清华汪小我等人开发CRISPRsgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。 七月二十三日，清华大学自动化系的汪小我和美国斯坦福大学的Lei S Qi博士带领的研究小组，在国际权威杂志《Bioinformatics》发表了题为“CRISPR-ERA: a comprehensive design tool for CRISPR-mediated gene editing, repression and activation”的研究论文。随着越来越多使用CRISPR/Cas9进行基因编辑和调控的实验数据，该研究小组根据这些已发表的研究总结的一套sgRNA设计规则，开发出了一种综合性的计算......阅读全文
基因组研究让水稻育种走向精准设计
由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时，国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨，揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传
黄瓜变异组研究奠定全基因组设计育种基础
中国农业科学院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队，对115个黄瓜品系进行深度重测序，构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱，为全面了解黄瓜进化及多样性提供了新思路，并为全基因组设计育种打下了基础。相关成果10月20日在线发表于《自然·遗传学》杂志。 据国际黄瓜基因组计划首
设计基因调控回路延缓衰老
人类的寿命与个体细胞老化有关。3年前，美国加州大学圣地亚哥分校的一组研究人员破译了衰老过程背后的基本机制。在确定了细胞衰老过程中遵循的两个不同方向后，研究人员通过基因操作这些过程来延长细胞的寿命。据发表在最新一期《科学》杂志上的论文，他们现在利用合成生物学扩展了这项研究，设计了一种解决方案，可防止细
我国主导水稻基因国际研究离“设计水稻”更近一步
记者日前从中国农业科学院获悉，由中国科学家主导的“3010份水稻基因组计划”结出硕果，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传多样性，这一研究的重大成果将提升全球水稻基因组研究和分子育种水平，加快优质、广适、绿色、高产水稻新品种培育。 水稻种群的基因有着丰富的多样性和复杂的作用机制，是水稻育种改良的
“设计精子”将定制基因导入后代
英国北米姆斯皇家兽医学院的科学家们，在12月2日的The FASEB Journal杂志上发表的一项最新研究中，通过一个病毒载体将新的遗传物质导入小鼠精子中，让这些基因在胚胎中表达并起作用。这项发现——如果在人类中是成功的——能为遗传医学带来新的希望。 “新遗传学”承诺，通过利用“设计
基因转染和实验设计原则
磷酸钙-DNA共沉淀法核酸以磷酸钙-DNA共沉淀物的形式出现时，可使DNA附在细胞表面，利于细胞吞入摄取，或通过细胞膜脂相收缩时裂开的空隙进入细胞内，进入细胞的DNA仅有1%～5%可以进入细胞核中，其中仅有不到1%的DNA可以与细胞DNA整合，在细胞中进行稳定表达，基因转导的频率大约为10-4，这项
药物临床研究的盲法设计
实验材料人试剂、试剂盒安慰剂胶囊抗生素仪器、耗材药袋大袋：内装供试药或对照药；中袋：内装与大袋药相同的2-3个递补号，例如41、43、46为甲院A药的递补号，42、44、45为甲院B药递补号。以便在受试者中途剔除时，可以补用指定的药袋，而不破盲；小袋：写有该袋实际放入的药名及抢救措施的字条，以便发生
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA，用cDNA作为模板扩增基因的CDS区，然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因，首先在NCBI找到它的mRNA序列，然后找到它的CDS序列，全部复制下来，在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始（比如18bp），反向引物从CDS最后一
美设计地外基因组研究设备－地球生命是否来自火星或得验证
如果说地球生命都是起源于火星上的有机物，这对许多行星科学家来说并非不可想象。据美国物理学家组织网3月24日(北京时间)报道，目前麻省理工和哈佛大学的研究人员正在设计一种仪器，为地球生命是否来自火星提供支持证据。 麻省理工科研人员克里斯托夫·卡尔说：“我们可能起源于火星，或者
电解水材料设计研究取得进展
上方豌豆射手添加Co3O4，发射少量豌豆（代表氧气）；下方豌豆射手添加Co2MnO4，可长时间、稳定、快速地发射豌豆，代表高效稳定地催化电解水反应近日，中国科学院大连化学物理研究所理论催化创新特区研究组研究员肖建平团队与日本理化学研究所教授中村龙平团队，在电解水材料设计研究中取得新进展，制备了尖晶石
小型气象站的相关设计研究
成套的自动气象站价格十分昂贵，简易的气象站在农业上的实时监控就已经足够。于是，就小型气象站进行设计研究，采用单片机采集温湿度、气压、风力风向及雨量传感器的信号，经串口通迅RS232转RS485后,可传至千米以外的PC机，PC机端采用LabVIEW接收和显示来自串口的数据，同时可将这些数据通过网络传送
科学家设计基因调控回路延缓衰老
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499595.shtm
如何利用已知基因设计特异性引物
首先在NCBI进行blast比对,找到基因的特异序列,与其他基因同源性低的区域,然后再这些区域设计引物。还有一种方法是先在基因上设计引物，然后再blast比对引物，看看在你的目的物种中是否有同源基因。
研究建立植物高效引导编辑设计策略
实现重要农作物精准基因组编辑对加快农作物遗传改良进程具有重要意义。引导编辑技术（Prime Editing）能够在基因组的靶位点处实现精准的片段插入、删除及碱基的任意替换。引导编辑系统由两部分构成：一部分是nCas9(H840A)与工程化改造的逆转录酶（Reverse Transcriptase
高产优质水稻品种设计育种研究获进展
水稻是重要的粮食作物，是我国60％以上人口的主粮。在粮食危机和人们生活水平日益增长的双重压力下，育种学家和稻米种业长期以来致力于培育“高产优质”型超级水稻新品种，但是传统育种进展缓慢。随着水稻功能基因组的发展，“品种设计育种”应运而生，其重要内容之一是将重要农艺性状关键基因的优异等位形式高效聚合
新冠病毒相关临床研究亟需科学设计
据悉，在过去约1个月时间内，共有175项新冠病毒感染疾病临床研究在启动或准备中，截至2月17日，有144项新冠病毒相关临床研究在中国临床试验注册中心注册；31项新冠病毒相关临床研究在美国临床试验数据库注册。 复旦大学附属中山医院教授王吉耀、副研究员金雪娟发现，从注册登记信息看，在当前疫情下，临
高温液态金属粘度仪的研究与设计
粘度是表征流体性质的一项重要参数，能直接反映不同流体的特性。粘度及其测量在国民经济许多领域有着广泛的应用，许多工程技术应用都需要流体粘度参数。随着工业现代化的发展及科学技术的进步，相关领域里的粘度测量越来越得到重视，粘度测量方法与测量技术也有很多新的发展。目前粘度测量正在向高精度、自动化、实时在线的
全基因组设计培育高产优质抗病粳稻
近日，江苏里下河地区农业科学研究所李爱宏团队联合中国农业科学院植物保护所宁约瑟团队、扬州大学杨泽峰团队在《基因组生物学》发表研究论文。 该研究收集了我国江苏省、浙江省和山东省等地大面积推广的198份粳稻品种并进行基因组重测序分析，解析了华中地区优良粳稻品种的基因组信息和优势基因位点的遗传学
全基因组设计培育高产优质抗病粳稻
近日，江苏里下河地区农业科学研究所李爱宏团队联合中国农业科学院植物保护所宁约瑟团队、扬州大学杨泽峰团队在《基因组生物学》发表研究论文。 该研究收集了我国江苏省、浙江省和山东省等地大面积推广的198份粳稻品种并进行基因组重测序分析，解析了华中地区优良粳稻品种的基因组信息和优势基因位点的遗传学
贺林：－基因测序发展需要更多顶层设计
创新启示录：基因测序产业应用前景广泛 《中国出生缺陷防治报告（2012）》指出，我国出生缺陷发生率为5.6%，每年新增出生缺陷患儿89.6万，其中结构畸形25万，防治形势严峻。这些实际仅是来自刚出生时的统计数据，如果把后发的也进行统计，出生缺陷人数要远远高于此数。 “冰岛的人口不过30万人，
临床基因扩增实验室设计有哪些要求
临床基因扩增实验室设计、建设SICOLAB区域划分要求：如下1、原则上，临床基因扩增实验室（标本前处理区、试剂储存和准备区、标本制备区、扩增区、扩增产物分析区）并有独立的通风系统、缓冲间。2、根据使用仪器的功能，区域可适当合并，例如使用实时荧光PCR仪，扩增区、扩增产物分析区可合并；采用样本处理、核
基因编辑鼠的构建－Guide－RNA设计和筛选
众所周知，CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”，它可以高效地实现靶基因的编辑，自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成，Cas9核酸酶会在向导RNA（Guide RNA, gRNA）的指引下，在完整基因组上的特定位点完成切割反应，同
基因测序产品的设计应听取临床医生建议
今天我想跟各位群友分享的主要内容是：基因测序产品本身在设计和应用过程当中应该主要考虑的一些问题。一、基因测序的发展史我们知道基因测序技术它从人类基因组计划开始，通过一代测序发展起来，当年我自己也做过一代测序，做一段基因的一代测序非常不容易，要设计引物，跑PCR验证，遇到一些片段引物非常难设计。这个过
CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计
sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有：1、http://crispr.mit.edu/ ；2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/；等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要，但仍然存在很多不足和缺陷。例如：1、数据分析周期长；2、无具体的脱靶数据；
药物设计，设计什么？
上周《Nat. Rev. Drug Discov.》一篇分析显示设计符合类药性（drug-like）规则的候选药物并不能真正增加这些药物在开发路程上的成功率。那么现在药物需要如何设计才能保证一定的成功率呢？ 首先药物设计不是大学教科书里讲的活性分子设计，设计活性化合物要容易无数倍。新药在今天的
华大基因中心正研究智商基因
中国有基因中心进行天才基因比对研究，希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议，被利用来针对某个族群。亦有学者担心，人类有朝一日会藉研究成果，透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。 深圳华大基因中心进行的基因智力专桉，是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本，和普通人的基因样本做比对，
种子数粒仪的设计研究及结论
在如今的育种工作中，我们可能会经常听到“种子千粒重”这类行业术语， 其实它指的就是一千粒种子的重量。为什么要拿出来讲，是因为这里面的难点就在于如何才能准确数出一千粒种子甚至更多。相信如果采用人工数粒方式是很难做到 的，而且人工计数的千粒重测定方法不仅费时费力而且误差大。为此小编结合了相关资
研究团队设计出电磁强化的沼气生产系统
我国是农业发达的国家，玉米种植面积较大，每年生产约800吨的玉米秸秆。然而，玉米秸秆使用效率较低，如现场燃烧或堆放，造成环境污染，并浪费这一资源。厌氧发酵技术可以将玉米秸秆转化为甲烷的有效技术。 中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室研究员杨玉义与东北电力大学副教授赵波等合作设计出一
如何写出优秀的生物和医学研究设计？
生物和医学研究设计 生物和医学研究设计是在生物、医学和涉及人类其他类型研究中进行实验以及观察性研究的表述。一个好的实验设计能有效提高研究水平，节省科研人员的精力及时间。那如何才能完成一个优秀的生物和医学研究设计？来跟杨国源教授学！设计范例+研究经验+理论方法，帮你打造设计方法论，快速开展科研。1.设
正交设计法研究花生粗脂肪含量测定方法
花生是我国主要的油料作物和经济作物,其脂肪含量为45%～55%。花生中脂肪含量的高低，决定了花生的品质。如果要知道花生中含有多少的脂肪，我们可以借助于粗脂肪测定仪，它有多种型号，如SZF-06A脂肪测定仪、SZF-06B脂肪测定仪、SZF-06脂肪测定仪。花生种子的脂肪含量是决定其品质的重要指标之一