队首先

非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法

据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴

上海交大长江学者Nature子刊调控代谢的开关

  来自上海交通大学医学院的研究人员在新研究中发现,一个称之为LGR4的因子在能量代谢和体重控制中发挥重要的作用,敲除LGR4可通过推动白细胞向棕色脂肪转换,促进能量消耗。研究结果在线发表在11月10日的《自然细胞生物学》(Nature Cell Biology)杂志上。   领导这一研究的是

J-Proteome-Res:-代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究

  微囊藻毒素(MCLR),作为一种肝毒素,正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内,肝脏是MCLR主要攻击的器官,然而具体代谢变化目前任然未知。近日,中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下,通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究,向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢

告别平均!单细胞代谢组学技术“精准签发”每个细胞的代谢履历

  在生命科学研究领域,代谢组学致力于剖析生物体代谢物的奥秘。传统代谢组学研究聚焦群体细胞,忽略了细胞间的代谢异质性,使得单个细胞的独特特征被群体平均属性掩盖,难以满足精准研究需求。单细胞代谢组学应运而生,它能深入细胞亚群精准分析,挖掘被忽视的关键信息。单细胞代谢物浓度极低且代谢物无法扩增,导致对检

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试验或温室

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试

合作成果丨靶向代谢组学

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料:SIMCA - P 多变量统计软件    试剂、试剂盒:[ 1H ] - NMR 抽提剂      仪器、耗材:Eppendorf 聚丙稀管                                                                  NMR 管    

临床代谢组学研究常见问题

分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。Q:如何设置验证集和测试集?A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念,通常

自然基金资助:微生物生物膜功能代谢组学领域取得进展

  自然基金资助成果:我国科学家在微生物生物膜功能代谢组学领域取得新进展  在国家自然科学基金项目(批准号:81274175,31670031 )等资助下,上海交通大学吕海涛课题组,整合运用精准靶向代谢组学和遗传学整合策略(Precision-Targeted Metabolomics combin

铁代谢是如何代谢的?

(一)铁的来源1.来自食物,正常人每天从食物中吸收的铁量1.0~1.5mg、孕妇2~4mg.2.内源性铁主要来自衰老和破坏的红细胞,每天制造红细胞所需铁20~25mg.(二)铁的吸收动物食品铁吸收率高(可达20%),植物食品铁吸收率低(1%~7%)。食物中铁以三价铁为主,必须在酸性环境中或有还原剂如