拟南芥基因研究显示:环境对遗传多样性影响巨大

一项针对多种拟南芥的基因研究表明,环境因素对物种遗传多样性和基因组的影响比之前人们预期的更大。相关论文发表在7月20日的《科学》杂志上。 除了实验室中科学家的“最爱”,世界各地还分布着多种野生拟南芥。它们的生长速度、叶子颜色以及发枝方式都是不同的。在最新的研究中,由德国马普发育生物学研究所(Max Planck Institute for Developmental Biology)Detlef Weigel领导的国际科学家小组,从美洲、非洲和亚洲以及其他极地和亚热带区域搜集了19种拟南芥,并将它们的基因序列(约1.2亿个碱基对)与实验室用拟南芥基因组(2000年测定完成)进行了对比研究,从而确定了相关的遗传差异。 所得到的结果令人吃惊:它们遗传差异的广度远远超过了所谓的“改进基因组”(streamlined genome)。研究人员发现,平均每180个碱基对中就有一个是可变的。同时研究表明,大约4%的实验室......阅读全文

关于遗传多样性的研究意义介绍

  对遗传多样性的研究具有重要的理论和实际意义。  首先,物种或居群的遗传多样性大小是长期进化的产物,是其生存适应和发展进化的前提。一个居群或物种遗传多样性越高或遗传变异越丰富,对环境变化的适应能力就越强越;容易扩展其分布范围和开拓新的环境。即使对无性繁殖占优势的种也不例外。理论推导和大量实验证据表

遗传多样性的差异显示PCR介绍

  可以用来研究同一个体不同生长时段和不同组织(或分化结构)或者不同个体之间基因表达差异.原理是:根据中心法则,每一个阅读框要表达必须先转录成mRNA.那么在不同细胞内只要存在基因差异表达现象,肯定就会存在不同的mRNA.我们可以提取细胞的mRNA,然后将其反转录为cDNA,并以此来作为PCR模板.

研究表明植物靠遗传网络调控“叶圈”微生物

   植物叶片上生存着大量的不同性质的微生物,有益微生物和有害微生物与植物长期共存,植物是如何控制其地上部分的叶、果实、茎这些“叶圈”里的微生物并且维持自身健康的?相关机制尚不明确。  4月8日,《自然》杂志在线发表了题为“A plant genetic network for preventing

植物表型研究文章TOP10(一)

鸡年接近尾声,各行各业都已经做了各种年度盘点,小编也不能免俗,以影响因子和引用次数为标准,将近五年跟植物表型研究相关的文章,做了盘点,列出了植物表型研究文章的TOP10 ,从微观表型到宏观表型,从实验室表型到田间表型,从基因型到表型,赶紧一睹为快吧。 TOP 10● 植物表型组学数据中动态数量性状位

生物和非生物刺激的反应转运蛋白相关的基因

这种植物具有耐盐、抗热,抗寒的特性。伊利诺伊大学厄巴纳 -香槟分校HanBohnert植物生化实验室博士后Dong-HaOh告诉GenomeWebDailiNew通常情况下。0,0;WORD-SPA CING:0px;-webkit-text-size-adjust:auto;-webkit-tex

拟南芥转化

实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培

遗传发育所拟南芥根木质部发育机制研究获进展

  真核生物转录起始因子eIF5A是一类在真核生物中高度保守的基因家族,调控真核生物生长发育的多个生物学过程。   中科院遗传与发育生物研究所左建儒研究组最近的研究发现,拟南芥eIF5A-2/FBR12通过细胞分裂素信号通路调控拟南芥根木质部的发育。 eIF5A-2/FBR1通过与细胞分裂素受

植物线粒体基因组组装新工具研发成功

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494540.shtm近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队开发出一套新型植物线粒体基因组组装工具GSAT。该工具能够快速组装图形化植物线粒体基因组,更好地评估其泛

华大基因再发PNAS文章

  作为基因组测序领域的排头兵,近期深圳华大基因研究院与中科院系统,以及韩国,美国等处的科学家合作,发表了题为“Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea(《小盐芥基因组研究揭示其耐逆奥妙》

多基因遗传与数量遗传

  多基因遗传(polygenic inheritance)是指生物和人类的许多表型性状由不同座位的较多基因协同决定,而非单一基因的作用,因而呈现数量变化的特征,故又称为数量性状遗传。多基因遗传时,每对基因的性状效应是微小的,故称微效基因(minor gene),但不同微效基因又称为累加基因

重大测序成果,改写绵羊遗传史

  在当前羊肉价格不断攀升、羊毛织品价格下跌之时,一项突破性的新研究利用先进的遗传测序技术,重写了绵羊沿着古老的丝绸之路育种及交易的历史。研究发现可以帮助发展中国家的当代牧民维持或恢复对于食物和经济安全至关重要的一些有价值的性状)。  这一发表在《MolecularBiologyandEvoluti

RNA测序发现杂交蝉遗传证据

  据英国《通讯·生物学》杂志近日发表的一项动物学研究,日本科学家通过RNA测序,出乎意料地发现了13年蝉与近亲17年蝉杂交的遗传证据,而这两种蝉至少221年才相遇一次。研究显示,杂交蝉在极其漫长时间里都维持了各自不同的生命周期,目前科学家无法就这种平行趋异演化给出遗传学解释。长期以来,周期蝉的生命

半导体测序助力胎儿遗传测试

  来自中国广州医科大学等机构的科研人员报告了一种基于半导体的DNA测序平台可能有助于增加胎儿遗传测试的速度并减少成本。    近来基于大规模平行测序的方法已经促进了迅速的、非侵入式的出生前遗传测试,这种测试通过分析母亲血浆中流动的无细胞DNA从而测试被称为非整倍性的染色体拷贝数的异常。   

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴...

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴定银屑病,俗称干癣,是一种常见的具有特征性皮损的慢性易于复发的炎症性皮肤病,被认为是是遗传因素与环境因素等多种因素相互作用的多基因遗传病。 在以往对多基因遗传病的发病机理探索中,研究者们通过正常与疾病对照样本的基于SNP芯片的全基因组GWAS实验,寻找

从“基因测序仪”观“测序行业”!

基因测序仪:基因测序“皇冠上的明珠”  基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节,它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑,同时也是壁垒最高的部分,处于基因测序产业价值链顶端。基因测序仪对于基因产业的重要性,如同发动机之于汽车行业,芯片之于电子通信行业,可谓是基因测序“皇冠上的明珠”。  到目前为

我国学者从基因水平上明确亚洲棉遗传多样性等演化特征

  近日,由农科院棉花研究所并联合武汉大学、中国农科院深圳农业基因组研究所、安阳工学院等单位的研究人员,在Nature Genetics在线发表了题为“Resequencing of 243 diploid cotton accessions based on an updated A genome

基因多样性的功能

基因多样性(Gene diversity)代表生物种群之内和种群之间的遗传结构的变异。每一个物种包括由若干个体组成的若干种群。各个种群由于突变、自然选择或其他原因,往往在遗传上 不同。

基因多样性的概念

基因多样性(Gene diversity)代表生物种群之内和种群之间的遗传结构的变异。每一个物种包括由若干个体组成的若干种群。各个种群由于突变、自然选择或其他原因,往往在遗传上 不同。

新研究挑战DNA随机突变进化理论

根据美国加州大学戴维斯分校和德国马克斯普朗克发育生物学研究所开展的一项新研究,拟南芥可能是理解和预测DNA突变的关键。这一发表在12日《自然》杂志上的新发现,将从根本上改变人们对进化的理解,有朝一日或可帮助研究人员培育出更好的作物,甚至帮助人类对抗癌症。 当DNA受损且未修复时,就会发生突变,从

纳米孔测序联合光学测绘揭示转基因植物细节

  索尔克的研究人员利用最新的DNA测序技术,在分子水平上研究植物插入新基因后会发生什么。  索尔克的研究人员绘制了具有最高分辨率的转基因植物系基因组和表观基因组图,为了精确地揭示插入一段外源DNA后,在分子水平上会发生什么。他们的研究结果发表在2019年1月15日的PLOS Genetics,阐明

微生物检验中的两种新型“武器”大PK

  16SrRNA基因测序和宏基因组测序是现在微生物检验中的两大新型武器,它们在微生物研究中共同发挥着极大的作用,都是研究微生物的重要方法。但是二者又有什么不同呢?接下来将做一个简单说明。   定义   16SrRNA基因测序:就是指从微生物样本中提取16SrRNA的基因片段,通过克隆、测序或酶

揭秘:长期高温下植物的突变规律

  近日,Genome Biology杂志在线发表了来自扬州大学徐辰武教授团队和园艺与植物保护学院金飚教授团队题为Genome-wide DNA mutations in Arabidopsis plants after multigenerational exposure to high temp

遗传发育所等完成短花药野生稻基因组测序及分析

  稻属是从事植物比较、进化和功能基因组学研究的理想系统。野生稻蕴含着宝贵的基因资源。为了更好地利用稻属的野生资源,美国亚利桑那大学的Rod Wing教授在2009年发起了国际稻属基因组计划(I-OMAP),旨在构建稻属所有物种的全基因组序列图谱,并在此基础上开展比较、进化和功能基因组学研究。

基因测序可作为新生儿遗传病筛查的关键方法

  近日,《JAMA Network Open》上发表了题为《Genomic Sequencing as a First-Tier Screening Test and Outcomes of Newborn Screening》的研究文章。该研究结果为基因筛查作为一级筛查方法来改进现有新生儿筛查项

科学家完成90个鹰嘴豆基因组测序

  1月28日,《自然—生物技术》杂志在线发表了国际鹰嘴豆基因组测序协作组(ICGSC)90个鹰嘴豆基因组测序及分析的成果。该协作组由来自10个国家、23个研究机构的49名科学家组成,深圳华大基因研究院也参与了该项研究。   据了解,鹰嘴豆是全球第二大豆类作物,营养价值高、耐旱性强,主要集中在热带

碳离子束辐射对拟南芥基因组诱变效应研究获进展

  重离子辐射诱变育种是植物品种改良的重要手段,辐射诱变效应及分子机制的研究是涉及多学科交叉的重要共性课题。目前,对重离子辐射诱变效应的研究集中在表型、染色体畸变、遗传物质多态性及特定基因序列分析等方面,而分子水平的突变特征研究仍相对薄弱,欠缺全基因组水平大视角、多方位及大样本量数据支持。  中国科

中科院植物种质农业重点实验室举行2012年度学术交流活动

     重点实验室举行2012年度青年学术交流活动  10月26日,中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室2012年度青年科研人员学术交流活动在黄陂举行,重点实验室所属学科组青年科研人员共20余人参加了交流活动。  本着增进了解、加强合作的目的,此次交流会选取了4个不同研究方向

东南亚人群基因组计划首期成果发表

  东南亚是全球最重要的人类演化区域之一。该地区人群拥有极高的遗传多样性, 但基因组学研究长期缺失,制约了人类环境适应性进化与疾病遗传机制的深度解析,因而被称为全球人类基因组研究“最后一块拼图”。  中国科学院昆明动物研究所联合东南亚多国科研机构,组织发起了中国西南与东南亚人类学联合研究联盟(CAS

基因组测序揭示水熊虫极端环境适应性

  水熊虫是一种小型水生动物,又称为缓步动物,9月20日出版的《自然—通讯》发表了一篇有关其基因组测序的最新研究成果。该研究在缓步动物体内发现一种基因,其蛋白质能够抵抗人类培养细胞内的DNA损伤。这表明特异于缓步动物的蛋白质或有助于细胞抵抗DNA损伤来源。  缓步动物可以在极端的压力环境(包括真空)

美培育遗传多样性新型实验鼠

  据《自然》网络版近日消息,具有遗传多样性的新型实验鼠品种即将培育成功。   科学家们曾花费近一个世纪的时间才完成对第一批实验鼠的饲养。早期实验鼠只携带部分野生老鼠遗传多样性片段,如今实验鼠的品种已达成百上千种,但它们具备人类遗传特征的性状却非常少,对引发人类疾病基因的研究有很大局限性。为改变这