多种测序技术或将深入推动癌症领域研究

本文中小编整理了多篇文章,来解读测序技术在阐明癌症发生机制、癌症诊断及疗法开发等方面的巨大潜力,与各位一起学习! 【1】JAMIA:新工具深入挖掘外显子测序结果 帮助找到最佳癌症治疗药物 doi:10.1093/jamia/ocw022 科罗拉多大学的研究人员最近在国际学术期刊JAMIA上发表了一项癌症研究,他们开发了一种新工具能够帮助进行肿瘤细胞全外显子测序原始数据解读,随后根据癌细胞的特定基因图谱找到FDA批准的靶向治疗药物。 现在全外显子测序技术越来越普及,一些病人可以得到全外显子测序检测,而这个工具的出现将帮助病人对测序数据进行提炼,找到候选基因以及与之相应的治疗方法。 研究人员将这种工具叫做IMPACT(Integrating Molecular Profiles with Actionable Therapeutics),利用这种工具可以根据全外显子测序产生的原始数据(由A,T,C,G组成的序列)匹配出......阅读全文

每个癌症患者都应进行DNA测序

  英国首席医疗官萨利·戴维斯女士近日发布了一份年度报告,主旨是建议每个癌症患者接受DNA测序,以防止误诊、不必要的反复确诊和无效的化疗。  目前,英国每年有超过35万人被诊断患有癌症,每年约有16.3万人因此死亡。萨利表示,是时候结束“诊断性恶性肿瘤”了,这类患者一般要咨询5位以上医生,在确诊前平

PNAS:新测序方法助力癌症研究

  在去年圣诞节期间的加拿大落基山脉冰攀之旅中,两位来自华盛顿大学的年轻研究人员:Michael Schmitt和Jesse Salk突发奇想,谈到了一个简单但功能强大,可用于检测癌细胞,获得更好结果的新方法――如果他们能降低DNA测序中的错误率,那么就可以更好的检测出这些细胞中的变异,这种改进

检测癌症相关DNA修饰新测序方法

  牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明,他们开发的新方法,TET辅助吡啶硼烷测序(TET-assisted pyridine borane sequencing,TAPS)是一种比亚硫酸氢盐测序(bis

Cell新文章:癌症全基因组测序

  根据华盛顿大学医学院的一项新研究,具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。   论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说:“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因

Nature子刊:癌症单细胞测序新技术

  只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。   发布在7月22日《自然生物技术》(

证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变

  最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。  这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。  UT西南

CollabRx公司:-推出分析工具角逐癌症基因测序市场

  位于旧金山的生物技术公司 CollabRx宣布将要竞逐癌症基因测序市场,公司目前推出了一套Genetic Variant Annotation (GVA)的服务软件,能帮助研究人员分离定位并鉴定癌症基因。利用生物信息学确定癌症基因已经成为癌症研究人员研究的重要途径之一,因此也使得这个领域成为

Nature外显子测序发现癌症等相关突变

  来自西雅图儿童医院,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“De novo germline and postzygotic mutations in AKT3, PIK3R2 and PIK3CA cause a spectrum of related megalencephaly syn

多种测序技术或将深入推动癌症领域研究

  本文中小编整理了多篇文章,来解读测序技术在阐明癌症发生机制、癌症诊断及疗法开发等方面的巨大潜力,与各位一起学习!  【1】JAMIA:新工具深入挖掘外显子测序结果 帮助找到最佳癌症治疗药物  doi:10.1093/jamia/ocw022  科罗拉多大学的研究人员最近在国际学术期刊JAMIA上

新一代测序在癌症中的临床应用

一提起癌症,人们往往谈虎色变。的确,癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计,2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸,DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识,也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。如今,新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面?美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前

Cancer:1527例患者“揭秘”基因测序如何帮助癌症治疗?

  精准医学、基因测序,如今它们已经不是什么新鲜的词汇,但在各大学术会议与产业大会中,它们依旧是蔚然成风,受到科研以及企业家们的追捧。去年奥巴马提出了精准医学概念,现如今,关于精准医疗的期刊论文以及学术报告已有无数篇问世,而且这个势头仍在增长。今天,我们来讲述Cancer杂志上的一篇研究,他们揭示了

新一代测序在癌症中的临床应用

  一提起癌症,人们往往谈虎色变。的确,癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计,2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸,DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识,也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。  如今,新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面?美国罕见病基因组研究所的研究人

全基因组测序有望改善癌症预防与诊断

  美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。  “全基因组测序是一种新的基因

单细胞测序技术应用于癌症无创诊断

  2013年12月10日著名学术期刊美国《国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences USA)在线发表了北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心谢晓亮、白凡课题组与北大肿瘤医院王洁团队合作的研究结果。在题为“Reprod

MDAnderson实施分层癌症测序,以实现个性化治疗

  MD Anderson癌症中心个性化癌症治疗研究所的研究人员开始对癌症患者实施两层的测序方案,以便指导治疗,并确定合适的临床试验。   MD Anderson个性化癌症治疗研究所的医疗主任Funda Meric-Bernstam在本月出席华大基因(BGI)主办的国际基因组学大会时解释道,患

柳叶刀子刊:大规模测序发现癌症风险基因

   近期发表在《Lancet Oncology》上的研究表明,一些已知癌基因发生生殖系突变可能增加个人对肉瘤的易感性,肉瘤是一种罕见的骨组织和软组织癌症。  作为国际肉瘤家族研究(ISKS)的一部分,澳大利亚研究人员领导的一个国际小组对1000多名肉瘤患者进行了靶向基因panel测序。除了已知的与

Science最新报道:单细胞测序助跑癌症精准分型

  麻省综合医院(MGH)、MIT布罗德研究所、哈佛大学近日在Science杂志上发表了一篇文章(3月31日),使用单细胞RNA测序技术,并结合癌症基因组图谱分析了星形细胞瘤(astrocytomas)和少突神经胶质瘤(oligodendrogliomas)两种脑神经胶质瘤(gliomas)的细胞组

新一代测序在癌症中的临床应用

  一提起癌症,人们往往谈虎色变。的确,癌症是全球发病和死亡的主要原因。据WHO统计,2012年有820万例癌症相关的死亡。所幸,DNA测序技术的快速发展正在改变我们对癌症的认识,也在转变癌症的筛查、诊断和治疗。  如今,新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面?美国罕见病基因组研究所的研究人

新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7

-Sci-Transl-Med:肿瘤基因测序可能会误导癌症治疗

  最近,约翰霍普金斯大学的科学家们研究表明,肿瘤基因组测序所获得的遗传变化线索,如果不先与癌旁组织的遗传信息进行比较,可能会误导近一半癌症患者的治疗。  约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员称,他们分析了超过800名癌症患者的测序数据——由Personal Genome Diagnost

快速的DNA测序仪正带来简单的癌症血液检测

  中国(相关)的一切都很大,包括它的癌症问题。在一些富裕的城市,如北京,癌症被认为是最常见的杀手。空气污染,吸烟率高,以及因工业污染而造成的“癌症村”,正在增加这个国家的死亡率。它的肝癌发生率是西方国家的四倍,部分原因在于每14个中国人中就有一个携带乙肝病毒,全世界每年死于癌症的人中,大约有27%

我科学家PNAS:测序诊断癌症的强大工具

  最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患 者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、 癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中

全基因组测序是癌症诊断的强有力工具

  一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1  和  BRCA2突变检测)无法显示出有用的

震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?

   近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。  全基因组测序(Whole-genome seque

110个癌症相关基因!最新测序技术解析“DNA成环”

  在有史以来最全面的研究中,英国伦敦癌症研究所的科学家们发现了110个与乳腺癌风险增加有关的基因。  这项研究采用了一种先进的遗传学技术:Capture Hi-C分析与遗传性乳腺癌相关的DNA区域图谱,由此确定了增加女性患病风险的实际基因。  这一研究成果公布在Nature Communicati

EBioMedicine:全基因组测序高效识别癌症相关基因突变

  UT西南医学中心癌症研究人员已经证明,全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险,其可以潜在地改善癌症的预防,诊断和治疗。  这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组,诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具,能够确定

基于新一代测序的癌症检测被纳入保险范畴!

  11日,医保机构Independence Blue Cross和NantHealth公司宣布,基于全基因组和蛋白质组的分子诊断综合性平台GPS CancerTM成为全美第一个保险报销的临床癌症检测。该平台可用于诊断癌症发生的分子机制,并确定个性化的治疗方案。此举对癌症精准医疗具有里程碑的意义,同

-下一代测序:癌症个性化治疗的核心

  毫无疑问,未来的癌症治疗将会根据患者特异性的生物标志物变得越来越个性化。在实现癌症个性化治疗的道路上,下一代测序(NGS)技术发挥着不可取代的作用。在过去的几年里,NGS变得更加精确,它帮助研究人员和病理学家实现了从单基因检测到多基因检测的完美转换。  NGS 通过广泛的基因筛查,预测癌症的发病

Nature子刊:基因测序揭示12种癌症的遗传易感性

  12月22日《NatureCommunications》杂志上的一项研究阐述了12种癌症的遗传性,意外发现胃癌遗传概率与乳腺癌等同,同时还揭示了乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2突变对其他癌症的影响。  12种癌症的遗传性(遗传性易感性)  长期以来,众所周知癌症的部分风险因素为遗传,且遗传突

不止于遗传病和癌症,靶向测序还有这些用途

二代测序(NGS)的快速发展加速了遗传病、癌症等领域的研究,其本身也作为一种更为先进的基因检测手段逐步走进临床。在NGS的众多技术中,靶向测序正在成为新时代的“宠儿”。遗传病诊断(WES/Panel)、肿瘤伴随诊断(肿瘤多基因Panel)、免疫治疗疗效预测(WES/Panel),这些NGS应用热点都