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2015年可谓是基因测序的元年，自精准医疗概念提出以来，基因测序在我国曾几度被央视报道。随着人类基因组计划的完成，基因测序技术不断提高，价格也不断降低，人类完成各种基因组测序成为了可能。无论在医疗行业还是在农业等领域，基因测序技术均大放光彩，殊不知，近年来基因测序在食品行业也渐渐崛起。本文综述了近期国内基因测序的新研究成果，同时盘点了发生在食品领域的基因测序事件。 近期我国基因测序科研领域所获的成就 基因测序在医疗界可谓是如火如荼，国家对医疗领域基因测序的政策出台速度和密度史无前例，国内测序市场规模也迅猛增长，预计未来市场规模可破千亿元。除了受医疗领域青睐，农业也钟情于基因测序，目前我国已完成了水稻、小麦、玉米以及黄瓜等大概70%到80%重要的作物基因组测序，初步掌握了这些作物遗传基因的功能性状，研究水平已走在国际前列。 基因测序不仅受到我国企业家们的青睐，同时也是科研界的宠儿，近期我国有关基因测序的研究成果频频发表于......阅读全文
作为世界三大粮食作物之一，小麦养活了全球40%的人口，提供人类营养所需的20%的热能和蛋白质。 随着基因组学的发展，水稻和玉米的基因组相继被破译，但关于小麦基因组的测序研究依然困难重重、进展缓慢，小麦基因组成了横在科学家面前的一座大山。 中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工
现代基因组学的最大需求之一，就是得到人类和模式生物的高质量完成基因组。目前，人们利用二代测序技术对越来越多的物种(从原核生物到真核生物)进行了基因组测序，取得了许多重要的研究成果。 不过大部分物种的基因组还中存在有大量的缺口gap，就目前的数据来说，各种已测序物种的基因组中缺口gap所占的
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！ 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低，全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源，但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用，使得基因组数据面临很多问题。 近
2 Craig Venter挑战人类基因组计划 John Craig Venter 出生于1946年，曾应征加入美国海军医疗队参加越战，越南战场的残酷使他认识到时间和生命的宝贵，“人生的每一分钟都应该有所创新”。回国后，Venter仅用了6年时间先后就读于圣马特奥学院 (College o
在完成的基因组的复兴时代，科学家使用由第三代测序技术提供的长读取，来填补基因组装配中的缺口（gap）。新一代测序能赶得上吗？ 新一代测序，可让科学家们以比Sanger测序更快的速度和更低的价格，进行基因组测序，为1000美元基因组测序铺平了道路。但是这种方法牺牲了长读取速度，将平均读长减少至大
猫是研究人类失明和艾滋病模型之一，因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”（Cinnamon）的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》（Genome Research）杂
在DNA测序过去的40年中，我们见证了诸多技术的变革和测序规模的极度增长。从几千个碱基到第一个人体基因组，乃至当前数以万计的人体和无数其它的基因组。包括作为大量分子现象的“计数器”在内，DNA测序被广泛和创造性地应用于各个领域。从长远来看，我们可以预测DNA测序技术所带来的影响将会与显微镜的使用
新的一年即将来临，The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究，让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。 斑马鱼基因组 种属：Zebrafish, Danio rerio 基因组大小：~1.41 billion base pairs 斑马鱼(Da
麦田 研究人员已经展示了普通小麦基因组的序列草图，从而在通往创制世界上种植最广泛谷物作物之一的完整参考序列的道路上到达了一个主要的里程碑。他们的工作给了科学家们一个可在小麦个体染色体上快速定位特定基因的工具，这一资源可帮助他们改良小麦育种以满足从未有过的对食物的更高需求，加快小麦新品种的开发并增加
近来，各大杂志上陆续发表了不少重要的基因组测序成果。the scientist杂志对此进行了盘点，以飨读者。 种属：野鸭，绿头鸭(Anas platyrhynchos) 基因组：约13 billion bp 鸭子是几乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人员测
8月2日，我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法，在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。 事实上，自2000年人类基因组草图绘制完成迄今，科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因，基于此的基因诊断产业已经初现端倪，但10
不久前，中国科学院遗传与发育生物学研究所发表于国际著名期刊《自然》的论文称，该所研究团队已完成小麦A基因组测序和染色体精细图谱绘制。这是继2013年，该团队成功绘制出小麦A基因组祖先种乌拉尔图小麦基因组草图并发表于《自然》之后，在此领域的又一项重大成果。图片来源于网络 中国科学院遗传与发育生
美国科学家于1985年率先提出人类基因组计划，1990年正式启动，美国、英国、法国、德国、日本和中国科学家都参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。之后，2000年6月26日，六国科学家共同宣布，人类基因组草图的绘制工作已经完成。在这场规模宏大、影响世界的基因测序项目落幕后，全球内陆续又有不
几近完成的普通小麦基因组测序 研究人员已经展示了普通小麦基因组的序列草图，从而在通往创制世界上种植最广泛谷物作物之一的完整参考序列的道路上到达了一个主要的里程碑。他们的工作给了科学家们一个可在小麦个体染色体上快速定位特定基因的工具，这一资源可帮助他们改良小麦育种以满足从未有过的对食物的更高需求
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文，引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法，不通过培养，直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物，甚至可以
由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序，并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。 研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍
作为测序生力军的第三代测序技术能够大大增加测序的效率和通量，不过很显然第二代测序技术仍会继续被广泛采用。近日BioTechniques杂志评出了今年最受欢迎的两篇测序文章以飨读者，而这两篇文章正是目前技术过渡时期的写照。 近年来，基因组学、转录组学和宏基因组学等领域迎来了爆炸式的增长，这都
美国马里兰州伯赛大，2014年7月18日 国际小麦基因组测序协作组织今日在国际知名杂志《科学》上公布了普通小麦的基因组草图。作为世界上种植最广泛的谷物作物，这份基于单条染色体而绘制的基因组草图为揭示其复杂而庞大的基因组之结构、组织及进化特征提供了新的视角。 对于植物科学研究者和育种家来说，这份
从安吉丽娜·朱莉进行乳腺癌基因检测、个性化DNA检测被美国《时代》杂志评为年度最佳发明，到转基因食品大讨论，再到复旦大学日前关于曹操家族DNA的研究成果……今天，“基因”已当之无愧地成为一个全民话题。 2003年，人类绘制成功第一幅基因组工程(HGP)草图。10年来，由中国完成的基因测序物
科学技术进步有多快？当我们今天大谈基因测序与健康话题时，别忘了人类基因组计划才完成不过15年。 2000年6月26日，时任美国总统克林顿在白宫举行的记者招待会上郑重宣布，由来自美国、英国、德国、日本、中国和法国的上千名科学家共同参与的“人类基因组研究计划”已经完成人类基因组草图。他在评价这一历
美国马里兰大学医学院基因组科学研究所(IGS)近日获得美国FDA的一份研究项目合同，利用两种高通量测序技术对细菌病原体进行测序、组装和注释，以支持公共参考数据库的扩展。 据介绍，这个项目将持续两年，目标是产生序列草图，让其他研究人员能够用来开发和评估基于NGS的体外诊断，以鉴定病
小麦是全球最重要的粮食作物之一，提供了20%人类所需的热量。2010年英国科学家宣布他们绘制出了小麦基因组草图，但这一序列并不完整。在7月17日Science杂志上，两个研究组分别公布了Chinese Spring小麦品种的每个染色体臂的基因组序列，以及小麦染色体3B基因组序列，另外两个研究小组
美国于2015年年初提出的“精确医学”计划倍受世界各国关注。有消息称，我国的相关计划将在今年下半年或明年启动。对此，中科院上海生命科学研究院吴家睿研究员近期撰文指出，“精确医学”是一个有着丰富内涵的复杂概念，需要人们认真地思考和小心地解读。当前，亟需我们明晰的两个问题是：为何要在此时启动精确医学
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
对面包型小麦基因组进行的初步测序有助于科学家的改良工作。 一些人相信，攀登农作物基因组中的珠穆朗玛峰——具有挑战性的小麦基因组——的艰巨任务已经接近完成。一个国际研究团队已经拿出了一份小麦脱氧核糖核酸（DNA）序列的草图——这份草图鉴别出了小麦的许多基因，并且可能勾勒出了有
57年前，美国生物学家詹姆斯·沃森与弗朗西斯·克里克共同发现了脱氧核糖核酸(DNA)分子结构的双螺旋模型，并因这项基因研究领域的重大突破获得诺贝尔奖。今天，沃森成为自己研究的受益者——他将成为世界第一份完全破译的“个人版”基因组图谱的拥有者。 仅用两年完成海量工程 据英国《独
新的基因研究成果可能将成为开发各种更加抗盐、抗旱或提高产量的小麦新品种的开始。 随着英国科学家日前发布了第一批小麦基因组的测序结果，一项能够改进未来农作物并提高农业产量的生物技术研究取得了重要进展。 科学家们表示，新的基因研究成果可能将成为开发
生物探索网站报道 据外媒报道，有科学家称，他们组合了一条更完整的基因链条，这个基因链条可以控制鹦鹉模仿主人和其他声音的能力。 研究者用一种新技术分解了鹦鹉的基因组中的某个区域，进行了单分子测序，并用来自较早的DNA解码设备的数据对其进行了纠错。研究者还解码了来自玉米和细菌的难以测序的基因物