靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴...
靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴定银屑病,俗称干癣,是一种常见的具有特征性皮损的慢性易于复发的炎症性皮肤病,被认为是是遗传因素与环境因素等多种因素相互作用的多基因遗传病。 在以往对多基因遗传病的发病机理探索中,研究者们通过正常与疾病对照样本的基于SNP芯片的全基因组GWAS实验,寻找到了两组个体中多态性与该遗传病相关性。然而许多疾病的发病又是后天的,如糖尿病与饮食即后天的生活环境有很大的关联,这类复杂的疾病遗传机制很难通过基于SNP芯片的GWAS找到全部决定性的遗传变异。随着二代测序技术以及序列富集技术的改进,人们将解决这个问题的注意力转向了与疾病相关的基因编码区域。 全基因组外显子测序是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域 DNA 捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于其具有对常见和罕见变异高灵敏度, 能发现外显子区绝大部分疾病相关变异以及仅需要对约 1%的基因组进行测序等优点, 促使全基因组......阅读全文
靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴...
靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴定银屑病,俗称干癣,是一种常见的具有特征性皮损的慢性易于复发的炎症性皮肤病,被认为是是遗传因素与环境因素等多种因素相互作用的多基因遗传病。 在以往对多基因遗传病的发病机理探索中,研究者们通过正常与疾病对照样本的基于SNP芯片的全基因组GWAS实验,寻找
安徽医科大学Nature子刊发表银屑病研究新成果
来自安徽医科大学、复旦大学等20多家机构的研究人员在新研究中,采用全外显子组SNP微阵列(SNP array)技术鉴别出了15个新的银屑病易感位点。相关论文发表在4月9日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 论文的通讯作者是安徽医科大学的张学军(Xuejun Z
不止于遗传病和癌症,靶向测序还有这些用途
二代测序(NGS)的快速发展加速了遗传病、癌症等领域的研究,其本身也作为一种更为先进的基因检测手段逐步走进临床。在NGS的众多技术中,靶向测序正在成为新时代的“宠儿”。遗传病诊断(WES/Panel)、肿瘤伴随诊断(肿瘤多基因Panel)、免疫治疗疗效预测(WES/Panel),这些NGS应用热点都
关于多基因遗传病的特点介绍
一、多基因遗传病的家族聚集现象 ①这类病有家族聚集现象,但患者同胞中的发病率远低于1/2~1/4,且患者的双亲和子代的发病率与同胞相同。因此,不符合常染色体显、隐性遗传。 ②遗传度在60%以上的多基因病中,病人的第一级亲属(指有1/2的基因相同的亲属,如双亲与子女以及兄弟姐妹之间,即为一级亲
关于多基因遗传病的基本信息介绍
多基因遗传病是遗传信息通过两对以上致病基因的累积效应所致的遗传病,其遗传效应较多地受环境因素的影响。与单基因遗传病相比,多基因遗传病不是只由遗传因素决定,而是遗传因素与环境因素共同起作用。 与环境因素相比,遗传因素所起的作用大小叫遗传度,用百分数表示。如精神病中最常见的也是危害人类精神健康最大
电子捕获鉴测器的清洗
电子捕获鉴测器中有放射源,通常为H3或Ni63,因此要特别小心。 先拆开鉴定器中有放射源箔片,然后用2:1:4的硫酸、硝酸及水溶液洗鉴测器的金属及聚四氟乙烯部分。 当清洗液已干净时,再用蒸馏水清洗,然后用丙酮洗,再置于100度左右的烘箱中烘干。 对H3源箔片,先用己烷或戊烷淋洗,绝不能用水
NGS测序技术的不同检测方案
测序技术是单基因遗传病诊断应用的主要技术,针对检测基因的范围可大体分为单基因检测技术和多基因检测技术。单基因检测是指针对某一特定基因进行测序的技术,适用于具有特异疾病表型的疾病。单基因检测技术中应用最广泛的是Sanger测序,也称一代测序。Sanger测序因仅能检测一个或少数几个基因,因此适用于明确
染色体病单基因病多基因病和体细胞遗传病
遗传病可分为染色体病、单基因病、多基因病和体细胞遗传病。近年,随着遗传病研究的日渐深入,还发现有些遗传病的发病机制是由于线粒体基因突变,并随线粒体传递,呈细胞质遗传。1.染色体病由于染色体的结构和数目异常而导致的遗传性疾病称为染色体病(chromosomedis order)。迄今已知的染色
靶向深度测序和单细胞基因测序的区别
1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序
靶向深度测序和单细胞基因测序的区别
1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序
JAMA-Oncology:多基因测序正在迅速取代BRCA1/2测序
好莱坞女星安吉丽娜•朱莉,通过基因检测发现由于遗传原因,自己携带了BRCA基因,医生告诉她患乳腺癌的几率有87%,患卵巢癌的几率有50%。于是,她为了预防癌症,先是于2013年切除了乳腺,约2年后接着又切除了卵巢和输卵管,震惊世界。 而实际上,新诊断为癌症的患者,也可以通过肿瘤基因检测,指
高质量基因捕获测序如何实现?
近十几年来,NGS(二代测序技术)的快速发展使得DNA测序成本大幅降低,然而就现阶段而言,全基因组重测序的成本依然很高,且得到的海量数据分析速度缓慢,无法大规模地应用。靶向测序技术可以将感兴趣的基因组区域富集出来测序,单个样本测序数据产出少且分析速度较快,因此更能经济高效地发挥NGS技术的优势,广泛
高通量测序平台发展及在临床分子诊断中的应用
自2000年人类基因组计划完成,测序技术得到了快速的发展。在美国ABI公司基于末端终止法的第一代测序基础上,各大公司相继推出了不同的NGS测序平台。核酸(DNA和RNA)测序技术的发展推动了医学对遗传病分子特征的认识。以揭示疾病分子特征为目的的高通量测序,即下一代测序(next generati
单核测序方法精确捕获潜在“致病”的人类大脑细胞类型
细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。根据加州大学旧金山分校(UCSF)对人死后脑组织的研究,发现特定脑细胞中基因活性的变化与自闭症患儿的严重程度有关。作者认为,
测序技术查明罕见疾病致病基因
临床遗传学家Hugh Rienhoff称,9岁大的女儿Bea性格暴躁行为放肆,从生理上看其眼距过宽和上颚后部组织分裂,这些特征据估计很可能是遗传疾病。Bea因无法承担肌肉重量而佩戴支架以支撑纤细的大腿,令Rienhoff忧虑的是,目前健康状况良好的她可能面临严重的心脏疾病。 为了查明女
安捷伦:用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案
简化的RNA和DNA测序解决方案,用于精简临床NGS 2020年9月1日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计,为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法,从而确保客户能够简化并整合其工作流程,而无
PCRfree的靶向捕获技术遇上PCRfree-PacBio-SMRT测序
高通量测序技术已经被广泛用于疾病基因组特征和分子机制研究,研究策略无非是全基因组测序或是靶向测序,在靶向测序中,常见的靶向富集技术有PCR扩增目的区域或基于探针的靶向捕获技术,但这两种方法都很难绕过一个关键步骤-PCR扩增,使得研究人员无法对原始的基因组区域进行测序,从而无法保证测序结果的真实性
武大联合团队开发纳米孔靶向测序-快速“捕获”新冠病毒
武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法(NTS),能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。 3月7日,该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。 既往
追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术
追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术 Thermo 与 Illumina合作的消息公布之后,在生物医学界投下了一颗重磅炸弹,Ion Ampliseq也一下子成为网络热搜词。Ion Ampliseq这个技术究竟是什么?它有什么独特之处?为什么这个技术会造成轰动性的效应呢?让我们追根溯源,
追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术
追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术 Thermo 与 Illumina合作的消息公布之后,在生物医学界投下了一颗重磅炸弹,Ion Ampliseq也一下子成为网络热搜词。Ion Ampliseq这个技术究竟是什么?它有什么独特之处?为什么这个技术会造成轰动性的效应呢?让我们追根溯源,
澳发明新基因测序技术“捕获测序”有助快速诊断血癌
澳大利亚科学家发明了一种新的基因测序技术,其精度大大高于现有方法。它就像一台倍数更高的显微镜,可用于对基因组进行精细研究,并帮助快速诊断血癌(即白血病)。 这项技术被称为“捕获测序”,由新南威尔士大学和加文医学研究所的科研人员开发,发表在新一期英国《自然·方法学》杂志上。 新南威尔士大学日前
澳发明新基因测序技术“捕获测序”有助快速诊断血癌
澳大利亚科学家发明了一种新的基因测序技术,其精度大大高于现有方法。它就像一台倍数更高的显微镜,可用于对基因组进行精细研究,并帮助快速诊断血癌(即白血病)。 这项技术被称为“捕获测序”,由新南威尔士大学和加文医学研究所的科研人员开发,发表在新一期英国《自然·方法学》杂志上。 新南威尔士大学日前
Cell子刊:基因测序揭示血癌致病基因
由圣犹他儿童研究医院-华盛顿大学儿科癌症基因组计划领导的一项研究证实一种融合基因导致了一种预后极差的罕见儿童白血病亚型30%的病例。 研究结果提供了首个证据表明一种错误导致了显著比例的儿童急性巨核细胞白血病(AMKL)。AMKL约占儿童急性髓系白血病(AML)的10%。这一发现为推动迫切所
JAMA子刊:多基因测序改善乳腺癌的检测
斯坦福大学、密歇根大学等机构的研究人员通过一项大型的回顾性群体研究发现,与传统的BRCA1和BRCA2检测相比,对乳腺癌患者的多基因检测让致病变异的检测率提高了一倍,但不会增加预防性的乳腺切除术。这项成果发表在《JAMA Oncology》上。 这项研究由斯坦福大学医学院的Allison Ku
突破耐药基因组测序缺陷-靶向测序对抗耐药菌新契机
自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来,细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后,情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下,敏感菌株被抑制或杀灭,天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播,导致细菌的耐药性增高。 细
靶向捕获让ctDNA无处遁形
循环肿瘤DNA(ctDNA)是一类具备广泛应用前景的肿瘤标志物,可用于肿瘤发展及预后状态的无创测定。现有的ctDNA检测方法要根据每位癌症患者的情况来制定繁琐的检测步骤,且敏感度低,难以适用于广泛的临床应用。近期在Nature Medicine上发表的一篇文章中1,研究人员介绍了一种全新的ctDNA
SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结...
SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结构研究的应用在2020年的美国AGBT(基因组生物学与技术进展)大会上,由斯坦福大学实验室的Alexander Urban和Hanlee Ji主导的一项国际合作项目中,研究人员使用SageHLS超大片段核酸回收系统在结构复杂的人类染色
MALBAC®技术在三代试管婴儿中单基因遗传病检测上的应用
案例分享2016年12月21日16时58分,随着一声清脆的啼哭声,承载着整个家庭梦想的“珍贵儿”诞生了。几天后的新生儿听力筛查结果显示:该婴儿听力完全正常。望着这个健康可爱的小宝贝,一家人喜极而泣。至此,这个家庭的显性遗传性耳聋被彻底阻断了。 此新生儿的奶奶及父亲均是耳聋患者,为了下一代能够彻底摆脱
基因的MALBAC®技术在三代试管婴儿中单基因遗传病检测上
案例分享 2016年12月21日16时58分,随着一声清脆的啼哭声,承载着整个家庭梦想的“珍贵儿”诞生了。几天后的新生儿听力筛查结果显示:该婴儿听力完全正常。望着这个健康可爱的小宝贝,一家人喜极而泣。至此,这个家庭的显性遗传性耳聋被彻底阻断了。 此新生儿的奶奶及父亲均是耳聋患者,
外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用
孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量