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如何协调两种酶从染色体上去除RNADNA杂合结构?

由分子生物学研究所的Brian Luke和Helle Ulrich教授领导的两个研究小组已经破译了如何协调两种酶RNase H2和RNase H1从染色体上去除RNA-DNA杂合结构。 RNA-DNA杂合体对于促进正常的细胞活动(如基因调控和DNA修复)很重要,但过多也有DNA受损的风险,并可能导致神经退行性疾病和癌症。 Brian和Helle在今天发表在《 Cell Reports》上的文章中表明,RNase H2酶主要是在DNA复制后去除RNA-DNA杂合体。然后,任何剩余的RNA-DNA结构都会被RNase H1去除,而RNase H1的作用与细胞周期无关。(图片来源:Www.pixabay.com) 通常发现DNA是稳定的双链结构。但是,DNA有时也会与RNA相互作用形成调节基因表达和DNA修复的RNA-DNA杂化结构。 R-环是一种特殊类型的RNA-DNA杂合体,其中RNA链与DNA分子的一条链结合,并推出另一......阅读全文

DNA and RNA EXTRACTIONS

A protocol / method / schedule /procedure for extraction / isolation of both DNA and RNA from the same material typically plant leaf / leaves(See also

RNA连接酶与DNA连接酶的区别

RNA连接酶与DNA连接酶的区别RNA聚合酶是在转录的时候,以核苷酸为原料,DNA的一条链为模板,合成RNA的酶RNA连接酶是可以识别特定RNA序列,将两端RNA链接起来的酶

RNA连接酶与DNA连接酶的区别

真核细胞RNA前体形成成熟的功能RNA分子时,需要经过剪切和连接过程.RNA连接酶可能在此过程中起连接作用.真核细胞RNA前体形成成熟的功能RNA分子时,需要经过剪切和连接过程.RNA连接酶可能在此过程中起连接作用.RNA连接酶与DNA连接酶的区别RNA聚合酶是在转录的时候,以核苷酸为原料,DNA的

RNA酶保护试验

    RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗

DNA、RNA斑点杂交

实验概要将RNA  或DNA 变性后直接点样于硝酸纤维素膜上,同探针进行杂交,用于基因组中特定基因及其表达的定性及定量研究,称为斑点印迹。与Southern  及Nouthern  印迹法相比,其优点是简单、迅速,可在一张膜上同时进行多个样品的检测,特别是对于核酸粗提样晶的检测。缺点是不能鉴定所测基

DNA和RNA提取原理

TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,R

RNA 和 DNA 提取:洗脱

DNA 提取方案的还剩余IDE步骤步就是从硅胶中释放纯 DNA 或 RNA。对于 DNA 制备,通常使用 pH 值为 8-9 的 10 mM Tris。DNA 在弱碱性 pH 值下更稳定,在缓冲液中溶解得更快。即使对于 DNA 颗粒也是如此。水的 pH 值往往较低,低至 4-5,并且高分子量 DNA

DNA提取方法--洗涤 DNA(或 RNA)

当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤

用 T4 DNA连接酶连接RNA分子

实验材料 T4DNA 连接酶 T4 多聚核酸激酶 RNA 供体 受体 寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒 10X 连接缓冲液 [Y32P]ATP 无 RNase 水 l0 mmol LATP RNasin。 无 RNase 的 DNase。 5XTBE 2X 变性胶上样缓冲液 TE仪器、耗材 真空

RNA酶活性的控制

为了获得高质量的真核细胞mRNA, 必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法,最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNA酶的活性。同时,避免偶然引入实验室内其他潜在的痕量RNA酶也很重要。下面列举避免RNA酶法染问题的一些注意事项。大多数有经验的研究者并不拘泥于这些注

如何防止RNA酶污染

在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所

RNA酶活性的控制

为了获得高质量的真核细胞mRNA, 必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法,最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNA酶的活性。同时,避免偶然引入实验室内其他潜在的痕量RNA酶也很重要。下面列举避免RNA酶法染问题的一些注意事项。大多数有经验的研究者并不拘泥于这些注

防止RNA酶污染方法

防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。3. 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10mi

真菌DNA和RNA提取方法

真菌DNA和RNA提取方法一、真菌DNA的提取(方法一)实验试剂(1)DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS(2)3M NaAc(3)TE:10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA(4)酚(p

RNA和DNA病毒的区别

DNA病毒和RNA病毒的区别,主要是病毒核酸的类型不同,DNA病毒的病毒核酸是DNA,RNA病毒的病毒核酸是RNA。RNA病毒的复制过程比较独特,由于遗传信息直接保存在RNA上,因此复制过程通常发生在细胞质内。RNA病毒是用它们自己的RNA复制酶来对基因组进行复制,但是DNA病毒基因组的复制发生在细

生物薄膜DNA、RNA提取要点

 早前的文章我们讨论过了生物薄膜(biofilm)样品的基本特性以及影响样品制备和处理方法的因素。今天我们与你分享提取生物薄膜样品DNA或RNA的几个要点。下面列是我们处理了大量各种类型生物薄膜和微生物垫(biomats)总结出来的,以及与我们联合共同开发PowerBiofilm Kit的科学家的经

简明介绍DNA与RNA异同

  一、DNA和RNA异同点  1.核酸是携带遗传信息的物质;在生物体的遗传、变异和蛋白质的生物合成中 有极其重要的作用。核酸有DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)两种核酸。  2.真核细胞DNA主要分布在真核细胞的细胞核中,少部分分布在线粒体和叶绿体中;RNA主要分布在细胞质中,少部分分布在

FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp

用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

实验材料 T4RNA连接酶供体RNA受体RNA试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液无核酸酶的水FEGRNA酶抑制剂实验步骤 一材料与设备1)10XT4RNA 连接酶缓冲液:50 mmol/LTris (pH7,8),l0 mmol/L MgCl2,5 mmol/LDTT,1 mmol/L AT

用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

            实验材料 T4RNA连接酶 供体RNA 受体RNA 试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液

3.6.1 用 T4 DNA连接酶连接RNA分子

T4 DNA 连接酶可将双链复合物缺刻连接,其中包括 RNA-DNA 杂合链及 RNA-RNA 杂合链。实验材料T4DNA 连接酶T4 多聚核酸激酶RNA 供体受体寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒10X 连接缓冲液[Y32P]ATP无 RNase 水l0 mmol LATPRNasin。无 RN

3.6.2 用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

T4RNA 连接酶已经用来生成很多位点特异修饰的 RNA,尤其是寡核苷酸修饰和用反义密码 tRNA 修饰的 RNA。另外,T4RNA 连接酶还可用于 RNA/DNA 分子内/分子间连接、甲链寡脱氧核苷酸的连接、克隆全长 cDNA 及将非天然氨基酸掺入蛋白分子中。实验材料T4RNA连接酶供体RNA受体

RNA SI 核酸酶作图

            实验材料 [γ-32P」ATP 合适的寡核苷酸 DNA 模板l 10XdNTP 混合物 KLenow 片段 合适的限 制性内切核酸酶

RNA SI 核酸酶作图

实验材料 [γ-32P」ATP合适的寡核苷酸DNA 模板l10XdNTP 混合物KLenow 片段合适的限 制性内切核酸酶X 射线胶片洗脱缓冲液tRNA 石蜡油S1 核酸酶试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液PNK10X 复性缓冲液6% 聚丙烯酰胺 8mol L 尿素溶液 (溶于 0.5XTBE) 及甲

RNA修饰相关酶PCR芯片

应用场景:通过关键酶/蛋白的RNA表达变化,确定样品表型与特定RNA 修饰的联系 优势:预制的PCR板,覆盖68个针对不同RNA修饰的Writers/Erasers/Readers基因。精心优化的引物Tm值均一,并经过了严格的预实验验证,无须摸索引物设计和测试。工业化生产的高度均一的PCR

RNA复制酶的相关介绍

  即“RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)”RNA聚合酶的一种,存在于大部分RNA病毒中。和细胞中用来转录的RNA聚合酶(DdRp)不同,RNA复制酶的模板是RNA分子。  某些RNA复制酶还有解旋酶活性,正链RNA或双链RNA病毒复制时都会产生双链RNA,RNA复制酶可以解开这些双链,保证RNA

RNA聚合酶的特点

RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点:①以DNA为模板;②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应;④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸;⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。

防止RNA酶污染的措施

在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所

RNA聚合酶的类别

通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500

什么是端粒酶RNA?

端粒酶RNA(TR),是端粒酶的一个组成部分,由端粒酶RNA基因(TERC)编码。端粒酶RNA在脊椎动物中,纤毛虫和酵母菌的序列和结构之间有很大的不同,但它们共享一个5'假结结构的模板序列。脊椎动物端粒酶RNA的3'H / ACA snoRNA的域。