《自然》:上海交大中药代谢组研究新方法

来自上海交通大学药学院的研究人员介绍的中药代谢组学研究新方法登上了7月12日出版的《自然》杂志的新闻特写(News Feature)栏目,并受到了高度评价。 代谢组学将成为评价中药体内整体性疗效的有效方法,并有可能使中医药和现代科学技术完全融合。采用系统生物学手段开展中药现代化研究受到国际学术界和医疗界越来越多的关注。上海交大药学院贾伟教授及其工作团队今年上半年数次登上《自然》杂志,他们所从事的中药代谢组学研究新方法被介绍在7月12日出版的最新一期的新闻特写(News Feature)栏目。 这篇题为“A Culture in the Balance”的特写文章,提出“在中医药与西方科学面临无可调和的差别之下,系统生物学是否可能使两者互融”的问题,其中着重介绍了贾伟教授团队采用的代谢组学用来评价中药体内整体性疗效的方法。 这些采用系统生物学的思维所开展的中药研究,在最近一期的《Nature Reviews Drug Dis......阅读全文

代谢组学:一项艰巨的任务

  学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢,一系列代谢通路,一大堆代谢产物,简直让人头晕眼花。然而,这又不能跳过。毕竟,DNA编码蛋白质,而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候,科学界对这些分子一无所知。  “如果你测定一滴血中的小分子,大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配,

临床代谢组学研究常见问题(一)

  分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。   Q:如何设置验证集和测试集?   A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这

岛津非靶向代谢组学解决方案

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

临床代谢组学研究常见问题(一)

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AFADESI空间代谢组学高级研修班

  为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作,由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里,我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台

综述:代谢组学在疾病中的应用

   代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起,实现一次性检测坚定上千种物质,同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。   应用代谢组学的定义事件的预测生

原位代谢组学分析方法与应用进展

  2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕,在5位院士的精彩报告后,多位学者做了高水平的大会报告。   中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所、中央民族大学再帕尔·阿不力孜教授:原位代谢组学分析方法与应用进展  中国医学科学院/北京协和医学院药物研

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

胆红素代谢中的肝内代谢

  肝内代谢:肝脏对胆红素有摄取、转化、排泄的功能。  1)摄取:  胆红素随血运输到肝后,在膜上与白蛋白解离,并被肝细胞摄取。  肝细胞内有Y蛋白和Z蛋白的两种色素受体蛋白。Y蛋白是肝细胞主要的胆红素转运蛋白,Z蛋白对长链脂肪酸具有很强的亲和力。Y、Z蛋白与进入胞质的胆红素结合,并将它运至内质网。

胆红素代谢中的肝内代谢

肝内代谢:肝脏对胆红素有摄取、转化、排泄的功能。1)摄取:胆红素随血运输到肝后,在膜上与白蛋白解离,并被肝细胞摄取。肝细胞内有Y蛋白和Z蛋白的两种色素受体蛋白。Y蛋白是肝细胞主要的胆红素转运蛋白,Z蛋白对长链脂肪酸具有很强的亲和力。Y、Z蛋白与进入胞质的胆红素结合,并将它运至内质网。2)转化:肝细胞

肝脏的代谢:蛋白质代谢

蛋白质代谢:(1)合成自身结构蛋白并合成多种血浆蛋白质,其中合成量最多的是白蛋白。(2)肝脏合成的许多凝血因子和纤维蛋白原等,在血液凝固功能上起重要作用。(3)有丰富的氨基酸代谢酶,转化和分解氨基酸。(4)经鸟氨酸循环合成尿素(尿素是血中非蛋白含氮物质主要成分)。

α酮酸代谢的代谢过程

氨基酸脱氨后生成的 α-酮酸可进一步代谢。主要有以下三方面:1.经氨基化生成非必需氨基酸实验证明人体不能合成赖、异亮、苯丙、亮、色、缬、苏、蛋等8种氨基酸相对应的α-酮酸,因而这些氨基酸不能在体内合成,必须从食物摄取,称为营养必需氨基酸。其它十二种氨基酸则称为营养非必需氨基酸,所谓非必需氨基酸并不是

酮体代谢

 由脂肪酸的β-氧化及其他代谢所产生的乙酰CoA,在一般的细胞中可进入三羧酸循环进行氧化分解,但在动物的肝脏、肾脏、脑、等组织中,尤其在饥饿、禁食。糖尿病等情形下,乙酰CoA还有另一条代谢去路。最终生成乙酸乙酯、β-羟基丁酸和丙酮,这三种产物统称为酮体。  酮体是人体利用脂肪的正现象,对于不能利用脂

酮体代谢

由脂肪酸的β-氧化及其他代谢所产生的乙酰CoA,在一般的细胞中可进入三羧酸循环进行氧化分解,但在动物的肝脏、肾脏、脑、等组织中,尤其在饥饿、禁食。糖尿病等情形下,乙酰CoA还有另一条代谢去路。最终生成乙酸乙酯、β-羟基丁酸和丙酮,这三种产物统称为酮体。   酮体是人体利用脂肪的正现象,对于不能利用脂

清华大学药学院胡泽平教授:代谢组学与代谢流分析技术

  本次我们邀请到了清华大学药学院胡泽平研究员,为大家带来代谢组学领域的相关知识。聆听大咖观点!  代谢组能让我们全面理解一个生物系统,它能为研究者提供许多功能性信息。请您介绍一下,目前代谢组学主要研究手段有哪些?该领域目前的研究及临床应用情况如何?  胡教授:代谢是生物体进行生命活动的基础,代谢紊

成都生物所中药提取物体外代谢研究获进展

  由于中药代谢的复杂性和分析检测手段的局限,其体外代谢研究大多针对某个或某些活性成分的代谢。但是,中药是多组分的复杂混合物,某一成分的代谢或各成分代谢的简单叠加都难以体现中药代谢的真实情况。因此,对中药提取物的整体代谢研究可能为这一命题提供新思路。体外中药整体代谢研究,需要解决体外代谢效率以及复杂

什么是代谢途径?代谢途径的过程

习惯上把这种连续的化学反应叫作代谢途径。如酵解途径,三羧酸循环途径,戊糖磷酸途径,糖原合成途径,糖异生途径,脂肪酸合成途径等。中间代谢也称为细胞内代谢。在中间代谢过程中,机体借助于各种反应从营养素或消化产物中获得能量,以及机体构成所需要的“原材料”。整个中间代谢可以划分为两个过程,即分解代谢和合成代

物质代谢与能量代谢的关系

新陈代谢包括物质代谢与能量代谢。物质代谢是指生物体与外界环境之间物质的交换和生物体内物质的转变过程,能量代谢是指生物体与外界环境之间能量的交换和生物体内能量的转变过程,二者是相互联系、相互偶联的。例如,进食后能量摄人过多时,脂肪合成增加;而在饥饿时进行脂肪动员,释放出能量供机体使用。

糖代谢VS脂代谢:科学家找到了癌症代谢新联系

  上海交通大学医学院和Albert Einstein医学院的研究人员发现了一种使肿瘤细胞迅速增殖的酶,抑制这种酶可能是缓解癌症生长的潜在策略。这项研究发表于著名学术期刊《Journal of Biological Chemistry》。  健康细胞从血液中获取脂肪酸和胆固醇用于自身细胞膜建设,然而

Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作

Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究   2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司

Agilent与Stemina-宣布代谢组学领域的合作

Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究   2010 年 5 月 24 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布,两家公司

LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究

mGWAS (metabolome  Genome-Wide Association  Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰

代谢组学在疾病诊断中的应用

代谢组学  (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学,是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终

大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展

  近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。   原发性肝癌是全球最

Science:逆转传统认知,代谢组学揭示重要机制

  来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物,通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物,干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合,而并未参

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如

当代谢组学技术遇到单细胞测序技术

代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

  我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

  我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息

上海交大微生物代谢国家重点实验室通过验收

  近日,科技部基础研究管理中心在上海交通大学召开了微生物代谢国家重点实验室建设验收会。本次会议专家组由9位微生物领域知名专家组成,组长为吉林农业大学李玉院士。教育部科技司基础处副处长明媚代表主管部门出席,上海交通大学副校长梅宏出席会议并致辞,上海交通大学生命科学技术学院领导、微生物代谢国家重点实验