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科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法

长期以来,直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在,氨基酸序列破译结果并非完全正确,甚至与真实序列有很大差异。近期,荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法,该技术能够读取蛋白质信息内容,直接对蛋白质的氨基酸序列进行测序。研究成果发表在《Science》期刊,标题为“Multiple rereads of single proteins at single–amino acid resolution using nanopores”。 研究人员开发出基于纳米孔技术的单分子肽“阅读器”。在Hel308 DNA解旋酶的作用下,将DNA-肽偶联物拉过MspA纳米孔,此时纳米孔会在离子流中产生独特的阶梯状电流信号。通过配套的识别软件,可以准确识别电流信号,并对电流中值进行分析,从而回溯确认序列的信息。进一步研究显示,在构建的......阅读全文

氨基酸序列测定实验

基本方案 测定通过 SDS-PAGE 转移到 PVDF 膜上样品的氨基酸序列 辅助方案 准备SDS-PAGE蛋白质样品             实验方法原理

氨基酸序列测定实验

实验方法原理 实验材料 分离胶和积层胶溶液还原型谷胱甘肽干粉试剂、试剂盒 4 × 凝胶缓冲液10 × 下槽缓冲液10 × 上槽缓冲液甲醇转移缓冲液0.1%(V/V)考马斯亮蓝的 50%甲醇溶液10%(V/V)乙酸的 50%甲醇溶液仪器、耗材 微量注射器或凝胶加样吸头PVDF 膜小型电转装置自动蛋白质

什么是氨基酸序列?

  氨基酸序列是氨基酸相互连接形成肽链(或多肽)的顺序。如果肽链是一个蛋白质,氨基酸序列就经常被叫做蛋白质主要结构。根据氨基酸的结构和它们连接在一起的方式,氨基酸序列只能按照一个方向读取,并且以特定形式形成肽。  氨基酸有100多种不同类型,其中20种常用于生产蛋白质。所有氨基酸都具有一个常规结构,

氨基酸序列的测定方法

有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析,可用;

氨基酸序列的测定方法

有两种方法,一是直接测序列法,常用Edman降解法,在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸(阿尔发)与PITC反应,标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱,在无水酸的存在下发发生降解,第一个氨基酸(AA1)经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析,可用;

氨基酸序列测定实验——辅助方案

实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒1 mol/L NaHCO3 (可选)100% 冰冷乙醇(不含变性剂 USP 级)样品缓冲液 0.1% (V/V)焦宁 Y 染料仪器、耗材超滤浓缩器/Speedvac蒸发器拉细的巴斯德吸管/凝胶加样吸头1.5 ml 微量离心管离心机实验步骤1. 必要时,用1 mol/L

氨基酸序列测定实验——基本方案

测定通过 SDS-PAGE 转移到 PVDF 膜上样品的氨基酸序列实验材料分离胶和积层胶溶液还原型谷胱甘肽干粉试剂、试剂盒4 × 凝胶缓冲液10 × 下槽缓冲液10 × 上槽缓冲液甲醇转移缓冲液0.1%(V/V)考马斯亮蓝的 50%甲醇溶液10%(V/V)乙酸的 50%甲醇溶液仪器、耗材微量注射器或

什么是氨基酸序列的覆盖率

你是质谱结果么?意思就是质谱鉴定出来的能够跟数据库中的序列对的上的那一部分氨基酸占总的氨基酸序列的比值。例如,二级质谱能够找到的若干个肽段含有的总氨基酸个数是40个,而你的目标蛋白的氨基酸总过有100个,那么氨基酸序列覆盖率即为40%.

组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸

氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。生物功能大分子蛋白质的基本组成单位,是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物。氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。  基酸中包含的羧基(COOH),氨基(NH

重叠基因的调控序列

①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN