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PNAS:新测序方法助力癌症研究

在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中,两位来自华盛顿大学的年轻研究人员:Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想,谈到了一个简单但功能强大,可用于检测癌细胞,获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率,那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异,这种改进能用于癌症的早期诊断,以及帮助医师们了解哪些细胞会对化疗产生抗性。 上篇: 双重测序方法的诞生 双重测序方法是随着新一代测序技术的发展而诞生的,新一代测序技术近年来风头劲猛,这种能同时完成上十亿个序列测定的方法被广泛应用到了癌症,传染疾病等多个研究领域中,目前寻找预先存在的癌细胞的最直接方法就是对癌细胞进行测序,从中识别癌症相关的基因突变,但由于原有的技术存在大量的误差率,因此出来了太多假阳性结果。 Loeb实验室的一位研究人员:Scott Kennedy博士,一直都致力于完善一种称为Safe-SeqS的新......阅读全文

【盘点】单细胞测序研究进展一览

  细胞是生物学的基本单位,近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术,该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始

全民测序时代 基因测序到底有什么用?

  近两年精准医学的概念逐渐深入人心,这是一种将个人基因、环境与生活习惯差异考虑在内的疾病预防与处置的新兴方法。2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”,希望精准医学可以引领一个医学新时代。随后习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委,要求国家成立中国精准医疗战略专家组,科

基因组测序新公司工作全靠机器人

CG公司的基因组测序工作完全由机器人完成工作人员正在蓝色幽暗的“车间”内操作检测设备   美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在,一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起,那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过,一家名为“整

IVD这个细分领域未来市场容量或达200亿

  2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出了2017年度全球十大新兴技术榜单,其中肿瘤的无创诊断技术成功入选并荣膺榜首。肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。与传统的组织活检相比,液体活检具备实时

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

神经生物学领域最新研究进展

  本期为大家带来的是神经生物学领域最近的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Nature:新研究首次揭示抑制年龄相关的神经活动增加竟可延长寿命  doi:10.1038/s41586-019-1647-8.  在一项针对线虫、小鼠和人类的研究中,来自美国哈佛医学院的研究人员发现在整个动物界

2017年5月CRISPR/Cas亮点盘点

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。  

单细胞RNA测序,众多研究都pick它

  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。  多细胞测序和单细胞测序,你pick谁?如今,大多数研究人员也许会选择后者,因为不一样的角度,会带来不一样的见解。单细胞测序的最初动力来自癌症研究,可帮助人们了解肿瘤异质性和肿瘤微环

第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展

  目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。  何为NGS?它面临着哪些问题?  NGS已经成为一个研究平台

Nabsys定位测序仪首次亮相AGBT

  AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。Nabsys,一家DNA技术的创业型公司,在会议上展出了其固态基因测序仪。据介绍,这款仪器将会在今年下半年上市,价格大约在50,000美元。   Nabsys公司总部位于美国罗德岛州普

多种测序技术或将深入推动癌症领域研究

  本文中小编整理了多篇文章,来解读测序技术在阐明癌症发生机制、癌症诊断及疗法开发等方面的巨大潜力,与各位一起学习!  【1】JAMIA:新工具深入挖掘外显子测序结果 帮助找到最佳癌症治疗药物  doi:10.1093/jamia/ocw022  科罗拉多大学的研究人员最近在国际学术期刊JAMIA上

癌症耐药性是如何产生的?

  近年来,研究者们在肿瘤的预防与治疗领域取得了突破性的进展,临床上手术、放化疗以及免疫疗法的结合使用也大幅提高了患者的寿命以及生活质。然而,在很多情况下,肿瘤组织还是会出现较强的抗药性,使得治疗结果往往不佳。因此,进一步探究癌细胞的耐药性的产生以及寻找针对性的治疗方法是目前的研究热点。本期为大家带

JAMA:两家基因检测公司做的液体活检,结果竟不相同

  如今,癌症的精准医疗已经不是什么神秘又高冷的名词了,在消费级基因检测的推广和各种科普下,不知道点什么“液体活检”“基因测序”“循环肿瘤DNA(ctDNA)”之类的名词可真是有点落伍了。  在科研领域飞速发展的同时,临床医生们也与时俱进,抽血做个基于ctDNA的液体活检,一方面可以又快又准确地帮助

最聪明的生物公司在做什么?扒一扒你不知道的黑科技

  近日,美国著名的《麻省理工科技评论》评选出了全球最聪明(创造力)的50家公司。这50个名单不仅包含了亚马逊、谷歌、微软等互联网巨头,也包含了创立于2013年的Editas Medicine这一类新型公司。在这50家公司里,生物医疗相关的公司总共有15家。  在这15家公司中,有10家公司与基因相

当下最流行的表观遗传研究检测技术是什么?看看这里……

  11月17日Cell杂志SnapShot专栏介绍了表观遗传研究的检测方法,这四种方法包括:亚硫酸氢钠测序法(bisulfite sequencing)、染色质免疫沉淀测序技术(chromatin immunoprecipiation sequencing)、开放染色质测定(determinati

精准医疗:再吸金€6.7亿,4篇Nature奠定临床新技术

  近年来,随着基因组学技术在医疗领域的广泛应用,全球范围内对疾病的诊疗能力有了很大的提高,各国政府也纷纷制定了相关的医疗计划,并投入大量的资金。近日法国首次宣布启动《法国基因组医疗2025》计划,精准医疗再度吸来重金。疾病诊疗技术是精准医疗得以实现的关键,6月27日,Nature平台连发四篇文章证

年终盘点:2016年国内不容错过的重磅生物研究

  时间总是过得很快,2016年马上就要过去了,迎接我们的将是崭新的2017年,2016年,我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果,发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究,以饕读者。   --结构生物学 --  1.清华大学 施一

华人学者Nature子刊单细胞基因组测序新突破

  在加州大学圣地亚哥分校生物工程师们的领导下,研究人员生成了来自单个大肠杆菌细胞以及人类大脑单个神经元的最完整基因组序列。采用一项新的单细胞基因组测序技术,他们在只有12纳升体积、充满液体的小孔中完成了基因组扩充,从而获得了这一突破性的成果。该项研究发表在11月10日的《自然生物技术》(Natur

Science特刊:一文读懂微生物组如何影响癌症免疫疗法

  癌细胞往往会表达一系列肿瘤相关的抗原,从而成为T细胞攻击肿瘤的突破口。然而,癌细胞同时也会释放出一些免疫抑制分子,压制免疫细胞的功能。近年来取得突破的免疫检查点抑制剂,正是通过阻止PD-1与PD-L1的结合,使T细胞得到激活,用以攻击癌细胞。但从临床数据上看,诸多肿瘤依旧缺乏T细胞浸润。研究人员

Science特刊:一文读懂微生物组如何影响癌症免疫疗法

  编者按:微生物组对于人体的健康可谓至关重要。在癌症方面,它们能够影响癌症的发生、进展、乃至疗法的效果。一方面,这是因为微生物能够影响到药物的药代动力学;另一方面,这是因为与细胞共生的微生物能对局部、乃至远方的免疫系统造成影响。可以说,想要开发未来的精准药物,离不开对微生物组的诊断与理解。最近,《

数学模型如何助力人类疾病研究?

  在科学研究的道路上,科学家们常常会开发多种模型来帮助研究,其中数学模型就是研究者们经常使用的一种模型,随着近年来研究的不断深入,就有研究人员开发出新型的数学模型来解析中和抗体和HIV-1之间相互作用的机制,当然除此之外,科学家们还利用数学模型对其它疾病进行了大量研究,本文中,小编盘点了近年来多篇

数学模型如何助力人类疾病研究?

  在科学研究的道路上,科学家们常常会开发多种模型来帮助研究,其中数学模型就是研究者们经常使用的一种模型,随着近年来研究的不断深入,就有研究人员开发出新型的数学模型来解析中和抗体和HIV-1之间相互作用的机制,当然除此之外,科学家们还利用数学模型对其它疾病进行了大量研究,本文中,小编盘点了近年来多篇

2018年5月Science期刊不得不看的亮点研究

  2018年5月份即将结束了,5月份Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Science:肠道微生物组竟能控制肝脏中的抗肿瘤免疫反应  doi:10.1126/science.aan5931; doi:10.1126/science.aat8289 

11月初重大事件一览:悄然走近的无创基因检测

  11月以来,伴随着APEC在京如火如荼地召开,我们的基因检测行业也爆发了许多新鲜的大事。本文由测序周报(资讯篇)重点搜集了与无创基因检测相关的国内外最新资讯,回顾了9条上周关注及13条综合资讯。大家品读完之后,一定会觉得基因检测离我们已真的不远了!  上周关注  01 达安基因测序仪和唐筛试剂盒

2019年3月Cell期刊不得不看的亮点研究

  2019年3月份即将结束了,3月份Cell期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Cell:迄今为止最大规模人体微生物组研究揭示出数千种新型微生物物种  doi:10.1016/j.cell.2019.01.001  在一项新的研究中,来自意大利特兰托大学计算宏基

Nature:人类细胞图谱研究先锋Aviv Regev

  Aviv Regev是一位生物分析专家。现在,她正致力于绘制人体的每一个细胞。  计算生物学家Aviv Regev喜欢做一些看似不可能完成的任务。2011年,她与分子遗传学家Joshua Levin合作,测试了RNA测序的几种方法。科学家们在测试几种技术的极限,以查看哪种方法表现最佳。他们用降解

Tecan帝肯发布2019年财报 全年收入6.4亿瑞士法郎增7.2%

分析测试百科网讯,帝肯Tecan公司发布2019年财报。2019年销售收入6.368亿瑞士法郎,相比去年5.938亿增7.2%,公司毛利润2.973亿瑞士法郎,毛利率46.7%,净利润7320万瑞士法郎,净利润率11.5%。2019年研发费用5985.7万瑞士法郎,研发占比为9.4%。公司收入主要来

Nature方法:发布蛋白质组检测新技术

  在Fred Hutchinson癌症研究中心癌症蛋白质组学专家Amanda Paulovich博士领导下,一个国际科学家研究小组证实了大规模、标准化蛋白质检测的可行性,这是验证疾病生物标志物和药物靶点的必要条件。   这项在线发表在12月8日《自然方法》(Nature Methods)

新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7