由分子生物学研究所的Brian Luke和Helle Ulrich教授领导的两个研究小组已经破译了如何协调两种酶RNase H2和RNase H1从染色体上去除RNA-DNA杂合结构。
RNA-DNA杂合体对于促进正常的细胞活动(如基因调控和DNA修复)很重要,但过多也有DNA受损的风险,并可能导致神经退行性疾病和癌症。 Brian和Helle在今天发表在《 Cell Reports》上的文章中表明,RNase H2酶主要是在DNA复制后去除RNA-DNA杂合体。然后,任何剩余的RNA-DNA结构都会被RNase H1去除,而RNase H1的作用与细胞周期无关。
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通常发现DNA是稳定的双链结构。但是,DNA有时也会与RNA相互作用形成调节基因表达和DNA修复的RNA-DNA杂化结构。 R-环是一种特殊类型的RNA-DNA杂合体,其中RNA链与DNA分子的一条链结合,并推出另一条DNA链,从而使其暴露为单链环。 R环可调节基因活性,但由于不正确的去除会损坏DNA,从而可能引起突变,因此也会迅速变得危险。因此,过量的R环形成可能对细胞有毒-实际上,已知R环去除蛋白中的突变会导致神经炎性疾病和癌症。
RNase H1和RNase H2酶催化R环的去除,降解RNA链。另外,RNase H2还具有切除单个核糖核苷酸的辅助能力,有时会被聚合酶错误地掺入DNA中,称为核糖核苷酸切除修复(RER)。先前的研究表明,RNase H2的突变比RNase H1突变对基因组稳定性的破坏更大,这表明RNase H2在维持基因组稳定性方面具有更重要的作用。但是,从来没有完全了解这些重要的酶是如何协调的。
为了剖析RNase H1和H2在R环去除中的独特作用,作者改造了酵母,使其仅在细胞周期的特定阶段表达RNase H1和H2,然后将其暴露于甲磺酸甲酯(MMS)中,这种物质会增加R环形成。在此条件下,只有能够有效去除R环的酵母才能生存,而那些具有受损R环去除能力的酵母将无法生存。
在Ulrich实验室的支持下,他们发现仅在G2期间(DNA复制后细胞周期的“生长阶段”)表达RNase H2的酵母对MMS具有抗性,而仅在S阶段(DNA复制阶段)表达RNase H2的酵母对)更敏感。这表明RNase H2主要作用是在G2期间处理R环。相反,在G2或S期表达RNase H1的酵母都能在MMS中存活。出乎意料的是,RNase H2在S期的表达实际上引起了更多的DNA损伤,这需要一种特殊的DNA修复方法,即同源重组来修复。先前不知道该途径在S期起作用。因此,这项研究可能已经揭示了一种未探索的修复途径,该途径可抵抗DNA复制过程中RNase H2活性引起的损伤。
这些结果可以解释为什么细胞进化出两种不同的RNAse H酶。Brian Luke说:“我们认为RNase H2是修复大多数RNA-DNA杂种的'管家'酶,但它受到细胞周期的严格调节,仅在G2期或DNA复制后起作用。” Brian和Helle推测这可能是因为RNase H2的额外RER活性在DNA中产生了缺口,这在S期DNA复制过程中有双链断裂的风险。因此,细胞可能还进化出了一种不具有RER活性的二级酶RNase H1,它可以在细胞周期的所有阶段(包括S期)发挥作用。
这些发现有助于我们进一步了解细胞如何修复与RNA-DNA杂种有关的DNA损伤以及该过程的损伤如何导致疾病。
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