发布时间:2017-03-17 16:32 原文链接: 270个与七种疾病有关的基因座,NatureGenetics验证假说

  多年来,自身免疫疾病和炎症疾病的研究已经鉴定出了数百个与这些病症相关的遗传区域。同时,表达数量性状基因座(eQTLs)的相关研究也揭示了正常人群中基因表达水平遗传变异的丰度。目前科学家们大多认为大多数疾病相关基因座是通过基因表达中的调节性变化影响疾病风险,但这种假说并未得到验证,尤其是大多数影响疾病风险的遗传基因座是否也可以被eQTL检测到。

  为了验证这一假说,来自布莱根妇女医院(Brigham and Women's Hospital,BWH)的研究人员分析大约270个与七种疾病相关的遗传基因座,尝试在关键免疫细胞中利用eQTL将它们映射致病基因上,这一研究成果公布在Nature Genetics杂志上。

  在高等生物中,许多重要生理性状及复杂疾病都是数量性状,如农作物的产量和人类的高血压、糖尿病等,这些复杂性状受到多个基因和环境因素的控制。为了有效地研究多基因控制的复杂性状,数量性状基因座(QTL)分析技术在20世纪90年代应运而生,有效地将控制数量性状的众多主效基因定位在相应的染色体上。

  在这篇文章中,研究人员分析了大约270个与七种疾病相关的遗传基因座,其中55个候选基因关联与未受刺激的免疫细胞中的基线基因表达的变化具有强统计学一致性,但是这只是其中的少部分基因座,大约为25%。而余下的研究人员没有观察到eQTL数据中与自身免疫性疾病相关性一致的任何信号,尽管事实上与其它疾病相比,更容易从血液样品获得疾病相关的细胞群体。

  文章作者表示,“如果只是基于与疾病的相关性来推断观察到的eQTL的病理相关性,那么就必须十分谨慎“。因此在进行耗时又昂贵的实验性解析之前,需要先获得共有遗传效应的有力证据。

  此前,在美国国立卫生研究院基因型-组织表达(GTEx)项目的资金资助下,美国研究人员曾构建出了一个新数据资源,可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。

  甚至在多个组织中活化之时,同一变异有时在不同的组织中也可以产生不同的影响。例如,GTEx研究人员发现有一个变异影响了两个与血液相关的基因的活性,虽然在其他组织中有着更高的总体基因活性,它对胫动脉中血压相关的基因表达造成了更强的影响。牛津大学的Manuel Rivas博士和同事们利用 GTEx数据和来自一个大型欧洲项目的信息,研究了600多人的基因读值。研究小组发现一些PTVs是通过降解基因转录物或是破坏剪接过程来影响了蛋白质生成。研究人员利用GTEx数据在两种情况下检测了一些个体和组织类型中的这些效应。研究小组现正在开发更好的方法来预测患者中发现的一些PTVs的影响。

相关文章

全新表观遗传分子助力口颌面自身免疫疾病诊治

近日,上海交通大学医学院附属第九人民医院(以下简称“九院”)口腔外科郑凌艳课题组联合口腔微生态与系统性疾病实验室,原创性地挖掘了介导免疫细胞糖代谢重编程的全新表观遗传分子,为口颌面自身免疫疾病诊治提供......

白细胞介素17信号介导炎症慢性化持续机制方面取得进展

南京大学徐强教授团队在白细胞介素-17(IL-17)信号介导炎症慢性化持续机制方面取得进展。研究成果以“白细胞介素-17受体信号的自激活可维持炎症持续并促进疾病进展(Anautonomousactiv......

研究人员发现神经元能够冷却脂肪组织中的炎症

正如食物中存在不同类型的脂肪一样,体内也存在不同类型的脂肪组织。白色脂肪组织(WAT)是最丰富的脂肪形式,而棕色脂肪组织(BAT)在生热作用(通过燃烧卡路里产生热量的过程)中发挥着重要作用。最近的研究......

合成肽:炎症性疾病检测的游戏规则改变者

来自BÜHLMANN和EPFL的科学家们开发了肽,作为抗体的替代品来检测对诊断和监测炎症性疾病至关重要的蛋白质--钙蛋白。这些多肽为生物标志物的检测提供了一种更准确、更稳定和更具成本效益的手段,提高了......

铜促进炎症产生机制,有望开发抗击炎症和癌症的新疗法

炎症是一种复杂的生物过程,可以根除病原体并促进受损组织的修复。然而,免疫系统失调会导致炎症不受控制,反而产生病变。炎症也与癌症有关。炎症的分子机制并不完全了解,因此开发针对炎症的新药面临着重大挑战。早......

端粒、线粒体、炎症“关系匪浅”衰老三标志共同作用可防癌

随着年龄的增长,染色体的端粒逐渐缩短。美国索尔克研究所的科学家们发现,当端粒变得非常短时,它们会与“细胞的发电厂”线粒体进行交流。这种交流会触发一组复杂的信号通路,并引发炎症反应,从而破坏可能癌变的细......

2023年曹雪涛团队首篇文章:事关免疫和炎症机制

自身免疫和自身炎症反应源于对自身成分的异常免疫和炎症反应,有助于各种自身免疫性疾病和自身炎症性疾病。RNA结合蛋白(RNA-bindingproteins,RBPs)是免疫细胞发育和功能所必需的,主要......

女性皮下脂肪给大脑当“保镖”

美国科学家研究称,女性臀部、手臂等部位堆积的更多脂肪,即所谓皮下脂肪,至少可以在更年期之前防止大脑炎症。而大脑炎症会导致痴呆和中风等病变。相关研究近日发表于《糖尿病》。男性多在腹腔等主要器官周围堆积脂......

阳康后嗅觉长期失灵?Science子刊:背后根本原因找到了

SARS-CoV-2会引起嗅觉的深刻变化,包括完全丧失嗅觉。尽管这些改变通常是短暂的,但许多COVID-19患者表现出持续数月至数年的嗅觉功能障碍。尽管动物和人体尸检研究已经提出了导致急性嗅觉丧失的机......

解开细胞死亡和炎症之间的隐藏联系

随着研究人员对人体免疫系统的动态内部世界有了新的认识,越来越清楚的是,线粒体是我们身体对疾病反应的关键调节器。除了它们作为“细胞的动力源”的传统工作之外,线粒体在细胞的生命——更重要的是,死亡——中发......