外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量测序在疾病病因寻找中逐步显示出巨大的潜力。 二代测序方法中全基因组测序、外显组测序和定向基因测序是最为常用的方法,各种方法各有其优势。全基因组测序覆盖了最广泛的区域,可以检测非编码区的突变,但测序量要求大,费用高,测序平均深度低,发现的突变的置信度可能下降。疾病相关基因的定向测序所需的测序量最少,获得的测序深度最大,但不适合用于罕见的、或者相关疾病基因研究不成熟的遗传病。而外显子组测序相比全基因组测序降低测序量,提高测序深度,使得突变的发现更加可靠,而针对所有编码区域、部分表达调控、microRNA测序等全面的检测,相比定向基因......阅读全文

外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量测序

外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

  孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高通量

Cell改写百年孟德尔遗传定律

  研究人员给百年历史的孟德尔遗传生物定律增加了一个新观点——他们发现在怀孕妈妈的体内有一小群细胞提高了遗传适合度和多代的生殖健康。来自辛辛那提儿童医院医学中心的科学家们将他们的研究发现报告在7月23日的《细胞》(Cell)杂志上。  论文的资深作者、辛辛那提儿童医院围产期研究所及传染病部门儿科医生

Cell改写百年孟德尔遗传定律

  研究人员给百年历史的孟德尔遗传生物定律增加了一个新观点――他们发现在怀孕妈妈的体内有一小群细胞提高了遗传适合度和多代的生殖健康。来自辛辛那提儿童医院医学中心的科学家们将他们的研究发现报告在7月23日的《细胞》(Cell)杂志上。  论文的资深作者、辛辛那提儿童医院围产期研究所及传染病部门儿科医生

分子遗传学词汇外显子

断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语

孟德尔遗传病可用基因的突变进行病因确认

  孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一.对于,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、表型特点进行临床判断,同时通过细胞、分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认.传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、芯片分析、目标基因的一代Sanger测序等,而随着二代测序的发展,高

分子遗传学词汇外显子互换

中文名称:外显子互换英文名称:exon exchange定  义:通过交换外显子进行基因重排的方式。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇外显子捕获

中文名称:外显子捕获外文名称:exon trapping定义:外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体

分子遗传学词汇外显子跳读

中文名称:外显子跳读英文名称:exon skipping定  义:跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇外显子混编

当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。中文名称:外显子混编定    义:混编而成基因片段可能就是外显子

外显子测序成诊断遗传病新希望

  当一个婴儿迟迟不会爬或说话,或者出现其他症状表明其可能有遗传性疾病时,家长寻找答案的过程通常是漫长且令人沮丧的。医生可能会安排一系列的测试,但仍不能得出一个特定的诊断结果。   现在,价格便宜的DNA测序能有助于揭示这些神秘疾病的原因。该方法是对病人编码蛋白质的DNA中的1%(外显子组)进行测

孟德尔豌豆实验(图)

孟德尔认为子一代的遗传性状来自于亲代父本和母本,然后再把这些性状传给子二代,而不是在子代那里混合起来的。 纯合的父本(圆豌豆)和纯合的母本(皱豌豆)杂交,每个亲代产生一种配子,S 或 s,杂交之后产生的子一代的基因型都是Ss,而表型都是圆豌豆。 当子一代进行自交时,它产生两种卵细胞,S和s,还有两种

人类外显子组迄今最全遗传变异记录公布

  近期发布的几组研究报告显示,科学家们正以前所未有的力度考察人类的遗传变异。其中在一项关于人类基因组外显子组(蛋白质编码区)的深度分析中,研究人员提供了迄今为止有关该区域最全面的遗传变异记录;而在另一项研究中,科学家们改进了对基因变体的解读。  基因组分析 外显子组领先  简单来说,外显子组就是遗

Nature子刊:外显子测序助力遗传病诊断

  德州大学健康科学中心休斯顿UTHealth和巴黎的研究人员发现,TGFB2基因突变会引起一系列系统性并发症,包括致命的胸主动脉瘤和颅内动脉瘤。这一新综合症具有与Marfan综合症和Loeys-Dietz综合症类似的症状,但并不完全相同。文章于7月8日发表在Nature Genetics杂志网

NIH拨款7000万美元资助疾病基因组研究

  美国国立卫生研究院(NIH)计划投资新建两个遗传疾病基因组学研究中心。NIH投资6000万美元助研常见疾病遗传因素的研究,另外1000万美元资助孟德尔遗传性疾病的研究。  这些基因组学研究中心将是大规模测序平台,用于鉴定遗传学疾病的罕见基因变异,危险因素和保护因素。项目目标包括尽可能全面和更好地

Nature:RNAseq疾病诊断潜力不容忽视

  全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS)对于罕见的孟德尔遗传病的检测能力最高只能达到50%,基于这两种手段,我们对于遗传多样性带来具体生物学功能差异和临床疾病病因的解释能力是十分有限的。Cummings课题组曾使用RNA测序(RNAseq)对肌肉疾病进行了准确的检测,证实了RNAseq在

Cell:揭示玉米破坏孟德尔定律之谜

  正如19世纪奥地利植物学家格雷戈尔-孟德尔(Gregor Mendel)首次描述的那样,现代遗传学的基础是基因以一种可预测的方式传递给后代。他确定了基因是成对存在的,一对基因中的每一个都有相同的机会传递给下一代,这就是著名的孟德尔定律。但是,在极少数情况下,细胞中的染色体能够欺骗这个过程并以较高

-基因外显子组测序,可以诊断近三成的临床疾病

  贝勒医学院分子和人类遗传学儿科学系、人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心的研究人员最新一项报道称,在家族性帕金森病患者发现几个关键的突变基因,包括TNK2和TNR有稀有突变。在12个家系中,这两个基因有9个突变位点。这项研究为深入研究帕金森病的致病基因提供依据。  实际上,贝勒

“疑难杂症”的基因秘密

  所谓“罕见病”顾名思义就是指那些发病率极低的疾病,又称孤儿病,也就是我们平时说到的疑难杂症,目前确认的罕见病有六七千种,约占人类疾病的10%,在这些疾病中,约有80%是遗传缺陷所致,而且重要的是多数都是单基因(例如α1-抗胰蛋白酶缺乏症)缺陷,而另一些是由于几个基因突变,这就为这类疾病的诊断和治

对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

  据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。    研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序分析。他们成功地对其中5名患

挑战孟德尔和达尔文定律的基因

  去年2月份,北卡罗来纳大学教堂山分校(UNC)的医学研究人员发现,一个叫做R2d2的基因——减数分裂驱动(meiotic drive)2的响应基因,打破了一百多年以来的孟德尔“分离定律”,该定律认为,后代继承双亲每个基因两个拷贝其中一个的概率是相等的。  多年来,科学家们有证据表明,在哺乳动物中

对于不明原因的肝病,外显子组测序显神威

  据统计,大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”,就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍,也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过,最新研究表明,外显子组测序能够发现部分患者中的突变。  耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序

Nature:四分之三基因均突变

  来自贝勒医学院等处的基因组学和遗传学专家指出,从进化的角度上说,在最近的五千到一万年间,编码细胞蛋白的基因有将近四分之三发生了突变。这一令人惊讶的研究成果公布在Nature杂志上。   文章的作者之一,贝勒医学院分子和人类遗传学教授Suzanne Leal博士表示,“其中最有趣的一点就是,

Science:三大型测序项目公布初步成果

  寻找对常见病患病风险有重大影响的基因突变比人们预想的更加困难。美国人类遗传学学会ASHG的年会于本月召开,一些大型DNA测序研究公布了初步成果,这些项目旨在寻找一些常见病(如糖尿病或心脏病)背后的潜在突变。在这一领域有一个颇为普遍的观点,一般人群中或多或少携带着一些罕见突变,这些突变大大增加(或

全外显子组测序接近成为“新家族史”

  贝勒医学院分子和人类遗传学儿科学系、人类基因组测序中心和德克萨斯大学健康科学中心的研究人员曾经报道称,在3386名接受全外显子组检测的患者当中,有大约四分之一的患者被诊断为一种已知的遗传疾病。  最近在《Journal of the American Medical Association》(J

外显子应用机理

应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。

什么是外显子?

断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。

Science大型低成本,外显子测序成果

  来自华盛顿大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员利用一种新型技术,完成了多达2446个样品外显子测序分析,找到了自闭症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的多个频发突变,不仅为治疗ASD疾病提供了新思路,而且也提出了一种低成本,多基因测序新方法。相关成

Nature-Genetics:全基因组测序的诊断价值

   根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。   这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查

Nature-Genetics:全基因组测序的诊断价值

  根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。  这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来解