泛素连接酶E3的识别机制

靶蛋白通过被泛素途径的酶E2或E3识别而被泛素化修饰,通常是通过识别靶蛋白的特定Lys残基而将泛素连接到靶蛋白上。有时对靶蛋白的识别还需要特定位点的磷酸化并且要达到一定的磷酸化阈值。除此之外还有另外两种识别机制,即N.end规则和一种新的区别于N.end规则的N端氨基酸残基识别机制。N.end规则一般是针对于不稳定的蛋白质而言(若N端第一个氨基酸是Phe、Leu、Trp、Tyr、Ile、Arg、Lys和His等时此蛋白质为不稳定蛋白质),泛素系统识别靶蛋白N端的不稳定氨基酸,然后将泛素连接到靶蛋白特定或非特定的Lys残基的£氨基基团上。 区别于N.end规则的N端氨基酸残基识别机制一般是针对于某些N端并不是不稳定氨基酸残基的靶蛋白,泛素系统识别靶蛋白N端氨基酸序列蕴涵的泛素化修饰信息从而将靶蛋白泛素化标记。对于此种识别机制,LYS残基不是必须,靶蛋白中所有Lys残基被剔除后仍然被泛素化修饰降解,但与野生型相比泛素化修饰率偏......阅读全文

泛素连接酶E3的识别机制

  靶蛋白通过被泛素途径的酶E2或E3识别而被泛素化修饰,通常是通过识别靶蛋白的特定Lys残基而将泛素连接到靶蛋白上。有时对靶蛋白的识别还需要特定位点的磷酸化并且要达到一定的磷酸化阈值。除此之外还有另外两种识别机制,即N.end规则和一种新的区别于N.end规则的N端氨基酸残基识别机制。N.end规

泛素连接酶E3的基本介绍

  泛素蛋白酶体途径是己知的所有真核生物体内具有高度选择性的最为重要的蛋白质降解途径。真核细胞中泛素化修饰后的靶蛋白可能被降解、可能被转移到细胞或细胞外的特定部位,也有可能导致靶蛋白的功能发生变化,这主要取决于靶蛋白所加的泛素链的结构,以及泛素链的长短。泛素连接酶E3决定靶蛋白的特异性识别,在泛素途

概述泛素连接酶E3的分类

  发现鉴定的泛素连接酶E3主要有两大类:HECT结构域家族和RING结构域家族,最近又发现了一类新的E3家族:U.box蛋白家族。HECT结构域主要是通过与泛素形成催化作用所必需的硫酯键发挥作用,而RING结构域为E2和底物提供居留位点从而使E2催化泛素转移到底物上。

BMC-Biology:基于深度学习预测E3泛素连接酶识别位点

真核细胞内蛋白质的降解依赖于自噬及泛素-蛋白酶体系统(2004年诺贝尔化学奖)。其中,泛素-蛋白酶体系统负责降解细胞内超过80%的蛋白,该系统的关键酶为E3泛素连接酶,负责识别要被降解的底物蛋白并将其泛素化。人体内表达600余种E3,这些E3以特定规则结合不同底物蛋白,从而实现降解过程的特异性。底物

简述HECT结构域家族的泛素连接酶E3

  HECT结构域(homologoustoE6-APCterminus,HECT)家族的泛素连接酶E3s是所知的唯一的可以和泛素形成硫酯键中间体的泛素连接酶,并且它可以直接催化靶蛋白的泛素化。HECTE3s有一个分子量大约为40kDa的具有保守性的羧基末端催化结构域,即HECT结构域。HECTE3

概述Ring结构域家族的泛素连接酶E3

  缺乏HECT结构域的E3s在亚基组成和氨基酸序列上是多样的,但大部分含有与E2相连的RING结构域。RING结构域家族最典型的特点是具有环指结构域(Ringfingerdomain),RING结构域是此家族具有泛素连接酶作用的重要因素。RINGE3s中RING结构域的氨基酸序列为:Cys.X2.

科研人员创制首个植物E3泛素连接酶文库

近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队创制了植物中首个E3泛素连接酶(UbE3)文库用于泛素化互作组鉴定,并利用该文库鉴定了苯丙氨酶家族蛋白PALs的核心E3泛素连接酶OsFBK16,揭示OsFBK16通过降解OsPALs负调控稻瘟病抗性的分子机制。相关研究论文发表于《

水生所揭示ELL作为E3泛素连接酶的新功能

  ELL基因最早是通过其与MLL基因转位形成融合蛋白从而导致急性髓系白血病而被发现的。随后的研究表明,ELL可以与RNA聚合酶II结合并发挥转录延伸的作用,从而调控HOX等基因的延伸和表达。此外,在哺乳动物体内,ELL基因还可以与类固醇受体、低氧诱导因子HIF-α以及E2F1相结合,从而调控这些转

E3泛素连接酶HOIL1L的催化机制和调控机理研究获进展

  泛素化修饰是哺乳动物细胞中广泛存在的一种蛋白质翻译后修饰。泛素化修饰包括单泛素化修饰和不同连接方式的多泛素化修饰。泛素化修饰在众多的细胞过程中发挥关键作用,包括蛋白质降解、细胞自噬、DNA修复、信号传导等。其中,线性泛素化修饰参与多种免疫相关过程,如NF-kB信号通路和抗入侵病原体的选择性自噬等

昆明动物所揭示E3泛素连接酶CUL7促进肿瘤细胞生存新机制

  肿瘤的抗凋亡是目前临床治疗的主要障碍之一。研究发现Cullin家族蛋白在癌症发生和发展中扮演重要角色,家族成员CUL7、CCDC8和OBSL1的突变能引发3-M综合症。患者具有严重的产前及产后生长迟缓,常伴特殊面容、男性性腺机能减退,大多智力正常。CUL7在肿瘤中具有抗凋亡功能,然而它如何抑制凋

关于U.box结构域家族的泛素连接酶E3介绍

  U—box家族的泛素连接酶E3是真核细胞蛋白质翻译后质量控制所必需的。此类蛋白质的c端都包含一个大约70个氨基酸残基的从酵母菌到人类具保守性的U—box结构域,U—box的三维结构类似于RING结构域家族泛素连接酶E3s的RING结构域,是此类型的泛素连接酶酶活性所必需的。U—box蛋白家族的泛

TRIM7:全新抑制人肠道病毒的E3泛素连接酶

  泛素-蛋白酶体途径介导的蛋白质降解是维持细胞内蛋白稳态的重要调控系统之一,其在多种细胞内生命活动进程中发挥重要的调控作用,例如细胞增殖、细胞分化、DNA修复、肿瘤发生、感染与免疫等 。  E3泛素连接酶是泛素-蛋白酶体系统的重要组成部分,E3识别特异性底物,通过对底物进行不同类型的泛素化修饰而决

磷酸化依赖的泛素降解底物研究获进展

  7月2日,中国科学院上海药物研究所研究员谭敏佳课题组和江苏海洋大学教授刘彬团队合作,在Cell Death & Differentiation上,在线发表了题为Global identification of phospho-dependent SCF substrates reveals a

PROTAC技术的小分子降解剂类型概况

近年来,PROTAC技术以其可靶向传统“不可成药”蛋白的独特优势而备受医药研发人员的关注。目前对PROTACs技术的突破主要集中在对于E3连接酶类型的改变,使PROTACs由肽类向小分子转变。泛素连接酶E3是一个蛋白家族,泛素化修饰的失调会给生命体带来一系列负面影响,严重者将导致疾病,甚至危及生命,

和泛素连接酶互作一定是被降解吗

不一定需要被讲解。E3酶与E2酶之间的互作是必要的,但不一定需要被讲解。事实上,这种互作已经得到广泛研究,并且已经有很多关于它的详细机制的文献发表。然而,在介绍泛素化过程时,对于E3酶与E2酶之间的互作进行简要的说明是有意义的,因为它能够帮助人们更好地理解泛素化的过程。和泛素连接酶(E3酶)与泛素激

Cell综述:三种泛素连接酶

  泛素化(ubiquitination)作为一类作用方式更加复杂且作用结果更加多样的蛋白质修饰, 在细胞生命周期各个方面扮演着同样重要的角色。  泛素化过程通常需要3种泛素酶的协同作用,其中E1泛素激活酶(ubiquitin-activating enzyme)与E2 泛素偶联酶(ubiquiti

泛素活化酶的泛素系统的介绍

  蛋白质的泛素化修饰主要发生在赖氨酸残基的侧链,且通常是多聚化 (多泛素化) 过程。被多泛素化修饰的蛋白质会被蛋白酶体(proteasome)识别进而被降解。三种关键的酶共同介导了这一多泛素化过程, 包括泛素活化酶 E1 (ubiquitin activating enzyme),泛素结合酶 E2

蛋白质的泛素化修饰

蛋白质的泛素化修饰主要发生在赖氨酸残基的侧链,且通常是多聚化 (多泛素化) 过程。被多泛素化修饰的蛋白质会被蛋白酶体(proteasome)识别进而被降解。三种关键的酶共同介导了这一多泛素化过程, 包括泛素活化酶 E1 (ubiquitin activating enzyme),泛素结合酶 E2 (

关于单泛素化修饰的基本介绍

  单泛素化修饰是一种调节信号可以引起靶蛋白的活性、定位以及蛋白质结构的改变从而对蛋白质的胞吞途径、膜泡的出芽、组蛋白的修饰、基因的转录以及蛋白质核内的定位进行调节。单独的泛素本身并没有任何生物功能,它只是一种分子标记蛋白,发挥作用必须在ATP提供能量的前提下依靠泛素途径的相关酶类及蛋白酶体。Gua

LYTAC-与靶向蛋白降解技术讲解(三)

到目前为止,除 CRBN/IMiD 分子胶之外,分子胶的设计构想仍依赖偶然的发现,包括通过系统地挖掘数据库得到的 CDK 抑制剂  CR8  分子,以及优化 MDM2 双功能降解剂 MD-222 得到的  MG-277 。 ■ 自噬介导的靶向蛋白质降解 (AUTAC): 自噬靶向嵌合体 (AUTAC

泛素化的过程

具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(蛋白

泛素化的过程

具体过程:泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上(绿色所示,注意在这个结构中,Cys突变为Ala)激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上(蛋白

药界新宠:LYTAC-与靶向蛋白降解技术(二)

■ 分子胶 (Molecular Glue):分子胶是一类诱导或稳定蛋白之间相互作用的小分子化合物,通过结合 E3 泛素连接酶并修饰其分子表面,诱导新的蛋白质间相互作用 (正常情况下两者原先没有相互作用),并在连接酶的作用下,导致蛋白降解 。沙利度胺 (Thalidomide) 及类似物泊马度胺 (

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

水生所百人计划JBC发表新成果

  FBXO32 (MAFbx/Atrogin-1)是一种E3泛素连接酶,在肌萎缩中是显著上调的。虽然一些数据支持,FBXO32可能在肿瘤发生过程中起重要作用,但是FBXO32在肿瘤发生中的分子机制,一直知之甚少。最近,中科院水生生物研究所“百人计划”肖武汉研究员带领的一项研究,阐释了FBXO32的

iScience:利用蛋白质组学构建预测模型识别未知底物

  近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子功能研究组研究员朴海龙团队基于生物信息学方法,揭示了癌症中关键的去泛素化与泛素化分子相互作用网络。  去泛素化与泛素化作用是生命体内至关重要的转录后修饰作用,参与到细胞周期、免疫调控、信号传递等几乎所有的生物学通路过程中。同时,该作用体系对

丁铲团队揭示HDV-V靶向降解MAVS抑制宿主先天性免疫机制

   近日,上海兽医研究所水禽病毒病创新团队发现,新城疫病毒(NDV)感染宿主细胞过程中,其非结构蛋白V能够招募宿主E3泛素连接酶RNF5降解重要的先天性免疫接头分子MAVS,抑制宿主先天性免疫从而促进病毒复制。该研究揭示了NDV V蛋白拮抗宿主先天性免疫的新机制,对抗病毒和抗肿瘤疗法具有重要意义。

人类的泛素连接酶有哪些

泛素 (英語: Ubiquitin )是一種存在於大多數 真核細胞 中 的小 蛋白 。它的主要功能是標記需要分解掉的蛋白質,使其被 水解 。 當附有泛素的蛋白質移動到桶狀的 蛋白酶 的時候, 蛋白酶就會將該蛋白質水解。泛素也可以標記 跨膜蛋白 ,如 受體 , 將其從 細胞膜 上除去。 泛素由76個

孙毅团队发现拟素化调控肿瘤细胞谷氨酰胺吸收和代谢

  代谢是细胞及机体生命活动能量与物质来源的基础,其稳态平衡是机体应对内外时空变化的重要保障。代谢紊乱或调控机制异常与多种人类疾病密切相关,例如,肿瘤代谢异常赋予肿瘤细胞特异性增殖优势,影响和改变肿瘤微环境,促进肿瘤细胞的存活。因此,揭示代谢途径调控机制,将为包括肿瘤在内的疾病发病机理提供全新突破口

Nat-Communi-|-谭泽华/庄怀佳揭示了T细胞活化的重要调控新机制

  DUSP22是一种双特异性磷酸酶,通过使激酶Lck失活来抑制T细胞活化。  2024年1月15日,中国台湾国家卫生研究院谭泽华及庄怀佳共同通讯在Nature Communications 发表题为“The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63