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Nature重要发现:跳跃基因的拦路虎

一个称之为组蛋白的蛋白质家族为DNA提供了支持和并赋予其结构,然而多年来科学家们一直对其中的一些非常规组蛋白感到迷惑不解,它们似乎是因为特殊而又通常神秘的原因而存在。现在,研究结果揭示出了这样一种组蛋白变体的新用途:通过让某些所谓的“跳跃基因”待在合适的位置阻止了遗传突变。 这项由洛克菲勒大学发起,发表在5月4日《自然》(Nature)杂志上的新研究,揭示出了表观遗传学通过DNA以外的手段来发挥作用的一种基本机制。由于组蛋白与DNA关系密切,科学家们知道它们常常参与基因的表观遗传调控已有一段时间。在这个案例中,一种特殊的组蛋白变体似乎降低了干细胞中潜在有害改变发生的机会,这些干细胞最终可以生成构成生物的各种组织类型。 研究作者、染色质生物学和表观遗传学实验室主任及教授C. David Allis说道:“人们说,好东西总是不起眼。组蛋白变体尤其如此。这项研究发现与常规H3组蛋白略有不同的组蛋白变体H3.3,帮助阻止了某些遗......阅读全文

Piggybac转座子载体的作用原理和应用

在我们研究某种疾病的发病机制或者某种药物的作用靶点时,经常需要建立目的基因过表达或基因敲除的细胞模型,目前构建稳转细胞株及部分敲除细胞株最常用的方式之一是慢病毒法,慢病毒因其可以转染几乎所有种类的细胞,且在转染后可以整合到细胞的基因组而长期表达的优势,是目前较为主流的构建方法,但慢病毒构建的稳转细胞

中科院PNAS表观遗传研究新进展

  近日来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的研究人员在组蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要进展,证实水稻中的H3K4特异性去甲基酶JMJ703参与控制了转座子活性,相关研究论文于1月14日在线发表在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。   领导这一研究的是中国科学院遗传发育所基因组生物学研究

Nature子刊:华中农大发现转座子可抑制mRNA翻译

  来自华中农业大学生命科学学院,作物遗传改良国家重点实验室的研究人员发现水稻中的一类DNA转座子具有翻译抑制功能,这揭示了微小反向重复转座元件的新功能,对研究其他重复序列的功能提供了借鉴意义,同时也拓宽了对于转座子的认识。  这一研究成果公布在3月3日的Nature Communications杂

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

科学家揭开“垃圾”DNA的神秘角色!

  生物学家们在很长一段时间里都认为,既然几乎所有具体的生理机能都要由蛋白质来完成,那么不编码蛋白质的DNA应该是没有用的,可以称为“垃圾DNA”;而且人类基因组项目发现人的基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的,其余的98.5%的序列是以前认为的“垃圾”DNA。  此前研究人员进行了一项名为E

2006年中国植物科学若干领域重要研究进展

3  蛋白质组学、功能基因组学与基因进化 蛋白质组学分析  北京大学朱玉贤研究组利用 2-DE、 MALDI-TOF MS 和 ESI-MS/MS 等蛋白质组学的方法研究了拟南芥中的 cp29A 和 cp29B 蛋白。cp29A 和 cp29B 是拟南芥8个叶绿体核糖核蛋白

Science重要成果:人类癌症反转录转座子图谱

  在人类基因组中,称为反转录转座子(retrotransposon)的小DNA元件通过自我复制和重新插入到基因组的多个位点从而具有造成突变性破坏的潜力。正常的成人细胞通过抑制机制阻止这些元件四处跳跃,然而根据发表在6月28日《科学》(Science)杂志上的一篇研究报道,这些机制在某些癌症中可能发

一文读懂老药新用研究新成果!

  时至岁末,转眼间2019年已经接近尾声,迎接我们的将是崭新的2020年,在即将过去的2019年里,科学家们在老药新用研究领域上取得了多项研究成果,本文中,小编就对本年度相关重要研究进行整理,分享给大家!  图片来源:http://cn.bing.com  【1】Cell Rep:老药新用!一类乳

研究发现水稻转座子受驯化选择和抗病抗逆中的调节功能

  6月19日,Molecular Plant 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所何祖华研究组题为Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究

Nat Com:多功能蛋白或可阻断寄生基因进行“跳跃”

  近日研究发现,大多数生物包括人类都有一种叫做“跳跃基因”的寄生DNA片段,它们将自己插入到DNA分子中破坏遗传程序。这一现象会导致与年龄相关疾病的产生,如癌症。但是罗彻斯特大学的研究人员报告说,在小鼠实验中,当多功能蛋白质为执行另一种功能而阻止它们受控制时,老鼠的“跳跃基因”就变得异常活跃。  

Gene Dev:研究发现抗癌基因有助于控制“跳跃”基因

  所有肿瘤中约有一半具有基因p53的突变,通常负责抵御癌症。现在,UT西南大学的科学家发现了p53在对抗肿瘤中的新作用:防止逆转座子或“跳跃基因”在人类基因组中跳跃。研究小组发现,在p53缺失或突变的细胞中,逆转座子的移动与扩增比平时更为常见。这一发现可能会导致检测或治疗具有p53突变的癌症的新方

在生命之初,胚胎中最早的转录因何触发

  在一段生命旅程开始之初,精子细胞刺穿卵细胞,它们的遗传物质融合。然而,在之后的一段时间,所获得的DNA一直保持沉默:受精卵或早期胚胎中的基因不被转录。科学家也不清楚,是什么最终启动了这一过程。  最近发表在《Nature Genetics》上的三项研究深入探索了这一过程。研究人员报告了一个基因D

PNAS:sRNA测序揭示杂种优势之谜

  Illinois大学的功能基因组学副教授Steve Moose及其团队发现了玉米杂种优势的新因素,即20至25个核苷酸长的双链小RNA分子sRNA。文章发表在6月26日的Proceedings of the National Academy of Science杂志上。   “杂种优势

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

作物基因组学研究进展(二)

⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源

Neuron揭示精神分裂症的病因根源

  常被称之为“垃圾DNA”的反转录转座子DNA片段,有可能在精神分裂症中发挥了重要的作用。在一项发表在《神经元》(Neuron)杂志上的研究中,一个日本的研究小组揭示了LINE-1反转录转座子在精神分裂症大脑中异常的丰富,在大脑发育过程中改变了与精神分裂症相关的一些基因的表达,有可能是精神分裂症的

科学家们在机体炎症研究领域取得的新成果

  本文中,小编整理了近期科学家们在炎症研究领域取得的新成果,与大家一起学习!  【1】Sci Transl Med:科学家们利用炎症来治疗炎症  doi:10.1126/scitranslmed.aau8217  加拿大基南生物医学科学研究中心的科学家们在实验室模型中发现了一种治疗包括关节炎在内的

Cell新发现:意料不到的保护“裸露”基因组的RNA

  2015年,来自冷泉港实验室的Andrea Schorn和Rob Martienssen等人发现了Piwi系统的一个重要奥秘:它们能利用一种蛋白质将细胞的基因沉默机器引导到了基因组中的正确位点,使得它能够让转座子失活,且不会干扰生物体自身的基因。从中他们指出,胚胎基因组之所以不会受到攻击是因为小

Science:跳跃基因如何找到目标?

  为了了解转座子如何形成基因组,极其重要的是,要发现它们定向整合(targeted integration)背后的机制。最近,来自法国国家健康与医学研究院病理学实验室的研究人员,与法国CEA-Saclay和美国一个实验室合作,确定了两种蛋白质之间的相互作用,是一个转座子整合到酵母基因组中一个特定区

武汉大学:建立体外高效CRISPR/Cas9靶向DNA编辑系统

  在我们的DNA深处潜伏着许多“寄生虫”,那就是被称为跳跃基因的转座子。这些尾巴很长的家伙如果插入健康的基因,就可能会引发疾病。不过迄今为止,人们还不清楚这种尾巴对于转座子的跳跃有何作用。  密西根大学医学院的研究团队在十一月十二日的Molecular Cell杂志上发表文章指出,没有尾巴的转座子

Cell子刊解决跳跃基因之谜

  在我们的DNA深处潜伏着许多“寄生虫”,那就是被称为跳跃基因的转座子。这些尾巴很长的家伙如果插入健康的基因,就可能会引发疾病。不过迄今为止,人们还不清楚这种尾巴对于转座子的跳跃有何作用。  密西根大学医学院的研究团队在十一月十二日的Molecular Cell杂志上发表文章指出,没有尾巴的转座子

高质量黑麦基因组揭示重要的农艺基因

  Nature Genetics  2021年3月18日,由河南农业大学王道文研究员团队联合多个单位共同破译黑麦基因组。相关研究成果“A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomi

昆明植物所等首次成功破译茶树基因组

  茶是世界上最为古老也是最为广泛饮用的含咖啡因软饮料,目前全球160多个国家的30亿人喝茶爱茶。普遍认为,茶树起源于中国的云南、四川等地;作为传播中国文化的使者,在茶从中国起身向世界各地传播的数千年的漫长历程里,与全球100多个国家多元的文化邂逅交融,发展形成了地球上复杂而美妙的茶文化。除了因为迷

Nature聚焦小RNA 破解系统生物学大难题

  最新一期的Nature Genetics在线版刊登了三篇文章,三个独立的研究团队解决了系统生物学理论中最重要的理论,三文章释放了一系列的数据解答了系统生物学细胞定向分化的关键调控网络。同期Nature配发了评论文章,FANTOM studies networks in cells。   系统生

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cD

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA

RACE技术的原理和操作

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA

Science最新成果:一种能让细胞“变身”的miRNA

   在被无情剥夺这种miRNA之后,你一定不会相信干细胞竟然会发生这种改变,一项最新研究表明,通过去除单个微小RNA(miRNA),多能干细胞竟可以实现罕见的全能化,获得分化成为胎盘等胚外组织的能力。这一研究极大程度上丰富了学术界对于细胞发育调控分子途径的认识,可以帮助临床医生和科学家通过干细胞技

基因工程操作技术及原理之基因克隆

1.克隆已知序列的基因 根据已知基因的序列设计引物(primer),利用PCR方法克隆基因。即使不同种属之间,基因编码区序列的同源性高于非编码区的序列。在某种植物的同源基因被克隆的条件下,可先构建eDNA文库或基因组文库,然后以该基因(或部分序列)为探针来筛选目的基因的克隆。 2.功能克隆 根据基