一种新颖的蛋白质序列可视化模型
摘 要：利用相似规则、互补规则和分子识别理论建立一种氨基酸数字编码模型用于研究序列特征、功能预测。给出一种新的基于元胞自动机的蛋白质序列图像生成方法，其优点是考虑了氨基酸前后的相互作用，生成的图像与基因序列一一对应，许多隐藏在蛋白质序列中的重要特性通过元胞自动机图可以表现出来。基于蛋白质元胞自动机图所得到的蛋白质伪氨基酸成分，蛋白质亚细胞定位预测成功率可以达到86.4%。点击这里进入下载页面：进入下载页面......阅读全文
生科院提出环形RNA内部序列结构可视化新方法
1月18日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队于Bioinformatics 杂志上在线刊发了题为Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。该研
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法；2、熟悉蛋白质基本性质分析；3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测；4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（ad
核酸和蛋白质序列分析1
在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等，识别调控区的顺式作用元件，可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本
核酸和蛋白质序列分析2
（2）输出：除了以文本形式外，还可以通过JalView显示和编辑结果。此外，还可以另外使用GeneDoc（常见于文献）及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列，需要进行ORF分析，每个生
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；（
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；
蛋白质序列分析和结构预测实验
蛋白质序列分析和结构预测实验 实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其
Nature:蓝斑蜥蜴斑点何来？
蓝斑蜥蜴（学名：Timon lepidus）又名珠宝蜥，主要分布在意大利西北部，法国南部，西班牙及葡萄牙。栖居在开阔林地、葡萄园及橄榄林内。日行性，卵生，每次产约4～6枚卵。在野外以昆虫、小型蜥蜴、其他动物的蛋与小型哺乳动物为食，本种若在茂密的灌木林内被发现，体型大者逃跑时会因碰撞矮树丛而发出很
全自动机械臂固相萃取仪产品详情
仪器主要性能特点： 通道数量和控制模式：仪器主机采用模块化设计，支持现场升级通道数，支持1/2/4/8多种通道组合； 连续处理能力：最大连续处理能力超过100位样品； 机械臂：X/Y/Z三维机械臂设计，采用双螺旋滚珠丝杆，兼顾灵活移动与精准定位； 样品泵：取样精准、耐溶剂腐蚀、具有较
N－端封闭蛋白质内部序列测定实验
实验材料 蛋白质样品（约 200 mol） 试剂、试剂盒 1％乙酸溶液（含丽春红 S 染料）1％ 乙酸0.2 mol／L NaOH0.1 mol／L 乙酸溶液(含PVP-40)消化缓冲液1 mg／ml 胰蛋白酶层析溶液 A层析溶液 B 仪器、耗材 0.22 μm
N－端封闭蛋白质内部序列测定实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 蛋白质样品（约 200 mol）
N－端封闭蛋白质内部序列测定实验
实验方法原理 实验材料 蛋白质样品（约 200 mol）试剂、试剂盒 1％乙酸溶液（含丽春红 S 染料）1％ 乙酸0.2 mol／L NaOH0.1 mol／L 乙酸溶液(含PVP-40) 消化缓冲液 1 mg／ml 胰蛋白酶层析溶液 A 层析溶液 B仪器、耗材 0.22 μm 硝酸纤维素膜酸洗过的
岩石动态开裂快速连续到非连续分析方法研究获进展
深部地下工程在爆破开挖、地震作用下的岩体开裂破坏实质是一个动态的过程，准确分析模拟其过程需要建立岩石动态开裂破坏过程的连续到非连续数值模拟分析方法。经典细胞自动机方法计算无需组装总体刚度矩阵，极大节省计算内存，但是计算效率相比传统有限元等方法有所降低，因此，在传统的连续到非连续细胞自动机方法的基
上海药物所实现光控药物胞浆递送和肿瘤的可视化治疗
细胞毒性T细胞具有特异性杀伤异常细胞的能力，在肿瘤治疗中发挥着重要作用。嵌合抗原受体-T细胞（CAR-T）的发明进一步拓宽了其在肿瘤治疗领域的应用。然而，细胞毒性T细胞在体内的行为难以监测和调控，在实体瘤治疗中由于免疫微环境的存在疗效有限，且需要从患者提取T细胞进行修饰，规模化制备受限。 中国
从航天可视化到可视化航天
自9月28日进入北京航天飞行控制中心，在历时12天的紧张工作中，石家庄铁道大学校信息科学与技术学院院长赵正旭教授及刘展威、佟宽章、王威4人圆满地完成了嫦娥二号三维可视化前期任务。向全球展现了嫦娥二号发射任务的实时精彩仿真。 “以前是航天可视化，现在是可视化航天。”北京航天飞行控制中心
预测蛋白质3D结构，单条蛋白质序列就能实现
7月22日，华深智药对外宣布，公司在蛋白质结构预测方面开发出一项新技术OmegaFold，突破了已有计算机预测三维结构的模式，是人工智能（AI）和生命科学领域结合实现的一个突破。华深智药是由清华大学人工智能产业研究院孵化，是一家致力于使用AI重构药物开发流程来提高新药研发速度和效率的企业。日前，华深
日本实现活体生物体内蛋白质状态的可视化
日本九州大学和东京大学的一个联合研究小组日前说，他们利用长约1毫米的线虫进行的实验中，首次成功看到活体生物体内蛋白质变化的情况。 九州大学助教广津崇亮等研究人员对线虫头部嗅觉神经中负责传递气味信号的Ras蛋白质进行了研究。他们通过基因操作，将一种发光颜色会随Ras蛋白质状态变化而变化的分子
蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤
序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析，motif分析和功能预测等，结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构，二级结构目前预测还是比较准确的，三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测，也可以采用一些其他软件，如modeller和一些商业软件，主要原理是同源
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验
方案1 两相柱测序仪的样品上样实验实验材料样品溶液试剂、试剂盒甲醇（HPLC级）三氟乙酸（TFA）仪器、耗材双向测序柱（Agilent）氮气供应设备聚丙烯试管样品加样器上样漏斗实验步骤一、浸润层析柱1.将准备好的两相柱的亲水段（凸向接头）移开，放在一边。2.将柱的疏水段（凹向接头）和上样漏斗装配在一
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验
方案1 两相柱测序仪的样品上样实验 方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验 方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验 方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验 方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验 方案6 羧基端序列分
科学家建立高效运载胞内蛋白质技术
5月16日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remod
科学家建立高效运载胞内蛋白质技术
5月16日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remod
科学家建立高效运载胞内蛋白质技术
5月16日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remod
科学家建立高效运载胞内蛋白质技术
5月16日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remode
血红素存在抑制了胞蛋白质合成
血红素通过影响eIF-2对蛋白质进行调控。当血红素存在时,抑制了胞蛋白质合成,而且还能促进通常不合成血红蛋白的细胞合成蛋白质,如促进肝癌细胞、海拉细胞和腹水瘤细胞无细胞制剂的蛋白质合成。
电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验
方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化：大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化：微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验4
方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验实验材料包含目的蛋白的二维电泳凝胶点试剂、试剂盒丙烯酰胺混合物（30%）琼脂糖 50g L考马斯亮蓝染色液脱色液平衡缓冲液10 X 聚丙烯酰胺电泳缓冲液浓缩胶仪器、耗材巴氏滴管聚丙烯管Protean II xi 2-D 电泳槽（Bio-Rad)注射器试管管式
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验5
方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验实验材料放射性标记的多肽试剂、试剂盒碳二亚胺试剂偶联缓冲液甲醇-水多肽溶剂S3 (氯丁烷 正丁醇）闪烁液仪器、耗材ATZ-收集器加热块小滴管Mylar 聚酯薄膜蛋白质测序仪闪烁计数器Sequelon-AA 试剂盒测试管实验步骤1.将放射性标记的肽段在小试管中溶解于
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验3
方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验实验材料含目的蛋白的 PVDF 膜试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色液脱色液仪器、耗材塑料容器实验步骤1.依方案2 电转移后，将 PVDF膜迅速放于塑料容器中，并加人考马斯亮蓝染色液浸没膜。室温下染 5〜10 min 。2.弃去染色液，加人脱色液浸没膜，在 PVDF