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新一代测序在癌症中的临床应用

一提起癌症,人们往往谈虎色变。的确,癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计,2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸,DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识,也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。 如今,新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面?美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前在《Frontiers in Genetics》杂志上进行了详细介绍。在这篇文章中,他们回顾了新一代测序近期的科研和临床应用,同时,他们强调了100%基因组测序的重要性,也就是测序高度重复的非编码序列。 利用新一代测序(NGS)技术,人们已经完成了多种癌症的外显子组测序和基因组测序,并提出了癌症分型的新标准。以乳腺癌为例,癌症基因组图谱(Cancer Genome Atlas)测序了510个乳腺癌外显子组,将其分为四个亚型:luminal A、 luminal B、HER2-enriched和basal-like。 测序所......阅读全文

DNA测序技术的现状和发展(七)

3. 新一代测序技术的前景在2007年6月,James Watson的基因组序列登录到了GenBank数据库当中,这是第一次使用非Sanger测序法获得了人类个体基因组序列,并且第一次将个人基因组序列公之于众。整个测序过程在两个月之内就完成了,花费不到100万美元,这只占耗时10年之久的人类

基因测序路在何方——专访Life Technologies销售总监柴映爽

  近年来,基因测序技术飞速发展,使得几十个甚至上百个基因的测序能够在几天之内完成,测序的成本也下降到普通百姓可以承受的范围,这使得基因测序的临床应用成为可能。在临床研究方面,外显子组甚至全基因组的基因测序大大加速了疾病分子标志物的寻找,使得多种疾病病因的诊断与分型与以往相比更加精确,在用药时也能更

DNA测序技术的现状和发展(二)

三、新一代DNA测序技术DNA测序技术已广泛应用于生物学研究的各个领域,很多生物学问题都可以借助高通量DNA测序技术予以解决。过去三年,大规模平行 测序平台(massively parallel DNA sequencing platform)已经发展为主流的测序技术,这项测序技术的出现不仅

下一代测序技术将改变生物学现状

  新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技

高通量测序技术——第二代测序技术

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de

法医 DNA检测平台的研究进展与比较研究

法医 DNA检测平台的研究进展与比较研究摘要:现代科学技术带动了 DNA检测技术在法医领域的不断发展.以目前世界上比较先进的三个 DNA检测平台为例,探讨法医 DNA检测平台的研究与应用.每项技术有其优缺点,在实际的法医 DNA检 测中,要灵活地选用检测平台,以促进工作的顺利开展.近几年来,中国

下一代测序技术将改变生物学现状(二)

最新的新一代测序仪操作只需一个人,24小时内可产生与几百台桑格毛细管测序仪同样多的序列数据。此外,样品中DNA损伤与常温贮藏的状态以及新一代测序误差等因素往往超过了序列变异,因此很难确定样品来源于现代人类还是古穴人。相比较而言,断言长毛象的某一特定顺序是来源于古代标本,而不是现代污染物更容易,因为现

高通量测序的应用及前景

一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力,对照一个参比基因组(reference genome)高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence),2007年van Orsouw

DNA测序仪:454测序仪

454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了

强强联合:在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术

  摘要:   CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验

DNA测序技术的现状和发展(一)

一、我们将如何应对海量的基因信息新一代测序技术带给人们大量遗传信息的同时,却成为限制其广泛应用的一个障碍。1980年,英国生物化学家Frederick Sanger与美国生物化学家Walter Gilbert建立了DNA测序技术并获得诺贝尔化学奖,至今已有近三十年了。在这三十年,DNA测序技

新一代测序技术(下)-SOLiD (ABI)

 【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代

新一代测序技术之三国时代(上):Illumina

【摘要】2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代测序

DNA测序技术的现状和发展(六)

2. 用于处理新一代测序技术数据的软件和标准各种新一代测序仪的飞速发展面临着一个极其重要的问题,那就是生物信息学问题,这些问题包括序列质量评分(sequence quality scoring)问题、序列比对问题、序列组装问题、数据发布问题等。下面将逐个进行讨论。2.1 序列质量问题目前,序列质量评

新一代测序技术为生物制药开启新路径

        新一代测序技术现在越来越多使用在新兴生物药的开发和疫苗生产上。目前药物研发部门使用的各种高通量技术,例如基因芯片、代谢组学建模、酵母双杂、蛋白质组学、高通量化学筛选、电子杂交定位,有望被新一代测序技术替代或作为补充

基因测序技术产业新浪潮

        基因测序也称DNA测序,是现代生物学研究中重要的手段之一。基因测序技术经过了三个发展阶段。第一代DNA测序技术是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)提出的链终止法。第一代技术准确率高,读取长,

在CRISPR/Cas9相关研究中应用高通量测序技术(二)

四.CRISPR/Cas9技术与新一代测序技术的联用 革命性技术总是发展迅速、应用广泛的。作为另一项革命性的生命科学研究技术,DNA新一代测序技术在近五、六年得到快速发展和推广。它已经用于生命科学相关领域的许多方面。同样地,也可以用在CRISPR/Cas9相关的研究中。两者之间的应用领域有

Biotechniques:新一代测序中的缺口填补

  在完成的基因组的复兴时代,科学家使用由第三代测序技术提供的长读取,来填补基因组装配中的缺口(gap)。新一代测序能赶得上吗?  新一代测序,可让科学家们以比Sanger测序更快的速度和更低的价格,进行基因组测序,为1000美元基因组测序铺平了道路。但是这种方法牺牲了长读取速度,将平均读长减少至大

对话Life Tech:Ion Proton台式基因组测序仪

  著名的生物技术公司Life Technologies(纳斯达克股票代码:LIFE)3月28日宣布,在中国推出新的台式基因测序仪:Ion Proton™。借助该技术产品,只需 1000 美元即可在一天时间内完成个人全基因组测序。    这一新型测序仪采用了新一代半导体测序技术。此前推出的同样基于这

Qiagen收购IBS 进军测序市场

  Qiagen公司在周一收市后宣布,它已经收购了新一代测序公司Intelligent Bio-Systems(IBS),并推出一项举措,旨在将测序技术推向分子诊断和临床研究市场。  私人持有的IBS公司在今年3月召开的“Association of Biomolecular Resour

基因测序技术随“新”而“动”

  【摘要】5月16日,在杭州举办的“2014转化医学高峰论坛”上,赛默飞世尔科技公司旗下Life Technologies中国区仪器平台销售总监张焱女士指出,基因组工具的发展突飞猛进,转化医学正从一个平台深入到医疗领域的方方面面,创新技术和方法令人应接不暇,临床应用迎来了前所未有的机遇期。  十年

全新一代测序技术:没有光的测序

  至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心   ――明斯特大学Dag Harmsen   在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过

安捷伦科技与Covaris公司签署合作开发市场协议

安捷伦科技公司与Covaris公司签署合作开发市场协议 将靶向序列富集与DNA剪切技术结合 用于新一代测序分析   2010年1月5日,北京安捷伦科技公司(NYSE: A)与Covaris 公司于今日宣布了一项合作开发市场协议,该协议表明,未来Covaris S2 DNA剪切技术将与安捷伦 S

新一代测序技术的先锋-SOLiD系统

2008年12月  作为上世纪生命科学领域最重要的技术发明之一,测序技术深刻地改变了我们对生命本质的理解和掌控能力。假如没有测序技术,基因序列就无法确定,酶切、克隆、反转录、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技术也就根本无从谈起,生命科学领域也不会有今日的蓬勃发展。无人不晓的GenBank;

DNA三代测序技术原理、平台、特点介绍

人类基因组计划、基因芯片、个性化分子诊断、生物云计算……这些在21世纪第一个十年里吸引无数眼球的热门词汇,都和一个产业颇有渊源——DNA测序。生物技术和信息技术在这片创意新天地里水乳交融,如果用一句诗来形容坐拥两大技术护航的DNA测序产业,那就是——天生丽质难自弃。随着人类基因组计划的完成,人类对自

重感冒病人患上帕金森氏症的风险是健康人的两倍

  在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过50人的生命(德国范围内),在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。   Harmsen 教授在这

美国DeNovix公司超微量/荧光全功能光度计在新一代测序...

美国DeNovix公司超微量/荧光全功能光度计在新一代测序样品质量上的应用对于新一代测序,待测样品的质量和浓度,是文库成功构建的两个非常关键因素,也是新一代测序成功与否的关键。它可以最大程度上减小序列的偏差,并且输出可靠的序列信息。严格把关送测样品的浓度和质量,是确保新一代测序的数据准确、以及高通量

NGS测序十年记:ABI奋起直追

  说起全自动测序仪,Applied Biosystems(ABI)那是绝对的领头羊,其3730旗舰测序仪在人类基因组计划中立下赫赫战功。然而,在新一代测序方面,454和Solexa抢了先机,率先推出了NGS仪器。ABI当然不会作壁上观,让客户的实验室里摆满对手的仪器。  于是,它在2006年斥资1

基因测序万亿蓝海:国产测序仪能替代进口吗?

   基因测序是一个革命性技术,所带来的应用领域非常宽广,是一片未开发的蓝海领域。近几年来,随着基因测序技术的进步,基因测序行业进入高速发展时期。  在基因测序产业链中,最上游基因测序仪的研发和生产是产业的命门,长期以来,基因测序仪的生产一直被国外所垄断,而从今年开始,中国制造的基因测序仪将逐步替代

全新测序技术利弊比较之单分子测序

  在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过50人的生命(德国范围内),在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。   Harmsen教授在这场疫情